MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRF

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007110	AT	3	6	295	300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007110	AT	3	6	316	321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007110	AT	3	6	430	435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007110	TA	3	6	1031	1036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007110	AT	3	6	1111	1116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007110	TA	3	6	1212	1217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007110	AT	3	6	3088	3093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007110	TA	3	6	7715	7720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007110	TA	3	6	7828	7833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007110	TA	3	6	8952	8957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007110	TC	3	6	11155	11160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007110	TA	3	6	11242	11247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007110	CA	3	6	13270	13275	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007110	TA	3	6	17065	17070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007110	GT	3	6	17283	17288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007110	TA	3	6	19140	19145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007110	AT	4	8	20768	20775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007110	TA	3	6	20861	20866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007110	GA	3	6	21560	21565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007110	GA	3	6	21582	21587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007110	TA	3	6	21968	21973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007110	GA	3	6	28168	28173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007110	TG	3	6	29621	29626	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007110	GT	3	6	30250	30255	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007110	AG	3	6	30429	30434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007110	AC	3	6	31535	31540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007110	TC	3	6	31591	31596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007110	TA	3	6	31958	31963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007110	TA	3	6	32002	32007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007110	TG	3	6	32607	32612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007110	TA	3	6	35235	35240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007110	CT	3	6	36377	36382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007110	AC	3	6	46323	46328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007110	GT	3	6	50188	50193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007110	TA	4	8	53560	53567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007110	AC	3	6	53714	53719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007110	AT	3	6	54799	54804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007110	AT	3	6	59918	59923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007110	TA	3	6	60260	60265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007110	CT	3	6	61487	61492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.