MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 1063

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006142	TATT	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006142	CAAA	2	8	963	970	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_006142	ATTT	2	8	1303	1310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006142	TTTA	2	8	5979	5986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006142	TAAA	2	8	5998	6005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006142	TAAC	2	8	8478	8485	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_006142	TTTA	2	8	8725	8732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006142	TAAT	2	8	8830	8837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006142	GCTC	2	8	8992	8999	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_006142	TGAG	2	8	9029	9036	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006142	TCTG	2	8	14041	14048	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_006142	TTTA	2	8	14115	14122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006142	TCTT	2	8	14123	14130	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_006142	ATTA	2	8	14361	14368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006142	AAAG	2	8	14443	14450	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006142	TTAT	2	8	14617	14624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006142	AGTC	2	8	18113	18120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_006142	AAGA	2	8	18631	18638	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006142	AGTA	2	8	18727	18734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006142	ATAG	2	8	18753	18760	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006142	CTTA	2	8	19036	19043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_006142	TAAT	2	8	26687	26694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006142	TATT	2	8	26738	26745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006142	TTTA	2	8	26983	26990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006142	AGTT	2	8	29331	29338	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006142	TCAT	2	8	29549	29556	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_006142	TGAT	2	8	29599	29606	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006142	GTAA	2	8	35993	36000	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006142	TTAC	2	8	44435	44442	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_006142	TTAA	2	8	47537	47544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006142	TAAC	2	8	47837	47844	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_006142	AAAT	2	8	49768	49775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006142	AGAA	2	8	49840	49847	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006142	TAAA	2	8	50414	50421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006142	AATT	2	8	50827	50834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006142	GTAA	2	8	50856	50863	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006142	AATT	2	8	50999	51006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006142	TAAA	2	8	57406	57413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006142	ATGA	2	8	57531	57538	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006142	TAAT	2	8	57550	57557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006142	GCAT	2	8	61096	61103	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_006142	TAAA	2	8	61147	61154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006142	TACT	2	8	61426	61433	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_006142	TTAG	2	8	61528	61535	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006142	TCTA	2	8	61829	61836	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_006142	AAAT	2	8	61916	61923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006142	TTTA	2	8	62985	62992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006142	TTAT	2	8	65918	65925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006142	TTAC	2	8	66147	66154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_006142	CAAG	2	8	66226	66233	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_006142	ACAT	2	8	66346	66353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_006142	TTAA	2	8	66705	66712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006142	ATTA	2	8	66940	66947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006142	GTAA	2	8	67068	67075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006142	ACAA	2	8	67173	67180	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_006142	GCAT	2	8	67348	67355	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_006142	GTAA	2	8	67585	67592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006142	TACA	2	8	67604	67611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_006142	TGAT	2	8	67908	67915	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006142	AATA	2	8	67965	67972	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006142	ATAA	2	8	72605	72612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006142	ATTT	2	8	73626	73633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006142	ATAA	2	8	75950	75957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006142	ACAT	2	8	76819	76826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_006142	TAAA	2	8	76851	76858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006142	TTTA	2	8	82005	82012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006142	TTAC	2	8	82042	82049	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_006142	TAAG	2	8	82128	82135	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006142	TTAA	2	8	82196	82203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006142	TATT	2	8	83591	83598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006142	TTTA	2	8	83836	83843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006142	TAAA	2	8	84075	84082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006142	TATT	2	8	91242	91249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006142	ATTT	2	8	91516	91523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006142	TTTA	2	8	92132	92139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006142	AAGT	2	8	101232	101239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006142	TATT	2	8	102787	102794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006142	CAAA	2	8	102832	102839	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_006142	TAAA	2	8	102861	102868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006142	ATCT	2	8	103078	103085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_006142	GATT	2	8	103613	103620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006142	ATTA	2	8	103742	103749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006142	TAAT	2	8	103839	103846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006142	TAAT	2	8	104063	104070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006142	AATA	2	8	104112	104119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006142	TTAT	2	8	104464	104471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006142	TATT	2	8	104570	104577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006142	TCTT	2	8	105699	105706	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_006142	ATTA	2	8	109529	109536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006142	TTAT	2	8	109588	109595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006142	ATTA	2	8	111519	111526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006142	ATTT	2	8	112689	112696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006142	TATT	2	8	112721	112728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006142	ATAG	2	8	112746	112753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006142	ATAA	2	8	116325	116332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006142	AAAC	2	8	117563	117570	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_006142	TAAA	2	8	117744	117751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006142	TATT	2	8	119673	119680	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006142	AATA	2	8	120970	120977	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006142	TTAA	2	8	121105	121112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006142	ATTT	2	8	121363	121370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006142	ATAA	2	8	124113	124120	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006142	TTAA	2	8	124179	124186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006142	TATT	2	8	124885	124892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006142	TTAA	2	8	124913	124920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006142	ATTA	2	8	126038	126045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006142	GATT	2	8	126119	126126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006142	ATTT	2	8	126195	126202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006142	TTTA	2	8	126383	126390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006142	AAAT	2	8	129662	129669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006142	ATTT	2	8	129890	129897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006142	ATTT	2	8	130722	130729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006142	TACT	2	8	130895	130902	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_006142	GCAT	2	8	131236	131243	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_006142	CATT	2	8	132959	132966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_006142	TGCT	2	8	133172	133179	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_006142	AATA	2	8	133623	133630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006142	AAAT	2	8	133701	133708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006142	TACT	2	8	135598	135605	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_006142	TTAA	2	8	140120	140127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006142	AAAT	2	8	141412	141419	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006142	TTTG	2	8	141427	141434	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006142	AGTT	2	8	141454	141461	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006142	CTAT	2	8	141575	141582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_006142	CTTG	2	8	142293	142300	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_006142	ATCT	2	8	142304	142311	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_006142	ATAA	2	8	142752	142759	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006142	TAGA	2	8	142779	142786	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006142	TCAG	2	8	142997	143004	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_006142	TTTA	2	8	152796	152803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006142	TAAG	2	8	153702	153709	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006142	ATTA	2	8	158070	158077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006142	TATT	2	8	160956	160963	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006142	ATAA	2	8	161028	161035	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006142	TAAT	2	8	161061	161068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006142	TACA	2	8	165498	165505	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_006142	CAAA	2	8	165558	165565	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_006142	AAAT	2	8	165590	165597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006142	AGAA	2	8	170258	170265	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006142	ATGT	2	8	170376	170383	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006142	TCTA	2	8	170406	170413	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_006142	ATAA	2	8	170772	170779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006142	GAAA	2	8	173796	173803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006142	ATTG	2	8	175703	175710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006142	ATTT	2	8	179966	179973	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006142	TTAC	2	8	179981	179988	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_006142	TAAT	2	8	185181	185188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006142	AAAT	2	8	188645	188652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006142	TATT	2	8	188699	188706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006142	CTTT	2	8	189275	189282	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_006142	TAAT	2	8	189794	189801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_006142	AGCA	2	8	192609	192616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_006142	TGAT	2	8	193775	193782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_006142	AATT	2	8	195512	195519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_006142	ATTT	2	8	529885	529892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_006142	TAAC	2	8	549616	549623	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
500	NC_006142	TTAT	2	8	549631	549638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

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