MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 56310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022535	TTGA	2	8	24880	24887	25 %	50 %	25 %	0 %	549704435
502	NC_022535	AT	3	6	24911	24916	50 %	50 %	0 %	0 %	549704435
503	NC_022535	CCAGA	2	10	25003	25012	40 %	0 %	20 %	40 %	549704435
504	NC_022535	CGG	2	6	25126	25131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704435
505	NC_022535	TCG	2	6	25170	25175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704435
506	NC_022535	CG	3	6	25184	25189	0 %	0 %	50 %	50 %	549704435
507	NC_022535	CAGG	2	8	25208	25215	25 %	0 %	50 %	25 %	549704435
508	NC_022535	GCC	2	6	25220	25225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704435
509	NC_022535	GGCG	2	8	25227	25234	0 %	0 %	75 %	25 %	549704435
510	NC_022535	TGTC	2	8	25237	25244	0 %	50 %	25 %	25 %	549704435
511	NC_022535	GCC	2	6	25311	25316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704435
512	NC_022535	GGCC	2	8	25463	25470	0 %	0 %	50 %	50 %	549704435
513	NC_022535	GCG	2	6	25487	25492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704435
514	NC_022535	CGG	2	6	25496	25501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704435
515	NC_022535	TCG	2	6	25504	25509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704435
516	NC_022535	CGCGC	2	10	25544	25553	0 %	0 %	40 %	60 %	549704435
517	NC_022535	GCC	2	6	25579	25584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704435
518	NC_022535	TGG	2	6	25748	25753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704435
519	NC_022535	GC	3	6	25789	25794	0 %	0 %	50 %	50 %	549704435
520	NC_022535	GCA	2	6	25859	25864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704435
521	NC_022535	GAGT	2	8	25885	25892	25 %	25 %	50 %	0 %	549704435
522	NC_022535	CAC	3	9	25971	25979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704435
523	NC_022535	CGG	2	6	26000	26005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704435
524	NC_022535	CGG	4	12	26015	26026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704435
525	NC_022535	CGA	2	6	26048	26053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704435
526	NC_022535	GGA	2	6	26102	26107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704435
527	NC_022535	CGGG	2	8	26155	26162	0 %	0 %	75 %	25 %	549704435
528	NC_022535	AGA	2	6	26165	26170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704435
529	NC_022535	A	6	6	26185	26190	100 %	0 %	0 %	0 %	549704435
530	NC_022535	CCA	2	6	26205	26210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704435
531	NC_022535	TTC	2	6	26259	26264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704435
532	NC_022535	CG	3	6	26299	26304	0 %	0 %	50 %	50 %	549704435
533	NC_022535	GCG	2	6	26342	26347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704435
534	NC_022535	CG	3	6	26407	26412	0 %	0 %	50 %	50 %	549704435
535	NC_022535	CGG	2	6	26442	26447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704435
536	NC_022535	GAA	2	6	26481	26486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704435
537	NC_022535	GTC	2	6	26493	26498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704435
538	NC_022535	GCC	2	6	26544	26549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704435
539	NC_022535	AAG	2	6	26550	26555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704435
540	NC_022535	CGA	2	6	26558	26563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704435
541	NC_022535	GCA	2	6	26573	26578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704435
542	NC_022535	CGC	2	6	26590	26595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704435
543	NC_022535	AT	3	6	26604	26609	50 %	50 %	0 %	0 %	549704435
544	NC_022535	GCC	2	6	26659	26664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704435
545	NC_022535	GTG	2	6	26742	26747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704435
546	NC_022535	GAT	2	6	26786	26791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704436
547	NC_022535	CG	3	6	26879	26884	0 %	0 %	50 %	50 %	549704436
548	NC_022535	CGT	2	6	26923	26928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704436
549	NC_022535	AGC	2	6	26931	26936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704436
550	NC_022535	ATGGCG	2	12	26946	26957	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549704436
551	NC_022535	GAC	2	6	26966	26971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704436
552	NC_022535	GGT	2	6	27050	27055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704436
553	NC_022535	GAA	2	6	27104	27109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704436
554	NC_022535	GCT	2	6	27145	27150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704436
555	NC_022535	AGA	2	6	27160	27165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704436
556	NC_022535	CCGGG	2	10	27187	27196	0 %	0 %	60 %	40 %	549704436
557	NC_022535	CCG	3	9	27225	27233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704436
558	NC_022535	TCA	2	6	27238	27243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704436
559	NC_022535	TCG	2	6	27255	27260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704436
560	NC_022535	CGGCG	2	10	27280	27289	0 %	0 %	60 %	40 %	549704436
561	NC_022535	GTG	3	9	27317	27325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704436
562	NC_022535	GAC	2	6	27332	27337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704436
563	NC_022535	CGG	2	6	27460	27465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704436
564	NC_022535	CCATGC	2	12	27524	27535	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549704437
