MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 40094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022545	CTG	2	6	128287	128292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728218
2502	NC_022545	CCG	2	6	128323	128328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728218
2503	NC_022545	CGG	2	6	128361	128366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728218
2504	NC_022545	CGA	2	6	128380	128385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728218
2505	NC_022545	GAT	2	6	128399	128404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728218
2506	NC_022545	GGC	2	6	128456	128461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728218
2507	NC_022545	TCA	2	6	128470	128475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728218
2508	NC_022545	CTG	2	6	128480	128485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728218
2509	NC_022545	CAT	2	6	128513	128518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728218
2510	NC_022545	GAA	3	9	128522	128530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728218
2511	NC_022545	GCC	2	6	128563	128568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728218
2512	NC_022545	GAA	2	6	128570	128575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728218
2513	NC_022545	CGG	2	6	128632	128637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728218
2514	NC_022545	GGC	2	6	128713	128718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728218
2515	NC_022545	GGA	2	6	128728	128733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728218
2516	NC_022545	ACG	2	6	128736	128741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728218
2517	NC_022545	CTG	2	6	128846	128851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728218
2518	NC_022545	GAA	2	6	128993	128998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728219
2519	NC_022545	GGCC	2	8	129037	129044	0 %	0 %	50 %	50 %	549728219
2520	NC_022545	GCCACG	2	12	129045	129056	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549728219
2521	NC_022545	CGT	2	6	129142	129147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728219
2522	NC_022545	CCT	2	6	129181	129186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728219
2523	NC_022545	TCA	2	6	129207	129212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728219
2524	NC_022545	ACC	2	6	129345	129350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728219
2525	NC_022545	GGC	2	6	129398	129403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728219
2526	NC_022545	GAA	2	6	129416	129421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728219
2527	NC_022545	GCC	2	6	129710	129715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728219
2528	NC_022545	GCT	2	6	129721	129726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728219
2529	NC_022545	CGCC	2	8	129730	129737	0 %	0 %	25 %	75 %	549728219
2530	NC_022545	CGC	2	6	129745	129750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728219
2531	NC_022545	T	6	6	129801	129806	0 %	100 %	0 %	0 %	549728219
2532	NC_022545	TTG	2	6	129825	129830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728219
2533	NC_022545	CAGCGT	2	12	129872	129883	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549728219
2534	NC_022545	TGG	2	6	129913	129918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728219
2535	NC_022545	TCC	2	6	129996	130001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728220
2536	NC_022545	CCT	2	6	130094	130099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728220
2537	NC_022545	CCG	2	6	130180	130185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728220
2538	NC_022545	CTT	2	6	130292	130297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728220
2539	NC_022545	CGA	2	6	130340	130345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728220
2540	NC_022545	AG	3	6	130369	130374	50 %	0 %	50 %	0 %	549728220
2541	NC_022545	CGTG	2	8	130394	130401	0 %	25 %	50 %	25 %	549728220
2542	NC_022545	GAG	2	6	130419	130424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728220
2543	NC_022545	ATG	2	6	130465	130470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728220
2544	NC_022545	CGC	2	6	130532	130537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728220
2545	NC_022545	GGC	2	6	130545	130550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728220
2546	NC_022545	CAC	2	6	130689	130694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728220
2547	NC_022545	GC	3	6	130815	130820	0 %	0 %	50 %	50 %	549728220
2548	NC_022545	TTC	3	9	130929	130937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728221
2549	NC_022545	GGT	2	6	130988	130993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728221
2550	NC_022545	GTC	2	6	131010	131015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728221
2551	NC_022545	TCA	2	6	131086	131091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728221
2552	NC_022545	TCA	2	6	131110	131115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728221
2553	NC_022545	CAC	2	6	131172	131177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728221
2554	NC_022545	CGC	2	6	131216	131221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728221
2555	NC_022545	GCGG	2	8	131233	131240	0 %	0 %	75 %	25 %	549728222
2556	NC_022545	CAC	2	6	131270	131275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728222
2557	NC_022545	TCG	2	6	131301	131306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728222
2558	NC_022545	GC	3	6	131334	131339	0 %	0 %	50 %	50 %	549728222
2559	NC_022545	CTT	2	6	131468	131473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728222
2560	NC_022545	CGC	2	6	131491	131496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728222
