MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006569	GC	3	6	823	828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_006569	AT	3	6	3877	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006569	GC	3	6	12043	12048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_006569	GC	3	6	12924	12929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_006569	GC	3	6	14922	14927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_006569	CG	3	6	20438	20443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_006569	CG	3	6	22995	23000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_006569	GT	3	6	24720	24725	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006569	GC	3	6	24756	24761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_006569	GC	3	6	36561	36566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_006569	CG	3	6	39846	39851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_006569	TC	3	6	41433	41438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_006569	TG	3	6	51651	51656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006569	CG	3	6	51672	51677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_006569	CT	4	8	51824	51831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_006569	CG	3	6	53025	53030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_006569	GA	3	6	72741	72746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006569	AC	3	6	76050	76055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_006569	AC	3	6	80545	80550	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_006569	CG	5	10	81923	81932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006569	GC	3	6	82003	82008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_006569	CG	3	6	82335	82340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_006569	GC	4	8	82775	82782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_006569	CG	3	6	84985	84990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_006569	GC	3	6	85538	85543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_006569	CG	3	6	87406	87411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_006569	CG	3	6	90420	90425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_006569	GT	3	6	92698	92703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006569	GC	3	6	96537	96542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_006569	GC	3	6	96649	96654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_006569	GA	3	6	107001	107006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006569	CG	3	6	110151	110156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_006569	TG	3	6	112060	112065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006569	AT	3	6	115847	115852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006569	AG	3	6	125000	125005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006569	CT	3	6	127900	127905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_006569	GC	3	6	145302	145307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_006569	CG	3	6	145450	145455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_006569	CT	3	6	146610	146615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_006569	CG	3	6	152022	152027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_006569	TA	3	6	152166	152171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006569	GC	4	8	153407	153414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_006569	GA	3	6	164540	164545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006569	CT	3	6	171652	171657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_006569	GA	3	6	177888	177893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006569	GC	3	6	180414	180419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_006569	GC	3	6	181810	181815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_006569	GC	3	6	182886	182891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_006569	GC	3	6	187548	187553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_006569	CA	3	6	188974	188979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_006569	GC	3	6	193370	193375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006569	GC	3	6	194353	194358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_006569	CG	3	6	199536	199541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_006569	GC	3	6	214492	214497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_006569	GC	3	6	214771	214776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_006569	CG	3	6	233961	233966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_006569	GC	4	8	234955	234962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_006569	GC	3	6	241953	241958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_006569	CT	3	6	243889	243894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_006569	AC	3	6	253345	253350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_006569	GC	3	6	258066	258071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_006569	CA	3	6	264558	264563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_006569	TC	5	10	279480	279489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_006569	GC	4	8	285184	285191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_006569	GA	3	6	286959	286964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006569	CT	3	6	287682	287687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_006569	GC	3	6	299745	299750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_006569	GC	3	6	299866	299871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_006569	GT	3	6	299936	299941	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006569	AG	3	6	299965	299970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006569	CG	4	8	300479	300486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_006569	GC	3	6	304041	304046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_006569	CG	3	6	317578	317583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_006569	GC	4	8	320913	320920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_006569	GC	4	8	321936	321943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_006569	TC	3	6	331029	331034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_006569	AG	3	6	335087	335092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006569	GC	4	8	338297	338304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_006569	GT	3	6	338818	338823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006569	GT	3	6	339452	339457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006569	CA	3	6	339668	339673	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_006569	GC	3	6	339788	339793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_006569	GC	3	6	339872	339877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_006569	CA	3	6	350762	350767	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_006569	GC	4	8	351416	351423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_006569	AC	3	6	351506	351511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_006569	TG	3	6	353822	353827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006569	CG	3	6	357636	357641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_006569	GC	3	6	357654	357659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_006569	CG	3	6	357719	357724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_006569	TC	4	8	361164	361171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_006569	CG	4	8	362453	362460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_006569	GA	3	6	362499	362504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006569	CG	5	10	364970	364979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_006569	CG	3	6	366068	366073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_006569	TC	3	6	366130	366135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_006569	TG	3	6	366226	366231	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006569	CG	3	6	367037	367042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_006569	TA	3	6	367214	367219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006569	CG	3	6	367614	367619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_006569	CA	3	6	369027	369032	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_006569	CG	4	8	369039	369046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_006569	GC	3	6	369683	369688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_006569	GC	3	6	369727	369732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_006569	GC	3	6	369753	369758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_006569	CT	3	6	370311	370316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_006569	AT	3	6	378392	378397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006569	TG	4	8	378707	378714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006569	TC	3	6	385738	385743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_006569	GC	3	6	390542	390547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_006569	AG	5	10	416874	416883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006569	GC	3	6	416929	416934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_006569	GA	3	6	422340	422345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006569	AC	3	6	444883	444888	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_006569	GA	3	6	444901	444906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006569	GC	3	6	446660	446665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_006569	TC	3	6	449175	449180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_006569	AT	3	6	454795	454800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006569	GC	3	6	456716	456721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_006569	CT	3	6	458794	458799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_006569	GC	3	6	485264	485269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_006569	CG	3	6	485288	485293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_006569	GC	4	8	485851	485858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_006569	TA	4	8	490170	490177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.