MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 1675

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004041	CAA	2	6	126683	126688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_004041	CAT	2	6	126689	126694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_004041	GGA	2	6	126703	126708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_004041	CG	3	6	128024	128029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
505	NC_004041	GCGG	2	8	128063	128070	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
506	NC_004041	GTT	2	6	128097	128102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_004041	ATG	2	6	128143	128148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_004041	TTG	2	6	128162	128167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_004041	AGA	2	6	128168	128173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_004041	TTG	2	6	128188	128193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_004041	GAT	2	6	128199	128204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_004041	GCC	2	6	128212	128217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_004041	TCGGC	2	10	128240	128249	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
514	NC_004041	GAA	2	6	128271	128276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_004041	CTCA	2	8	128287	128294	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
516	NC_004041	CGC	2	6	128401	128406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_004041	CGA	2	6	128475	128480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_004041	TGG	2	6	128485	128490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_004041	GGC	2	6	128517	128522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_004041	ACG	2	6	128566	128571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_004041	CGC	2	6	128652	128657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_004041	GTTG	2	8	128675	128682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_004041	GCA	2	6	128853	128858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_004041	CCA	2	6	128915	128920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_004041	GAC	2	6	128926	128931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_004041	CGA	2	6	128993	128998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_004041	GTC	2	6	129043	129048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_004041	ACG	2	6	129062	129067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_004041	CGTC	2	8	129075	129082	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
530	NC_004041	TCG	2	6	129083	129088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_004041	CTG	2	6	129094	129099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_004041	ATGAG	2	10	129166	129175	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
533	NC_004041	ACC	2	6	129261	129266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_004041	TCCTTC	2	12	129475	129486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
535	NC_004041	GCC	2	6	129645	129650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_004041	AGA	2	6	130454	130459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_004041	CTG	2	6	130509	130514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_004041	TCGA	2	8	130531	130538	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_004041	GGA	2	6	130550	130555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_004041	ACC	2	6	131082	131087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_004041	ATCAC	2	10	131089	131098	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
542	NC_004041	GGC	2	6	131115	131120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_004041	CAT	2	6	131577	131582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_004041	GAG	2	6	131596	131601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_004041	GGC	2	6	132802	132807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_004041	CGG	2	6	132817	132822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_004041	GAG	2	6	132842	132847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_004041	TAC	2	6	135740	135745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_004041	AGG	2	6	135810	135815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_004041	CCCA	2	8	135887	135894	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
551	NC_004041	GA	3	6	135897	135902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_004041	AGA	2	6	135920	135925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_004041	GTGA	2	8	136037	136044	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_004041	AGG	3	9	136611	136619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_004041	GCC	2	6	137910	137915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_004041	GCC	2	6	137946	137951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_004041	CAT	2	6	137997	138002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_004041	AGC	2	6	138047	138052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_004041	GCTCC	2	10	138108	138117	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
560	NC_004041	TCGG	2	8	138934	138941	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
561	NC_004041	GCA	2	6	140542	140547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_004041	A	6	6	141281	141286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_004041	CTT	2	6	141290	141295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_004041	GTCTT	2	10	141347	141356	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
565	NC_004041	TCC	2	6	142490	142495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_004041	CG	3	6	142514	142519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_004041	AAT	2	6	142547	142552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_004041	TAG	2	6	142712	142717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_004041	GCCA	2	8	142835	142842	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
570	NC_004041	AAAAC	2	10	143557	143566	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
571	NC_004041	A	6	6	143574	143579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_004041	TATT	2	8	143596	143603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_004041	CCG	2	6	143637	143642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_004041	GAG	2	6	143647	143652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_004041	AAGGC	2	10	143671	143680	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
576	NC_004041	GCC	2	6	143700	143705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_004041	GGA	3	9	143716	143724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_004041	GC	4	8	149875	149882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
579	NC_004041	GC	3	6	149888	149893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
580	NC_004041	CTG	2	6	151202	151207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_004041	GCA	2	6	151269	151274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_004041	AT	3	6	151298	151303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_004041	TGAT	2	8	151309	151316	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
584	NC_004041	GAAG	2	8	151445	151452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_004041	TGA	2	6	151453	151458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_004041	CCGA	2	8	152450	152457	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
587	NC_004041	GCA	2	6	152497	152502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_004041	GAT	2	6	152553	152558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_004041	CGA	2	6	152569	152574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_004041	CA	3	6	152648	152653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
591	NC_004041	GTC	2	6	152714	152719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_004041	GCG	2	6	155003	155008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_004041	TGA	2	6	155037	155042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_004041	GC	3	6	157983	157988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
595	NC_004041	GCG	2	6	158005	158010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_004041	ACT	2	6	158045	158050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_004041	ACT	2	6	158084	158089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_004041	CGA	2	6	158145	158150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_004041	CTA	2	6	158210	158215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_004041	CAT	2	6	158338	158343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_004041	CTGA	2	8	158445	158452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