2561	NC_022545	AGC	2	6	131509	131514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728222
2562	NC_022545	AG	3	6	131540	131545	50 %	0 %	50 %	0 %	549728222
2563	NC_022545	GAT	2	6	131570	131575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728222
2564	NC_022545	CGGA	2	8	131608	131615	25 %	0 %	50 %	25 %	549728222
2565	NC_022545	CAG	2	6	131621	131626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728222
2566	NC_022545	TGT	2	6	131698	131703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728222
2567	NC_022545	GCG	2	6	131736	131741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728222
2568	NC_022545	CCA	2	6	131746	131751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728222
2569	NC_022545	GCC	2	6	131771	131776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728222
2570	NC_022545	CGG	3	9	131779	131787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728222
2571	NC_022545	CGG	2	6	131818	131823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728222
2572	NC_022545	GCC	2	6	131877	131882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728222
2573	NC_022545	GCC	2	6	131892	131897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728222
2574	NC_022545	CGTC	2	8	131959	131966	0 %	25 %	25 %	50 %	549728222
2575	NC_022545	GC	4	8	132063	132070	0 %	0 %	50 %	50 %	549728222
2576	NC_022545	GAC	2	6	132197	132202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728222
2577	NC_022545	TGT	2	6	132208	132213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728222
2578	NC_022545	CGT	2	6	132310	132315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728222
2579	NC_022545	TGCGC	2	10	132460	132469	0 %	20 %	40 %	40 %	549728222
2580	NC_022545	GACC	2	8	132511	132518	25 %	0 %	25 %	50 %	549728222
2581	NC_022545	GCC	2	6	132530	132535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728222
2582	NC_022545	AGA	2	6	132552	132557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728222
2583	NC_022545	GCA	2	6	132848	132853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728223
2584	NC_022545	CGT	2	6	132891	132896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728223
2585	NC_022545	ATC	2	6	132897	132902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728223
2586	NC_022545	TCA	2	6	132907	132912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728223
2587	NC_022545	GCA	2	6	132923	132928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728223
2588	NC_022545	TCGA	2	8	132934	132941	25 %	25 %	25 %	25 %	549728223
2589	NC_022545	CGG	2	6	132984	132989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728223
2590	NC_022545	GTC	2	6	133014	133019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728223
2591	NC_022545	GGC	3	9	133080	133088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728223
2592	NC_022545	CAG	2	6	133158	133163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728223
2593	NC_022545	TCA	2	6	133174	133179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728223
2594	NC_022545	GCG	2	6	133275	133280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728223
2595	NC_022545	GAA	2	6	133314	133319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728223
2596	NC_022545	CCA	2	6	133352	133357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728223
2597	NC_022545	GCG	2	6	133412	133417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728223
2598	NC_022545	GCT	2	6	133451	133456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728223
2599	NC_022545	GCG	2	6	133487	133492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728223
2600	NC_022545	GAT	2	6	133494	133499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728223
2601	NC_022545	CATT	2	8	133511	133518	25 %	50 %	0 %	25 %	549728223
2602	NC_022545	CGA	2	6	133566	133571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728223
2603	NC_022545	ATG	3	9	133660	133668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728223
2604	NC_022545	GAT	2	6	133671	133676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728223
2605	NC_022545	CGG	3	9	133684	133692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728223
2606	NC_022545	TTC	2	6	133732	133737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728223
2607	NC_022545	TCT	2	6	133763	133768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728223
2608	NC_022545	CGGG	2	8	133809	133816	0 %	0 %	75 %	25 %	549728223
2609	NC_022545	CGA	2	6	133823	133828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728223
2610	NC_022545	TTC	2	6	133839	133844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728223
2611	NC_022545	TCG	2	6	133988	133993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728224
2612	NC_022545	T	6	6	134007	134012	0 %	100 %	0 %	0 %	549728224
2613	NC_022545	GC	3	6	134195	134200	0 %	0 %	50 %	50 %	549728224
2614	NC_022545	GCC	2	6	134223	134228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728224
2615	NC_022545	ATC	2	6	134245	134250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728224
2616	NC_022545	CGTCG	2	10	134274	134283	0 %	20 %	40 %	40 %	549728224
2617	NC_022545	AGC	2	6	134437	134442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728224
2618	NC_022545	GC	3	6	134471	134476	0 %	0 %	50 %	50 %	549728224
2619	NC_022545	CAC	2	6	134484	134489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728224
2620	NC_022545	GAC	2	6	134526	134531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728224
2621	NC_022545	CG	3	6	134598	134603	0 %	0 %	50 %	50 %	549728224
2622	NC_022545	CAC	2	6	134604	134609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728224
2623	NC_022545	GCC	2	6	134625	134630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728224
2624	NC_022545	TGC	2	6	134660	134665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728224
