MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 40094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022545	TCA	2	6	151201	151206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728240
3002	NC_022545	AGC	2	6	151218	151223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728240
3003	NC_022545	CCAC	2	8	151242	151249	25 %	0 %	0 %	75 %	549728240
3004	NC_022545	ACG	2	6	151260	151265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728240
3005	NC_022545	GAGGAA	2	12	151271	151282	50 %	0 %	50 %	0 %	549728240
3006	NC_022545	CTG	2	6	151302	151307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728240
3007	NC_022545	ATC	2	6	151365	151370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728240
3008	NC_022545	GCC	2	6	151394	151399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728240
3009	NC_022545	AGC	2	6	151488	151493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728240
3010	NC_022545	GCG	2	6	151524	151529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728240
3011	NC_022545	AG	3	6	151530	151535	50 %	0 %	50 %	0 %	549728240
3012	NC_022545	TCC	2	6	151539	151544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728240
3013	NC_022545	ACG	2	6	151599	151604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728240
3014	NC_022545	CAG	2	6	151657	151662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728240
3015	NC_022545	GCG	2	6	151709	151714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728240
3016	NC_022545	GC	4	8	151774	151781	0 %	0 %	50 %	50 %	549728240
3017	NC_022545	GTGGGC	2	12	151851	151862	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	549728240
3018	NC_022545	GCG	3	9	151865	151873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728240
3019	NC_022545	CCG	2	6	151874	151879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728240
3020	NC_022545	GGAG	2	8	151885	151892	25 %	0 %	75 %	0 %	549728240
3021	NC_022545	GC	3	6	151907	151912	0 %	0 %	50 %	50 %	549728240
3022	NC_022545	TGC	3	9	152041	152049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728241
3023	NC_022545	CAG	2	6	152118	152123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728241
3024	NC_022545	TCG	2	6	152140	152145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728241
3025	NC_022545	GCA	2	6	152189	152194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728241
3026	NC_022545	GTC	2	6	152321	152326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728241
3027	NC_022545	CGC	2	6	152453	152458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728241
3028	NC_022545	TCA	2	6	152489	152494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728241
3029	NC_022545	CGG	2	6	152528	152533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728241
3030	NC_022545	TAC	2	6	152552	152557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728241
3031	NC_022545	CCG	2	6	152573	152578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728241
3032	NC_022545	CGGC	2	8	152581	152588	0 %	0 %	50 %	50 %	549728241
3033	NC_022545	A	6	6	152983	152988	100 %	0 %	0 %	0 %	549728242
3034	NC_022545	GAC	2	6	153030	153035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728242
3035	NC_022545	GCG	2	6	153118	153123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728242
3036	NC_022545	CGG	2	6	153135	153140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728242
3037	NC_022545	TC	3	6	153147	153152	0 %	50 %	0 %	50 %	549728242
3038	NC_022545	CCGAA	2	10	153153	153162	40 %	0 %	20 %	40 %	549728242
3039	NC_022545	TGG	2	6	153170	153175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728242
3040	NC_022545	TCT	2	6	153216	153221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728242
3041	NC_022545	CTG	2	6	153265	153270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728242
3042	NC_022545	ATCGA	2	10	153271	153280	40 %	20 %	20 %	20 %	549728242
3043	NC_022545	CGC	2	6	153306	153311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728242
3044	NC_022545	CGA	2	6	153327	153332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728242
3045	NC_022545	GGT	2	6	153381	153386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728242
3046	NC_022545	CGC	2	6	153390	153395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728242
3047	NC_022545	TCT	2	6	153399	153404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728242
3048	NC_022545	CGG	2	6	153449	153454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728242
3049	NC_022545	TCG	2	6	153476	153481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728242
3050	NC_022545	TCT	2	6	153483	153488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728242
3051	NC_022545	GTC	2	6	153514	153519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728242
3052	NC_022545	CAA	2	6	153525	153530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728242
3053	NC_022545	GCC	2	6	153562	153567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728242
3054	NC_022545	ATC	2	6	153574	153579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728242
3055	NC_022545	AGG	2	6	153638	153643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728242
3056	NC_022545	GAA	2	6	153679	153684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728242
3057	NC_022545	ATCG	2	8	153811	153818	25 %	25 %	25 %	25 %	549728242
