MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 1717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022535	CCTCG	2	10	1071	1080	0 %	20 %	20 %	60 %	549704412
2	NC_022535	GCCGT	2	10	2070	2079	0 %	20 %	40 %	40 %	549704413
3	NC_022535	GCCCC	2	10	3700	3709	0 %	0 %	20 %	80 %	549704416
4	NC_022535	AAAGG	2	10	4303	4312	60 %	0 %	40 %	0 %	549704417
5	NC_022535	TTGCC	2	10	4940	4949	0 %	40 %	20 %	40 %	549704418
6	NC_022535	GCATG	2	10	7268	7277	20 %	20 %	40 %	20 %	549704421
7	NC_022535	TGCTT	2	10	8886	8895	0 %	60 %	20 %	20 %	549704423
8	NC_022535	CCGCG	2	10	8944	8953	0 %	0 %	40 %	60 %	549704423
9	NC_022535	ACGCC	2	10	10176	10185	20 %	0 %	20 %	60 %	549704423
10	NC_022535	ATGAA	2	10	12307	12316	60 %	20 %	20 %	0 %	549704426
11	NC_022535	TCCGA	2	10	12594	12603	20 %	20 %	20 %	40 %	549704426
12	NC_022535	CGGGC	2	10	12791	12800	0 %	0 %	60 %	40 %	549704426
13	NC_022535	GGCGC	2	10	14524	14533	0 %	0 %	60 %	40 %	549704428
14	NC_022535	TCCTT	2	10	15888	15897	0 %	60 %	0 %	40 %	549704429
15	NC_022535	GAGCC	2	10	16210	16219	20 %	0 %	40 %	40 %	549704429
16	NC_022535	CATCG	2	10	20060	20069	20 %	20 %	20 %	40 %	549704434
17	NC_022535	CCGCG	2	10	20438	20447	0 %	0 %	40 %	60 %	549704434
18	NC_022535	GCCTT	2	10	23256	23265	0 %	40 %	20 %	40 %	549704434
19	NC_022535	CCAGA	2	10	25003	25012	40 %	0 %	20 %	40 %	549704435
20	NC_022535	CGCGC	2	10	25544	25553	0 %	0 %	40 %	60 %	549704435
21	NC_022535	CCGGG	2	10	27187	27196	0 %	0 %	60 %	40 %	549704436
22	NC_022535	CGGCG	2	10	27280	27289	0 %	0 %	60 %	40 %	549704436
23	NC_022535	TGCGC	2	10	27680	27689	0 %	20 %	40 %	40 %	549704437
24	NC_022535	CGCTG	2	10	29275	29284	0 %	20 %	40 %	40 %	549704438
25	NC_022535	GGAAG	2	10	31456	31465	40 %	0 %	60 %	0 %	549704438
26	NC_022535	AGGAG	2	10	35558	35567	40 %	0 %	60 %	0 %	549704444
27	NC_022535	CCGCG	2	10	35759	35768	0 %	0 %	40 %	60 %	549704444
28	NC_022535	GGCGC	2	10	36885	36894	0 %	0 %	60 %	40 %	549704445
29	NC_022535	TGCGC	2	10	37725	37734	0 %	20 %	40 %	40 %	549704446
30	NC_022535	AGCCG	2	10	38427	38436	20 %	0 %	40 %	40 %	549704446
31	NC_022535	GTTGC	2	10	41062	41071	0 %	40 %	40 %	20 %	549704449
32	NC_022535	TCGTC	2	10	44647	44656	0 %	40 %	20 %	40 %	549704455
33	NC_022535	GGCAG	2	10	45137	45146	20 %	0 %	60 %	20 %	549704456
34	NC_022535	TGCGC	2	10	45842	45851	0 %	20 %	40 %	40 %	549704458
35	NC_022535	CATCG	2	10	46643	46652	20 %	20 %	20 %	40 %	549704458
36	NC_022535	GATCC	2	10	47517	47526	20 %	20 %	20 %	40 %	549704459
37	NC_022535	AGGGC	2	10	48807	48816	20 %	0 %	60 %	20 %	549704460
38	NC_022535	CCGCT	2	10	48876	48885	0 %	20 %	20 %	60 %	549704460
39	NC_022535	GCCGG	2	10	49330	49339	0 %	0 %	60 %	40 %	549704460
40	NC_022535	GGTCT	2	10	52547	52556	0 %	40 %	40 %	20 %	549704463
41	NC_022535	GGATG	2	10	54249	54258	20 %	20 %	60 %	0 %	549704465
42	NC_022535	GCCGG	2	10	54358	54367	0 %	0 %	60 %	40 %	549704465
43	NC_022535	ATCCG	2	10	54483	54492	20 %	20 %	20 %	40 %	549704465
44	NC_022535	CCCGT	2	10	54771	54780	0 %	20 %	20 %	60 %	549704465
