MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 7980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_006142	TAAT	2	8	650559	650566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_006142	TAA	2	6	650572	650577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_006142	A	6	6	650588	650593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_006142	TGT	2	6	650597	650602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_006142	GTT	2	6	650605	650610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_006142	CTT	2	6	650619	650624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_006142	ATA	2	6	650650	650655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_006142	ATA	2	6	650669	650674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_006142	GTA	2	6	650687	650692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_006142	GC	3	6	650695	650700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4511	NC_006142	ATA	2	6	650752	650757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_006142	CTA	2	6	650760	650765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_006142	ACA	2	6	650793	650798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_006142	AATT	2	8	650799	650806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_006142	ATT	2	6	650824	650829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_006142	ATAA	2	8	650838	650845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_006142	GAT	2	6	650873	650878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_006142	TTA	2	6	650882	650887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_006142	TTA	2	6	650909	650914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_006142	TTC	2	6	650942	650947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_006142	TTAAA	2	10	650977	650986	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_006142	AAT	4	12	651013	651024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_006142	AAATT	2	10	651030	651039	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_006142	ATG	2	6	651068	651073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_006142	TTC	2	6	651080	651085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_006142	ATT	2	6	651096	651101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_006142	CTT	2	6	651114	651119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_006142	TA	3	6	651157	651162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_006142	TAA	2	6	651186	651191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_006142	TAC	2	6	651243	651248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_006142	TAT	2	6	652433	652438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_006142	TAA	2	6	652444	652449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_006142	CA	3	6	652456	652461	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4534	NC_006142	ATT	2	6	652462	652467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_006142	AAC	2	6	652471	652476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_006142	A	6	6	652497	652502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_006142	ATT	2	6	652510	652515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_006142	A	6	6	652531	652536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_006142	TTA	2	6	653924	653929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_006142	ATT	2	6	653939	653944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_006142	TTAATA	2	12	653945	653956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_006142	GTAA	2	8	653997	654004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_006142	TA	3	6	654075	654080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_006142	TTA	2	6	654081	654086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_006142	TATG	2	8	654103	654110	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_006142	AAC	2	6	654123	654128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_006142	ATC	2	6	654152	654157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_006142	TAT	2	6	654169	654174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_006142	TGTATT	2	12	654175	654186	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_006142	AAAC	2	8	654195	654202	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4551	NC_006142	TTAT	2	8	655581	655588	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_006142	TTTATT	2	12	657367	657378	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_006142	TGT	2	6	658548	658553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_006142	ATT	2	6	658555	658560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_006142	AGT	2	6	658568	658573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_006142	TTGA	2	8	658574	658581	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_006142	AGCA	2	8	658583	658590	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4558	NC_006142	AAC	2	6	658599	658604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_006142	TAATAT	2	12	658614	658625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_006142	TTA	2	6	659950	659955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_006142	T	6	6	659956	659961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_006142	ATTAC	2	10	660038	660047	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4563	NC_006142	TTATT	2	10	660621	660630	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_006142	ATA	2	6	660646	660651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_006142	TAT	2	6	661187	661192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_006142	ATT	2	6	661216	661221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_006142	TAA	2	6	661246	661251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_006142	AGA	2	6	661273	661278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_006142	GATAT	2	10	661283	661292	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_006142	A	6	6	661297	661302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_006142	T	6	6	661303	661308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_006142	ATCTAA	2	12	661369	661380	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4573	NC_006142	T	6	6	661383	661388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_006142	A	6	6	661417	661422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_006142	TA	3	6	661429	661434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_006142	AAT	3	9	661436	661444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_006142	CTA	2	6	661461	661466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_006142	TA	3	6	661560	661565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_006142	AAT	3	9	661573	661581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_006142	TA	3	6	662432	662437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_006142	AAG	2	6	662452	662457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_006142	TAA	2	6	662516	662521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_006142	TA	3	6	662557	662562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_006142	TTA	2	6	664389	664394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_006142	T	6	6	665031	665036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_006142	TAA	3	9	665101	665109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_006142	T	6	6	666431	666436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_006142	TAT	2	6	666440	666445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_006142	A	8	8	666458	666465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_006142	GTT	2	6	666474	666479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_006142	AAT	2	6	666505	666510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_006142	TTGAT	2	10	666532	666541	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_006142	TAA	2	6	666567	666572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_006142	AT	3	6	666582	666587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_006142	TTTAA	2	10	666597	666606	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_006142	C	6	6	666655	666660	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4597	NC_006142	T	6	6	666701	666706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_006142	ATA	2	6	666716	666721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_006142	TAA	2	6	666765	666770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_006142	AATA	2	8	666784	666791	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_006142	ATTA	2	8	666805	666812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_006142	ATG	2	6	666835	666840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_006142	GTG	2	6	666893	666898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_006142	TA	3	6	666901	666906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_006142	AAT	2	6	666914	666919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_006142	AT	3	6	666927	666932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_006142	AT	4	8	666937	666944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_006142	AATT	2	8	666966	666973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_006142	ATT	2	6	666994	666999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_006142	ATT	2	6	667006	667011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_006142	TAT	2	6	667017	667022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_006142	TACT	2	8	667033	667040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4613	NC_006142	A	7	7	667156	667162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_006142	GAATA	2	10	667193	667202	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_006142	ATA	2	6	667263	667268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_006142	TGTA	2	8	667292	667299	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_006142	AT	3	6	667310	667315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_006142	ATG	2	6	667377	667382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_006142	AT	3	6	667385	667390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_006142	T	7	7	667422	667428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_006142	ACC	2	6	667438	667443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4622	NC_006142	ATAA	2	8	667457	667464	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_006142	A	7	7	667463	667469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_006142	ATC	2	6	667496	667501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_006142	T	7	7	667502	667508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_006142	ATT	2	6	667541	667546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_006142	TAG	2	6	667585	667590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_006142	CTT	2	6	667624	667629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_006142	ATTTT	2	10	667647	667656	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_006142	GATTTT	2	12	667660	667671	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_006142	TAT	2	6	667672	667677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_006142	TCT	2	6	667679	667684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4633	NC_006142	TTA	2	6	667688	667693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_006142	ATCTT	2	10	667776	667785	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4635	NC_006142	AT	3	6	667789	667794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4636	NC_006142	ACTA	2	8	667809	667816	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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