MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 7882

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_000963	TAA	2	6	534775	534780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_000963	AGG	2	6	534828	534833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_000963	T	6	6	536038	536043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_000963	TAC	2	6	536058	536063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_000963	AAC	2	6	536152	536157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_000963	ATA	3	9	536223	536231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_000963	AAT	2	6	536237	536242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_000963	CAA	2	6	536243	536248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_000963	TAA	2	6	536267	536272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_000963	ATT	2	6	536307	536312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_000963	TAAT	3	12	536314	536325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_000963	TAT	2	6	536398	536403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_000963	AAT	2	6	536423	536428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_000963	TAT	2	6	536442	536447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_000963	AGTT	2	8	536452	536459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_000963	TAA	2	6	536481	536486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_000963	TAT	2	6	536498	536503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_000963	TA	3	6	536563	536568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_000963	TTG	2	6	536569	536574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_000963	TAA	2	6	536579	536584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_000963	AT	4	8	536596	536603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_000963	TAAT	2	8	536623	536630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_000963	T	8	8	536642	536649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_000963	TCA	2	6	536686	536691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3526	NC_000963	TATAT	2	10	536726	536735	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3530	NC_000963	TAATT	2	10	536875	536884	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_000963	ATT	2	6	536890	536895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_000963	ATT	2	6	536928	536933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3541	NC_000963	TGT	2	6	537111	537116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_000963	T	6	6	537135	537140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_000963	AAT	2	6	537163	537168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3545	NC_000963	AAT	2	6	537218	537223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_000963	A	6	6	537262	537267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3549	NC_000963	T	6	6	538123	538128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_000963	AT	3	6	538130	538135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_000963	TAA	3	9	538147	538155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_000963	AATAA	2	10	538164	538173	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_000963	AAAT	2	8	538176	538183	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_000963	TAT	2	6	539880	539885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3556	NC_000963	ATT	2	6	539893	539898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3561	NC_000963	T	6	6	541112	541117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_000963	TTTA	2	8	541152	541159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_000963	T	6	6	541164	541169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_000963	TG	3	6	541179	541184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_000963	GAT	2	6	541246	541251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3568	NC_000963	ATA	2	6	541357	541362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_000963	AAT	2	6	541377	541382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_000963	TAT	2	6	541396	541401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_000963	ATA	2	6	541413	541418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_000963	TTTGA	2	10	541433	541442	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3574	NC_000963	A	6	6	541466	541471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_000963	A	9	9	541490	541498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3577	NC_000963	TAAT	2	8	541516	541523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_000963	ATG	2	6	542475	542480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3580	NC_000963	TATG	2	8	543455	543462	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_000963	TA	3	6	543472	543477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_000963	CAATA	2	10	543482	543491	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3584	NC_000963	TAAAT	2	10	543504	543513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_000963	TAA	2	6	543514	543519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_000963	AAT	2	6	543523	543528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3589	NC_000963	TTTATA	2	12	544556	544567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3591	NC_000963	TAAAT	2	10	544635	544644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3598	NC_000963	ATACT	2	10	544804	544813	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3599	NC_000963	TA	3	6	544842	544847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_000963	TTA	2	6	544939	544944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3602	NC_000963	ATA	2	6	544979	544984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_000963	ATG	2	6	545003	545008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_000963	ATA	2	6	545009	545014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_000963	ATTA	2	8	545051	545058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_000963	ATT	2	6	545085	545090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_000963	TAT	2	6	545110	545115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3609	NC_000963	GTG	2	6	545124	545129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_000963	ATGC	2	8	545140	545147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3611	NC_000963	TAA	2	6	545153	545158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_000963	TAT	2	6	545165	545170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3614	NC_000963	AT	3	6	545361	545366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_000963	ATA	2	6	545456	545461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3617	NC_000963	ATA	2	6	545495	545500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_000963	GATA	2	8	545516	545523	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_000963	TTTA	2	8	545587	545594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_000963	T	6	6	545614	545619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_000963	ATA	2	6	545671	545676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_000963	A	6	6	545691	545696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_000963	TTA	2	6	545742	545747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_000963	ATTA	2	8	548653	548660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_000963	TTAT	2	8	548666	548673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_000963	TAA	2	6	548674	548679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_000963	GAT	2	6	548683	548688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3629	NC_000963	GAT	2	6	548698	548703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3631	NC_000963	T	6	6	548798	548803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_000963	TAA	2	6	548838	548843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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