MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 40094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_022545	CGA	2	6	105281	105286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728194
2003	NC_022545	CGG	2	6	105303	105308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728194
2004	NC_022545	ATC	2	6	105337	105342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728194
2005	NC_022545	ATG	2	6	105409	105414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728194
2006	NC_022545	AGC	3	9	105445	105453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728194
2007	NC_022545	GAT	2	6	105456	105461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728194
2008	NC_022545	TGA	2	6	105464	105469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728194
2009	NC_022545	GAT	2	6	105480	105485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728194
2010	NC_022545	ATC	2	6	105517	105522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728194
2011	NC_022545	CAGC	2	8	105549	105556	25 %	0 %	25 %	50 %	549728194
2012	NC_022545	CGC	2	6	105564	105569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728194
2013	NC_022545	CAG	2	6	105582	105587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728194
2014	NC_022545	GTG	2	6	105598	105603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728194
2015	NC_022545	CGA	2	6	105668	105673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728194
2016	NC_022545	ACGC	2	8	105729	105736	25 %	0 %	25 %	50 %	549728194
2017	NC_022545	GAT	2	6	105744	105749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728194
2018	NC_022545	CAG	2	6	105756	105761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728194
2019	NC_022545	CAG	2	6	105780	105785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728194
2020	NC_022545	ATA	2	6	105786	105791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549728194
2021	NC_022545	CGGA	2	8	105821	105828	25 %	0 %	50 %	25 %	549728194
2022	NC_022545	CGA	2	6	105845	105850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728194
2023	NC_022545	GCT	2	6	105871	105876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728194
2024	NC_022545	GCAA	2	8	105877	105884	50 %	0 %	25 %	25 %	549728194
2025	NC_022545	CGG	2	6	105902	105907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728194
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2029	NC_022545	ATC	2	6	105979	105984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728194
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2031	NC_022545	ATC	2	6	106060	106065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728194
2032	NC_022545	GCCC	2	8	106067	106074	0 %	0 %	25 %	75 %	549728194
2033	NC_022545	GCC	2	6	106110	106115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728194
2034	NC_022545	TGACC	2	10	106139	106148	20 %	20 %	20 %	40 %	549728194
2035	NC_022545	CCG	2	6	106153	106158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728194
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2041	NC_022545	ATCAGC	2	12	106378	106389	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549728194
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2043	NC_022545	CGA	2	6	106481	106486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728195
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2047	NC_022545	CCCG	2	8	106548	106555	0 %	0 %	25 %	75 %	549728195
2048	NC_022545	TCG	2	6	106574	106579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728195
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2051	NC_022545	CAT	2	6	106689	106694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728195
2052	NC_022545	CGG	2	6	106742	106747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728195
2053	NC_022545	ATG	2	6	106756	106761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728195
2054	NC_022545	CGA	2	6	106844	106849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728195
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2064	NC_022545	ACA	2	6	107384	107389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728196
2065	NC_022545	CATCGG	2	12	107419	107430	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549728196
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2104	NC_022545	ACGGA	2	10	109136	109145	40 %	0 %	40 %	20 %	549728198
2105	NC_022545	CGC	2	6	109211	109216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728198
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2118	NC_022545	GCG	2	6	109682	109687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728198
2119	NC_022545	GC	3	6	109758	109763	0 %	0 %	50 %	50 %	549728198
2120	NC_022545	AGC	2	6	109788	109793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728198
2121	NC_022545	AGCC	2	8	109953	109960	25 %	0 %	25 %	50 %	549728198
2122	NC_022545	CGG	2	6	109978	109983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728198
2123	NC_022545	CGT	2	6	110029	110034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728198
2124	NC_022545	CCA	2	6	110047	110052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728198
2125	NC_022545	CCG	2	6	110063	110068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728198
2126	NC_022545	TGCG	2	8	110124	110131	0 %	25 %	50 %	25 %	549728198
2127	NC_022545	GCG	2	6	110244	110249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728199
2128	NC_022545	CG	3	6	110248	110253	0 %	0 %	50 %	50 %	549728199
2129	NC_022545	ACCGG	2	10	110255	110264	20 %	0 %	40 %	40 %	549728199
2130	NC_022545	AGA	2	6	110349	110354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728199
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2132	NC_022545	CCG	2	6	110513	110518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728199
2133	NC_022545	TCG	2	6	110612	110617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728199
