MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 1201

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022545	TGGAC	2	10	769	778	20 %	20 %	40 %	20 %	549728082
2	NC_022545	TTCCT	2	10	2882	2891	0 %	60 %	0 %	40 %	549728088
3	NC_022545	CCGTG	2	10	8036	8045	0 %	20 %	40 %	40 %	549728095
4	NC_022545	CTTCA	2	10	9928	9937	20 %	40 %	0 %	40 %	549728096
5	NC_022545	ACGAT	2	10	12063	12072	40 %	20 %	20 %	20 %	549728098
6	NC_022545	ACTTG	2	10	15447	15456	20 %	40 %	20 %	20 %	549728099
7	NC_022545	CGAAA	2	10	19513	19522	60 %	0 %	20 %	20 %	549728104
8	NC_022545	TTGGC	2	10	20093	20102	0 %	40 %	40 %	20 %	549728104
9	NC_022545	GAAAT	2	10	25616	25625	60 %	20 %	20 %	0 %	549728110
10	NC_022545	ACCAC	2	10	29405	29414	40 %	0 %	0 %	60 %	549728113
11	NC_022545	ACCGA	2	10	31421	31430	40 %	0 %	20 %	40 %	549728116
12	NC_022545	CGATC	2	10	34685	34694	20 %	20 %	20 %	40 %	549728120
13	NC_022545	TCGCC	2	10	37040	37049	0 %	20 %	20 %	60 %	549728121
14	NC_022545	TGGAC	2	10	40728	40737	20 %	20 %	40 %	20 %	549728124
15	NC_022545	CGGGC	2	10	40755	40764	0 %	0 %	60 %	40 %	549728124
16	NC_022545	GCCTC	2	10	41565	41574	0 %	20 %	20 %	60 %	549728124
17	NC_022545	GGCAC	2	10	42238	42247	20 %	0 %	40 %	40 %	549728125
18	NC_022545	GCGCC	2	10	42820	42829	0 %	0 %	40 %	60 %	549728126
19	NC_022545	GCCCT	2	10	43630	43639	0 %	20 %	20 %	60 %	549728126
20	NC_022545	AAACA	2	10	45237	45246	80 %	0 %	0 %	20 %	549728128
21	NC_022545	AAGGC	2	10	45337	45346	40 %	0 %	40 %	20 %	549728128
22	NC_022545	GACCG	2	10	47177	47186	20 %	0 %	40 %	40 %	549728130
23	NC_022545	GCGCC	2	10	48357	48366	0 %	0 %	40 %	60 %	549728131
24	NC_022545	CGATG	2	10	49302	49311	20 %	20 %	40 %	20 %	549728132
25	NC_022545	TTCAT	2	10	49584	49593	20 %	60 %	0 %	20 %	549728133
26	NC_022545	ATTTC	2	10	51712	51721	20 %	60 %	0 %	20 %	549728136
27	NC_022545	TACCC	2	10	53252	53261	20 %	20 %	0 %	60 %	549728138
28	NC_022545	CCCGC	2	10	55020	55029	0 %	0 %	20 %	80 %	549728140
29	NC_022545	GGCGC	2	10	56146	56155	0 %	0 %	60 %	40 %	549728141
30	NC_022545	GCACG	2	10	60395	60404	20 %	0 %	40 %	40 %	549728144
31	NC_022545	AGTGG	2	10	62335	62344	20 %	20 %	60 %	0 %	549728146
32	NC_022545	AGGAC	2	10	65014	65023	40 %	0 %	40 %	20 %	549728148
33	NC_022545	GCCGC	2	10	65779	65788	0 %	0 %	40 %	60 %	549728150
34	NC_022545	GTCCC	2	10	67439	67448	0 %	20 %	20 %	60 %	549728151
35	NC_022545	CGGCG	2	10	67939	67948	0 %	0 %	60 %	40 %	549728152
36	NC_022545	GAGCG	2	10	71872	71881	20 %	0 %	60 %	20 %	549728156
