MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 40094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022545	GCC	2	6	175424	175429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728262
3502	NC_022545	GAA	2	6	175484	175489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728262
3503	NC_022545	CTT	2	6	175493	175498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728262
3504	NC_022545	ATG	2	6	175502	175507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728262
3505	NC_022545	AAG	2	6	175531	175536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728262
3506	NC_022545	ACC	2	6	175590	175595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728262
3507	NC_022545	CTG	2	6	175610	175615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728262
3508	NC_022545	GAT	2	6	175619	175624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728262
3509	NC_022545	GAA	2	6	175640	175645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728262
3510	NC_022545	GAT	2	6	175688	175693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728262
3511	NC_022545	CCT	2	6	175729	175734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728262
3512	NC_022545	ATG	2	6	175758	175763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728262
3513	NC_022545	ACG	3	9	175779	175787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728262
3514	NC_022545	CCA	2	6	175798	175803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728262
3515	NC_022545	ACAT	2	8	175863	175870	50 %	25 %	0 %	25 %	549728262
3516	NC_022545	AGC	2	6	175887	175892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728262
3517	NC_022545	CAC	2	6	175901	175906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728262
3518	NC_022545	ATG	2	6	175917	175922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728262
3519	NC_022545	CAC	2	6	175955	175960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728262
3520	NC_022545	GAT	2	6	175970	175975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728262
3521	NC_022545	TCGA	2	8	176004	176011	25 %	25 %	25 %	25 %	549728262
3522	NC_022545	CTC	2	6	176081	176086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728262
3523	NC_022545	GGC	2	6	176153	176158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728262
3524	NC_022545	GGC	2	6	176176	176181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728262
3525	NC_022545	CGC	2	6	176200	176205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728262
3526	NC_022545	CG	3	6	176217	176222	0 %	0 %	50 %	50 %	549728262
3527	NC_022545	GAA	2	6	176241	176246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728262
3528	NC_022545	GC	3	6	176259	176264	0 %	0 %	50 %	50 %	549728262
3529	NC_022545	CTG	2	6	176330	176335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728262
3530	NC_022545	CGGC	2	8	176364	176371	0 %	0 %	50 %	50 %	549728262
3531	NC_022545	ATCC	2	8	176450	176457	25 %	25 %	0 %	50 %	549728262
3532	NC_022545	GC	3	6	176491	176496	0 %	0 %	50 %	50 %	549728262
3533	NC_022545	CCA	2	6	176596	176601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728262
3534	NC_022545	TCA	2	6	176602	176607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728262
3535	NC_022545	TGCC	2	8	176617	176624	0 %	25 %	25 %	50 %	549728262
3536	NC_022545	CTG	2	6	176642	176647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728262
3537	NC_022545	CTGC	2	8	176653	176660	0 %	25 %	25 %	50 %	549728262
3538	NC_022545	GCG	3	9	176893	176901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728262
3539	NC_022545	GCA	2	6	176926	176931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728262
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3541	NC_022545	CGA	2	6	176971	176976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728262
3542	NC_022545	CGAT	2	8	176994	177001	25 %	25 %	25 %	25 %	549728262
3543	NC_022545	A	6	6	177003	177008	100 %	0 %	0 %	0 %	549728262
3544	NC_022545	GCG	2	6	177071	177076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728263
3545	NC_022545	TCG	2	6	177086	177091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728263
3546	NC_022545	TCT	2	6	177129	177134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728263
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3548	NC_022545	CGC	2	6	177221	177226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728263
3549	NC_022545	GAC	2	6	177250	177255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728263
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3551	NC_022545	CTG	2	6	177295	177300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728263
3552	NC_022545	CTG	2	6	177331	177336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728263
3553	NC_022545	ACAT	2	8	177350	177357	50 %	25 %	0 %	25 %	549728263
3554	NC_022545	GCA	2	6	177363	177368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728263
3555	NC_022545	CGC	2	6	177393	177398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728263
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3558	NC_022545	CAG	2	6	177445	177450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728263