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2137	NC_022545	CTT	2	6	110701	110706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728199
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2141	NC_022545	GC	3	6	111200	111205	0 %	0 %	50 %	50 %	549728200
2142	NC_022545	CAGC	2	8	111206	111213	25 %	0 %	25 %	50 %	549728200
2143	NC_022545	CCG	3	9	111250	111258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728200
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2145	NC_022545	CG	3	6	111356	111361	0 %	0 %	50 %	50 %	549728200
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2149	NC_022545	GAC	2	6	111536	111541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728200
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2152	NC_022545	GTG	2	6	111588	111593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728200
2153	NC_022545	CGG	2	6	111666	111671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728200
2154	NC_022545	ATG	2	6	111672	111677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728200
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2225	NC_022545	GGC	2	6	115181	115186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728206
2226	NC_022545	TGCAC	2	10	115188	115197	20 %	20 %	20 %	40 %	549728206
2227	NC_022545	CGCC	2	8	115267	115274	0 %	0 %	25 %	75 %	549728206
2228	NC_022545	CG	3	6	115305	115310	0 %	0 %	50 %	50 %	549728206
2229	NC_022545	GAA	2	6	115317	115322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728206
2230	NC_022545	CCA	2	6	115330	115335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728206
2231	NC_022545	CCGA	2	8	115404	115411	25 %	0 %	25 %	50 %	549728206
2232	NC_022545	GC	3	6	115465	115470	0 %	0 %	50 %	50 %	549728206
2233	NC_022545	GGC	2	6	115481	115486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728206
2234	NC_022545	AG	3	6	115487	115492	50 %	0 %	50 %	0 %	549728206
2235	NC_022545	GCC	2	6	115503	115508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728206
2236	NC_022545	CGG	2	6	115519	115524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728206
2237	NC_022545	CGG	3	9	115549	115557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728206
2238	NC_022545	GCCT	2	8	115563	115570	0 %	25 %	25 %	50 %	549728206
2239	NC_022545	A	6	6	115671	115676	100 %	0 %	0 %	0 %	549728206
2240	NC_022545	CGG	3	9	115678	115686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728206
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2242	NC_022545	GCA	2	6	115738	115743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728206
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2362	NC_022545	TGG	2	6	121851	121856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728211
2363	NC_022545	AT	3	6	121871	121876	50 %	50 %	0 %	0 %	549728211
2364	NC_022545	CGC	2	6	121882	121887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728211
2365	NC_022545	CCG	2	6	121928	121933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728211
2366	NC_022545	CGG	2	6	122067	122072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728211
2367	NC_022545	CGC	2	6	122101	122106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728211
2368	NC_022545	TGA	2	6	122109	122114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728211
2369	NC_022545	CTT	2	6	122302	122307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728211
2370	NC_022545	CGG	2	6	122310	122315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728211
2371	NC_022545	ATC	2	6	122323	122328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728211
2372	NC_022545	TGG	2	6	122340	122345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728211
2373	NC_022545	GCCT	2	8	122356	122363	0 %	25 %	25 %	50 %	549728211
2374	NC_022545	CGG	2	6	122595	122600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728211
2375	NC_022545	GGC	2	6	122605	122610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728211
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2382	NC_022545	CGA	2	6	123167	123172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728212
2383	NC_022545	GC	3	6	123187	123192	0 %	0 %	50 %	50 %	549728212
2384	NC_022545	CGA	2	6	123262	123267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728212
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2386	NC_022545	TGC	2	6	123373	123378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728212
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2389	NC_022545	ATG	2	6	123451	123456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728212
2390	NC_022545	GCC	2	6	123504	123509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728212
2391	NC_022545	CGA	2	6	123518	123523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728212
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2393	NC_022545	CG	4	8	123640	123647	0 %	0 %	50 %	50 %	549728212
2394	NC_022545	TGA	2	6	123658	123663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728212
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2398	NC_022545	CGG	3	9	123787	123795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728212
2399	NC_022545	AGC	2	6	123844	123849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728213
2400	NC_022545	GCTGC	2	10	123850	123859	0 %	20 %	40 %	40 %	549728213
2401	NC_022545	CGC	2	6	123862	123867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728213
2402	NC_022545	CGC	2	6	123976	123981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728213
2403	NC_022545	CTG	2	6	124012	124017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728213
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2422	NC_022545	GCT	2	6	124894	124899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728215
2423	NC_022545	GCT	2	6	124990	124995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728215
2424	NC_022545	TCA	2	6	125079	125084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728215
