MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 7980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006142	TAT	2	6	92067	92072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_006142	TTA	2	6	92076	92081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_006142	TAA	2	6	92096	92101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_006142	TTA	2	6	92108	92113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_006142	TA	3	6	92112	92117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_006142	TTTA	2	8	92132	92139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_006142	TA	3	6	92138	92143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_006142	ATG	2	6	92145	92150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_006142	AT	3	6	92170	92175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_006142	TTC	2	6	92189	92194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_006142	ATA	2	6	92256	92261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_006142	AAT	2	6	92289	92294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_006142	ATT	2	6	93141	93146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_006142	TTA	2	6	95158	95163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_006142	AT	3	6	95194	95199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_006142	TTA	2	6	95200	95205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_006142	T	6	6	95222	95227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_006142	AT	3	6	95234	95239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_006142	TA	3	6	95308	95313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_006142	AAGT	2	8	101232	101239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
521	NC_006142	T	6	6	101246	101251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_006142	T	7	7	101257	101263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_006142	AAT	2	6	101264	101269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_006142	TATT	2	8	102787	102794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_006142	CAAA	2	8	102832	102839	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
526	NC_006142	T	6	6	102844	102849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_006142	TAAA	2	8	102861	102868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_006142	TA	3	6	102926	102931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_006142	TAA	2	6	102940	102945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_006142	T	6	6	102994	102999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_006142	ATCT	2	8	103078	103085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
532	NC_006142	CAG	2	6	103098	103103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_006142	TAA	2	6	103110	103115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_006142	ATT	2	6	103126	103131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_006142	ATA	2	6	103154	103159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_006142	CTT	2	6	103160	103165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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539	NC_006142	GAA	2	6	103277	103282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_006142	ATT	2	6	103293	103298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_006142	AAG	2	6	103327	103332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_006142	T	6	6	103345	103350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_006142	TTA	2	6	103383	103388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_006142	TAC	2	6	103398	103403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_006142	AAT	2	6	103427	103432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_006142	AT	3	6	103499	103504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_006142	GGA	2	6	103530	103535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_006142	ATA	2	6	103542	103547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_006142	AGA	2	6	103565	103570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_006142	ATT	2	6	103593	103598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_006142	TACAAG	2	12	103601	103612	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
552	NC_006142	GATT	2	8	103613	103620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
553	NC_006142	TAA	3	9	103675	103683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_006142	TAA	2	6	103703	103708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_006142	ATT	2	6	103710	103715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_006142	GAT	2	6	103728	103733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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558	NC_006142	ATA	2	6	103759	103764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_006142	TAT	2	6	103777	103782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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563	NC_006142	T	6	6	103851	103856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_006142	ATG	2	6	103878	103883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_006142	AT	3	6	103890	103895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_006142	A	6	6	103958	103963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_006142	TCA	2	6	104022	104027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_006142	TAAT	2	8	104063	104070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_006142	ATT	2	6	104104	104109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_006142	AATA	2	8	104112	104119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_006142	TAG	2	6	104164	104169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_006142	TTA	2	6	104197	104202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_006142	AAT	2	6	104314	104319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_006142	GTA	2	6	104349	104354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_006142	CT	3	6	104363	104368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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580	NC_006142	TATAA	2	10	104472	104481	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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585	NC_006142	TAT	3	9	104694	104702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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592	NC_006142	TCA	2	6	105333	105338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_006142	CTA	2	6	105346	105351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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595	NC_006142	TAT	3	9	105470	105478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_006142	TAG	2	6	105651	105656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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602	NC_006142	ATT	2	6	105722	105727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_006142	ATA	2	6	105756	105761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_006142	AT	4	8	108087	108094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_006142	AGT	2	6	108108	108113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_006142	AAT	2	6	108131	108136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_006142	A	7	7	108166	108172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_006142	ATT	3	9	109375	109383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_006142	TTA	3	9	109403	109411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_006142	ATTTT	2	10	109418	109427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_006142	AAT	2	6	109432	109437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_006142	AAC	2	6	109492	109497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_006142	A	6	6	109519	109524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_006142	ATTA	2	8	109529	109536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_006142	TTAT	2	8	109588	109595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_006142	T	6	6	111457	111462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_006142	ATTA	2	8	111519	111526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_006142	TA	3	6	111533	111538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_006142	TGA	2	6	111560	111565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_006142	TTC	2	6	111590	111595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_006142	T	7	7	111617	111623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_006142	T	7	7	111636	111642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_006142	ATT	2	6	111663	111668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_006142	AT	3	6	111671	111676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_006142	T	6	6	111753	111758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_006142	AAT	2	6	111823	111828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_006142	ATT	2	6	111851	111856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_006142	CT	3	6	112679	112684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_006142	ATTT	2	8	112689	112696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_006142	TATT	2	8	112721	112728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_006142	ATAG	2	8	112746	112753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
633	NC_006142	ATT	2	6	112777	112782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_006142	ATT	2	6	112791	112796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_006142	T	6	6	112803	112808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_006142	ATT	2	6	112825	112830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_006142	ATT	2	6	112847	112852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_006142	TAA	2	6	114836	114841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_006142	TTG	2	6	116248	116253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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