MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006569	CAC	2	6	3870	3875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_006569	AGT	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006569	TGG	2	6	3941	3946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006569	CCG	2	6	3958	3963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_006569	GCC	2	6	4893	4898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_006569	GGC	2	6	10637	10642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_006569	GCC	2	6	10649	10654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_006569	CGA	2	6	11236	11241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_006569	GGT	2	6	11253	11258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006569	GCG	2	6	12810	12815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_006569	GAT	2	6	15508	15513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006569	CTT	2	6	20410	20415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_006569	TTA	2	6	24545	24550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006569	ATG	2	6	24571	24576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006569	GCA	2	6	24640	24645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_006569	CGC	2	6	24733	24738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_006569	ATT	2	6	30797	30802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006569	AAT	2	6	30808	30813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006569	TGA	2	6	34223	34228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006569	ATT	2	6	34276	34281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006569	CCG	2	6	34402	34407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_006569	CAC	2	6	34454	34459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_006569	AGA	2	6	34511	34516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006569	GGC	2	6	34539	34544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006569	GCC	2	6	34556	34561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_006569	ACA	2	6	34601	34606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_006569	TCG	3	9	36575	36583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_006569	TCC	3	9	36585	36593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_006569	CGG	2	6	36628	36633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_006569	CGG	2	6	36659	36664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_006569	GTC	2	6	36757	36762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_006569	CCG	2	6	37086	37091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_006569	CGG	2	6	37529	37534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_006569	AGG	2	6	45078	45083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006569	CGG	2	6	50910	50915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_006569	ATC	2	6	51537	51542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_006569	TTG	2	6	51609	51614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006569	CCT	2	6	51832	51837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_006569	TCT	2	6	51870	51875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_006569	CCG	2	6	51876	51881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_006569	GCC	2	6	53500	53505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_006569	GCC	2	6	53507	53512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_006569	CGG	2	6	53521	53526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_006569	CAT	2	6	56524	56529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_006569	CGG	2	6	56553	56558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_006569	GGC	2	6	57449	57454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_006569	GCC	2	6	57459	57464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_006569	GCA	2	6	59720	59725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006569	AGG	2	6	60611	60616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006569	CAA	2	6	63148	63153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_006569	AGA	2	6	63181	63186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006569	CGG	2	6	67468	67473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006569	CAA	2	6	68404	68409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_006569	ATG	2	6	73706	73711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006569	GGT	2	6	75852	75857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006569	ATA	2	6	75889	75894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006569	GCT	2	6	75928	75933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_006569	AAG	2	6	75968	75973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006569	CAT	2	6	76058	76063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_006569	TGA	2	6	79322	79327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006569	TAG	2	6	80494	80499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006569	TCC	2	6	80564	80569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_006569	TTC	2	6	80607	80612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_006569	GGC	2	6	80663	80668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_006569	CTG	3	9	81358	81366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_006569	TGG	2	6	81424	81429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006569	ACC	2	6	81575	81580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_006569	CTC	2	6	81597	81602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_006569	GCG	2	6	81622	81627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006569	CTT	2	6	81628	81633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_006569	CCA	2	6	81693	81698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_006569	GTC	2	6	81745	81750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_006569	GCG	3	9	81930	81938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006569	GTG	2	6	81976	81981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006569	CGC	2	6	82013	82018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_006569	ACC	2	6	82124	82129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_006569	TCC	2	6	82150	82155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_006569	AGG	2	6	82185	82190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006569	ATT	2	6	82221	82226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006569	TCG	3	9	82243	82251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_006569	AGC	2	6	82272	82277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_006569	TGG	2	6	82443	82448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006569	GTT	2	6	82496	82501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006569	GCA	2	6	82507	82512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_006569	CCG	2	6	82811	82816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_006569	CCG	2	6	82839	82844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_006569	ACT	2	6	82860	82865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_006569	TTG	2	6	82914	82919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006569	ATT	2	6	82927	82932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006569	TCT	2	6	84768	84773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_006569	GAA	2	6	84775	84780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006569	TCT	2	6	85149	85154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_006569	AAG	2	6	85216	85221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006569	CGC	2	6	85225	85230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_006569	TCG	2	6	85354	85359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_006569	GTC	2	6	85360	85365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_006569	TCC	2	6	85498	85503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_006569	ACG	2	6	87100	87105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_006569	AGT	2	6	87110	87115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006569	TGC	2	6	87181	87186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_006569	AGC	2	6	87349	87354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_006569	GCC	2	6	87452	87457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_006569	ACA	2	6	87494	87499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_006569	AGG	2	6	87573	87578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006569	GAT	2	6	90021	90026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006569	TAC	2	6	90061	90066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_006569	AGG	2	6	90091	90096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006569	GAT	2	6	90099	90104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006569	TCG	2	6	90122	90127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_006569	CTA	2	6	90147	90152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_006569	CCA	2	6	90247	90252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_006569	GGT	2	6	90457	90462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006569	TTG	2	6	90529	90534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006569	TCA	2	6	91281	91286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_006569	TCC	2	6	92009	92014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_006569	GCG	2	6	92466	92471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_006569	TGC	2	6	92493	92498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_006569	GGC	2	6	92551	92556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_006569	AAG	2	6	92661	92666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006569	TTC	2	6	92748	92753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_006569	CGA	2	6	92809	92814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_006569	CAG	2	6	92825	92830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_006569	TCG	2	6	92919	92924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_006569	GCG	2	6	92925	92930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_006569	GAG	2	6	92942	92947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006569	AGG	2	6	93012	93017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006569	CAG	2	6	93189	93194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_006569	TTC	2	6	96186	96191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_006569	GTG	2	6	96230	96235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006569	GCG	2	6	96357	96362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_006569	CCG	2	6	96378	96383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_006569	GCC	2	6	96559	96564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_006569	TTC	2	6	102278	102283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_006569	AGA	2	6	102289	102294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006569	AGG	2	6	102356	102361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006569	TGA	2	6	106755	106760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006569	CAG	2	6	106883	106888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_006569	TCC	2	6	107259	107264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_006569	GCA	2	6	107270	107275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_006569	TGC	2	6	107310	107315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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276	NC_006569	AGA	2	6	229946	229951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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