MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 6251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005027	TCCGC	2	10	1124373	1124382	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1002	NC_005027	TCGG	2	8	1124389	1124396	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_005027	TTTC	2	8	1124422	1124429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_005027	TCG	3	9	1124497	1124505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_005027	CTT	2	6	1124582	1124587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_005027	CAG	2	6	1124618	1124623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_005027	GAT	2	6	1124652	1124657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_005027	GATC	2	8	1124663	1124670	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_005027	AGC	2	6	1131618	1131623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_005027	CGAC	2	8	1138349	1138356	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_005027	ACC	2	6	1138851	1138856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_005027	AGA	2	6	1138861	1138866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_005027	TCAG	2	8	1138915	1138922	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_005027	CGG	2	6	1138935	1138940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_005027	A	7	7	1144175	1144181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_005027	GGT	2	6	1144191	1144196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_005027	CAAC	2	8	1144602	1144609	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_005027	TCA	2	6	1144612	1144617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_005027	TCCA	2	8	1144647	1144654	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_005027	TGC	2	6	1144722	1144727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_005027	TCAA	2	8	1144775	1144782	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_005027	GGGGA	2	10	1146217	1146226	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_005027	CAG	2	6	1146241	1146246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_005027	TCGA	2	8	1146257	1146264	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_005027	CTG	2	6	1146409	1146414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_005027	TCA	3	9	1146417	1146425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_005027	ACA	2	6	1148005	1148010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_005027	CCG	2	6	1148051	1148056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_005027	GAG	2	6	1149695	1149700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_005027	GGA	2	6	1149776	1149781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_005027	AACC	2	8	1149823	1149830	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_005027	GAT	2	6	1149914	1149919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_005027	CGCAAT	2	12	1151246	1151257	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_005027	ACA	2	6	1151295	1151300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_005027	GCTCG	2	10	1151307	1151316	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1036	NC_005027	AAG	2	6	1151323	1151328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_005027	TGT	2	6	1151454	1151459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_005027	TCGG	2	8	1151471	1151478	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_005027	ACT	2	6	1151509	1151514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_005027	TGC	2	6	1151518	1151523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_005027	GTG	2	6	1152469	1152474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_005027	TAC	2	6	1152519	1152524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_005027	CGA	2	6	1152683	1152688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_005027	GCC	2	6	1154155	1154160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_005027	CGG	2	6	1154586	1154591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_005027	CGG	2	6	1154612	1154617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_005027	TCG	2	6	1154660	1154665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_005027	AG	3	6	1154746	1154751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_005027	TTCC	2	8	1154753	1154760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_005027	TCG	2	6	1155303	1155308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_005027	A	6	6	1156008	1156013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_005027	TG	3	6	1156076	1156081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_005027	AGC	2	6	1161437	1161442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_005027	GGC	2	6	1162300	1162305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_005027	GGT	2	6	1163783	1163788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_005027	CAC	2	6	1163789	1163794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_005027	GATT	2	8	1167641	1167648	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_005027	GAT	2	6	1167658	1167663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_005027	CCA	2	6	1173040	1173045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_005027	CGAA	2	8	1175130	1175137	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_005027	GCA	2	6	1175148	1175153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_005027	AG	3	6	1175237	1175242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_005027	GATT	2	8	1176888	1176895	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_005027	GAT	2	6	1178547	1178552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_005027	GCG	2	6	1178580	1178585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_005027	C	6	6	1178599	1178604	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1067	NC_005027	TGA	2	6	1178623	1178628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_005027	CCCT	2	8	1178644	1178651	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1069	NC_005027	A	8	8	1179271	1179278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_005027	TTTG	2	8	1179313	1179320	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_005027	GTT	2	6	1179371	1179376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_005027	CGA	2	6	1179403	1179408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_005027	CGT	2	6	1179465	1179470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_005027	AAC	2	6	1181258	1181263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_005027	C	6	6	1181305	1181310	