MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia eutropha JMP134 chromosome 1

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007347	CAGCCG	2	12	2149	2160	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007347	TGTCTG	2	12	90586	90597	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_007347	TCCCGG	2	12	101649	101660	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007347	CGGCTG	2	12	104259	104270	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007347	GTTGCC	2	12	143071	143082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007347	ACTGGC	2	12	231758	231769	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007347	TGCTTA	2	12	231780	231791	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_007347	CCGTCA	2	12	239638	239649	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007347	TCAAGC	2	12	267002	267013	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007347	TTCTGC	2	12	268053	268064	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007347	GCAGCG	2	12	311685	311696	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007347	AAAAGG	2	12	322833	322844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007347	ATTCCA	2	12	332141	332152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007347	CGGGCG	2	12	369033	369044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007347	GAAAAA	2	12	529803	529814	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007347	CACGAC	2	12	543236	543247	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007347	TCGTTG	2	12	612900	612911	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_007347	CAACCC	2	12	648470	648481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_007347	ATATGG	2	12	728748	728759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007347	TTTCCG	2	12	797333	797344	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007347	CCGCCA	2	12	818624	818635	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_007347	GCCCGG	2	12	873464	873475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007347	CGAACG	2	12	874450	874461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007347	CTGGCT	2	12	896436	896447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007347	GGGGGT	2	12	935761	935772	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007347	GCCGCG	2	12	1002840	1002851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007347	GCATCT	2	12	1037227	1037238	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007347	TCCGGA	2	12	1038909	1038920	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007347	AGACAA	2	12	1046652	1046663	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_007347	GTAAAA	2	12	1115232	1115243	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007347	ATACGA	2	12	1142316	1142327	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_007347	AAAAAG	2	12	1142488	1142499	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007347	GCCGGG	2	12	1156989	1157000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007347	CAAAAA	2	12	1208031	1208042	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_007347	ACGAGT	2	12	1253154	1253165	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_007347	GATGTC	2	12	1259833	1259844	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_007347	GGAGAA	2	12	1330036	1330047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007347	AGCGCC	2	12	1360983	1360994	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007347	GATGGT	2	12	1363460	1363471	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007347	ACGAAA	2	12	1363865	1363876	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_007347	CAACGA	2	12	1465839	1465850	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007347	GAAGCG	2	12	1467306	1467317	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007347	ATGCAT	2	12	1470914	1470925	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_007347	AAAATT	2	12	1519921	1519932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007347	GGCCAG	2	12	1534363	1534374	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007347	GCCGGC	2	12	1548428	1548439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_007347	CACGGC	3	18	1577383	1577400	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007347	CGGCAC	2	12	1594236	1594247	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007347	GGCAAA	2	12	1610465	1610476	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_007347	GATCTG	2	12	1610510	1610521	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_007347	TCGCCA	2	12	1612148	1612159	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007347	GGGGAA	2	12	1631228	1631239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007347	GCCACC	2	12	1639668	1639679	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_007347	GCCACC	2	12	1658227	1658238	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_007347	CGGCGC	2	12	1669363	1669374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007347	CAAAAG	2	12	1697209	1697220	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007347	TCTGAA	2	12	1804145	1804156	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_007347	GACACT	2	12	1805280	1805291	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007347	TGACTG	2	12	1843248	1843259	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_007347	ACGGGG	2	12	1935775	1935786	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007347	CGGCGA	2	12	1940135	1940146	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007347	ATCCGG	2	12	1954746	1954757	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007347	ATCGGC	2	12	1969932	1969943	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007347	CGGAGC	2	12	1975734	1975745	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007347	CGGCAC	2	12	1997128	1997139	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007347	CGCGGG	2	12	2046096	2046107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007347	CCTGCC	2	12	2141381	2141392	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_007347	ACTGAT	2	12	2143073	2143084	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_007347	