MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 56310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022535	TTC	2	6	47811	47816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704459
1002	NC_022535	TCGGCC	2	12	47842	47853	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549704459
1003	NC_022535	TGG	2	6	47890	47895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704459
1004	NC_022535	ACG	2	6	47929	47934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704459
1005	NC_022535	CAT	2	6	47954	47959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704459
1006	NC_022535	CGCT	2	8	47970	47977	0 %	25 %	25 %	50 %	549704459
1007	NC_022535	GGC	2	6	47987	47992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704459
1008	NC_022535	ATCG	2	8	48005	48012	25 %	25 %	25 %	25 %	549704459
1009	NC_022535	GAA	2	6	48047	48052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704459
1010	NC_022535	GC	3	6	48098	48103	0 %	0 %	50 %	50 %	549704459
1011	NC_022535	GC	3	6	48131	48136	0 %	0 %	50 %	50 %	549704459
1012	NC_022535	GGA	2	6	48164	48169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704459
1013	NC_022535	ATT	2	6	48172	48177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549704459
1014	NC_022535	GGCT	2	8	48180	48187	0 %	25 %	50 %	25 %	549704459
1015	NC_022535	TTC	2	6	48446	48451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704460
1016	NC_022535	GAA	2	6	48487	48492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704460
1017	NC_022535	A	6	6	48528	48533	100 %	0 %	0 %	0 %	549704460
1018	NC_022535	GA	3	6	48549	48554	50 %	0 %	50 %	0 %	549704460
1019	NC_022535	TGC	2	6	48667	48672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1020	NC_022535	GTT	2	6	48692	48697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549704460
1021	NC_022535	CGC	2	6	48727	48732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704460
1022	NC_022535	CCGATG	2	12	48786	48797	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1023	NC_022535	AGGGC	2	10	48807	48816	20 %	0 %	60 %	20 %	549704460
1024	NC_022535	GC	3	6	48854	48859	0 %	0 %	50 %	50 %	549704460
1025	NC_022535	CCGCT	2	10	48876	48885	0 %	20 %	20 %	60 %	549704460
1026	NC_022535	TCG	2	6	48924	48929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1027	NC_022535	GCT	2	6	48934	48939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1028	NC_022535	TTG	2	6	48945	48950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549704460
1029	NC_022535	CGA	2	6	49023	49028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1030	NC_022535	GATC	2	8	49066	49073	25 %	25 %	25 %	25 %	549704460
1031	NC_022535	GGGC	2	8	49101	49108	0 %	0 %	75 %	25 %	549704460
1032	NC_022535	GAC	2	6	49138	49143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1033	NC_022535	CAT	2	6	49144	49149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704460
1034	NC_022535	GCC	2	6	49169	49174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704460
1035	NC_022535	GGC	2	6	49256	49261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704460
1036	NC_022535	CGC	2	6	49274	49279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704460
1037	NC_022535	TAT	2	6	49295	49300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549704460
1038	NC_022535	GCCGG	2	10	49330	49339	0 %	0 %	60 %	40 %	549704460
1039	NC_022535	CAT	2	6	49423	49428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704460
1040	NC_022535	GTC	2	6	49436	49441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1041	NC_022535	ATGT	2	8	49508	49515	25 %	50 %	25 %	0 %	549704460
1042	NC_022535	GAA	2	6	49541	49546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704460
1043	NC_022535	CAT	2	6	49621	49626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704460
1044	NC_022535	GAG	2	6	49631	49636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704460
1045	NC_022535	CGC	2	6	49637	49642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704460
1046	NC_022535	CG	3	6	49670	49675	0 %	0 %	50 %	50 %	549704460
1047	NC_022535	TCA	2	6	49695	49700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704460
1048	NC_022535	GAT	2	6	49759	49764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704460
1049	NC_022535	GCC	2	6	49787	49792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704460
1050	NC_022535	CGC	2	6	49798	49803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704460
1051	NC_022535	GGC	2	6	49897	49902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704460
1052	NC_022535	AGA	2	6	49914	49919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704460
1053	NC_022535	CGC	2	6	50011	50016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704460
1054	NC_022535	GAA	2	6	50105	50110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704460
1055	NC_022535	ACA	2	6	50127	50132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704460
1056	NC_022535	GCT	2	6	50184	50189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1057	NC_022535	CAA	2	6	50206	50211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704460
1058	NC_022535	GGA	2	6	50224	50229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704460
1059	NC_022535	CG	3	6	50231	50236	0 %	0 %	50 %	50 %	549704460
1060	NC_022535	GCA	2	6	50254	50259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1061	NC_022535	CGT	2	6	50284	50289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1062	NC_022535	TCG	2	6	50304	50309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1063	NC_022535	GGC	2	6	50326	50331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704460
1064	NC_022535	GCT	2	6	50411	50416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1065	NC_022535	CCG	3	9	50476	50484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704460
1066	NC_022535	GGC	2	6	50506	50511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704460
1067	NC_022535	TGC	2	6	50615	50620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704461
1068	NC_022535	GAA	2	6	50683	50688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704461
1069	NC_022535	ATA	2	6	50979	50984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549704461
1070	NC_022535	CG	3	6	50996	51001	0 %	0 %	50 %	50 %	549704461
1071	NC_022535	GAT	2	6	51009	51014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704461
1072	NC_022535	CGA	2	6	51044	51049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704461
