MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 40094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022545	TTCC	2	8	222790	222797	0 %	50 %	0 %	50 %	549728307
4502	NC_022545	CCGG	2	8	222873	222880	0 %	0 %	50 %	50 %	549728307
4503	NC_022545	TGCC	2	8	222903	222910	0 %	25 %	25 %	50 %	549728307
4504	NC_022545	CAG	2	6	222995	223000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728307
4505	NC_022545	CGA	2	6	223054	223059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728307
4506	NC_022545	GCC	2	6	223064	223069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728307
4507	NC_022545	CG	3	6	223090	223095	0 %	0 %	50 %	50 %	549728307
4508	NC_022545	TGA	2	6	223140	223145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728307
4509	NC_022545	CGT	3	9	223186	223194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728307
4510	NC_022545	GCC	2	6	223199	223204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728307
4511	NC_022545	TGA	2	6	223231	223236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728307
4512	NC_022545	GGCC	2	8	223439	223446	0 %	0 %	50 %	50 %	549728308
4513	NC_022545	G	6	6	223479	223484	0 %	0 %	100 %	0 %	549728308
4514	NC_022545	TGC	2	6	223508	223513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728308
4515	NC_022545	GC	4	8	223512	223519	0 %	0 %	50 %	50 %	549728308
4516	NC_022545	GGCC	2	8	223523	223530	0 %	0 %	50 %	50 %	549728308
4517	NC_022545	GGA	2	6	223577	223582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728308
4518	NC_022545	GCC	2	6	223663	223668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728308
4519	NC_022545	GGT	2	6	223692	223697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728308
4520	NC_022545	CAG	2	6	223701	223706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728308
4521	NC_022545	CCGC	2	8	223717	223724	0 %	0 %	25 %	75 %	549728308
4522	NC_022545	TGC	3	9	223747	223755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728308
4523	NC_022545	GCC	2	6	223806	223811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728308
4524	NC_022545	TTC	2	6	223846	223851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728308
4525	NC_022545	TCG	2	6	223852	223857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728308
4526	NC_022545	CAT	3	9	223898	223906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728308
4527	NC_022545	TGG	2	6	223948	223953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728308
4528	NC_022545	GTGG	2	8	223986	223993	0 %	25 %	75 %	0 %	549728308
4529	NC_022545	GAG	2	6	224315	224320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728309
4530	NC_022545	CGG	2	6	224530	224535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728309
4531	NC_022545	ATC	2	6	224562	224567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728309
4532	NC_022545	GCCG	2	8	224621	224628	0 %	0 %	50 %	50 %	549728309
4533	NC_022545	TCG	2	6	224630	224635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728309
4534	NC_022545	TGC	2	6	224643	224648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728309
4535	NC_022545	TCG	2	6	224718	224723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728309
4536	NC_022545	GCG	2	6	224728	224733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728309
4537	NC_022545	CGG	2	6	224787	224792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728309
4538	NC_022545	GGGC	2	8	224809	224816	0 %	0 %	75 %	25 %	549728309
4539	NC_022545	CGA	2	6	224842	224847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728309
4540	NC_022545	CCG	2	6	224949	224954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728309
4541	NC_022545	A	6	6	225299	225304	100 %	0 %	0 %	0 %	549728310
4542	NC_022545	TCA	2	6	225312	225317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728310
4543	NC_022545	CGG	2	6	225358	225363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728310
4544	NC_022545	GGA	2	6	225370	225375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728310
4545	NC_022545	CCT	2	6	225381	225386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728310
4546	NC_022545	AT	3	6	225394	225399	50 %	50 %	0 %	0 %	549728310
4547	NC_022545	CCA	2	6	225411	225416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728310
4548	NC_022545	GCC	2	6	225431	225436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728310
4549	NC_022545	TCA	2	6	225459	225464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728310
4550	NC_022545	CGA	2	6	225475	225480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728310
4551	NC_022545	CGTG	2	8	225529	225536	0 %	25 %	50 %	25 %	549728310
4552	NC_022545	TGC	2	6	225573	225578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728310
4553	NC_022545	GGC	2	6	225682	225687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728310
4554	NC_022545	GCAC	2	8	225705	225712	25 %	0 %	25 %	50 %	549728310
4555	NC_022545	GGCC	2	8	225823	225830	0 %	0 %	50 %	50 %	549728310
4556	NC_022545	ATGGCG	2	12	225831	225842	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549728310
4557	NC_022545	TCG	2	6	225912	225917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728310
4558	NC_022545	GAA	3	9	225923	225931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728310
4559	NC_022545	GT	3	6	226007	226012	0 %	50 %	50 %	0 %	549728310
4560	NC_022545	GGCT	2	8	226154	226161	0 %	25 %	50 %	25 %	549728310
4561	NC_022545	GCG	2	6	226164	226169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728310
4562	NC_022545	GCG	2	6	226206	226211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728310
4563	NC_022545	GCCT	2	8	226240	226247	0 %	25 %	25 %	50 %	549728310
4564	NC_022545	TTC	2	6	226274	226279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728310
4565	NC_022545	CAA	2	6	226294	226299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728310
4566	NC_022545	CGA	2	6	226417	226422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728310
4567	NC_022545	AAG	2	6	226457	226462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728310
4568	NC_022545	GACG	2	8	226523	226530	25 %	0 %	50 %	25 %	549728310
4569	NC_022545	GCC	2	6	226553	226558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728310
4570	NC_022545	GTC	2	6	226676	226681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728310
4571	NC_022545	CGA	2	6	226705	226710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728310
4572	NC_022545	GC	3	6	226723	226728	0 %	0 %	50 %	50 %	549728310
4573	NC_022545	TGC	2	6	226788	226793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728310