45	NC_022535	GCTCA	2	10	64180	64189	20 %	20 %	20 %	40 %	549704466
46	NC_022535	CTCGA	2	10	67854	67863	20 %	20 %	20 %	40 %	549704468
47	NC_022535	CTCTG	2	10	68781	68790	0 %	40 %	20 %	40 %	549704469
48	NC_022535	ACCGC	2	10	68802	68811	20 %	0 %	20 %	60 %	549704469
49	NC_022535	GTGCC	2	10	71670	71679	0 %	20 %	40 %	40 %	549704473
50	NC_022535	AGCGA	2	10	73111	73120	40 %	0 %	40 %	20 %	549704474
51	NC_022535	GCCAT	2	10	73319	73328	20 %	20 %	20 %	40 %	549704474
52	NC_022535	GACAA	2	10	74081	74090	60 %	0 %	20 %	20 %	549704475
53	NC_022535	TTCGG	2	10	76006	76015	0 %	40 %	40 %	20 %	549704476
54	NC_022535	ACGGC	2	10	76674	76683	20 %	0 %	40 %	40 %	549704477
55	NC_022535	TCCAG	2	10	79005	79014	20 %	20 %	20 %	40 %	549704480
56	NC_022535	TGCAT	2	10	80018	80027	20 %	40 %	20 %	20 %	549704481
57	NC_022535	GGGCA	2	10	83433	83442	20 %	0 %	60 %	20 %	549704484
58	NC_022535	CGTTT	2	10	85899	85908	0 %	60 %	20 %	20 %	549704485
59	NC_022535	CGTAG	2	10	86968	86977	20 %	20 %	40 %	20 %	549704487
60	NC_022535	AGCGA	2	10	88945	88954	40 %	0 %	40 %	20 %	549704489
61	NC_022535	GCTGG	2	10	90861	90870	0 %	20 %	60 %	20 %	549704489
62	NC_022535	CCTGC	2	10	91334	91343	0 %	20 %	20 %	60 %	549704491
63	NC_022535	CGGAC	2	10	91532	91541	20 %	0 %	40 %	40 %	549704491
64	NC_022535	CGGCC	2	10	94971	94980	0 %	0 %	40 %	60 %	549704494
65	NC_022535	GCCTT	2	10	96315	96324	0 %	40 %	20 %	40 %	549704495
66	NC_022535	GCGAT	2	10	96533	96542	20 %	20 %	40 %	20 %	549704495
67	NC_022535	TATCG	2	10	98010	98019	20 %	40 %	20 %	20 %	549704496
68	NC_022535	CATGG	2	10	98067	98076	20 %	20 %	40 %	20 %	549704496
69	NC_022535	GGCGA	2	10	98299	98308	20 %	0 %	60 %	20 %	549704497
70	NC_022535	CAGCC	2	10	98999	99008	20 %	0 %	20 %	60 %	549704498
71	NC_022535	TCGCC	2	10	101176	101185	0 %	20 %	20 %	60 %	549704499
72	NC_022535	CGCAT	2	10	102845	102854	20 %	20 %	20 %	40 %	549704502
73	NC_022535	CCTTG	2	10	105368	105377	0 %	40 %	20 %	40 %	549704505
74	NC_022535	ATGGC	2	10	105507	105516	20 %	20 %	40 %	20 %	549704505
75	NC_022535	ATGCG	2	10	107100	107109	20 %	20 %	40 %	20 %	549704506
76	NC_022535	GATCT	2	10	107909	107918	20 %	40 %	20 %	20 %	549704506
77	NC_022535	TCTGG	2	10	109062	109071	0 %	40 %	40 %	20 %	549704507
78	NC_022535	TGCGG	2	10	110818	110827	0 %	20 %	60 %	20 %	549704510
79	NC_022535	GACCA	2	10	111028	111037	40 %	0 %	20 %	40 %	549704510
80	NC_022535	GGCGC	2	10	111840	111849	0 %	0 %	60 %	40 %	549704511
81	NC_022535	CGATG	2	10	113925	113934	20 %	20 %	40 %	20 %	549704514
82	NC_022535	GAACC	2	10	115666	115675	40 %	0 %	20 %	40 %	549704514
83	NC_022535	CGCAG	2	10	120554	120563	20 %	0 %	40 %	40 %	549704518
84	NC_022535	ACGAC	2	10	121478	121487	40 %	0 %	20 %	40 %	549704519
85	NC_022535	TGGTC	2	10	121506	121515	0 %	40 %	40 %	20 %	549704519
86	NC_022535	GACCA	2	10	121762	121771	40 %	0 %	20 %	40 %	549704519
87	NC_022535	CGGCG	2	10	123130	123139	0 %	0 %	60 %	40 %	549704521
88	NC_022535	CTGCG	2	10	123989	123998	0 %	20 %	40 %	40 %	549704521
89	NC_022535	ACTTC	2	10	127687	127696	20 %	40 %	0 %	40 %	549704525