37	NC_022545	AGCGA	2	10	72903	72912	40 %	0 %	40 %	20 %	549728157
38	NC_022545	TGATC	2	10	76066	76075	20 %	40 %	20 %	20 %	549728159
39	NC_022545	AGCGG	2	10	77893	77902	20 %	0 %	60 %	20 %	549728161
40	NC_022545	CCCTC	2	10	81066	81075	0 %	20 %	0 %	80 %	549728163
41	NC_022545	CGAAG	2	10	83939	83948	40 %	0 %	40 %	20 %	549728167
42	NC_022545	CGAAC	2	10	84652	84661	40 %	0 %	20 %	40 %	549728168
43	NC_022545	ATTTC	2	10	87116	87125	20 %	60 %	0 %	20 %	549728170
44	NC_022545	TCGCT	2	10	87209	87218	0 %	40 %	20 %	40 %	549728170
45	NC_022545	GCACC	2	10	88477	88486	20 %	0 %	20 %	60 %	549728171
46	NC_022545	ACCTG	2	10	89858	89867	20 %	20 %	20 %	40 %	549728172
47	NC_022545	GAAGA	2	10	92227	92236	60 %	0 %	40 %	0 %	549728175
48	NC_022545	CGCCC	2	10	97669	97678	0 %	0 %	20 %	80 %	549728187
49	NC_022545	ATATT	2	10	97896	97905	40 %	60 %	0 %	0 %	549728187
50	NC_022545	CCGCG	2	10	98561	98570	0 %	0 %	40 %	60 %	549728188
51	NC_022545	CGGCG	2	10	99115	99124	0 %	0 %	60 %	40 %	549728188
52	NC_022545	ACCGA	2	10	102710	102719	40 %	0 %	20 %	40 %	549728191
53	NC_022545	CCGAA	2	10	103477	103486	40 %	0 %	20 %	40 %	549728192
54	NC_022545	TGGGT	2	10	104666	104675	0 %	40 %	60 %	0 %	549728193
55	NC_022545	CGGCA	2	10	105034	105043	20 %	0 %	40 %	40 %	549728193
56	NC_022545	TGACC	2	10	106139	106148	20 %	20 %	20 %	40 %	549728194
57	NC_022545	TCCGC	2	10	107832	107841	0 %	20 %	20 %	60 %	549728196
58	NC_022545	ACGGA	2	10	109136	109145	40 %	0 %	40 %	20 %	549728198
59	NC_022545	CTGCC	2	10	109436	109445	0 %	20 %	20 %	60 %	549728198
60	NC_022545	ACCGG	2	10	110255	110264	20 %	0 %	40 %	40 %	549728199
61	NC_022545	CGGAA	2	10	112656	112665	40 %	0 %	40 %	20 %	549728201
62	NC_022545	TGCAC	2	10	115188	115197	20 %	20 %	20 %	40 %	549728206
63	NC_022545	TTCGG	2	10	118628	118637	0 %	40 %	40 %	20 %	549728208
64	NC_022545	CCGCA	2	10	118793	118802	20 %	0 %	20 %	60 %	549728208
65	NC_022545	CGCGG	2	10	119234	119243	0 %	0 %	60 %	40 %	549728208
66	NC_022545	TGCCG	2	10	121684	121693	0 %	20 %	40 %	40 %	549728211
67	NC_022545	GCTGC	2	10	123850	123859	0 %	20 %	40 %	40 %	549728213
68	NC_022545	GATTT	2	10	124652	124661	20 %	60 %	20 %	0 %	549728213
69	NC_022545	TCCGT	2	10	126333	126342	0 %	40 %	20 %	40 %	549728216
70	NC_022545	GGATC	2	10	127213	127222	20 %	20 %	40 %	20 %	549728217
71	NC_022545	TGCGC	2	10	132460	132469	0 %	20 %	40 %	40 %	549728222
72	NC_022545	CGTCG	2	10	134274	134283	0 %	20 %	40 %	40 %	549728224
73	NC_022545	ACGGC	2	10	136855	136864	20 %	0 %	40 %	40 %	549728226