GGGTCG	2	12	2209442	2209453	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_007347	CGCCGG	2	12	2211465	2211476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007347	CGCCTT	2	12	2279596	2279607	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007347	AAACGG	2	12	2290237	2290248	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007347	GCCGAG	2	12	2379016	2379027	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007347	GCGCTC	2	12	2416607	2416618	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007347	CACCGC	2	12	2421842	2421853	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_007347	CGGGTT	2	12	2427616	2427627	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_007347	AAAGAG	2	12	2427841	2427852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007347	ATTCAG	2	12	2447631	2447642	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_007347	CAGAAC	2	12	2452004	2452015	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007347	CAAAAA	2	12	2456288	2456299	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_007347	AATGGT	2	12	2470696	2470707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007347	CAACGC	2	12	2472613	2472624	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007347	CGGGCA	2	12	2476416	2476427	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007347	ATTCCA	2	12	2492365	2492376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007347	CTTTTT	2	12	2521829	2521840	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_007347	CACCGA	2	12	2522063	2522074	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007347	TCCTTC	2	12	2582133	2582144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_007347	CGGAAT	2	12	2604629	2604640	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_007347	GCATTT	2	12	2612346	2612357	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_007347	GGCAGA	2	12	2621207	2621218	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_007347	ATAGCA	2	12	2621238	2621249	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_007347	TTTTTC	2	12	2623159	2623170	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_007347	TGCGCG	2	12	2662451	2662462	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007347	ACTGTA	2	12	2675368	2675379	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_007347	TGCCGC	2	12	2741855	2741866	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_007347	ATCCGG	2	12	2773576	2773587	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007347	TCGCTA	2	12	2786783	2786794	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007347	GGCGCT	2	12	2788479	2788490	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007347	ATCATT	2	12	2816263	2816274	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_007347	TATCGA	2	12	2839467	2839478	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_007347	CATCCG	2	12	2850071	2850082	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007347	GCATTG	2	12	2869423	2869434	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_007347	ATGAGT	2	12	2887756	2887767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007347	TTTTTG	2	12	2989988	2989999	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007347	CCGGCG	2	12	3005780	3005791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_007347	GCCAGC	2	12	3033639	3033650	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_007347	CCCGCT	2	12	3065179	3065190	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_007347	GCGCCC	2	12	3073716	3073727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_007347	GCGCCG	2	12	3121784	3121795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007347	ACAAAG	2	12	3138223	3138234	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_007347	GCGCTC	2	12	3157485	3157496	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007347	CAGACG	2	12	3176641	3176652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007347	AGGCAA	2	12	3217689	3217700	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_007347	GCCGCA	2	12	3253298	3253309	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007347	GGGAGA	2	12	3298228	3298239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007347	GCCCCG	2	12	3323150	3323161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_007347	CCAGCA	2	12	3357512	3357523	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
118	NC_007347	CAGCCG	2	12	3390937	3390948	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_007347	TCTGGA	2	12	3395705	3395716	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_007347	GCGGCA	4	24	3424383	3424406	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007347	GTTTTT	2	12	3429598	3429609	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007347	CTGTGC	2	12	3459391	3459402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007347	ACAAAA	2	12	3465060	3465071	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_007347	GCGTTT	2	12	3479357	3479368	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_007347	CAAAAA	2	12	3481018	3481029	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_007347	TCGGTA	2	12	3498373	3498384	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_007347	GTCCCG	2	12	3552833	3552844	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007347	CTTTTT	2	12	3588367	3588378	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_007347	TCAGTT	2	12	3602958	3602969	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_007347	TAATAT	2	12	3621012	3621023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007347	CAAACG	2	12	3621924	3621935	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007347	GCTAGG	2	12	3625830	3625841	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_007347	CGAAGG	10	60	3675911	3675970	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_007347	GCTGTT	2	12	3691388	3691399	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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140	NC_007347	GCAGGC	2	12	3737120	3737131	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007347	GGAGAA	2	12	3802425	3802436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.