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1076	NC_005027	AGGG	2	8	1181453	1181460	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_005027	CGAGCA	4	24	1182378	1182401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_005027	CCG	2	6	1182427	1182432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_005027	TGA	2	6	1184089	1184094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_005027	GTT	2	6	1186098	1186103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_005027	CGC	2	6	1187023	1187028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_005027	CCG	2	6	1187123	1187128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_005027	AAC	2	6	1189006	1189011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_005027	ATGCAA	2	12	1189013	1189024	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1085	NC_005027	GCA	2	6	1191431	1191436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_005027	GCC	2	6	1192494	1192499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_005027	CGC	2	6	1198525	1198530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_005027	ACC	2	6	1198576	1198581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_005027	CCG	2	6	1198708	1198713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_005027	TGC	2	6	1198720	1198725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_005027	C	6	6	1198799	1198804	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1092	NC_005027	GCG	2	6	1201108	1201113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_005027	GCG	2	6	1201541	1201546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_005027	TC	3	6	1201547	1201552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_005027	AG	3	6	1201578	1201583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_005027	CGA	2	6	1206749	1206754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_005027	TGC	2	6	1206758	1206763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_005027	A	7	7	1208997	1209003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_005027	CTC	2	6	1209035	1209040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_005027	GTG	2	6	1209096	1209101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_005027	AC	3	6	1209194	1209199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_005027	CAT	2	6	1209976	1209981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_005027	ATCG	2	8	1209988	1209995	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_005027	CCAA	2	8	1210029	1210036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_005027	ACC	2	6	1211135	1211140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_005027	CCAT	2	8	1211578	1211585	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_005027	TCC	2	6	1212883	1212888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_005027	GAA	2	6	1212956	1212961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_005027	AGA	2	6	1212983	1212988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_005027	CGAA	2	8	1213944	1213951	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_005027	ATCG	2	8	1213984	1213991	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_005027	AC	3	6	1214607	1214612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_005027	CTTT	2	8	1214663	1214670	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_005027	ACTG	2	8	1215097	1215104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_005027	GCC	2	6	1215117	1215122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_005027	TGCGA	2	10	1215125	1215134	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1117	NC_005027	CTT	2	6	1215619	1215624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_005027	GCG	2	6	1215625	1215630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_005027	GAC	2	6	1215631	1215636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_005027	GAAG	2	8	1215669	1215676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_005027	CAA	2	6	1215686	1215691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_005027	GTA	2	6	1216028	1216033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_005027	GTG	2	6	1216059	1216064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_005027	CGG	2	6	1216654	1216659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_005027	CAC	2	6	1216660	1216665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_005027	CT	3	6	1216694	1216699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_005027	TCG	2	6	1216776	1216781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_005027	TG	3	6	1217680	1217685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_005027	GGT	2	6	1218163	1218168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_005027	GAG	2	6	1218173	1218178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_005027	AAT	2	6	1218211	1218216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_005027	CGC	2	6	1221739	1221744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_005027	GCG	2	6	1222929	1222934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_005027	GAC	2	6	1223380	1223385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_005027	GGT	2	6	1223730	1223735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_005027	TTCG	2	8	1223792	1223799	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1242	NC_005027	GAAT	2	8	1348321	1348328	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1251	NC_005027	C	6	6	1360609	1360614	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1252	NC_005027	AACG	2	8	1363425	1363432	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1253	NC_005027	CGCC	2	8	1364500	1364507	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1254	NC_005027	TC	3	6	1364511	1364516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1255	NC_005027	TCAA	2	8	1369206	1369213	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1256	NC_005027	ACA	2	6	1371473	1371478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1257	NC_005027	CCG	2	6	1371519	1371524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1258	NC_005027	GTCG	2	8	1371593	1371600	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1259	NC_005027	TGGTT	2	10	1373149	1373158	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1393	NC_005027	GCG	2	6	1530248	1530253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1394	NC_005027	CTG	2	6	1530321	1530326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1396	NC_005027	TCG	2	6	1537663	1537668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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