74	NC_022545	CTGGA	2	10	138221	138230	20 %	20 %	40 %	20 %	549728227
75	NC_022545	CGCGG	2	10	138292	138301	0 %	0 %	60 %	40 %	549728227
76	NC_022545	CGACC	2	10	138369	138378	20 %	0 %	20 %	60 %	549728227
77	NC_022545	TCTGG	2	10	140031	140040	0 %	40 %	40 %	20 %	549728229
78	NC_022545	GCTCG	2	10	141084	141093	0 %	20 %	40 %	40 %	549728230
79	NC_022545	CCGGC	2	10	145741	145750	0 %	0 %	40 %	60 %	549728234
80	NC_022545	AGGAC	2	10	151093	151102	40 %	0 %	40 %	20 %	549728240
81	NC_022545	CCGAA	2	10	153153	153162	40 %	0 %	20 %	40 %	549728242
82	NC_022545	ATCGA	2	10	153271	153280	40 %	20 %	20 %	20 %	549728242
83	NC_022545	GCAGC	2	10	154532	154541	20 %	0 %	40 %	40 %	549728243
84	NC_022545	TGCCC	2	10	155141	155150	0 %	20 %	20 %	60 %	549728244
85	NC_022545	TCCGT	2	10	159405	159414	0 %	40 %	20 %	40 %	549728248
86	NC_022545	CCGGA	2	10	164956	164965	20 %	0 %	40 %	40 %	549728254
87	NC_022545	CGGGC	2	10	165884	165893	0 %	0 %	60 %	40 %	549728255
88	NC_022545	GCCGA	2	10	166017	166026	20 %	0 %	40 %	40 %	549728255
89	NC_022545	TGGCC	2	10	166978	166987	0 %	20 %	40 %	40 %	549728256
90	NC_022545	AAGCG	2	10	167078	167087	40 %	0 %	40 %	20 %	549728256
91	NC_022545	TACCT	2	10	170380	170389	20 %	40 %	0 %	40 %	549728259
92	NC_022545	TCACC	2	10	171507	171516	20 %	20 %	0 %	60 %	549728260
93	NC_022545	GCCGC	2	10	174910	174919	0 %	0 %	40 %	60 %	549728262
94	NC_022545	GCTTC	2	10	177723	177732	0 %	40 %	20 %	40 %	549728263
95	NC_022545	CGGCG	2	10	178613	178622	0 %	0 %	60 %	40 %	549728264
96	NC_022545	CCGCG	2	10	179603	179612	0 %	0 %	40 %	60 %	549728264
97	NC_022545	CGGCC	2	10	180216	180225	0 %	0 %	40 %	60 %	549728265
98	NC_022545	GCCTT	2	10	180318	180327	0 %	40 %	20 %	40 %	549728265
99	NC_022545	GCGCC	2	10	184819	184828	0 %	0 %	40 %	60 %	549728269
100	NC_022545	GCCAT	2	10	191235	191244	20 %	20 %	20 %	40 %	549728275
101	NC_022545	CGCGT	2	10	191503	191512	0 %	20 %	40 %	40 %	549728275
102	NC_022545	CCTTG	2	10	194825	194834	0 %	40 %	20 %	40 %	549728278
103	NC_022545	TTGTC	2	10	195212	195221	0 %	60 %	20 %	20 %	549728278
104	NC_022545	CGCTG	2	10	196010	196019	0 %	20 %	40 %	40 %	549728279
105	NC_022545	ACGGA	2	10	196353	196362	40 %	0 %	40 %	20 %	549728280
106	NC_022545	CTGCG	2	10	199547	199556	0 %	20 %	40 %	40 %	549728284
107	NC_022545	TGCCG	2	10	200140	200149	0 %	20 %	40 %	40 %	549728284
108	NC_022545	TCGCG	2	10	205036	205045	0 %	20 %	40 %	40 %	549728291
109	NC_022545	CCACG	2	10	207424	207433	20 %	0 %	20 %	60 %	549728293
110	NC_022545	GCGCC	2	10	209384	209393	0 %	0 %	40 %	60 %	549728296
