MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 6251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005027	TGG	3	9	508048	508056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_005027	A	7	7	509412	509418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_005027	TTGG	2	8	509445	509452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_005027	GTG	2	6	511744	511749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_005027	TGT	2	6	511794	511799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_005027	TCGT	2	8	511818	511825	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
507	NC_005027	TGAA	2	8	511834	511841	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
508	NC_005027	GCA	2	6	512370	512375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_005027	GTT	2	6	512440	512445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_005027	CGG	2	6	517391	517396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_005027	CGA	2	6	517491	517496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_005027	ATC	2	6	518807	518812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_005027	GTT	2	6	518822	518827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_005027	GAG	2	6	523341	523346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_005027	TCG	2	6	523373	523378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_005027	GAA	2	6	523435	523440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_005027	AGCC	2	8	523443	523450	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
518	NC_005027	GT	3	6	523452	523457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
519	NC_005027	AGG	2	6	527253	527258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_005027	GCGGG	2	10	536712	536721	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
521	NC_005027	GTGGG	2	10	536727	536736	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
522	NC_005027	CGC	2	6	536740	536745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_005027	GGC	2	6	536772	536777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_005027	GGT	2	6	536840	536845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_005027	TGG	2	6	536890	536895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_005027	TCC	2	6	536896	536901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_005027	GTG	2	6	536926	536931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_005027	ACC	2	6	536945	536950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_005027	GTT	2	6	539038	539043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_005027	T	6	6	541397	541402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_005027	ATC	2	6	541407	541412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_005027	CGA	2	6	541447	541452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_005027	AC	3	6	543395	543400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_005027	GACT	2	8	543404	543411	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
535	NC_005027	CATG	2	8	548207	548214	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
536	NC_005027	TCC	2	6	548226	548231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_005027	TG	3	6	548270	548275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_005027	TTCC	2	8	553915	553922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_005027	GGT	2	6	553944	553949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_005027	AG	3	6	554003	554008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_005027	AAG	2	6	555471	555476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_005027	AGGG	2	8	557993	558000	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
543	NC_005027	CAA	2	6	558005	558010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_005027	GCC	2	6	558033	558038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_005027	ATCG	2	8	558046	558053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
546	NC_005027	GCCGTT	2	12	558058	558069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_005027	AAT	2	6	564689	564694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_005027	ATCC	2	8	564713	564720	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_005027	TCT	2	6	564736	564741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_005027	GTTC	2	8	564791	564798	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
551	NC_005027	CGA	2	6	564812	564817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_005027	GTT	2	6	564853	564858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_005027	CTC	2	6	567449	567454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_005027	AACG	2	8	572384	572391	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
555	NC_005027	AGG	2	6	572396	572401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_005027	GCG	2	6	572414	572419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_005027	CGAC	2	8	572928	572935	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
558	NC_005027	GTT	2	6	572954	572959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_005027	CCG	2	6	572984	572989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_005027	AGG	2	6	573838	573843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_005027	GCCTG	2	10	573953	573962	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
562	NC_005027	CGGA	2	8	573977	573984	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
563	NC_005027	C	6	6	574149	574154	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
564	NC_005027	AGA	2	6	574201	574206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_005027	CCT	2	6	574280	574285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_005027	CTT	2	6	574292	574297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_005027	T	7	7	574328	574334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_005027	CCGGA	2	10	574355	574364	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
569	NC_005027	CGC	2	6	574398	574403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_005027	GAA	2	6	574470	574475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_005027	TC	3	6	574938	574943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
572	NC_005027	GATT	2	8	574979	574986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
573	NC_005027	CCG	2	6	575022	575027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_005027	CGTG	2	8	578243	578250	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
575	NC_005027	GT	3	6	578251	578256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_005027	AGA	2	6	580445	580450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_005027	GCA	2	6	580571	580576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_005027	AAC	2	6	583636	583641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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580	NC_005027	CGAG	2	8	593205	593212	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
581	NC_005027	AAG	2	6	593214	593219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_005027	TTA	2	6	593240	593245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_005027	GCG	2	6	593261	593266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_005027	CTC	2	6	595376	595381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_005027	TCC	2	6	602135	602140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_005027	GAA	2	6	602167	602172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_005027	A	6	6	602174	602179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_005027	CA	3	6	602190	602195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
589	NC_005027	CGG	2	6	602995	603000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_005027	CCCT	2	8	603705	603712	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
591	NC_005027	CAAC	2	8	603818	603825	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
592	NC_005027	ACC	2	6	604683	604688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_005027	CAC	2	6	604982	604987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_005027	CAT	2	6	605035	605040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_005027	CCA	2	6	605558	605563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_005027	GCG	2	6	605602	605607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_005027	TTCG	2	8	605635	605642	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
598	NC_005027	CCG	2	6	609504	609509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_005027	GCG	2	6	609546	609551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_005027	GC	3	6	610934	610939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
601	NC_005027	CG	3	6	611412	611417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
602	NC_005027	CGG	2	6	612072	612077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_005027	CAA	2	6	612759	612764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_005027	TCAG	2	8	612776	612783	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
605	NC_005027	CGT	2	6	613418	613423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_005027	CGA	2	6	615080	615085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_005027	CTTG	2	8	615213	615220	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
608	NC_005027	GCAA	2	8	615360	615367	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
609	NC_005027	GAT	2	6	616498	616503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_005027	CAA	3	9	618919	618927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_005027	TTC	2	6	622651	622656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_005027	TC	3	6	622667	622672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
613	NC_005027	CGATCC	2	12	622813	622824	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
614	NC_005027	ACC	2	6	624338	624343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_005027	CT	3	6	627333	627338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_005027	GCG	2	6	629647	629652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_005027	GTC	2	6	629664	629669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_005027	GTC	2	6	629722	629727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_005027	CGA	2	6	631505	631510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_005027	TC	3	6	635352	635357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_005027	AAC	2	6	635375	635380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_005027	AC	3	6	635382	635387	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_005027	GAT	2	6	635394	635399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_005027	CAT	2	6	638396	638401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_005027	CAG	2	6	640438	640443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_005027	CGG	2	6	640462	640467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_005027	CCG	2	6	640471	640476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_005027	TTC	2	6	640484	640489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_005027	CGG	2	6	640519	640524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_005027	TCCGG	2	10	640557	640566	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
631	NC_005027	CGG	2	6	640585	640590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_005027	CCG	2	6	640594	640599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_005027	CGG	2	6	641054	641059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_005027	TCTG	2	8	641060	641067	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
635	NC_005027	TGCC	2	8	641068	641075	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
636	NC_005027	TCCGG	2	10	641092	641101	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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638	NC_005027	TCGA	2	8	642681	642688	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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