4574	NC_022545	CGAC	2	8	226821	226828	25 %	0 %	25 %	50 %	549728310
4575	NC_022545	CCG	2	6	226836	226841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728310
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4577	NC_022545	TGG	2	6	226886	226891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728310
4578	NC_022545	ACC	2	6	226910	226915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728310
4579	NC_022545	TCG	2	6	226974	226979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728310
4580	NC_022545	GAA	2	6	227012	227017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728310
4581	NC_022545	GGCT	2	8	227032	227039	0 %	25 %	50 %	25 %	549728310
4582	NC_022545	CGC	2	6	227086	227091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728310
4583	NC_022545	GGCT	2	8	227096	227103	0 %	25 %	50 %	25 %	549728310
4584	NC_022545	CGA	2	6	227119	227124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728310
4585	NC_022545	GC	4	8	227183	227190	0 %	0 %	50 %	50 %	549728310
4586	NC_022545	ATGA	2	8	227266	227273	50 %	25 %	25 %	0 %	549728311
4587	NC_022545	CGA	2	6	227361	227366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728311
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4591	NC_022545	CTG	2	6	227536	227541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728311
4592	NC_022545	TGC	2	6	227582	227587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728311
4593	NC_022545	CAT	2	6	227664	227669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728311
4594	NC_022545	CTT	2	6	227799	227804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728311
4595	NC_022545	GCC	2	6	227828	227833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728311
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4600	NC_022545	CGT	2	6	227976	227981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728311
4601	NC_022545	CAT	2	6	228069	228074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728311
4602	NC_022545	CAC	2	6	228126	228131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728311
4603	NC_022545	CGG	2	6	228227	228232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728311
4604	NC_022545	GCA	2	6	228310	228315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728311
4605	NC_022545	GCCGAT	2	12	228328	228339	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549728311
4606	NC_022545	CGG	2	6	228341	228346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728311
4607	NC_022545	GCCT	2	8	228371	228378	0 %	25 %	25 %	50 %	549728311
4608	NC_022545	CGT	2	6	228429	228434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728311
4609	NC_022545	CGC	2	6	228441	228446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728311
4610	NC_022545	CGG	2	6	228546	228551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728311
4611	NC_022545	ACCGG	2	10	228573	228582	20 %	0 %	40 %	40 %	549728311
4612	NC_022545	ATG	3	9	228616	228624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728311
4613	NC_022545	ACA	2	6	228683	228688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728311
4614	NC_022545	CGG	2	6	228726	228731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728311
4615	NC_022545	CAA	2	6	228741	228746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728311
4616	NC_022545	TCG	2	6	228788	228793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728311
4617	NC_022545	CGC	3	9	228861	228869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728311
4618	NC_022545	CGTCAT	2	12	228891	228902	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549728311
4619	NC_022545	TGG	2	6	228943	228948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728311
4620	NC_022545	GC	4	8	228994	229001	0 %	0 %	50 %	50 %	549728311
4621	NC_022545	GAT	2	6	229036	229041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728312
4622	NC_022545	GAC	3	9	229076	229084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728312
4623	NC_022545	TGA	2	6	229123	229128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728312
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4625	NC_022545	CGC	2	6	229209	229214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728312
4626	NC_022545	CGA	2	6	229261	229266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728312
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4634	NC_022545	CTG	2	6	229568	229573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728312
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4641	NC_022545	GGC	2	6	229795	229800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728312
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4643	NC_022545	GC	3	6	229907	229912	0 %	0 %	50 %	50 %	549728312
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4866	NC_022545	GGC	2	6	242962	242967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728325
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4982	NC_022545	CCTG	2	8	248710	248717	0 %	25 %	25 %	50 %	549728333
4983	NC_022545	GAC	2	6	248773	248778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728333
4984	NC_022545	CCG	2	6	248842	248847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728334
4985	NC_022545	ATTG	2	8	248860	248867	25 %	50 %	25 %	0 %	549728334
4986	NC_022545	CCGT	2	8	248893	248900	0 %	25 %	25 %	50 %	549728334
4987	NC_022545	GC	3	6	248927	248932	0 %	0 %	50 %	50 %	549728334
4988	NC_022545	GGC	2	6	248977	248982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728334
4989	NC_022545	TCGC	2	8	249032	249039	0 %	25 %	25 %	50 %	549728334
4990	NC_022545	TGG	2	6	249063	249068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728334
4991	NC_022545	CGG	2	6	249072	249077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728334
4992	NC_022545	TGC	2	6	249141	249146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728334
4993	NC_022545	GC	4	8	249145	249152	0 %	0 %	50 %	50 %	549728334
4994	NC_022545	CGA	2	6	249187	249192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728334
4995	NC_022545	GCT	2	6	249283	249288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728334
4996	NC_022545	GGCC	2	8	249385	249392	0 %	0 %	50 %	50 %	549728334
4997	NC_022545	TGA	2	6	249417	249422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728334
4998	NC_022545	GC	3	6	249445	249450	0 %	0 %	50 %	50 %	549728334
4999	NC_022545	TC	3	6	249502	249507	0 %	50 %	0 %	50 %	549728334
5000	NC_022545	CGC	2	6	249514	249519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728334

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