MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 1121

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005027	GGAC	2	8	7465	7472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_005027	GCTC	2	8	11090	11097	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_005027	CGAT	2	8	13944	13951	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_005027	TGCT	2	8	14002	14009	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_005027	CCGC	2	8	15321	15328	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_005027	TAAT	2	8	19989	19996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005027	AGCG	2	8	22384	22391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_005027	CAGC	2	8	22455	22462	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_005027	ACTC	2	8	25559	25566	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_005027	GCCT	2	8	34223	34230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_005027	TGTC	2	8	36390	36397	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_005027	GCGA	2	8	39449	39456	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_005027	GGAT	2	8	39463	39470	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005027	TCGC	2	8	39596	39603	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_005027	ACGA	2	8	40657	40664	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_005027	ACTC	2	8	41220	41227	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_005027	GACA	2	8	58296	58303	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_005027	AACC	2	8	85526	85533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_005027	CCCA	2	8	86674	86681	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_005027	CACC	2	8	86743	86750	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_005027	TCAA	2	8	92574	92581	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_005027	ATTC	2	8	93091	93098	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_005027	CGTT	2	8	95351	95358	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_005027	TCAA	2	8	100999	101006	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_005027	ATCG	2	8	102781	102788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_005027	CACC	2	8	109092	109099	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_005027	GACT	2	8	134440	134447	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_005027	CGCT	2	8	150371	150378	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_005027	CCCT	2	8	153208	153215	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_005027	TGTT	2	8	159187	159194	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005027	TCTT	2	8	159250	159257	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_005027	GAAC	2	8	170745	170752	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_005027	GGAA	2	8	171525	171532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005027	GTGA	2	8	180865	180872	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005027	ATTC	2	8	196122	196129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_005027	CCTC	2	8	226234	226241	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_005027	GCCT	2	8	233740	233747	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_005027	TTCA	2	8	233784	233791	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_005027	CTAC	2	8	234867	234874	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_005027	CGAA	2	8	283051	283058	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_005027	GCTG	2	8	284388	284395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_005027	GCGG	2	8	286125	286132	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_005027	AAGT	2	8	296465	296472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005027	TGCT	2	8	308499	308506	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_005027	GCAA	2	8	309898	309905	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_005027	GTTA	2	8	310973	310980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005027	AAAG	2	8	311018	311025	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005027	ATGT	2	8	347850	347857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005027	CCAA	2	8	351549	351556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_005027	ACGC	2	8	357980	357987	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_005027	ATCA	2	8	365011	365018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_005027	TTCT	2	8	366525	366532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_005027	GTTG	2	8	373978	373985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005027	CTAG	2	8	377622	377629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_005027	CTCA	2	8	407582	407589	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_005027	CCAA	2	8	409065	409072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_005027	GCAA	2	8	417441	417448	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_005027	CAAA	2	8	417462	417469	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_005027	ACTT	2	8	420991	420998	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_005027	AGAC	2	8	422808	422815	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_005027	ATGA	2	8	425743	425750	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005027	CTTC	2	8	425812	425819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_005027	CCGG	2	8	426048	426055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_005027	CTTC	2	8	426391	426398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_005027	TAAC	2	8	442020	442027	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_005027	GGAA	2	8	442089	442096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005027	GGGT	2	8	444656	444663	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005027	TGGC	2	8	444674	444681	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_005027	TTCG	2	8	452157	452164	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_005027	AACC	2	8	452193	452200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_005027	ATCG	2	8	461088	461095	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_005027	TATT	2	8	461099	461106	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005027	CGAA	2	8	470264	470271	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_005027	CGAA	2	8	476399	476406	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_005027	TGCC	2	8	485715	485722	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_005027	GTTT	2	8	500059	500066	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005027	AGCG	3	12	505774	505785	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_005027	TCGC	2	8	508008	508015	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_005027	TTGG	2	8	509445	509452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005027	TCGT	2	8	511818	511825	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_005027	TGAA	2	8	511834	511841	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005027	AGCC	2	8	523443	523450	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_005027	GACT	2	8	543404	543411	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_005027	CATG	2	8	548207	548214	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_005027	TTCC	2	8	553915	553922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_005027	AGGG	2	8	557993	558000	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005027	ATCG	2	8	558046	558053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_005027	ATCC	2	8	564713	564720	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_005027	GTTC	2	8	564791	564798	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_005027	AACG	2	8	572384	572391	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_005027	CGAC	2	8	572928	572935	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_005027	CGGA	2	8	573977	573984	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_005027	GATT	2	8	574979	574986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005027	CGTG	2	8	578243	578250	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_005027	CGAG	2	8	593205	593212	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_005027	CCCT	2	8	603705	603712	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_005027	CAAC	2	8	603818	603825	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_005027	TTCG	2	8	605635	605642	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_005027	TCAG	2	8	612776	612783	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_005027	CTTG	2	8	615213	615220	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_005027	GCAA	2	8	615360	615367	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_005027	TCTG	2	8	641060	641067	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_005027	TGCC	2	8	641068	641075	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_005027	CCTG	2	8	642649	642656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_005027	TCGA	2	8	642681	642688	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_005027	TTGC	2	8	643755	643762	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_005027	ACGG	2	8	650833	650840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_005027	GATT	2	8	650871	650878	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005027	CATT	2	8	654333	654340	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_005027	CCCA	2	8	654354	654361	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_005027	TTTC	2	8	664781	664788	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_005027	GGTC	2	8	670385	670392	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_005027	CGAT	2	8	670395	670402	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_005027	TCAA	2	8	670455	670462	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_005027	AGCA	2	8	675839	675846	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_005027	CAAA	2	8	686368	686375	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_005027	GGGA	2	8	686412	686419	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005027	GATC	2	8	695395	695402	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_005027	TGGC	2	8	711723	711730	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_005027	CGAG	2	8	712031	712038	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_005027	GGCC	2	8	713137	713144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_005027	TCGC	2	8	720382	720389	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_005027	TATG	2	8	722813	722820	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005027	CGTT	2	8	723267	723274	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_005027	GTCA	2	8	726625	726632	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_005027	TCAT	2	8	739750	739757	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_005027	GTCG	2	8	766717	766724	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_005027	AGTG	2	8	783932	783939	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005027	AGCG	2	8	790099	790106	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_005027	TTGA	2	8	790356	790363	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005027	TCGG	2	8	795661	795668	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_005027	GCTC	2	8	797635	797642	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_005027	GGCT	2	8	814308	814315	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_005027	AGTC	2	8	817204	817211	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_005027	AGGG	2	8	817303	817310	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005027	CCTG	2	8	821867	821874	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_005027	TCGT	2	8	823651	823658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_005027	GATG	2	8	823744	823751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005027	CGTT	2	8	834054	834061	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_005027	CAGA	2	8	834153	834160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_005027	TCGA	2	8	836428	836435	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_005027	CGAA	2	8	839609	839616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_005027	TGAA	2	8	846488	846495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005027	TCGA	2	8	853071	853078	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_005027	AGCG	2	8	887570	887577	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_005027	CCAT	2	8	891674	891681	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_005027	CCAT	2	8	891710	891717	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_005027	TGTC	2	8	893650	893657	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_005027	AGGT	2	8	905338	905345	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_005027	GGAT	2	8	905348	905355	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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