MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 15970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005296	TGC	2	6	360479	360484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_005296	CGGC	2	8	360493	360500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_005296	GAT	2	6	360507	360512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_005296	GC	4	8	360518	360525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_005296	GCCGC	2	10	360537	360546	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1006	NC_005296	GC	3	6	360548	360553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_005296	CGC	3	9	360605	360613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_005296	GACCC	2	10	360624	360633	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1009	NC_005296	C	7	7	360631	360637	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1010	NC_005296	CCG	2	6	360654	360659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_005296	CGC	2	6	360727	360732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_005296	AAG	2	6	360736	360741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_005296	CGA	2	6	362672	362677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_005296	TCA	2	6	362713	362718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_005296	GCCG	2	8	362768	362775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_005296	CGG	2	6	362776	362781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_005296	CAG	2	6	362849	362854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_005296	GTC	2	6	364006	364011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_005296	TTG	2	6	364042	364047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_005296	CGC	3	9	364705	364713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_005296	ATC	2	6	364753	364758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_005296	CGG	2	6	364777	364782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_005296	GCC	2	6	366463	366468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_005296	CGG	2	6	366495	366500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_005296	CAA	2	6	366517	366522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_005296	GGGC	2	8	367384	367391	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_005296	GCCC	2	8	367398	367405	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1028	NC_005296	G	6	6	368969	368974	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_005296	CTC	2	6	368985	368990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_005296	GAG	2	6	371332	371337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_005296	CGA	2	6	371343	371348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_005296	GCCG	2	8	374108	374115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_005296	GTC	2	6	374223	374228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_005296	AAC	2	6	374243	374248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_005296	CGC	2	6	374292	374297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_005296	GGC	2	6	374381	374386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_005296	AACT	2	8	374418	374425	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_005296	AGG	2	6	374512	374517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_005296	CTG	2	6	374554	374559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_005296	TCG	2	6	374564	374569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_005296	AGG	2	6	374582	374587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_005296	GTC	2	6	374589	374594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_005296	CGC	2	6	374602	374607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_005296	GCG	2	6	374615	374620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_005296	GGC	2	6	375406	375411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_005296	GC	4	8	375485	375492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_005296	TCG	2	6	377345	377350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_005296	TTG	2	6	377369	377374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_005296	GCCG	2	8	377389	377396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_005296	CCGA	2	8	377397	377404	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_005296	ACC	2	6	377405	377410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_005296	CAT	2	6	377424	377429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_005296	ACC	2	6	377467	377472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_005296	C	6	6	377471	377476	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1055	NC_005296	CGGCG	2	10	377503	377512	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1056	NC_005296	CG	3	6	377555	377560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_005296	GAC	2	6	377622	377627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_005296	TCG	2	6	378645	378650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_005296	GCC	2	6	378662	378667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_005296	CCG	2	6	383016	383021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_005296	CGG	2	6	383044	383049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_005296	GCC	2	6	384646	384651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_005296	CTC	2	6	385391	385396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_005296	CG	3	6	385416	385421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_005296	AAGGC	2	10	385482	385491	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1066	NC_005296	GAG	2	6	385495	385500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_005296	GCG	2	6	385503	385508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_005296	TG	3	6	385527	385532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_005296	GC	3	6	387874	387879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_005296	CGG	2	6	387925	387930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_005296	GCC	2	6	387934	387939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_005296	CTT	2	6	388650	388655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_005296	CG	3	6	388772	388777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_005296	GGCC	2	8	388787	388794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_005296	AT	3	6	388798	388803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_005296	GAACT	2	10	388851	388860	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1077	NC_005296	CGG	2	6	389636	389641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_005296	GCCG	2	8	389655	389662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_005296	TA	3	6	389717	389722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_005296	GGC	2	6	389753	389758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_005296	CG	3	6	389762	389767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_005296	GAG	2	6	389787	389792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_005296	GC	3	6	391416	391421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_005296	CGAT	2	8	391425	391432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_005296	GGC	2	6	391445	391450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_005296	GCC	2	6	391458	391463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_005296	GT	3	6	391477	391482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_005296	ACG	2	6	391496	391501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_005296	TGC	2	6	392501	392506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_005296	TGA	2	6	392641	392646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_005296	CG	3	6	393525	393530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_005296	GC	3	6	393531	393536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_005296	TCC	2	6	394669	394674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_005296	AGG	2	6	394686	394691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_005296	ACT	2	6	394722	394727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_005296	CGG	2	6	394737	394742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_005296	TAA	2	6	395586	395591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_005296	GGC	2	6	396541	396546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_005296	TCA	2	6	397047	397052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_005296	GC	3	6	397128	397133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_005296	CG	3	6	397134	397139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_005296	CAAA	2	8	397146	397153	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_005296	CCG	2	6	397158	397163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_005296	GCG	2	6	397196	397201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_005296	GCGG	2	8	398141	398148	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_005296	ATACG	2	10	398227	398236	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1107	NC_005296	CGT	2	6	398269	398274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_005296	CGC	2	6	398280	398285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_005296	AAC	2	6	398286	398291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_005296	TGC	2	6	398321	398326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_005296	GGT	2	6	399578	399583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_005296	CCG	2	6	399595	399600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_005296	GTC	2	6	399612	399617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_005296	CGG	2	6	399629	399634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_005296	GCC	2	6	399682	399687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_005296	CGTT	2	8	399722	399729	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_005296	TCCG	2	8	399734	399741	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_005296	CGT	2	6	399790	399795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_005296	GGAT	2	8	399849	399856	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_005296	GCC	2	6	399895	399900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_005296	GCG	3	9	399910	399918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_005296	TGCCA	2	10	400040	400049	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1123	NC_005296	TAG	2	6	402721	402726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_005296	AGG	2	6	402787	402792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_005296	ACC	2	6	402925	402930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_005296	TATAT	2	10	402982	402991	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_005296	CGG	2	6	403004	403009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_005296	CAC	2	6	405553	405558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_005296	CAT	2	6	405573	405578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_005296	AAC	2	6	405736	405741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_005296	TCT	2	6	407017	407022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_005296	TGC	2	6	407029	407034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_005296	GCA	2	6	407035	407040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1135	NC_005296	GAG	2	6	408012	408017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1408	NC_005296	CGG	2	6	509615	509620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1409	NC_005296	CGCC	2	8	509660	509667	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1410	NC_005296	CGT	2	6	509699	509704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_005296	TCC	2	6	510675	510680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1431	NC_005296	CGC	2	6	524437	524442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1434	NC_005296	GCC	2	6	524475	524480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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