MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006569	TGA	2	6	272595	272600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_006569	TCC	2	6	274127	274132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_006569	GTA	2	6	276016	276021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_006569	CAG	2	6	278248	278253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_006569	TTG	2	6	278255	278260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_006569	TCC	2	6	278278	278283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_006569	CAC	2	6	278338	278343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_006569	TC	5	10	279480	279489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
509	NC_006569	TCT	2	6	280254	280259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_006569	GGC	2	6	280331	280336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_006569	GCC	2	6	280361	280366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_006569	TCC	2	6	281431	281436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_006569	GGTT	2	8	282470	282477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_006569	TCC	2	6	283992	283997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_006569	TTC	2	6	284063	284068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_006569	GC	4	8	285184	285191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_006569	CAT	2	6	285265	285270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_006569	CAG	3	9	285341	285349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_006569	GA	3	6	286959	286964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_006569	CT	3	6	287682	287687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_006569	TGT	2	6	287724	287729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_006569	CCT	2	6	290950	290955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_006569	GGCA	2	8	290964	290971	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
524	NC_006569	TGC	2	6	294087	294092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_006569	A	6	6	294216	294221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_006569	GGCG	2	8	294273	294280	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
527	NC_006569	AAC	2	6	294397	294402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_006569	GGA	2	6	295283	295288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_006569	TCCC	2	8	296605	296612	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
530	NC_006569	GGC	2	6	296623	296628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_006569	ACGG	2	8	296657	296664	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
532	NC_006569	GC	3	6	299745	299750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
533	NC_006569	TGCT	2	8	299820	299827	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
534	NC_006569	GC	3	6	299866	299871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
535	NC_006569	GT	3	6	299936	299941	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_006569	AG	3	6	299965	299970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_006569	TGA	2	6	300021	300026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_006569	CTG	2	6	300030	300035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_006569	CGC	2	6	300076	300081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_006569	GAG	2	6	300115	300120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_006569	CCCG	2	8	300140	300147	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
542	NC_006569	AGA	2	6	300171	300176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_006569	CGG	2	6	300195	300200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_006569	TGG	2	6	300259	300264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_006569	GGT	2	6	300300	300305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_006569	TGA	2	6	300342	300347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_006569	GGC	2	6	300439	300444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_006569	CG	4	8	300479	300486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_006569	ATG	2	6	300559	300564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_006569	ACC	2	6	300573	300578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_006569	GCC	2	6	301273	301278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_006569	GC	3	6	304041	304046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
553	NC_006569	ACC	2	6	304995	305000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_006569	CGG	2	6	305038	305043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_006569	CCG	2	6	307695	307700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_006569	GGTTC	2	10	308728	308737	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
557	NC_006569	CCA	2	6	308810	308815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_006569	CAT	2	6	308842	308847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_006569	ATAA	2	8	308867	308874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_006569	ATG	2	6	308891	308896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_006569	GCA	2	6	311371	311376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_006569	GCC	2	6	311414	311419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_006569	GCC	2	6	313064	313069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_006569	AAC	2	6	313111	313116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_006569	CCT	2	6	314055	314060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_006569	CG	3	6	317578	317583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_006569	CTG	2	6	318759	318764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_006569	TCAT	2	8	318816	318823	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
569	NC_006569	G	7	7	319770	319776	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
570	NC_006569	GC	4	8	320913	320920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
571	NC_006569	CTG	2	6	321908	321913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_006569	GGC	2	6	321932	321937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_006569	GC	4	8	321936	321943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
574	NC_006569	GGT	2	6	321968	321973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_006569	GCT	2	6	322052	322057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_006569	T	6	6	322083	322088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_006569	GCGA	2	8	322127	322134	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
578	NC_006569	CGG	2	6	324266	324271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_006569	AGA	2	6	324320	324325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_006569	GCC	2	6	324333	324338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_006569	GCT	2	6	324388	324393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_006569	GAAC	2	8	324399	324406	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
583	NC_006569	CTC	2	6	324409	324414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_006569	CTG	2	6	324453	324458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_006569	GTG	2	6	328519	328524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_006569	CAA	2	6	329910	329915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_006569	AGC	2	6	329978	329983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_006569	TCG	2	6	329990	329995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_006569	ATT	2	6	330749	330754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_006569	GAT	2	6	330805	330810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_006569	GACAA	2	10	330916	330925	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
592	NC_006569	TCA	2	6	330934	330939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_006569	TTC	2	6	330985	330990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_006569	TC	3	6	331029	331034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
595	NC_006569	CAC	2	6	331042	331047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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599	NC_006569	T	6	6	334925	334930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_006569	CTTT	2	8	334931	334938	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
601	NC_006569	AGGGGA	2	12	334943	334954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_006569	GCT	2	6	334971	334976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_006569	CAG	2	6	335057	335062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_006569	TCG	2	6	335069	335074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_006569	AG	3	6	335087	335092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_006569	GGA	2	6	335816	335821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_006569	AGGGG	2	10	338175	338184	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
608	NC_006569	GTG	2	6	338193	338198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_006569	GC	4	8	338297	338304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
610	NC_006569	GCA	2	6	338307	338312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_006569	TGC	2	6	338320	338325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_006569	CCA	2	6	338402	338407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_006569	GCA	2	6	338427	338432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_006569	TTG	2	6	338439	338444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_006569	AGA	2	6	338448	338453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_006569	AGAC	2	8	338539	338546	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
617	NC_006569	GCC	2	6	338564	338569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_006569	GAA	3	9	338579	338587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_006569	CGC	2	6	338590	338595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_006569	GCA	2	6	338610	338615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_006569	TGG	2	6	338782	338787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_006569	GT	3	6	338818	338823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
623	NC_006569	GCG	2	6	338835	338840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_006569	TCG	2	6	338911	338916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_006569	TCG	2	6	338952	338957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_006569	GAT	2	6	339020	339025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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628	NC_006569	ATG	2	6	339102	339107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_006569	CCGC	2	8	339343	339350	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
630	NC_006569	CGA	2	6	339353	339358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_006569	CAG	2	6	339435	339440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_006569	GT	3	6	339452	339457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_006569	CGC	2	6	339518	339523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_006569	TGA	2	6	339648	339653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_006569	CA	3	6	339668	339673	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_006569	GTC	2	6	339711	339716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_006569	A	6	6	339717	339722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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