MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 40094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022545	CCG	2	6	273502	273507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728352
5502	NC_022545	ATG	2	6	273678	273683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728352
5503	NC_022545	CAT	2	6	273716	273721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728352
5504	NC_022545	CAC	2	6	273770	273775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728352
5505	NC_022545	GAAG	2	8	273848	273855	50 %	0 %	50 %	0 %	549728352
5506	NC_022545	CGA	2	6	273887	273892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728352
5507	NC_022545	GCC	2	6	273906	273911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728352
5508	NC_022545	GCC	2	6	273915	273920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728352
5509	NC_022545	TGCCT	2	10	273957	273966	0 %	40 %	20 %	40 %	549728352
5510	NC_022545	TCG	2	6	274075	274080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728352
5511	NC_022545	GAA	2	6	274146	274151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728352
5512	NC_022545	GCC	2	6	274156	274161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728352
5513	NC_022545	TGG	2	6	274165	274170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728352
5514	NC_022545	AGC	2	6	274171	274176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728352
5515	NC_022545	AGC	2	6	274210	274215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728352
5516	NC_022545	GAC	2	6	274218	274223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728352
5517	NC_022545	CGG	2	6	274262	274267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728352
5518	NC_022545	CGC	2	6	274347	274352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728352
5519	NC_022545	CAG	2	6	274648	274653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728353
5520	NC_022545	CCG	2	6	274666	274671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728353
5521	NC_022545	TCC	2	6	274692	274697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728353
5522	NC_022545	GCC	2	6	274698	274703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728353
5523	NC_022545	GGT	2	6	274709	274714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728353
5524	NC_022545	TGC	3	9	274762	274770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728353
5525	NC_022545	TCG	2	6	274800	274805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728353
5526	NC_022545	TCA	2	6	274842	274847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728353
5527	NC_022545	CGC	2	6	274903	274908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728353
5528	NC_022545	GCC	2	6	274958	274963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728353
5529	NC_022545	TGC	2	6	275084	275089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728353
5530	NC_022545	ATA	2	6	275096	275101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549728353
5531	NC_022545	CGG	2	6	275115	275120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728353
5532	NC_022545	ACC	2	6	275163	275168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728353
5533	NC_022545	TGG	2	6	275404	275409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728353
5534	NC_022545	AGC	2	6	275427	275432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728353
5535	NC_022545	CGCT	2	8	275433	275440	0 %	25 %	25 %	50 %	549728353
5536	NC_022545	CGCCA	2	10	275860	275869	20 %	0 %	20 %	60 %	549728354
5537	NC_022545	TTC	2	6	275888	275893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728354
5538	NC_022545	TGT	2	6	275922	275927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728354
5539	NC_022545	ACC	2	6	275932	275937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728354
5540	NC_022545	CAT	2	6	275943	275948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728354
5541	NC_022545	GC	3	6	275959	275964	0 %	0 %	50 %	50 %	549728354
5542	NC_022545	TGC	2	6	276077	276082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728354
5543	NC_022545	GCG	3	9	276185	276193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728354
5544	NC_022545	CGC	2	6	276309	276314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728354
5545	NC_022545	TGGT	2	8	276400	276407	0 %	50 %	50 %	0 %	549728354
5546	NC_022545	CGC	2	6	276497	276502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728354
5547	NC_022545	ATA	2	6	276539	276544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549728354
5548	NC_022545	CCG	2	6	276575	276580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728354
5549	NC_022545	CAG	2	6	276589	276594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728354
5550	NC_022545	GGC	2	6	276622	276627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728354
5551	NC_022545	GTCCC	2	10	276662	276671	0 %	20 %	20 %	60 %	549728354
5552	NC_022545	CTG	2	6	276685	276690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728354
5553	NC_022545	A	6	6	276744	276749	100 %	0 %	0 %	0 %	549728355
5554	NC_022545	GGC	3	9	276753	276761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728355
5555	NC_022545	GCC	2	6	276921	276926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728355
5556	NC_022545	AGG	2	6	276958	276963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728355
5557	NC_022545	GAA	2	6	276968	276973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728355
5558	NC_022545	TCG	2	6	276979	276984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728355
5559	NC_022545	TGG	2	6	277030	277035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728355
5560	NC_022545	GTG	2	6	277041	277046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728355
5561	NC_022545	ATG	2	6	277047	277052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728355
5562	NC_022545	TGG	2	6	277108	277113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728355
5563	NC_022545	CGG	2	6	277175	277180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728355
5564	NC_022545	AGA	2	6	277183	277188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728355
5565	NC_022545	GT	3	6	277192	277197	0 %	50 %	50 %	0 %	549728355
5566	NC_022545	CG	3	6	277206	277211	0 %	0 %	50 %	50 %	549728355
5567	NC_022545	CTG	2	6	277236	277241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728355
5568	NC_022545	GAC	2	6	277268	277273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728355
5569	NC_022545	GGA	2	6	277274	277279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728355
5570	NC_022545	TCG	2	6	277285	277290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728355
5571	NC_022545	CGA	2	6	277310	277315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728355
5572	NC_022545	CCAC	2	8	277336	277343	25 %	0 %	0 %	75 %	549728355
5573	NC_022545	CGG	2	6	277457	277462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728355
5574	NC_022545	CGG	2	6	277484	277489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728355
5575	NC_022545	CGC	2	6	277518	277523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728355
5576	NC_022545	GAT	2	6	277617	277622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728355
5577	NC_022545	CTT	2	6	277630	277635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728356
5578	NC_022545	TGG	2	6	277685	277690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728356
5579	NC_022545	TC	3	6	277707	277712	0 %	50 %	0 %	50 %	549728356
5580	NC_022545	TC	3	6	277827	277832	0 %	50 %	0 %	50 %	549728356
5581	NC_022545	CGG	2	6	277833	277838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728356
