MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 15970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_005296	GTCT	2	8	1109403	1109410	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_005296	ACT	2	6	1109421	1109426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_005296	TGG	2	6	1109462	1109467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_005296	GAT	2	6	1110445	1110450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_005296	CGC	2	6	1110451	1110456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_005296	CAA	2	6	1110488	1110493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_005296	TCC	2	6	1113689	1113694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3008	NC_005296	TCG	2	6	1113699	1113704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_005296	CGG	2	6	1113715	1113720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_005296	ATGA	2	8	1113779	1113786	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_005296	CGC	2	6	1113791	1113796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_005296	GCG	2	6	1113801	1113806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_005296	CGG	2	6	1113869	1113874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_005296	CGG	2	6	1113909	1113914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_005296	GC	3	6	1114608	1114613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_005296	GCC	2	6	1114680	1114685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_005296	CG	3	6	1114689	1114694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3018	NC_005296	TCCA	2	8	1114702	1114709	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3019	NC_005296	AAG	2	6	1116957	1116962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_005296	GGC	2	6	1116994	1116999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_005296	CG	3	6	1117049	1117054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_005296	AT	3	6	1117386	1117391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_005296	AT	3	6	1117520	1117525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_005296	AT	3	6	1117558	1117563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_005296	AGG	2	6	1117569	1117574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_005296	GCG	2	6	1118173	1118178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_005296	CAT	2	6	1118186	1118191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_005296	GAC	2	6	1118194	1118199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_005296	CGGCA	2	10	1118216	1118225	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3030	NC_005296	GAC	2	6	1118252	1118257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_005296	GCG	2	6	1118795	1118800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_005296	AGC	2	6	1118852	1118857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_005296	ATCG	2	8	1118881	1118888	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3034	NC_005296	CG	4	8	1118887	1118894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3035	NC_005296	GC	3	6	1118898	1118903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_005296	TGC	2	6	1118970	1118975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_005296	GC	3	6	1118974	1118979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_005296	AGC	2	6	1118993	1118998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_005296	TCC	2	6	1119011	1119016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_005296	GGC	2	6	1119445	1119450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_005296	GAG	2	6	1119472	1119477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_005296	CGA	2	6	1119483	1119488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_005296	TTGCT	2	10	1119522	1119531	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3044	NC_005296	CT	3	6	1119553	1119558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3045	NC_005296	ATG	2	6	1119588	1119593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_005296	CG	3	6	1119606	1119611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3047	NC_005296	TCC	3	9	1119822	1119830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_005296	CGGCC	2	10	1119838	1119847	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3049	NC_005296	AT	3	6	1119867	1119872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_005296	TAA	2	6	1119875	1119880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_005296	TA	3	6	1119884	1119889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_005296	GCGA	2	8	1125203	1125210	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3053	NC_005296	CGG	2	6	1125275	1125280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_005296	GTCGCG	2	12	1125331	1125342	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_005296	GCG	2	6	1125350	1125355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_005296	TCGCA	2	10	1125356	1125365	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3057	NC_005296	CAA	2	6	1128596	1128601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_005296	GAAC	3	12	1128672	1128683	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3059	NC_005296	CGG	2	6	1128712	1128717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_005296	CAT	2	6	1128740	1128745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_005296	TGC	2	6	1128767	1128772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_005296	CGT	2	6	1128788	1128793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_005296	CGC	2	6	1128797	1128802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3064	NC_005296	TTC	2	6	1128861	1128866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_005296	AC	3	6	1128876	1128881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3066	NC_005296	CGG	2	6	1129859	1129864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_005296	CGA	2	6	1129972	1129977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_005296	CGCA	2	8	1130536	1130543	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3069	NC_005296	CAA	2	6	1130615	1130620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_005296	CGA	2	6	1130628	1130633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_005296	GGA	2	6	1130636	1130641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_005296	TCGA	2	8	1130661	1130668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3073	NC_005296	CGC	2	6	1130675	1130680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_005296	CGT	2	6	1132216	1132221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_005296	CCG	2	6	1132224	1132229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_005296	GCG	2	6	1132240	1132245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_005296	CG	3	6	1132265	1132270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3078	NC_005296	CGG	2	6	1132332	1132337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_005296	CG	3	6	1132341	1132346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3080	NC_005296	GC	3	6	1132355	1132360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_005296	CGG	2	6	1132363	1132368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_005296	AATT	2	8	1133408	1133415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_005296	TGGA	2	8	1133432	1133439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_005296	GCG	2	6	1133459	1133464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_005296	CGG	2	6	1134047	1134052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_005296	ATC	2	6	1134129	1134134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3088	NC_005296	CGC	2	6	1135473	1135478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3089	NC_005296	CTT	2	6	1138014	1138019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_005296	GCG	2	6	1138863	1138868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_005296	AACAG	2	10	1138890	1138899	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3092	NC_005296	AGCC	2	8	1138972	1138979	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3093	NC_005296	GTT	2	6	1138994	1138999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_005296	CTT	2	6	1139000	1139005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_005296	A	6	6	1139056	1139061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_005296	CG	3	6	1140736	1140741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_005296	GCG	3	9	1140763	1140771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_005296	CGC	2	6	1140783	1140788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_005296	TGC	2	6	1140799	1140804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_005296	CCGC	2	8	1140834	1140841	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3101	NC_005296	TGC	2	6	1140924	1140929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_005296	CGG	2	6	1140935	1140940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_005296	GGC	2	6	1142765	1142770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_005296	CGGC	2	8	1142772	1142779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3105	NC_005296	GCG	2	6	1142784	1142789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_005296	AACGCG	2	12	1142792	1142803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_005296	G	6	6	1142811	1142816	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_005296	TTCGG	2	10	1142823	1142832	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3109	NC_005296	GC	4	8	1143797	1143804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3110	NC_005296	TCGC	2	8	1143853	1143860	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_005296	TTTG	2	8	1143888	1143895	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_005296	GCG	2	6	1144953	1144958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_005296	GCT	2	6	1144961	1144966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_005296	GCCG	2	8	1145001	1145008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3115	NC_005296	CGAT	2	8	1145071	1145078	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3116	NC_005296	GAC	2	6	1145113	1145118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_005296	ACT	2	6	1146163	1146168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_005296	GC	3	6	1146196	1146201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_005296	GCC	2	6	1146216	1146221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3120	NC_005296	CAA	2	6	1146236	1146241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_005296	CAG	2	6	1146245	1146250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_005296	CGT	2	6	1146277	1146282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_005296	TACC	2	8	1146329	1146336	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_005296	GTG	2	6	1146339	1146344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_005296	CGG	2	6	1147288	1147293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_005296	CGAG	2	8	1147707	1147714	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3127	NC_005296	GCG	2	6	1147725	1147730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_005296	ACC	2	6	1147733	1147738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_005296	GCA	2	6	1147751	1147756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3131	NC_005296	CCG	2	6	1147882	1147887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3263	NC_005296	CAA	2	6	1190640	1190645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3383	NC_005296	TTCAT	2	10	1232730	1232739	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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