MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 7980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006142	GGGT	2	8	249310	249317	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_006142	GATA	2	8	249331	249338	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_006142	TG	3	6	249349	249354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_006142	TCAATT	2	12	249355	249366	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1505	NC_006142	ATT	2	6	249370	249375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_006142	TAA	2	6	249380	249385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_006142	TTTAA	2	10	249438	249447	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_006142	TATCG	2	10	249463	249472	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1509	NC_006142	ATTG	2	8	249499	249506	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_006142	TTA	2	6	249517	249522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_006142	AAT	2	6	249533	249538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_006142	TAA	2	6	249585	249590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_006142	CAA	2	6	249619	249624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_006142	GA	3	6	249678	249683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_006142	ATT	2	6	249698	249703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_006142	GA	3	6	249950	249955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_006142	AAT	2	6	249969	249974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_006142	GAAA	2	8	250002	250009	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_006142	TAT	2	6	250012	250017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_006142	ATTC	2	8	250037	250044	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_006142	TA	3	6	250058	250063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_006142	ATA	2	6	252866	252871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_006142	ATA	2	6	252884	252889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_006142	TTA	2	6	252932	252937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_006142	TAA	2	6	252941	252946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_006142	TTATA	2	10	252954	252963	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_006142	TTA	2	6	252967	252972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_006142	GAT	2	6	252992	252997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_006142	TCA	2	6	253013	253018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_006142	TTAA	2	8	253024	253031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_006142	ATT	2	6	253080	253085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_006142	T	7	7	253098	253104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_006142	TGAAAT	2	12	253107	253118	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_006142	TAC	2	6	253140	253145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_006142	TAAAT	2	10	253225	253234	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_006142	ATT	2	6	253248	253253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_006142	T	6	6	253252	253257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_006142	ATTA	2	8	253290	253297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_006142	GTA	2	6	253337	253342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_006142	ATG	2	6	253368	253373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_006142	TTA	2	6	253377	253382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_006142	TTA	3	9	253411	253419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_006142	AT	3	6	253436	253441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_006142	GT	3	6	253489	253494	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_006142	AT	3	6	253510	253515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_006142	TTA	2	6	253518	253523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_006142	T	6	6	253530	253535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_006142	T	6	6	253580	253585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_006142	CCT	2	6	253602	253607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_006142	A	6	6	253624	253629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_006142	TA	3	6	253644	253649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_006142	ACT	2	6	253683	253688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_006142	ATTT	2	8	253691	253698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_006142	ATC	2	6	253701	253706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_006142	T	6	6	253718	253723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_006142	TAA	2	6	253746	253751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_006142	CTT	2	6	253752	253757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_006142	ATA	2	6	253825	253830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_006142	ATT	2	6	253881	253886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_006142	TTAT	2	8	253895	253902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_006142	TTA	2	6	253908	253913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_006142	TAT	2	6	253914	253919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_006142	AAAT	2	8	253947	253954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_006142	TAT	2	6	253974	253979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_006142	CTTT	2	8	253994	254001	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1566	NC_006142	TAT	2	6	255494	255499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_006142	GCTAAA	2	12	255504	255515	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1568	NC_006142	A	6	6	255513	255518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_006142	AAGTT	2	10	255520	255529	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_006142	T	6	6	255577	255582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_006142	GAT	2	6	255605	255610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_006142	T	7	7	255632	255638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_006142	AGC	2	6	255689	255694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_006142	TTG	2	6	255695	255700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_006142	AAC	2	6	255951	255956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_006142	ATAAAA	2	12	256002	256013	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_006142	ATT	2	6	256019	256024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_006142	TCA	2	6	256068	256073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_006142	CA	3	6	256072	256077	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1580	NC_006142	ATA	3	9	256144	256152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_006142	AAT	2	6	256173	256178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_006142	AATT	2	8	256184	256191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_006142	TAA	2	6	256235	256240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_006142	TGG	2	6	256248	256253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_006142	TAT	2	6	256371	256376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_006142	GGA	2	6	256434	256439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_006142	TAG	2	6	256463	256468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_006142	A	7	7	256502	256508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_006142	ACC	2	6	256623	256628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1590	NC_006142	CT	3	6	256644	256649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1591	NC_006142	GCAT	2	8	256750	256757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1592	NC_006142	TAT	2	6	256761	256766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_006142	TTAG	2	8	256873	256880	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_006142	ACT	2	6	256959	256964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_006142	TCAA	2	8	257124	257131	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1596	NC_006142	CAGA	2	8	257160	257167	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1597	NC_006142	AGA	2	6	257257	257262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_006142	AAC	2	6	257267	257272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_006142	AGC	2	6	257290	257295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_006142	CAT	2	6	257296	257301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_006142	AAAG	2	8	257304	257311	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_006142	CAA	2	6	257349	257354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_006142	GATT	2	8	257672	257679	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_006142	TAT	2	6	257713	257718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_006142	GA	3	6	257772	257777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_006142	GAA	2	6	257819	257824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_006142	TG	4	8	257833	257840	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_006142	TTA	2	6	257884	257889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_006142	GAC	2	6	257917	257922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_006142	AGG	2	6	257962	257967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_006142	CGG	2	6	257999	258004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_006142	ACC	2	6	258270	258275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_006142	TGG	2	6	258331	258336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_006142	GC	3	6	258378	258383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1615	NC_006142	GGT	2	6	258495	258500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_006142	TGA	2	6	258556	258561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_006142	CGA	2	6	258579	258584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_006142	TCA	2	6	258610	258615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_006142	CGT	2	6	258690	258695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_006142	TGG	2	6	258783	258788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_006142	CTG	2	6	258841	258846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_006142	ACCT	2	8	258865	258872	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_006142	TG	3	6	258944	258949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_006142	GATT	2	8	258973	258980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_006142	ATT	2	6	259048	259053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_006142	AATA	2	8	259075	259082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_006142	ATT	2	6	259139	259144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_006142	AAT	2	6	259155	259160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_006142	TAT	2	6	259179	259184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_006142	TGG	2	6	259217	259222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_006142	AC	3	6	259239	259244	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1632	NC_006142	ATCCC	2	10	259246	259255	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1633	NC_006142	TGCAA	2	10	259331	259340	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1634	NC_006142	AAT	2	6	259380	259385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_006142	AT	4	8	259404	259411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_006142	ACAGTA	2	12	259416	259427	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1637	NC_006142	TAA	2	6	259431	259436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_006142	CAA	2	6	259466	259471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1639	NC_006142	TAT	2	6	260600	260605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1757	NC_006142	TA	5	10	275181	275190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1762	NC_006142	ATA	2	6	275341	275346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1765	NC_006142	ATT	2	6	275482	275487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1766	NC_006142	TATAA	2	10	275611	275620	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1767	NC_006142	TA	3	6	275643	275648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1768	NC_006142	TTTA	2	8	275696	275703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1769	NC_006142	TAT	2	6	275708	275713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1771	NC_006142	T	7	7	275727	275733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1772	NC_006142	AAATG	2	10	275765	275774	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1773	NC_006142	T	6	6	275826	275831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_006142	AT	3	6	314752	314757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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