90	NC_022535	TCGAT	2	10	129011	129020	20 %	40 %	20 %	20 %	549704527
91	NC_022535	ACTTC	2	10	129420	129429	20 %	40 %	0 %	40 %	549704529
92	NC_022535	CGGTT	2	10	130924	130933	0 %	40 %	40 %	20 %	549704530
93	NC_022535	ATGAT	2	10	131182	131191	40 %	40 %	20 %	0 %	549704530
94	NC_022535	GGCGC	2	10	133072	133081	0 %	0 %	60 %	40 %	549704532
95	NC_022535	TCTGG	2	10	133434	133443	0 %	40 %	40 %	20 %	549704532
96	NC_022535	GGCGT	2	10	134173	134182	0 %	20 %	60 %	20 %	549704533
97	NC_022535	ATCCG	2	10	134884	134893	20 %	20 %	20 %	40 %	549704534
98	NC_022535	GCTCT	2	10	135133	135142	0 %	40 %	20 %	40 %	549704534
99	NC_022535	GTCGG	2	10	135504	135513	0 %	20 %	60 %	20 %	549704535
100	NC_022535	TGTCC	2	10	137062	137071	0 %	40 %	20 %	40 %	549704537
101	NC_022535	AGCAG	2	10	139324	139333	40 %	0 %	40 %	20 %	549704539
102	NC_022535	GTGCG	2	10	139608	139617	0 %	20 %	60 %	20 %	549704540
103	NC_022535	GCGCC	2	10	150214	150223	0 %	0 %	40 %	60 %	549704549
104	NC_022535	CCGAT	2	10	152232	152241	20 %	20 %	20 %	40 %	549704549
105	NC_022535	CGGTG	2	10	153616	153625	0 %	20 %	60 %	20 %	549704549
106	NC_022535	TCCGG	2	10	155212	155221	0 %	20 %	40 %	40 %	549704550
107	NC_022535	TTTCG	2	10	155784	155793	0 %	60 %	20 %	20 %	549704550
108	NC_022535	CGGCA	2	10	159314	159323	20 %	0 %	40 %	40 %	549704554
109	NC_022535	ACTTC	2	10	159970	159979	20 %	40 %	0 %	40 %	549704555
110	NC_022535	CAGGA	2	10	160263	160272	40 %	0 %	40 %	20 %	549704555
111	NC_022535	CGCGG	2	10	162914	162923	0 %	0 %	60 %	40 %	549704560
112	NC_022535	GGCCG	2	10	165770	165779	0 %	0 %	60 %	40 %	549704563
113	NC_022535	AGCGA	2	10	165886	165895	40 %	0 %	40 %	20 %	549704563
114	NC_022535	CGCTG	2	10	166540	166549	0 %	20 %	40 %	40 %	549704564
115	NC_022535	ATCGG	2	10	166553	166562	20 %	20 %	40 %	20 %	549704564
116	NC_022535	ACGGA	2	10	166599	166608	40 %	0 %	40 %	20 %	549704564
117	NC_022535	GACGC	2	10	168515	168524	20 %	0 %	40 %	40 %	549704566
118	NC_022535	GCGTC	2	10	171816	171825	0 %	20 %	40 %	40 %	549704570
119	NC_022535	GTGAA	2	10	173068	173077	40 %	20 %	40 %	0 %	549704571
120	NC_022535	CAGCG	2	10	173680	173689	20 %	0 %	40 %	40 %	549704572
121	NC_022535	CACCG	2	10	175475	175484	20 %	0 %	20 %	60 %	549704574
122	NC_022535	GTGCC	2	10	180495	180504	0 %	20 %	40 %	40 %	549704579
123	NC_022535	CGACG	2	10	183107	183116	20 %	0 %	40 %	40 %	549704582
124	NC_022535	GTGAA	2	10	186527	186536	40 %	20 %	40 %	0 %	549704586
125	NC_022535	GCGAC	2	10	187336	187345	20 %	0 %	40 %	40 %	549704587
126	NC_022535	CCGTT	2	10	190640	190649	0 %	40 %	20 %	40 %	549704590
127	NC_022535	GTGCG	2	10	194184	194193	0 %	20 %	60 %	20 %	549704593
128	NC_022535	CCGTT	2	10	197232	197241	0 %	40 %	20 %	40 %	549704595
129	NC_022535	GCGCG	2	10	201926	201935	0 %	0 %	60 %	40 %	549704599
130	NC_022535	GGCAG	2	10	203642	203651	20 %	0 %	60 %	20 %	549704601
131	NC_022535	GCCGG	2	10	205220	205229	0 %	0 %	60 %	40 %	549704602
132	NC_022535	CCGTG	2	10	207385	207394	0 %	20 %	40 %	40 %	549704606
133	NC_022535	AATGA	2	10	208760	208769	60 %	20 %	20 %	0 %	549704606
