MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 15970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_005296	GCG	2	6	544981	544986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_005296	CTGCG	2	10	546042	546051	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1503	NC_005296	ATG	2	6	546110	546115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_005296	CTG	2	6	546127	546132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_005296	CGG	2	6	546139	546144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_005296	CGC	2	6	546474	546479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_005296	TTGA	2	8	546494	546501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_005296	CGG	2	6	546507	546512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_005296	CGTG	2	8	546540	546547	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1510	NC_005296	TTCG	2	8	546637	546644	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_005296	TCG	2	6	546699	546704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_005296	GCA	2	6	546732	546737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_005296	GCC	3	9	546741	546749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_005296	CGG	2	6	550059	550064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_005296	TCC	2	6	554554	554559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_005296	TGG	2	6	554594	554599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_005296	AG	3	6	554629	554634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_005296	CGC	2	6	554653	554658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_005296	GAG	2	6	554813	554818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_005296	TCAA	2	8	555450	555457	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_005296	ACG	2	6	555463	555468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_005296	GCC	2	6	555498	555503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_005296	GGAC	2	8	556157	556164	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_005296	AGC	2	6	556207	556212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_005296	CGG	2	6	557964	557969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_005296	TAC	2	6	559765	559770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_005296	CG	3	6	559828	559833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_005296	CGC	2	6	559835	559840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_005296	CTGCCG	2	12	559848	559859	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_005296	CCG	2	6	561748	561753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_005296	GCCG	2	8	561772	561779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_005296	GGC	2	6	561849	561854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_005296	TCC	2	6	561872	561877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_005296	GCCCC	2	10	562861	562870	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1535	NC_005296	GGC	2	6	562879	562884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_005296	CGC	2	6	562949	562954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_005296	CCGCC	2	10	562994	563003	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1538	NC_005296	CCG	2	6	563121	563126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_005296	CG	3	6	563157	563162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_005296	GGC	2	6	564667	564672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_005296	GC	3	6	564671	564676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_005296	TCT	2	6	564677	564682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_005296	GAGC	2	8	564728	564735	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1544	NC_005296	CAC	2	6	564757	564762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_005296	GC	3	6	564775	564780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_005296	CAGA	2	8	564810	564817	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_005296	TGT	2	6	567726	567731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_005296	GC	4	8	567818	567825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_005296	CGA	2	6	567880	567885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_005296	CCCGA	2	10	567889	567898	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1551	NC_005296	GGC	2	6	567905	567910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_005296	CGCC	2	8	567943	567950	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1553	NC_005296	TCA	2	6	567962	567967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_005296	CCG	2	6	568017	568022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_005296	CGG	2	6	571850	571855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_005296	CTG	2	6	571908	571913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_005296	ATCC	2	8	573230	573237	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_005296	GC	3	6	573260	573265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_005296	CG	4	8	573268	573275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_005296	CGC	2	6	573305	573310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_005296	GGC	2	6	573318	573323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_005296	CCT	2	6	576593	576598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_005296	ATAAG	2	10	576608	576617	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_005296	TTA	2	6	576623	576628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_005296	GATC	2	8	576654	576661	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1566	NC_005296	CCGGT	2	10	576745	576754	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1567	NC_005296	GTG	2	6	576769	576774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_005296	GAG	2	6	577297	577302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_005296	GC	3	6	577307	577312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_005296	CG	3	6	577389	577394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_005296	GATC	2	8	579709	579716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_005296	TC	3	6	579778	579783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_005296	CGA	2	6	579857	579862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_005296	CCGT	2	8	581654	581661	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_005296	GGC	2	6	581691	581696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_005296	TGG	2	6	581698	581703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_005296	CCG	2	6	583468	583473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_005296	GCG	2	6	583922	583927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_005296	TCA	2	6	585584	585589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_005296	CGG	2	6	585610	585615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_005296	GGCCA	2	10	585625	585634	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1582	NC_005296	GC	3	6	586382	586387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_005296	GC	3	6	586448	586453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_005296	CTCG	2	8	586708	586715	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_005296	CGC	2	6	586769	586774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_005296	CG	3	6	586813	586818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1587	NC_005296	CGTCCG	2	12	586887	586898	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1588	NC_005296	TAT	2	6	588066	588071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_005296	GA	3	6	589899	589904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_005296	GTC	2	6	589956	589961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_005296	CAG	2	6	590004	590009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_005296	GCG	2	6	590719	590724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_005296	CGC	2	6	590727	590732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_005296	GTG	2	6	590736	590741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_005296	CGC	2	6	590763	590768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_005296	CGC	3	9	590795	590803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_005296	CCG	2	6	590849	590854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1598	NC_005296	GT	3	6	592078	592083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_005296	CGA	2	6	592086	592091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_005296	CGAG	2	8	592180	592187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1601	NC_005296	A	6	6	592226	592231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_005296	GAG	2	6	592242	592247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_005296	GT	3	6	593014	593019	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_005296	GGCG	2	8	593044	593051	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1605	NC_005296	CA	3	6	594475	594480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_005296	CGC	2	6	594487	594492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_005296	CG	3	6	594506	594511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_005296	AAC	2	6	597112	597117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_005296	CCCA	2	8	597135	597142	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1610	NC_005296	GAT	2	6	597209	597214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_005296	GAG	2	6	598322	598327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_005296	CGA	2	6	598333	598338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_005296	GCTTC	2	10	598371	598380	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1614	NC_005296	AGG	2	6	600063	600068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_005296	ATG	2	6	600087	600092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_005296	TCAA	2	8	600154	600161	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1617	NC_005296	CG	3	6	600203	600208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_005296	GCAGG	2	10	600236	600245	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1619	NC_005296	CGA	2	6	600264	600269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_005296	ACA	2	6	600457	600462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_005296	AGC	2	6	600507	600512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_005296	CTG	2	6	600549	600554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_005296	GCTT	2	8	600606	600613	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1624	NC_005296	AG	3	6	600630	600635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_005296	CGA	2	6	600651	600656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_005296	CGG	2	6	600664	600669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_005296	CCG	2	6	600674	600679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_005296	TCA	2	6	600684	600689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_005296	CAA	2	6	602185	602190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_005296	TGGA	2	8	602193	602200	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_005296	GAG	2	6	602224	602229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_005296	GAC	2	6	602282	602287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_005296	GCG	2	6	602310	602315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_005296	TCA	2	6	602330	602335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_005296	CAA	2	6	602396	602401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_005296	AGGTCG	2	12	602457	602468	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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