3058	NC_022545	GC	3	6	153837	153842	0 %	0 %	50 %	50 %	549728242
3059	NC_022545	TCT	2	6	153851	153856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728242
3060	NC_022545	GA	3	6	153884	153889	50 %	0 %	50 %	0 %	549728242
3061	NC_022545	TGG	2	6	153934	153939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728242
3062	NC_022545	CCG	2	6	153941	153946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728242
3063	NC_022545	CG	3	6	153965	153970	0 %	0 %	50 %	50 %	549728242
3064	NC_022545	ATG	2	6	153988	153993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728242
3065	NC_022545	CCG	2	6	154023	154028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728242
3066	NC_022545	AATG	2	8	154059	154066	50 %	25 %	25 %	0 %	549728242
3067	NC_022545	TGCC	2	8	154092	154099	0 %	25 %	25 %	50 %	549728242
3068	NC_022545	GGC	2	6	154133	154138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728242
3069	NC_022545	GGC	2	6	154173	154178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728242
3070	NC_022545	CAC	2	6	154368	154373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728243
3071	NC_022545	CAG	3	9	154401	154409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728243
3072	NC_022545	ATG	2	6	154432	154437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728243
3073	NC_022545	GAT	2	6	154464	154469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728243
3074	NC_022545	AGC	2	6	154483	154488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728243
3075	NC_022545	GCAGC	2	10	154532	154541	20 %	0 %	40 %	40 %	549728243
3076	NC_022545	AGC	2	6	154594	154599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728243
3077	NC_022545	CAG	2	6	154647	154652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728243
3078	NC_022545	GCC	2	6	154693	154698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728243
3079	NC_022545	CGC	2	6	154722	154727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728243
3080	NC_022545	AAAC	2	8	154743	154750	75 %	0 %	0 %	25 %	549728243
3081	NC_022545	GC	3	6	154894	154899	0 %	0 %	50 %	50 %	549728244
3082	NC_022545	TGGA	2	8	154936	154943	25 %	25 %	50 %	0 %	549728244
3083	NC_022545	GC	3	6	155012	155017	0 %	0 %	50 %	50 %	549728244
3084	NC_022545	GCA	2	6	155060	155065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728244
3085	NC_022545	AGA	2	6	155086	155091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728244
3086	NC_022545	GAT	2	6	155103	155108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728244
3087	NC_022545	TGCCC	2	10	155141	155150	0 %	20 %	20 %	60 %	549728244
3088	NC_022545	TGC	2	6	155289	155294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728245
3089	NC_022545	ATC	2	6	155324	155329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728245
3090	NC_022545	AGA	2	6	155358	155363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728245
3091	NC_022545	TCC	2	6	155535	155540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728245
3092	NC_022545	AAT	2	6	155557	155562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549728245
3093	NC_022545	AAC	2	6	155574	155579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728245
3094	NC_022545	CGG	2	6	155750	155755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728245
3095	NC_022545	CAC	2	6	155780	155785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728245
3096	NC_022545	CGA	2	6	155809	155814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728245
3097	NC_022545	GCC	2	6	155843	155848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728245
3098	NC_022545	TGA	2	6	155863	155868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728245
3099	NC_022545	GGT	2	6	155891	155896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728245
3100	NC_022545	GCA	2	6	155990	155995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728245
3101	NC_022545	CGT	3	9	156005	156013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728245
3102	NC_022545	GGT	2	6	156134	156139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728245
3103	NC_022545	A	6	6	156591	156596	100 %	0 %	0 %	0 %	549728246
3104	NC_022545	TGC	2	6	156611	156616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728246
3105	NC_022545	T	6	6	156633	156638	0 %	100 %	0 %	0 %	549728246
3106	NC_022545	GTG	2	6	156674	156679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728246
3107	NC_022545	CAA	2	6	156698	156703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728246
3108	NC_022545	CGC	2	6	156809	156814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728246
3109	NC_022545	CAT	2	6	156839	156844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728246
3110	NC_022545	ATG	2	6	156873	156878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728246
3111	NC_022545	TGC	2	6	156881	156886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728246
3112	NC_022545	GAAG	2	8	156917	156924	50 %	0 %	50 %	0 %	549728246
3113	NC_022545	CAA	2	6	156938	156943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728246
3114	NC_022545	GGCA	2	8	156956	156963	25 %	0 %	50 %	25 %	549728246
3115	NC_022545	TCG	2	6	156964	156969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728246
3116	NC_022545	TAT	2	6	156972	156977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549728246