134	NC_022535	CGGCC	2	10	210101	210110	0 %	0 %	40 %	60 %	549704608
135	NC_022535	GCGCT	2	10	210456	210465	0 %	20 %	40 %	40 %	549704608
136	NC_022535	CGGTC	2	10	211690	211699	0 %	20 %	40 %	40 %	549704610
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142	NC_022535	AGGCG	2	10	222773	222782	20 %	0 %	60 %	20 %	549704620
143	NC_022535	CTTGA	2	10	222984	222993	20 %	40 %	20 %	20 %	549704620
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244	NC_022535	GCGGT	2	10	394417	394426	0 %	20 %	60 %	20 %	549704808
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246	NC_022535	ATCCG	2	10	395788	395797	20 %	20 %	20 %	40 %	549704809
247	NC_022535	ATTAT	2	10	395835	395844	40 %	60 %	0 %	0 %	549704809
248	NC_022535	CTTTC	2	10	398112	398121	0 %	60 %	0 %	40 %	549704812
249	NC_022535	GTTCA	2	10	399782	399791	20 %	40 %	20 %	20 %	549704813
250	NC_022535	CGGAA	2	10	400137	400146	40 %	0 %	40 %	20 %	549704813
251	NC_022535	ATCGC	2	10	404013	404022	20 %	20 %	20 %	40 %	549704815
252	NC_022535	GCCTT	2	10	404786	404795	0 %	40 %	20 %	40 %	549704816
253	NC_022535	GGTGG	2	10	405478	405487	0 %	20 %	80 %	0 %	549704816
254	NC_022535	GGGCA	2	10	406117	406126	20 %	0 %	60 %	20 %	549704818
255	NC_022535	CGCGG	2	10	406255	406264	0 %	0 %	60 %	40 %	549704818
256	NC_022535	CGATC	2	10	407058	407067	20 %	20 %	20 %	40 %	549704818
257	NC_022535	GTTTT	2	10	408444	408453	0 %	80 %	20 %	0 %	549704819
258	NC_022535	CGGCA	2	10	411453	411462	20 %	0 %	40 %	40 %	549704824
259	NC_022535	CGGCG	2	10	412444	412453	0 %	0 %	60 %	40 %	549704825
260	NC_022535	GGCAA	2	10	412834	412843	40 %	0 %	40 %	20 %	549704825
261	NC_022535	GAAGA	2	10	416357	416366	60 %	0 %	40 %	0 %	549704828
262	NC_022535	TCACC	2	10	418487	418496	20 %	20 %	0 %	60 %	549704829
263	NC_022535	ATGGC	2	10	418708	418717	20 %	20 %	40 %	20 %	549704830
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265	NC_022535	TCGGT	2	10	421553	421562	0 %	40 %	40 %	20 %	549704832
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283	NC_022535	CGGCT	2	10	448781	448790	0 %	20 %	40 %	40 %	549704858
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303	NC_022535	GCGAT	2	10	479924	479933	20 %	20 %	40 %	20 %	549704888
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381	NC_022535	CGGCC	2	10	590656	590665	0 %	0 %	40 %	60 %	549704993
382	NC_022535	CAGGA	2	10	591595	591604	40 %	0 %	40 %	20 %	549704993
383	NC_022535	AAGTT	2	10	594786	594795	40 %	40 %	20 %	0 %	549704996
384	NC_022535	TCCTC	2	10	595292	595301	0 %	40 %	0 %	60 %	549704997
385	NC_022535	TCGCC	2	10	595326	595335	0 %	20 %	20 %	60 %	549704997
386	NC_022535	AACCC	2	10	597483	597492	40 %	0 %	0 %	60 %	549704999
387	NC_022535	CGGCG	2	10	598574	598583	0 %	0 %	60 %	40 %	549705000
388	NC_022535	GGCAA	2	10	598961	598970	40 %	0 %	40 %	20 %	549705000
389	NC_022535	TTCGG	2	10	601590	601599	0 %	40 %	40 %	20 %	549705003
390	NC_022535	TATCG	2	10	603252	603261	20 %	40 %	20 %	20 %	549705004
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