MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 chromosome

Total Repeats: 798

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007109	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007109	TTTA	2	8	7680	7687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007109	GCGA	2	8	10631	10638	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007109	ATTA	2	8	11331	11338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007109	AAAG	2	8	12693	12700	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007109	TAAA	2	8	14716	14723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007109	TCAT	2	8	14837	14844	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007109	CTTT	2	8	14971	14978	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007109	TTAT	2	8	20730	20737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007109	TTTA	2	8	26301	26308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007109	GCGA	2	8	31180	31187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007109	TATT	2	8	33311	33318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007109	TAAA	2	8	36709	36716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007109	ATAA	2	8	41049	41056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007109	AACA	2	8	41144	41151	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007109	ATTA	2	8	44913	44920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007109	AAAT	2	8	45032	45039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007109	AAGA	2	8	46376	46383	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007109	ATCC	2	8	47254	47261	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007109	TAAT	3	12	47319	47330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007109	ATTA	3	12	47354	47365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007109	AAAT	2	8	47377	47384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007109	TAAA	2	8	48718	48725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007109	AAAG	2	8	53840	53847	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007109	TTTA	2	8	53884	53891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007109	TGAG	2	8	54353	54360	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007109	AAAT	2	8	55913	55920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007109	ATTA	2	8	56132	56139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007109	ATCA	2	8	56865	56872	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007109	GCAA	2	8	59345	59352	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007109	AAGC	2	8	59421	59428	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007109	ATTT	2	8	61476	61483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007109	ATTA	2	8	62332	62339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007109	ATTT	2	8	64935	64942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007109	AGGC	2	8	66616	66623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007109	TTAT	2	8	68322	68329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007109	ATTA	2	8	73222	73229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007109	TAAA	2	8	73308	73315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007109	GTAC	2	8	74781	74788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007109	CTAT	2	8	77117	77124	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007109	AGTA	2	8	81886	81893	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007109	TCAC	2	8	84470	84477	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007109	TTTA	2	8	88697	88704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007109	TTTG	2	8	89271	89278	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007109	CGCC	2	8	89326	89333	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_007109	CGTA	2	8	89891	89898	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007109	AAAT	2	8	91920	91927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007109	TAAT	2	8	109474	109481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007109	ATTA	2	8	110209	110216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007109	AAAG	2	8	112608	112615	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007109	GGTG	2	8	112976	112983	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007109	TTTA	2	8	121006	121013	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007109	TTTC	2	8	121227	121234	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007109	GCGA	2	8	125079	125086	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007109	AATA	3	12	130312	130323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007109	TAAA	2	8	130482	130489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007109	ATTT	2	8	130571	130578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007109	TAAT	2	8	131433	131440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007109	TATT	2	8	140997	141004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007109	ATAA	2	8	141073	141080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007109	TCTA	2	8	141129	141136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007109	AAAT	2	8	142309	142316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007109	TAAA	2	8	142751	142758	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007109	AATA	2	8	144912	144919	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007109	CGTA	2	8	150655	150662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007109	TTAC	2	8	150666	150673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007109	TAAT	2	8	153133	153140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007109	ATTT	2	8	153950	153957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007109	TTAC	2	8	154041	154048	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007109	AAGT	2	8	155180	155187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007109	CACT	2	8	158866	158873	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007109	TAAA	2	8	160980	160987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007109	ATTA	2	8	161053	161060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007109	GTAA	2	8	164324	164331	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007109	ACTT	2	8	165162	165169	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007109	ATAA	2	8	167854	167861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007109	TAAT	2	8	167869	167876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007109	TTAA	2	8	167920	167927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007109	ATAA	2	8	169224	169231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007109	AGCA	2	8	169330	169337	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_007109	ATTT	2	8	172613	172620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007109	AAAT	2	8	174484	174491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007109	CAAT	2	8	181454	181461	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007109	AAGA	2	8	181605	181612	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007109	AGTC	2	8	186296	186303	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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87	NC_007109	TAAA	2	8	187485	187492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007109	ATAA	2	8	190986	190993	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007109	TAAA	2	8	191706	191713	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007109	TTAT	2	8	192237	192244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007109	TTAA	2	8	192435	192442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007109	CTAA	2	8	192888	192895	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_007109	TTAG	2	8	193175	193182	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007109	TGTA	2	8	195672	195679	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007109	TTAC	2	8	195754	195761	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_007109	ATTT	2	8	202239	202246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007109	CAAA	2	8	202363	202370	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_007109	TTTA	2	8	203226	203233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007109	TATT	2	8	203239	203246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007109	TTAT	2	8	203369	203376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007109	TTAT	2	8	205437	205444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007109	GTTT	2	8	208013	208020	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007109	ATTT	2	8	211139	211146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007109	GCGA	2	8	211193	211200	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_007109	GTAT	2	8	212057	212064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007109	TCGC	2	8	213106	213113	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_007109	ATTT	2	8	215604	215611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007109	AATA	2	8	216190	216197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007109	GTAA	2	8	218596	218603	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007109	ATTA	2	8	218714	218721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007109	AATT	2	8	218783	218790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007109	GTTT	2	8	219923	219930	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007109	TTCT	2	8	225015	225022	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007109	TAAA	2	8	233251	233258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007109	ACGA	2	8	236685	236692	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_007109	GTTC	2	8	236694	236701	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007109	AAAG	2	8	236758	236765	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007109	TTTA	2	8	236798	236805	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007109	AAAT	2	8	236918	236925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007109	GCGA	2	8	237526	237533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_007109	GCGA	2	8	241600	241607	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007109	CGTA	2	8	241653	241660	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_007109	AATA	2	8	245496	245503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007109	ATTT	2	8	245540	245547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007109	TTTA	2	8	261670	261677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007109	CTAC	2	8	264346	264353	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_007109	TAAA	2	8	264373	264380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007109	ATTA	2	8	265619	265626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007109	TTCC	2	8	267702	267709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007109	ATTT	2	8	272561	272568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007109	AGCA	2	8	282381	282388	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_007109	TTTC	2	8	287316	287323	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007109	TTTA	2	8	288163	288170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007109	TATT	2	8	288176	288183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007109	ATTA	2	8	290167	290174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007109	TAGT	2	8	290989	290996	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007109	TAAG	2	8	291167	291174	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_007109	TAAA	2	8	291830	291837	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007109	ATTT	2	8	291960	291967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007109	ATTT	2	8	293577	293584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007109	CTTT	2	8	293601	293608	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_007109	AAGT	2	8	293710	293717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007109	TAAG	2	8	293728	293735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007109	CTAG	2	8	297119	297126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_007109	TAAT	2	8	300048	300055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007109	TAAA	2	8	302902	302909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007109	TAAA	2	8	303724	303731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007109	TTTA	2	8	303997	304004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007109	GCTG	2	8	304142	304149	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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