2625	NC_022545	GCA	2	6	134840	134845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728224
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2652	NC_022545	GC	3	6	135985	135990	0 %	0 %	50 %	50 %	549728226
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2739	NC_022545	TCTGG	2	10	140031	140040	0 %	40 %	40 %	20 %	549728229
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2741	NC_022545	GCT	2	6	140184	140189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728229
2742	NC_022545	TCG	2	6	140192	140197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728229
2743	NC_022545	CGG	2	6	140223	140228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728229
2744	NC_022545	CATTGC	2	12	140229	140240	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549728229
2745	NC_022545	CAT	2	6	140283	140288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728229
2746	NC_022545	ATC	2	6	140290	140295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728229
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2748	NC_022545	GCC	2	6	140313	140318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728229
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2751	NC_022545	CTT	2	6	140388	140393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728229
2752	NC_022545	GCT	2	6	140430	140435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728229
2753	NC_022545	CAT	4	12	140439	140450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728229
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2755	NC_022545	GATG	2	8	140538	140545	25 %	25 %	50 %	0 %	549728229
2756	NC_022545	ATCT	2	8	140569	140576	25 %	50 %	0 %	25 %	549728229
2757	NC_022545	TC	3	6	140589	140594	0 %	50 %	0 %	50 %	549728229
2758	NC_022545	CTTC	2	8	140631	140638	0 %	50 %	0 %	50 %	549728229
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2764	NC_022545	ATC	2	6	140767	140772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728229
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2783	NC_022545	GCT	2	6	141447	141452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728230
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2858	NC_022545	CGGC	2	8	144982	144989	0 %	0 %	50 %	50 %	549728234
2859	NC_022545	GAT	2	6	145007	145012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728234
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2861	NC_022545	TGG	2	6	145066	145071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728234
2862	NC_022545	CCG	2	6	145132	145137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728234
2863	NC_022545	CG	3	6	145150	145155	0 %	0 %	50 %	50 %	549728234
2864	NC_022545	GCA	2	6	145170	145175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728234
2865	NC_022545	GAA	2	6	145190	145195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728234
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2870	NC_022545	AAGG	2	8	145355	145362	50 %	0 %	50 %	0 %	549728234
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2880	NC_022545	CCG	2	6	145700	145705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728234
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2882	NC_022545	GC	3	6	145730	145735	0 %	0 %	50 %	50 %	549728234
2883	NC_022545	CCGGC	2	10	145741	145750	0 %	0 %	40 %	60 %	549728234
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2892	NC_022545	TCG	2	6	146300	146305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728235
2893	NC_022545	GGCAAT	2	12	146373	146384	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549728235
2894	NC_022545	CGA	2	6	146438	146443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728235
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2980	NC_022545	GTGATG	2	12	150443	150454	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	549728239
2981	NC_022545	TCC	2	6	150513	150518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728239
2982	NC_022545	CCT	2	6	150535	150540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728239
2983	NC_022545	CCGG	2	8	150567	150574	0 %	0 %	50 %	50 %	549728239
2984	NC_022545	CCA	2	6	150616	150621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728239
2985	NC_022545	CAC	2	6	150692	150697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728239
2986	NC_022545	CGA	2	6	150766	150771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728239
2987	NC_022545	GTG	2	6	150774	150779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728239
2988	NC_022545	GAT	2	6	150821	150826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728239
2989	NC_022545	CGA	2	6	150838	150843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728239
2990	NC_022545	CGG	3	9	150853	150861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728239
2991	NC_022545	AGA	2	6	150894	150899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728239
2992	NC_022545	CG	3	6	150968	150973	0 %	0 %	50 %	50 %	549728240
2993	NC_022545	GGC	2	6	150976	150981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728240
2994	NC_022545	CGC	2	6	151006	151011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728240
2995	NC_022545	CCG	2	6	151048	151053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728240
2996	NC_022545	GAT	2	6	151058	151063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728240
2997	NC_022545	AGGAC	2	10	151093	151102	40 %	0 %	40 %	20 %	549728240
2998	NC_022545	ATGCCG	2	12	151125	151136	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549728240
2999	NC_022545	GGC	2	6	151184	151189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728240
3000	NC_022545	GCA	2	6	151195	151200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728240

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