MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 40094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_022545	GAGC	2	8	2028841	2028848	25 %	0 %	50 %	25 %	549729992
40002	NC_022545	TTC	2	6	2028942	2028947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729992
40003	NC_022545	GCTG	2	8	2029039	2029046	0 %	25 %	50 %	25 %	549729993
40004	NC_022545	GC	3	6	2029135	2029140	0 %	0 %	50 %	50 %	549729993
40005	NC_022545	GCA	2	6	2029142	2029147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729993
40006	NC_022545	GGC	2	6	2029581	2029586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729994
40007	NC_022545	CCG	2	6	2029656	2029661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729994
40008	NC_022545	GCA	2	6	2029666	2029671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729994
40009	NC_022545	CGG	2	6	2029717	2029722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729994
40010	NC_022545	GCT	2	6	2029811	2029816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729995
40011	NC_022545	CAT	2	6	2029817	2029822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729995
40012	NC_022545	GAC	2	6	2029869	2029874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729995
40013	NC_022545	TG	3	6	2029963	2029968	0 %	50 %	50 %	0 %	549729995
40014	NC_022545	GTC	2	6	2029992	2029997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729995
40015	NC_022545	CTGC	2	8	2030122	2030129	0 %	25 %	25 %	50 %	549729995
40016	NC_022545	CTTC	2	8	2030138	2030145	0 %	50 %	0 %	50 %	549729995
40017	NC_022545	TGA	2	6	2030153	2030158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729995
40018	NC_022545	GCC	2	6	2030205	2030210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729995
40019	NC_022545	TCA	2	6	2030291	2030296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729995
40020	NC_022545	GC	3	6	2030353	2030358	0 %	0 %	50 %	50 %	549729996
40021	NC_022545	TG	3	6	2030382	2030387	0 %	50 %	50 %	0 %	549729996
40022	NC_022545	GA	3	6	2030401	2030406	50 %	0 %	50 %	0 %	549729996
40023	NC_022545	TTG	2	6	2030464	2030469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729996
40024	NC_022545	GC	3	6	2030562	2030567	0 %	0 %	50 %	50 %	549729996
40025	NC_022545	TCG	2	6	2030572	2030577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729996
40026	NC_022545	TTG	2	6	2030579	2030584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729996
40027	NC_022545	GAA	2	6	2030588	2030593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729996
40028	NC_022545	GAA	2	6	2031776	2031781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729997
40029	NC_022545	GCCTCG	2	12	2031796	2031807	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549729997
40030	NC_022545	GAT	2	6	2031867	2031872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729997
40031	NC_022545	ACG	2	6	2031900	2031905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729997
40032	NC_022545	AGGT	2	8	2031913	2031920	25 %	25 %	50 %	0 %	549729997
40033	NC_022545	ACCTTC	2	12	2031973	2031984	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	549729997
40034	NC_022545	TCG	2	6	2031985	2031990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729997
40035	NC_022545	GTC	2	6	2032056	2032061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729997
40036	NC_022545	CCT	2	6	2032094	2032099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729997
40037	NC_022545	CCG	2	6	2032106	2032111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729997
40038	NC_022545	TTC	2	6	2032261	2032266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729997
40039	NC_022545	GCA	2	6	2032321	2032326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729997
40040	NC_022545	ATC	2	6	2032333	2032338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729997
40041	NC_022545	GCA	2	6	2032343	2032348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729997
40042	NC_022545	CAA	2	6	2032370	2032375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729997
40043	NC_022545	TCA	2	6	2032388	2032393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729997
40044	NC_022545	GTC	2	6	2032395	2032400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729997
40045	NC_022545	GAG	2	6	2032853	2032858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729998
40046	NC_022545	GC	3	6	2032879	2032884	0 %	0 %	50 %	50 %	549729998
40047	NC_022545	TTA	2	6	2032885	2032890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549729998
40048	NC_022545	TTGG	2	8	2032903	2032910	0 %	50 %	50 %	0 %	549729998
40049	NC_022545	CG	3	6	2032941	2032946	0 %	0 %	50 %	50 %	549729998
40050	NC_022545	GAACT	2	10	2032949	2032958	40 %	20 %	20 %	20 %	549729998
40051	NC_022545	GCA	2	6	2032960	2032965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729998
40052	NC_022545	GGT	2	6	2032966	2032971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729998
40053	NC_022545	GGC	2	6	2033015	2033020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729998
40054	NC_022545	CT	3	6	2033057	2033062	0 %	50 %	0 %	50 %	549729998
40055	NC_022545	CCTG	2	8	2033105	2033112	0 %	25 %	25 %	50 %	549729998
40056	NC_022545	GGC	2	6	2033198	2033203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729998
40057	NC_022545	CGA	2	6	2033317	2033322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729998
40058	NC_022545	TCA	2	6	2033344	2033349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729998
40059	NC_022545	TGC	2	6	2033371	2033376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729998
40060	NC_022545	GGC	2	6	2033391	2033396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729998
40061	NC_022545	GCT	2	6	2033404	2033409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729998
40062	NC_022545	TCT	3	9	2033445	2033453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729998
40063	NC_022545	GGC	2	6	2033540	2033545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729998
40064	NC_022545	TCA	2	6	2033565	2033570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729998
40065	NC_022545	GCT	2	6	2033624	2033629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729999
40066	NC_022545	TC	3	6	2033720	2033725	0 %	50 %	0 %	50 %	549729999
40067	NC_022545	TGG	2	6	2033776	2033781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729999
40068	NC_022545	GCG	2	6	2033833	2033838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729999
40069	NC_022545	ATG	2	6	2033860	2033865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729999
40070	NC_022545	CTT	2	6	2033880	2033885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729999
40071	NC_022545	TTG	2	6	2034046	2034051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729999
40072	NC_022545	CG	3	6	2034073	2034078	0 %	0 %	50 %	50 %	549729999
40073	NC_022545	ATT	2	6	2034144	2034149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549729999
40074	NC_022545	GAAT	2	8	2034212	2034219	50 %	25 %	25 %	0 %	549729999
40075	NC_022545	GAG	2	6	2034246	2034251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729999
40076	NC_022545	AGA	2	6	2034263	2034268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729999
40077	NC_022545	GCA	2	6	2034281	2034286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729999
40078	NC_022545	GGA	2	6	2034309	2034314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729999
40079	NC_022545	ATC	2	6	2034322	2034327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729999
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40081	NC_022545	TGC	2	6	2034475	2034480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729999
40082	NC_022545	CGT	2	6	2034575	2034580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549730000
40083	NC_022545	TCT	2	6	2034712	2034717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549730000
40084	NC_022545	TCAA	2	8	2034726	2034733	50 %	25 %	0 %	25 %	549730000
40085	NC_022545	TGA	2	6	2034751	2034756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549730000
40086	NC_022545	A	6	6	2034760	2034765	100 %	0 %	0 %	0 %	549730000
40087	NC_022545	CGA	2	6	2034776	2034781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549730000
40088	NC_022545	TC	3	6	2034897	2034902	0 %	50 %	0 %	50 %	549730000
40089	NC_022545	CCT	2	6	2034913	2034918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549730001
40090	NC_022545	AGG	2	6	2034947	2034952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549730001
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40092	NC_022545	TGT	2	6	2035023	2035028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549730001
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40094	NC_022545	CA	3	6	2035112	2035117	50 %	0 %	0 %	50 %	549730001

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.