602	NC_004041	CT	3	6	158494	158499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_004041	GGC	2	6	158506	158511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_004041	CAC	2	6	158550	158555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_004041	A	7	7	158620	158626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_004041	GCA	2	6	158720	158725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_004041	CTT	2	6	158745	158750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_004041	CGA	2	6	158807	158812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_004041	GC	3	6	158844	158849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
610	NC_004041	CGG	2	6	158870	158875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_004041	CGA	2	6	158888	158893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_004041	CGA	2	6	158929	158934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_004041	GTG	2	6	159053	159058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_004041	TGC	2	6	159060	159065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_004041	CGC	2	6	159104	159109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_004041	TCC	2	6	159127	159132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_004041	TGCGGG	2	12	159148	159159	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
618	NC_004041	CCG	2	6	159185	159190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_004041	CAA	2	6	160127	160132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_004041	GGA	2	6	160133	160138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_004041	GGC	2	6	160139	160144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_004041	GCC	2	6	160149	160154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_004041	CGC	2	6	160174	160179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_004041	CGT	2	6	160282	160287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_004041	CGGG	2	8	160628	160635	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
626	NC_004041	TTGA	2	8	160775	160782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
627	NC_004041	TGA	2	6	160816	160821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_004041	GAT	2	6	160851	160856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_004041	CTT	2	6	166272	166277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_004041	GGC	2	6	166301	166306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_004041	TGCTC	2	10	166361	166370	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
632	NC_004041	ATC	2	6	166377	166382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_004041	CCA	2	6	167435	167440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_004041	T	7	7	167463	167469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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636	NC_004041	GCC	2	6	172741	172746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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774	NC_004041	TC	3	6	202785	202790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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782	NC_004041	CGGC	2	8	203685	203692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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906	NC_004041	CCG	2	6	231466	231471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
907	NC_004041	GCG	2	6	231507	231512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
908	NC_004041	CTGCC	2	10	231546	231555	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
909	NC_004041	GAA	2	6	231641	231646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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911	NC_004041	ACC	2	6	232446	232451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
912	NC_004041	GC	3	6	232475	232480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
913	NC_004041	GGC	2	6	232496	232501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
914	NC_004041	GACG	2	8	232516	232523	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
915	NC_004041	GCC	2	6	232577	232582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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918	NC_004041	CAG	2	6	232644	232649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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920	NC_004041	CGAT	2	8	232779	232786	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
921	NC_004041	GGC	2	6	232790	232795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
922	NC_004041	TCG	2	6	232835	232840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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930	NC_004041	AAAT	2	8	233297	233304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
931	NC_004041	CAG	2	6	233883	233888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
932	NC_004041	GGA	2	6	235475	235480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
933	NC_004041	GTT	2	6	235531	235536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
934	NC_004041	GA	3	6	236252	236257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
935	NC_004041	ATC	2	6	238563	238568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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937	NC_004041	TC	3	6	238577	238582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
938	NC_004041	CGACA	2	10	239137	239146	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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941	NC_004041	GA	3	6	242597	242602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
942	NC_004041	TA	3	6	243007	243012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
943	NC_004041	GCAA	2	8	243016	243023	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
944	NC_004041	GCCC	2	8	243072	243079	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
945	NC_004041	CTG	2	6	243116	243121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
946	NC_004041	TGG	2	6	244860	244865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
947	NC_004041	ATGGC	2	10	244975	244984	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
948	NC_004041	AGG	2	6	246800	246805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
949	NC_004041	AAAG	2	8	247185	247192	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
950	NC_004041	TGA	2	6	247224	247229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
951	NC_004041	GGC	2	6	247237	247242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
952	NC_004041	TGC	2	6	247348	247353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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954	NC_004041	CGA	2	6	248474	248479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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956	NC_004041	AAT	2	6	248746	248751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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958	NC_004041	GCT	2	6	249958	249963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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962	NC_004041	CGC	2	6	250101	250106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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972	NC_004041	CGC	2	6	250510	250515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
973	NC_004041	GC	4	8	250514	250521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
974	NC_004041	GTCG	2	8	250532	250539	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
975	NC_004041	GC	3	6	250560	250565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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989	NC_004041	CCAA	2	8	253414	253421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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996	NC_004041	CT	3	6	254554	254559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
997	NC_004041	CAT	2	6	254571	254576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
998	NC_004041	GCC	2	6	254614	254619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
999	NC_004041	CA	3	6	254633	254638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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