MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 15970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_005296	GCGCG	2	10	2191214	2191223	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6002	NC_005296	GCCG	2	8	2191276	2191283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_005296	CCG	2	6	2191331	2191336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_005296	CT	3	6	2194531	2194536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6005	NC_005296	GAGC	2	8	2194563	2194570	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6006	NC_005296	CCA	2	6	2194580	2194585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_005296	ATCC	2	8	2194594	2194601	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6008	NC_005296	GC	3	6	2194616	2194621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_005296	ACC	2	6	2194645	2194650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_005296	GCTTCT	2	12	2194652	2194663	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_005296	GCC	2	6	2194676	2194681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_005296	CG	3	6	2194694	2194699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6013	NC_005296	CGG	2	6	2197883	2197888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_005296	GAG	2	6	2197907	2197912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_005296	GC	4	8	2197916	2197923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6016	NC_005296	CTT	2	6	2197927	2197932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_005296	GAC	2	6	2198000	2198005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_005296	TTG	2	6	2198856	2198861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_005296	TCC	2	6	2199986	2199991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6020	NC_005296	CGA	2	6	2199998	2200003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_005296	GC	3	6	2200033	2200038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6022	NC_005296	AAC	2	6	2201640	2201645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_005296	GC	3	6	2201650	2201655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6024	NC_005296	GCAC	2	8	2201693	2201700	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6025	NC_005296	CAC	2	6	2201717	2201722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_005296	GGA	2	6	2202745	2202750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_005296	GC	3	6	2202810	2202815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6028	NC_005296	CG	3	6	2202836	2202841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6029	NC_005296	GTCA	2	8	2203521	2203528	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6030	NC_005296	ATA	2	6	2203529	2203534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_005296	CTCG	2	8	2209058	2209065	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6032	NC_005296	CGAG	2	8	2210314	2210321	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6033	NC_005296	GAA	2	6	2212901	2212906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_005296	GCC	3	9	2212916	2212924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6035	NC_005296	GCC	2	6	2212934	2212939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_005296	AG	3	6	2212943	2212948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_005296	CG	3	6	2212950	2212955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6038	NC_005296	GGC	2	6	2212957	2212962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_005296	CGG	2	6	2212997	2213002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_005296	CGGA	2	8	2213013	2213020	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6041	NC_005296	CGT	2	6	2213076	2213081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_005296	CG	3	6	2213094	2213099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6043	NC_005296	GAAC	2	8	2213158	2213165	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6044	NC_005296	TCCG	2	8	2213821	2213828	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_005296	TCC	2	6	2213832	2213837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6046	NC_005296	AAT	2	6	2213882	2213887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_005296	TAT	2	6	2213905	2213910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_005296	GCCG	2	8	2213913	2213920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_005296	AAG	2	6	2213948	2213953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_005296	GCT	2	6	2218235	2218240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_005296	GAA	2	6	2218262	2218267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_005296	CCG	2	6	2218325	2218330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6053	NC_005296	AGCGG	2	10	2219900	2219909	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6054	NC_005296	CG	4	8	2221802	2221809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_005296	AGC	2	6	2221846	2221851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_005296	TGAGG	2	10	2222864	2222873	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_005296	GC	3	6	2222889	2222894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_005296	GAG	2	6	2222898	2222903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_005296	CGA	2	6	2222917	2222922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_005296	GCC	2	6	2222957	2222962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_005296	TTGCA	2	10	2222977	2222986	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6062	NC_005296	CG	4	8	2223009	2223016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6063	NC_005296	GCTGA	2	10	2223019	2223028	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6064	NC_005296	CGG	2	6	2224261	2224266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_005296	GTG	2	6	2224298	2224303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_005296	CCA	2	6	2224403	2224408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_005296	T	7	7	2224427	2224433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_005296	GC	3	6	2224440	2224445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_005296	CAA	2	6	2224468	2224473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_005296	GAG	2	6	2225612	2225617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_005296	T	6	6	2225625	2225630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_005296	