3117	NC_022545	ACA	2	6	157039	157044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728246
3118	NC_022545	GGCC	2	8	157061	157068	0 %	0 %	50 %	50 %	549728246
3119	NC_022545	GCC	2	6	157074	157079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728246
3120	NC_022545	CCG	2	6	157083	157088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728246
3121	NC_022545	GCC	2	6	157113	157118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728246
3122	NC_022545	CGC	2	6	157196	157201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728246
3123	NC_022545	AAC	2	6	157206	157211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728246
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3125	NC_022545	CGG	2	6	157241	157246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728246
3126	NC_022545	GGC	2	6	157338	157343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728246
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3129	NC_022545	ATC	2	6	157422	157427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728246
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3145	NC_022545	TCT	2	6	158041	158046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728247
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3153	NC_022545	GTG	2	6	158253	158258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728247
3154	NC_022545	ATG	2	6	158283	158288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728247
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3191	NC_022545	TGG	2	6	159374	159379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728248
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3226	NC_022545	CGGC	2	8	160855	160862	0 %	0 %	50 %	50 %	549728250
3227	NC_022545	ATC	2	6	160963	160968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728250
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3232	NC_022545	CCG	2	6	161566	161571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728251
3233	NC_022545	TCT	2	6	161593	161598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728251
3234	NC_022545	C	6	6	161614	161619	0 %	0 %	0 %	100 %	549728251
3235	NC_022545	CGG	2	6	161656	161661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728251
3236	NC_022545	CGG	2	6	161801	161806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728251
3237	NC_022545	CAG	2	6	161807	161812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728251
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3239	NC_022545	CGG	2	6	161890	161895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728251
3240	NC_022545	GAA	2	6	161909	161914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728251
3241	NC_022545	TGA	2	6	162001	162006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728251
3242	NC_022545	CGCGCA	2	12	162016	162027	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549728251
3243	NC_022545	GCC	2	6	162042	162047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728251
3244	NC_022545	TCC	2	6	162057	162062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728251
3245	NC_022545	GGC	2	6	162125	162130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728251
3246	NC_022545	GCAA	2	8	162150	162157	50 %	0 %	25 %	25 %	549728251
3247	NC_022545	GTT	2	6	162161	162166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728251
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3249	NC_022545	GCA	3	9	162503	162511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728252
3250	NC_022545	CGG	2	6	162521	162526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728252
3251	NC_022545	A	6	6	162589	162594	100 %	0 %	0 %	0 %	549728252
3252	NC_022545	GGC	2	6	162606	162611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728252
3253	NC_022545	CGG	2	6	162705	162710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728252
3254	NC_022545	AGA	2	6	162737	162742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728252
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3256	NC_022545	AAG	2	6	162883	162888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728252
3257	NC_022545	CGC	2	6	162918	162923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728252
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3259	NC_022545	GCG	2	6	163067	163072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728252
3260	NC_022545	GAG	2	6	163086	163091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728252
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3262	NC_022545	CGG	2	6	163154	163159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728252
3263	NC_022545	GGT	2	6	163160	163165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728252
3264	NC_022545	GCCA	2	8	163235	163242	25 %	0 %	25 %	50 %	549728252
3265	NC_022545	GCC	2	6	163258	163263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728252
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3270	NC_022545	AGC	3	9	163417	163425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728252
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3272	NC_022545	GCC	2	6	163464	163469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728252
3273	NC_022545	ACC	2	6	163495	163500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728252
