MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 15970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_005296	CAG	2	6	954702	954707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_005296	GCAA	2	8	954733	954740	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2503	NC_005296	CGG	2	6	954765	954770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_005296	CTG	2	6	954844	954849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_005296	CGC	2	6	954932	954937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2506	NC_005296	CAGT	2	8	955007	955014	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2507	NC_005296	TGG	2	6	955037	955042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_005296	CCG	2	6	957638	957643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2509	NC_005296	CGG	2	6	957644	957649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_005296	CGG	2	6	957662	957667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_005296	GGC	2	6	959841	959846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_005296	CCG	2	6	961034	961039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2513	NC_005296	CCA	2	6	961040	961045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2514	NC_005296	CGA	2	6	961055	961060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_005296	TCACC	2	10	961061	961070	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2516	NC_005296	GTC	2	6	961109	961114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_005296	CACCC	2	10	961234	961243	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2518	NC_005296	GAG	2	6	961281	961286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_005296	TGA	2	6	962799	962804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_005296	GC	3	6	963312	963317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2521	NC_005296	GTC	2	6	963368	963373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_005296	CG	4	8	963403	963410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2523	NC_005296	GC	3	6	963442	963447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2524	NC_005296	ATC	2	6	963472	963477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_005296	TCG	2	6	963482	963487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_005296	AGTG	2	8	963547	963554	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_005296	GCC	2	6	963568	963573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2528	NC_005296	AGC	2	6	963999	964004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_005296	GGC	3	9	964049	964057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_005296	CGC	2	6	964836	964841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2531	NC_005296	CG	4	8	964931	964938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2532	NC_005296	GGA	2	6	964941	964946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_005296	GGAG	2	8	964950	964957	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_005296	CG	3	6	966175	966180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2535	NC_005296	CGA	2	6	966190	966195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_005296	TGC	2	6	966217	966222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_005296	TTGG	2	8	966229	966236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_005296	CCCG	2	8	966244	966251	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2539	NC_005296	A	6	6	966318	966323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_005296	CGT	2	6	966332	966337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_005296	GTCA	2	8	966392	966399	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2542	NC_005296	AG	3	6	966408	966413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_005296	GA	4	8	966439	966446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_005296	GGC	2	6	966497	966502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_005296	TACC	2	8	966523	966530	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2546	NC_005296	AC	3	6	966536	966541	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2547	NC_005296	T	8	8	966606	966613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_005296	TCG	2	6	966639	966644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_005296	ATCA	2	8	966658	966665	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2550	NC_005296	GCG	2	6	966674	966679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_005296	TTC	2	6	966700	966705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_005296	ACG	2	6	966710	966715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_005296	CGG	2	6	966729	966734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_005296	CGGCG	2	10	966740	966749	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2555	NC_005296	CG	3	6	966754	966759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2556	NC_005296	GGCG	2	8	967047	967054	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2557	NC_005296	GCAAGC	2	12	967080	967091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_005296	GAT	2	6	967093	967098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_005296	CAG	2	6	967111	967116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_005296	TCC	2	6	967129	967134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2561	NC_005296	CAG	2	6	967148	967153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_005296	A	6	6	967174	967179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_005296	GGAT	2	8	967228	967235	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_005296	CAG	2	6	971298	971303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_005296	CGG	2	6	971345	971350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_005296	GAT	2	6	971361	971366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_005296	ACG	2	6	971405	971410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2569	NC_005296	AGC	2	6	971463	971468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2571	NC_005296	GCG	2	6	972576	972581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_005296	CG	3	6	972631	972636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2573	NC_005296	GAG	2	6	972653	972658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2578	NC_005296	CCAC	2	8	975243	975250	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2579	NC_005296	CAG	2	6	975272	975277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2582	NC_005296	GTT	2	6	976572	976577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_005296	GAG	2	6	976595	976600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_005296	TTG	2	6	976640	976645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2588	NC_005296	TCG	2	6	980414	980419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2593	NC_005296	GGGGA	2	10	981388	981397	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_005296	TGCT	2	8	981419	981426	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2595	NC_005296	CGA	2	6	982493	982498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2597	NC_005296	GTC	2	6	982885	982890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_005296	TG	3	6	985501	985506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_005296	ATC	2	6	986601	986606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2601	NC_005296	GGCCC	2	10	986662	986671	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2602	NC_005296	GGCG	2	8	986675	986682	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2603	NC_005296	TCA	2	6	986685	986690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_005296	AGG	2	6	986704	986709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_005296	CGC	2	6	987198	987203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2606	NC_005296	CTTT	2	8	987215	987222	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2607	NC_005296	CGC	2	6	987223	987228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2608	NC_005296	CGGG	2	8	988264	988271	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2609	NC_005296	GC	3	6	988296	988301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2610	NC_005296	TG	3	6	988303	988308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_005296	GGT	2	6	988362	988367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_005296	CG	4	8	988411	988418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2613	NC_005296	ACAGCA	2	12	993377	993388	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_005296	GAC	2	6	993437	993442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_005296	GC	3	6	994929	994934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2616	NC_005296	AGCG	2	8	994947	994954	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2617	NC_005296	ATCG	2	8	995004	995011	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2618	NC_005296	CG	3	6	995010	995015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2619	NC_005296	GC	3	6	995021	995026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2620	NC_005296	GCC	2	6	995102	995107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2621	NC_005296	GCCT	2	8	995118	995125	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2622	NC_005296	CCCGG	2	10	995152	995161	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2623	NC_005296	CTA	2	6	995204	995209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2625	NC_005296	CGAG	2	8	995256	995263	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2626	NC_005296	GCAACG	2	12	996758	996769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2628	NC_005296	TCGC	2	8	996932	996939	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2629	NC_005296	ACG	2	6	996957	996962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2634	NC_005296	GTTT	2	8	997816	997823	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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