2425	NC_022545	GCCT	2	8	125126	125133	0 %	25 %	25 %	50 %	549728215
2426	NC_022545	CATCGG	2	12	125134	125145	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549728215
2427	NC_022545	CG	3	6	125172	125177	0 %	0 %	50 %	50 %	549728215
2428	NC_022545	CGG	2	6	125194	125199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728215
2429	NC_022545	CTT	2	6	125221	125226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728215
2430	NC_022545	GGTG	2	8	125230	125237	0 %	25 %	75 %	0 %	549728215
2431	NC_022545	GCT	2	6	125263	125268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728215
2432	NC_022545	CGC	2	6	125269	125274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728215
2433	NC_022545	CTC	2	6	125330	125335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728215
2434	NC_022545	CCG	2	6	125380	125385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728215
2435	NC_022545	TGA	3	9	125442	125450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728215
2436	NC_022545	CTGGTG	2	12	125456	125467	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	549728215
2437	NC_022545	CCA	2	6	125478	125483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728215
2438	NC_022545	CTG	2	6	125570	125575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728215
2439	NC_022545	TTCCTC	2	12	125576	125587	0 %	50 %	0 %	50 %	549728215
2440	NC_022545	TTC	2	6	125609	125614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728215
2441	NC_022545	GGC	2	6	125615	125620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728215
2442	NC_022545	CG	3	6	125643	125648	0 %	0 %	50 %	50 %	549728215
2443	NC_022545	TGC	2	6	125694	125699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728215
2444	NC_022545	GTC	3	9	125732	125740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728215
2445	NC_022545	TCT	2	6	125751	125756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728215
2446	NC_022545	TCG	2	6	125775	125780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728215
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2450	NC_022545	GCT	2	6	125938	125943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728215
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2454	NC_022545	CAG	2	6	126179	126184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728216
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2458	NC_022545	CGAC	2	8	126312	126319	25 %	0 %	25 %	50 %	549728216
2459	NC_022545	TCCGT	2	10	126333	126342	0 %	40 %	20 %	40 %	549728216
2460	NC_022545	CAA	2	6	126379	126384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728216
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2463	NC_022545	TCG	2	6	126483	126488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728216
2464	NC_022545	TGG	2	6	126543	126548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728216
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2467	NC_022545	TCAT	2	8	126630	126637	25 %	50 %	0 %	25 %	549728216
2468	NC_022545	AGGCGC	2	12	126645	126656	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	549728216
2469	NC_022545	GGCG	2	8	126679	126686	0 %	0 %	75 %	25 %	549728216
2470	NC_022545	GGC	2	6	126705	126710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728216
2471	NC_022545	CGC	2	6	126745	126750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728216
2472	NC_022545	CGG	2	6	126754	126759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728216
2473	NC_022545	TGA	2	6	126786	126791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728216
2474	NC_022545	CGA	2	6	126940	126945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728216
2475	NC_022545	GGC	2	6	127161	127166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728217
2476	NC_022545	AGCGTC	2	12	127179	127190	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549728217
2477	NC_022545	GGATC	2	10	127213	127222	20 %	20 %	40 %	20 %	549728217
2478	NC_022545	CGG	2	6	127241	127246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728217
2479	NC_022545	GAT	2	6	127301	127306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728217
2480	NC_022545	CAG	2	6	127307	127312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728217
2481	NC_022545	CAGC	2	8	127414	127421	25 %	0 %	25 %	50 %	549728217
2482	NC_022545	GGC	2	6	127430	127435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728217
2483	NC_022545	GAT	2	6	127595	127600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728217
2484	NC_022545	TGA	2	6	127645	127650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728217
2485	NC_022545	CGG	2	6	127676	127681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728217
2486	NC_022545	GAAGGC	2	12	127724	127735	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	549728217
2487	NC_022545	CGG	2	6	127823	127828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728217
2488	NC_022545	GAG	2	6	127836	127841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728217
2489	NC_022545	GACG	2	8	127943	127950	25 %	0 %	50 %	25 %	549728217
2490	NC_022545	A	6	6	127966	127971	100 %	0 %	0 %	0 %	549728217
2491	NC_022545	GAG	2	6	127977	127982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728217
2492	NC_022545	TGACGT	2	12	127984	127995	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549728217
2493	NC_022545	GCC	2	6	128003	128008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728217
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2495	NC_022545	CGA	2	6	128083	128088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728217
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2497	NC_022545	AGGA	2	8	128115	128122	50 %	0 %	50 %	0 %	549728217
2498	NC_022545	CAG	2	6	128150	128155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728217
2499	NC_022545	CGA	2	6	128254	128259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728217
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