3559	NC_022545	TCA	2	6	177519	177524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728263
3560	NC_022545	GCC	2	6	177566	177571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728263
3561	NC_022545	GCT	2	6	177603	177608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728263
3562	NC_022545	TCG	2	6	177612	177617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728263
3563	NC_022545	GC	3	6	177648	177653	0 %	0 %	50 %	50 %	549728263
3564	NC_022545	CG	4	8	177665	177672	0 %	0 %	50 %	50 %	549728263
3565	NC_022545	GCTTC	2	10	177723	177732	0 %	40 %	20 %	40 %	549728263
3566	NC_022545	GCCT	2	8	177739	177746	0 %	25 %	25 %	50 %	549728263
3567	NC_022545	GCCACC	2	12	177749	177760	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	549728263
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3571	NC_022545	CCTT	2	8	177959	177966	0 %	50 %	0 %	50 %	549728263
3572	NC_022545	GAT	2	6	178000	178005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728263
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3579	NC_022545	GCCT	2	8	178644	178651	0 %	25 %	25 %	50 %	549728264
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3588	NC_022545	GATC	2	8	178919	178926	25 %	25 %	25 %	25 %	549728264
3589	NC_022545	TCG	2	6	178975	178980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728264
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3591	NC_022545	CAC	2	6	179172	179177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728264
3592	NC_022545	TCG	2	6	179245	179250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728264
3593	NC_022545	GCA	2	6	179273	179278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728264
3594	NC_022545	CG	3	6	179316	179321	0 %	0 %	50 %	50 %	549728264
3595	NC_022545	GAT	2	6	179400	179405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728264
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3602	NC_022545	AGC	2	6	179566	179571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728264
3603	NC_022545	CCGCG	2	10	179603	179612	0 %	0 %	40 %	60 %	549728264
3604	NC_022545	AAT	2	6	179645	179650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549728264
3605	NC_022545	CT	3	6	179713	179718	0 %	50 %	0 %	50 %	549728264
3606	NC_022545	CGA	2	6	179753	179758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728264
3607	NC_022545	GCC	2	6	179836	179841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728264
3608	NC_022545	AGA	2	6	179860	179865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728264
3609	NC_022545	CCGC	2	8	179891	179898	0 %	0 %	25 %	75 %	549728264
3610	NC_022545	ATCG	2	8	179976	179983	25 %	25 %	25 %	25 %	549728264
3611	NC_022545	CGGCC	2	10	180216	180225	0 %	0 %	40 %	60 %	549728265
3612	NC_022545	GC	3	6	180255	180260	0 %	0 %	50 %	50 %	549728265
3613	NC_022545	GCCTT	2	10	180318	180327	0 %	40 %	20 %	40 %	549728265
3614	NC_022545	TCA	2	6	180429	180434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728265
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3617	NC_022545	GCCG	2	8	180617	180624	0 %	0 %	50 %	50 %	549728265
3618	NC_022545	CGA	3	9	180694	180702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728265
3619	NC_022545	CGC	2	6	180707	180712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728265
3620	NC_022545	TCCGGC	2	12	180726	180737	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549728265
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3984	NC_022545	CAT	2	6	199534	199539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728284
3985	NC_022545	CTGCG	2	10	199547	199556	0 %	20 %	40 %	40 %	549728284
3986	NC_022545	TCA	2	6	199617	199622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728284
3987	NC_022545	TGC	2	6	199692	199697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728284
3988	NC_022545	TCGA	2	8	199745	199752	25 %	25 %	25 %	25 %	549728284
3989	NC_022545	GCT	2	6	199777	199782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728284
3990	NC_022545	ATC	2	6	199785	199790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728284
3991	NC_022545	CGG	2	6	199828	199833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728284
3992	NC_022545	CCG	2	6	199858	199863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728284
3993	NC_022545	CGCC	2	8	200004	200011	0 %	0 %	25 %	75 %	549728284
3994	NC_022545	GCC	2	6	200096	200101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728284
3995	NC_022545	GCC	2	6	200126	200131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728284
3996	NC_022545	TGCCG	2	10	200140	200149	0 %	20 %	40 %	40 %	549728284
3997	NC_022545	CCG	2	6	200186	200191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728284
3998	NC_022545	AAC	2	6	200351	200356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728285
3999	NC_022545	GAAC	2	8	200359	200366	50 %	0 %	25 %	25 %	549728285
4000	NC_022545	GAC	2	6	200437	200442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728285

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