GGCG	2	8	2225651	2225658	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6073	NC_005296	GCGA	2	8	2225678	2225685	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6074	NC_005296	TCG	2	6	2225726	2225731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_005296	CTC	2	6	2225737	2225742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6076	NC_005296	C	6	6	2227617	2227622	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6077	NC_005296	TCC	2	6	2228251	2228256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6078	NC_005296	GCG	2	6	2229450	2229455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_005296	CGC	2	6	2229470	2229475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6080	NC_005296	GCG	2	6	2229516	2229521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_005296	CG	3	6	2230046	2230051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6082	NC_005296	CAA	2	6	2230091	2230096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_005296	AGTT	2	8	2230104	2230111	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_005296	CGC	2	6	2230919	2230924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6085	NC_005296	CGC	2	6	2230932	2230937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6086	NC_005296	CGCGC	2	10	2230948	2230957	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6087	NC_005296	AG	3	6	2232238	2232243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_005296	GCG	2	6	2233641	2233646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_005296	CAA	2	6	2233687	2233692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_005296	CGCC	2	8	2233771	2233778	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6091	NC_005296	GGC	2	6	2233796	2233801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_005296	TTC	2	6	2233806	2233811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_005296	GAC	2	6	2235315	2235320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_005296	GC	3	6	2237507	2237512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6095	NC_005296	CG	3	6	2237538	2237543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6096	NC_005296	GTTT	2	8	2237548	2237555	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_005296	CAG	2	6	2237631	2237636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_005296	CTC	2	6	2238082	2238087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_005296	GAG	2	6	2238124	2238129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_005296	TGGT	2	8	2238264	2238271	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_005296	TCG	2	6	2239323	2239328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_005296	CGAC	2	8	2239371	2239378	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6103	NC_005296	ATA	2	6	2239432	2239437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_005296	ACAT	2	8	2239520	2239527	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6105	NC_005296	TGGCG	2	10	2239543	2239552	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6106	NC_005296	GAT	2	6	2239570	2239575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_005296	TCG	2	6	2239616	2239621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_005296	ATCT	2	8	2239723	2239730	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6109	NC_005296	GCA	2	6	2239738	2239743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_005296	GGA	2	6	2239767	2239772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_005296	TCA	2	6	2239779	2239784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_005296	GCC	2	6	2239814	2239819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6113	NC_005296	CGT	2	6	2239857	2239862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_005296	CCG	2	6	2240215	2240220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6115	NC_005296	CG	3	6	2240240	2240245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6116	NC_005296	ACCA	2	8	2240286	2240293	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6117	NC_005296	GCC	3	9	2240310	2240318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6118	NC_005296	GCC	2	6	2240339	2240344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6119	NC_005296	GGA	2	6	2240356	2240361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_005296	GCG	2	6	2243235	2243240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_005296	GGC	2	6	2243248	2243253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_005296	GC	3	6	2243255	2243260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_005296	GC	4	8	2243270	2243277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6124	NC_005296	GC	3	6	2243343	2243348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6125	NC_005296	AGCAA	2	10	2243373	2243382	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6126	NC_005296	TTG	2	6	2243438	2243443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_005296	GC	4	8	2243464	2243471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6128	NC_005296	CCT	2	6	2244161	2244166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_005296	AT	4	8	2244186	2244193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_005296	AAGG	2	8	2244212	2244219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_005296	TGG	2	6	2244247	2244252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_005296	GCTT	2	8	2244259	2244266	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6133	NC_005296	GGGT	2	8	2244314	2244321	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_005296	GGA	2	6	2244325	2244330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6139	NC_005296	CTT	2	6	2246143	2246148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6248	NC_005296	CGGG	2	8	2291103	2291110	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6249	NC_005296	GCC	2	6	2291115	2291120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6254	NC_005296	CG	3	6	2293227	2293232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6256	NC_005296	CG	3	6	2294523	2294528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6257	NC_005296	CG	3	6	2294536	2294541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6258	NC_005296	ATC	2	6	2295511	2295516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6264	NC_005296	GCC	3	9	2297867	2297875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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