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3280	NC_022545	TCT	2	6	163881	163886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728253
3281	NC_022545	CTT	2	6	163962	163967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728253
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3289	NC_022545	CGG	2	6	164467	164472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728254
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3312	NC_022545	AG	3	6	165791	165796	50 %	0 %	50 %	0 %	549728255
3313	NC_022545	CCA	2	6	165811	165816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728255
3314	NC_022545	AGCC	2	8	165837	165844	25 %	0 %	25 %	50 %	549728255
3315	NC_022545	CGGGC	2	10	165884	165893	0 %	0 %	60 %	40 %	549728255
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3319	NC_022545	GCCGA	2	10	166017	166026	20 %	0 %	40 %	40 %	549728255
3320	NC_022545	TGCCCT	2	12	166027	166038	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	549728255
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3326	NC_022545	GC	3	6	166200	166205	0 %	0 %	50 %	50 %	549728255
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3331	NC_022545	GGCC	2	8	166714	166721	0 %	0 %	50 %	50 %	549728256
3332	NC_022545	CATC	2	8	166783	166790	25 %	25 %	0 %	50 %	549728256
3333	NC_022545	CCG	2	6	166803	166808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728256
3334	NC_022545	GGT	2	6	166837	166842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728256
3335	NC_022545	TGA	2	6	166885	166890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728256
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3341	NC_022545	TCA	2	6	167134	167139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728256
3342	NC_022545	CG	4	8	167293	167300	0 %	0 %	50 %	50 %	549728256
3343	NC_022545	CTT	2	6	167396	167401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728256
3344	NC_022545	AAGC	2	8	167500	167507	50 %	0 %	25 %	25 %	549728256
3345	NC_022545	ATA	2	6	167546	167551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549728256
3346	NC_022545	ACG	2	6	167601	167606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728256
3347	NC_022545	TGA	2	6	167650	167655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728256
3348	NC_022545	GTC	2	6	167673	167678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728256
3349	NC_022545	TGT	2	6	168253	168258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728257
3350	NC_022545	GCG	2	6	168281	168286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728257
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3352	NC_022545	TCG	2	6	168591	168596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728257
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3356	NC_022545	CGG	2	6	168720	168725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728257
3357	NC_022545	TCG	2	6	168729	168734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728257
3358	NC_022545	TCA	2	6	168783	168788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728257
3359	NC_022545	ATA	2	6	168810	168815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549728257
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3361	NC_022545	GC	3	6	168901	168906	0 %	0 %	50 %	50 %	549728257
3362	NC_022545	CGA	2	6	168991	168996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728257
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3385	NC_022545	GCC	2	6	170202	170207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728258
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3467	NC_022545	GCGA	2	8	174096	174103	25 %	0 %	50 %	25 %	549728262
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3481	NC_022545	GGA	2	6	174524	174529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728262
3482	NC_022545	GCC	2	6	174540	174545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728262
3483	NC_022545	ACC	2	6	174585	174590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728262
3484	NC_022545	GCC	2	6	174644	174649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728262
3485	NC_022545	AGA	2	6	174675	174680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728262
3486	NC_022545	CGGC	2	8	174735	174742	0 %	0 %	50 %	50 %	549728262
3487	NC_022545	TGG	2	6	174787	174792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728262
3488	NC_022545	GCCGC	2	10	174910	174919	0 %	0 %	40 %	60 %	549728262
3489	NC_022545	GC	3	6	174931	174936	0 %	0 %	50 %	50 %	549728262
3490	NC_022545	CGG	2	6	174937	174942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728262
3491	NC_022545	GCG	3	9	175024	175032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728262
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3493	NC_022545	GGAGAA	2	12	175175	175186	50 %	0 %	50 %	0 %	549728262
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3495	NC_022545	CTG	2	6	175244	175249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728262
3496	NC_022545	GCT	2	6	175271	175276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728262
3497	NC_022545	TTCG	2	8	175322	175329	0 %	50 %	25 %	25 %	549728262
3498	NC_022545	CAG	2	6	175376	175381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728262
3499	NC_022545	CGC	2	6	175382	175387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728262
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