1073	NC_022535	CAT	2	6	51131	51136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704461
1074	NC_022535	GCCAGT	2	12	51250	51261	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549704461
1075	NC_022535	CAA	2	6	51510	51515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704462
1076	NC_022535	GCC	2	6	51533	51538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704462
1077	NC_022535	ATC	2	6	51679	51684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704462
1078	NC_022535	TCGA	2	8	51697	51704	25 %	25 %	25 %	25 %	549704462
1079	NC_022535	CGAT	2	8	51750	51757	25 %	25 %	25 %	25 %	549704462
1080	NC_022535	T	6	6	51760	51765	0 %	100 %	0 %	0 %	549704462
1081	NC_022535	CCGA	2	8	51784	51791	25 %	0 %	25 %	50 %	549704462
1082	NC_022535	GGA	2	6	51801	51806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704462
1083	NC_022535	GCC	2	6	51873	51878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704462
1084	NC_022535	ACC	2	6	51949	51954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704462
1085	NC_022535	GC	4	8	51988	51995	0 %	0 %	50 %	50 %	549704463
1086	NC_022535	CGC	2	6	52038	52043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704463
1087	NC_022535	CGT	2	6	52177	52182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704463
1088	NC_022535	CGG	2	6	52228	52233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704463
1089	NC_022535	ACG	2	6	52269	52274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704463
1090	NC_022535	GTC	2	6	52283	52288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704463
1091	NC_022535	CGG	2	6	52364	52369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704463
1092	NC_022535	CG	3	6	52383	52388	0 %	0 %	50 %	50 %	549704463
1093	NC_022535	GCC	2	6	52453	52458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704463
1094	NC_022535	TCA	2	6	52476	52481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704463
1095	NC_022535	CAG	2	6	52487	52492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704463
1096	NC_022535	CCG	2	6	52525	52530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704463
1097	NC_022535	GC	3	6	52531	52536	0 %	0 %	50 %	50 %	549704463
1098	NC_022535	GGTCT	2	10	52547	52556	0 %	40 %	40 %	20 %	549704463
1099	NC_022535	CTT	2	6	52644	52649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704464
1100	NC_022535	TCC	2	6	52653	52658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704464
1101	NC_022535	CG	3	6	52689	52694	0 %	0 %	50 %	50 %	549704464
1102	NC_022535	CCGGTT	2	12	52695	52706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704464
1103	NC_022535	AGCCCG	2	12	52770	52781	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549704464
1104	NC_022535	GT	3	6	52795	52800	0 %	50 %	50 %	0 %	549704464
1105	NC_022535	ATG	2	6	52878	52883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704464
1106	NC_022535	TGA	2	6	52896	52901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704464
1107	NC_022535	CG	3	6	52930	52935	0 %	0 %	50 %	50 %	549704464
1108	NC_022535	GAT	2	6	52976	52981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704464
1109	NC_022535	TCG	2	6	53007	53012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704464
1110	NC_022535	GCG	2	6	53062	53067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704464
1111	NC_022535	CCT	2	6	53074	53079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704464
1112	NC_022535	GGC	2	6	53101	53106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704464
1113	NC_022535	CTC	2	6	53114	53119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704464
1114	NC_022535	CGG	2	6	53125	53130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704464
1115	NC_022535	GAC	2	6	53143	53148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704464
1116	NC_022535	GCA	2	6	53182	53187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704464
1117	NC_022535	TCA	2	6	53211	53216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704464
1118	NC_022535	CGA	2	6	53245	53250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704464
1119	NC_022535	GCG	2	6	53289	53294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704464
1120	NC_022535	GCC	2	6	53295	53300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704464
1121	NC_022535	CAGC	2	8	53353	53360	25 %	0 %	25 %	50 %	549704464
1122	NC_022535	GTG	2	6	53421	53426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704464
1123	NC_022535	GCA	2	6	53455	53460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704464
1124	NC_022535	GAG	2	6	53549	53554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704464
1125	NC_022535	AGGCAA	2	12	53581	53592	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	549704464
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1142	NC_022535	GCCGG	2	10	54358	54367	0 %	0 %	60 %	40 %	549704465
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1158	NC_022535	GCC	2	6	54950	54955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704465
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1251	NC_022535	TTTC	2	8	66925	66932	0 %	75 %	0 %	25 %	549704468
1252	NC_022535	CCG	2	6	66937	66942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704468
1253	NC_022535	CCG	3	9	66946	66954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704468
1254	NC_022535	TCA	2	6	66970	66975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704468
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1259	NC_022535	TCT	2	6	67277	67282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704468
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1366	NC_022535	TC	3	6	73137	73142	0 %	50 %	0 %	50 %	549704474
1367	NC_022535	CGC	2	6	73194	73199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704474
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1370	NC_022535	GCCAT	2	10	73319	73328	20 %	20 %	20 %	40 %	549704474
1371	NC_022535	GC	3	6	73363	73368	0 %	0 %	50 %	50 %	549704474
1372	NC_022535	GGA	2	6	73389	73394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704474
1373	NC_022535	ACCG	2	8	73540	73547	25 %	0 %	25 %	50 %	549704474
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1499	NC_022535	AGC	2	6	80308	80313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704481
1500	NC_022535	GCAAGG	2	12	80328	80339	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	549704481

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