5582	NC_022545	GGC	2	6	277842	277847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728356
5583	NC_022545	AGA	2	6	277871	277876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728356
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5586	NC_022545	CGG	2	6	278040	278045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728356
5587	NC_022545	CCT	2	6	278052	278057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728356
5588	NC_022545	TGG	2	6	278087	278092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728356
5589	NC_022545	TTC	2	6	278095	278100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728356
5590	NC_022545	TCT	2	6	278153	278158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728356
5591	NC_022545	CTG	2	6	278164	278169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728356
5592	NC_022545	GCC	2	6	278170	278175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728356
5593	NC_022545	GCC	2	6	278185	278190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728356
5594	NC_022545	TCG	3	9	278213	278221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728356
5595	NC_022545	TGG	2	6	278225	278230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728356
5596	NC_022545	GACC	2	8	278259	278266	25 %	0 %	25 %	50 %	549728356
5597	NC_022545	TGA	2	6	278285	278290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728356
5598	NC_022545	TCA	2	6	278294	278299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728356
5599	NC_022545	CCA	2	6	278309	278314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728356
5600	NC_022545	CGG	2	6	278358	278363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728356
5601	NC_022545	GTG	2	6	278371	278376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728356
5602	NC_022545	GCC	2	6	278398	278403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728356
5603	NC_022545	GC	3	6	278449	278454	0 %	0 %	50 %	50 %	549728356
5604	NC_022545	GC	3	6	278456	278461	0 %	0 %	50 %	50 %	549728356
5605	NC_022545	GGA	2	6	278463	278468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728356
5606	NC_022545	TGA	2	6	278548	278553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728357
5607	NC_022545	TGC	2	6	278635	278640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728357
5608	NC_022545	GTG	3	9	278646	278654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728357
5609	NC_022545	TCA	2	6	278728	278733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728357
5610	NC_022545	AGG	2	6	278752	278757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728357
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5612	NC_022545	TGC	2	6	279007	279012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728357
5613	NC_022545	CTG	2	6	279021	279026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728357
5614	NC_022545	GC	3	6	279052	279057	0 %	0 %	50 %	50 %	549728357
5615	NC_022545	CAT	2	6	279071	279076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728357
5616	NC_022545	TC	3	6	279077	279082	0 %	50 %	0 %	50 %	549728357
5617	NC_022545	TCG	2	6	279094	279099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728357
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5619	NC_022545	TGC	2	6	279145	279150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728357
5620	NC_022545	TGG	2	6	279151	279156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728357
5621	NC_022545	TCG	2	6	279177	279182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728357
5622	NC_022545	TCG	2	6	279259	279264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728357
5623	NC_022545	CCG	2	6	279293	279298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728357
5624	NC_022545	GCAGCC	2	12	279510	279521	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549728358
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5627	NC_022545	CGT	2	6	279602	279607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728358
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5634	NC_022545	CCG	2	6	279916	279921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728359
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5643	NC_022545	CAT	3	9	280587	280595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728360
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5650	NC_022545	CAGA	2	8	281061	281068	50 %	0 %	25 %	25 %	549728360
5651	NC_022545	AGCGC	2	10	281069	281078	20 %	0 %	40 %	40 %	549728360
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5696	NC_022545	CGAT	2	8	283464	283471	25 %	25 %	25 %	25 %	549728362
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5732	NC_022545	GAG	2	6	285400	285405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728365
5733	NC_022545	CCG	2	6	285420	285425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728365
5734	NC_022545	TCCA	2	8	285430	285437	25 %	25 %	0 %	50 %	549728365
5735	NC_022545	CGTGGC	2	12	285489	285500	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549728365
5736	NC_022545	CG	3	6	285544	285549	0 %	0 %	50 %	50 %	549728365
5737	NC_022545	CGG	2	6	285690	285695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728365
5738	NC_022545	CGA	2	6	285714	285719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728365
5739	NC_022545	AC	3	6	285803	285808	50 %	0 %	0 %	50 %	549728365
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5741	NC_022545	GAA	2	6	285895	285900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728365
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5862	NC_022545	GTC	2	6	291823	291828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728370
5863	NC_022545	T	6	6	291929	291934	0 %	100 %	0 %	0 %	549728370
5864	NC_022545	CATGT	2	10	291965	291974	20 %	40 %	20 %	20 %	549728370
5865	NC_022545	TTGCC	2	10	292097	292106	0 %	40 %	20 %	40 %	549728371
5866	NC_022545	TCG	2	6	292135	292140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728371
5867	NC_022545	TGA	2	6	292145	292150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728371
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5869	NC_022545	GGC	2	6	292332	292337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728371
5870	NC_022545	GGCG	2	8	292346	292353	0 %	0 %	75 %	25 %	549728371
5871	NC_022545	TGA	2	6	292364	292369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728371
5872	NC_022545	GCG	2	6	292379	292384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728371
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5882	NC_022545	GCC	2	6	292917	292922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728371
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5887	NC_022545	TGC	2	6	293081	293086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728371
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5982	NC_022545	CGG	2	6	296986	296991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728375
5983	NC_022545	CGG	2	6	297003	297008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728375
5984	NC_022545	CAGC	2	8	297061	297068	25 %	0 %	25 %	50 %	549728375
5985	NC_022545	CCG	2	6	297078	297083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728375
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5987	NC_022545	AT	3	6	297146	297151	50 %	50 %	0 %	0 %	549728375
5988	NC_022545	GGC	2	6	297196	297201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728375
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5999	NC_022545	CCGG	2	8	297746	297753	0 %	0 %	50 %	50 %	549728376
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