111	NC_022545	GGCAA	2	10	212639	212648	40 %	0 %	40 %	20 %	549728298
112	NC_022545	GCCGA	2	10	212921	212930	20 %	0 %	40 %	40 %	549728298
113	NC_022545	TCCGA	2	10	213089	213098	20 %	20 %	20 %	40 %	549728298
114	NC_022545	TGCCC	2	10	215432	215441	0 %	20 %	20 %	60 %	549728300
115	NC_022545	TGCGC	2	10	215819	215828	0 %	20 %	40 %	40 %	549728300
116	NC_022545	GACCA	2	10	218260	218269	40 %	0 %	20 %	40 %	549728302
117	NC_022545	CCTTC	2	10	220305	220314	0 %	40 %	0 %	60 %	549728304
118	NC_022545	CGCGC	2	10	222479	222488	0 %	0 %	40 %	60 %	549728306
119	NC_022545	ACCGG	2	10	228573	228582	20 %	0 %	40 %	40 %	549728311
120	NC_022545	TCGCG	2	10	229615	229624	0 %	20 %	40 %	40 %	549728312
121	NC_022545	TGAGC	2	10	229943	229952	20 %	20 %	40 %	20 %	549728312
122	NC_022545	AAGGC	2	10	230317	230326	40 %	0 %	40 %	20 %	549728313
123	NC_022545	TTCGG	2	10	232651	232660	0 %	40 %	40 %	20 %	549728316
124	NC_022545	GCGCA	2	10	234241	234250	20 %	0 %	40 %	40 %	549728317
125	NC_022545	TGACG	2	10	237305	237314	20 %	20 %	40 %	20 %	549728320
126	NC_022545	ACGGT	2	10	238432	238441	20 %	20 %	40 %	20 %	549728321
127	NC_022545	CATTG	2	10	238531	238540	20 %	40 %	20 %	20 %	549728321
128	NC_022545	CAGCG	2	10	239436	239445	20 %	0 %	40 %	40 %	549728322
129	NC_022545	AGGCG	2	10	243006	243015	20 %	0 %	60 %	20 %	549728325
130	NC_022545	CTGCC	2	10	246522	246531	0 %	20 %	20 %	60 %	549728330
131	NC_022545	CGCAG	2	10	247523	247532	20 %	0 %	40 %	40 %	549728332
132	NC_022545	TGGCC	2	10	250735	250744	0 %	20 %	40 %	40 %	549728335
133	NC_022545	TGCTG	2	10	251586	251595	0 %	40 %	40 %	20 %	549728336
134	NC_022545	CGGCC	2	10	261773	261782	0 %	0 %	40 %	60 %	549728343
135	NC_022545	GCCGA	2	10	262375	262384	20 %	0 %	40 %	40 %	549728343
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169	NC_022545	GGCAA	2	10	327211	327220	40 %	0 %	40 %	20 %	549728403
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247	NC_022545	GCGAG	2	10	455918	455927	20 %	0 %	60 %	20 %	549728521
248	NC_022545	CGGAT	2	10	458800	458809	20 %	20 %	40 %	20 %	549728523
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251	NC_022545	GCCCG	2	10	469667	469676	0 %	0 %	40 %	60 %	549728534
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260	NC_022545	CCATA	2	10	477792	477801	40 %	20 %	0 %	40 %	549728541
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389	NC_022545	GCCCC	2	10	708210	708219	0 %	0 %	20 %	80 %	549728766
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