565	NC_022535	GCG	2	6	27554	27559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704437
566	NC_022535	GCG	2	6	27583	27588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704437
567	NC_022535	TGCGC	2	10	27680	27689	0 %	20 %	40 %	40 %	549704437
568	NC_022535	ATG	2	6	27694	27699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704437
569	NC_022535	AGC	2	6	27717	27722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704437
570	NC_022535	AAG	2	6	27731	27736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704437
571	NC_022535	GCC	2	6	27743	27748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704437
572	NC_022535	ATC	2	6	27850	27855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704437
573	NC_022535	CTG	2	6	27900	27905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704437
574	NC_022535	GCA	3	9	27938	27946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704437
575	NC_022535	CCA	2	6	28058	28063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704437
576	NC_022535	TGC	2	6	28118	28123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704437
577	NC_022535	TGA	2	6	28159	28164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704437
578	NC_022535	GCC	2	6	28168	28173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704437
579	NC_022535	CTC	2	6	28200	28205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704437
580	NC_022535	CGG	2	6	28220	28225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704437
581	NC_022535	CCG	2	6	28280	28285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704437
582	NC_022535	GAT	2	6	28287	28292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704437
583	NC_022535	GC	3	6	28298	28303	0 %	0 %	50 %	50 %	549704437
584	NC_022535	CGA	2	6	28397	28402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704437
585	NC_022535	GCG	2	6	28419	28424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704437
586	NC_022535	CGC	2	6	28490	28495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704437
587	NC_022535	GCG	2	6	28503	28508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704437
588	NC_022535	TC	3	6	28664	28669	0 %	50 %	0 %	50 %	549704437
589	NC_022535	TCC	2	6	28705	28710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704437
590	NC_022535	GAT	2	6	28806	28811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704437
591	NC_022535	CAGCGC	2	12	28935	28946	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549704437
592	NC_022535	GGAA	2	8	29051	29058	50 %	0 %	50 %	0 %	549704438
593	NC_022535	GTG	2	6	29073	29078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704438
594	NC_022535	GTG	2	6	29114	29119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704438
595	NC_022535	GCCG	2	8	29170	29177	0 %	0 %	50 %	50 %	549704438
596	NC_022535	CGCTG	2	10	29275	29284	0 %	20 %	40 %	40 %	549704438
597	NC_022535	TGA	2	6	29344	29349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704438
598	NC_022535	TGG	2	6	29367	29372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704438
599	NC_022535	CCA	2	6	29377	29382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704438
600	NC_022535	CGA	2	6	29404	29409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704438
601	NC_022535	AAT	2	6	29494	29499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549704438
602	NC_022535	ATG	2	6	29508	29513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704438
603	NC_022535	GAG	2	6	29568	29573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704438
604	NC_022535	TGC	2	6	29697	29702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704438
605	NC_022535	TTC	2	6	29712	29717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704438
606	NC_022535	CGT	2	6	29740	29745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704438
607	NC_022535	GC	3	6	29760	29765	0 %	0 %	50 %	50 %	549704438
608	NC_022535	TCA	2	6	29892	29897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704438
609	NC_022535	GC	3	6	29925	29930	0 %	0 %	50 %	50 %	549704438
610	NC_022535	CGT	2	6	29944	29949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704438
611	NC_022535	TGT	2	6	30130	30135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549704438
612	NC_022535	TTC	2	6	30303	30308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704438
613	NC_022535	GCT	2	6	30316	30321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704438
614	NC_022535	CGG	2	6	30334	30339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704438
615	NC_022535	GCCG	2	8	30445	30452	0 %	0 %	50 %	50 %	549704438
616	NC_022535	GAT	2	6	30478	30483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704438
617	NC_022535	CCCG	2	8	30572	30579	0 %	0 %	25 %	75 %	549704438
618	NC_022535	CGA	2	6	30592	30597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704438
619	NC_022535	GAA	2	6	30602	30607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704438
620	NC_022535	ACC	2	6	30624	30629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704438
621	NC_022535	CG	3	6	30671	30676	0 %	0 %	50 %	50 %	549704438
622	NC_022535	TCT	2	6	30679	30684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704438
623	NC_022535	TTCGCC	2	12	30785	30796	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	549704438
624	NC_022535	GCT	2	6	30814	30819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704438
625	NC_022535	CGCA	2	8	30899	30906	25 %	0 %	25 %	50 %	549704438
626	NC_022535	TTG	2	6	30909	30914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549704438
627	NC_022535	GCC	2	6	30941	30946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704438
628	NC_022535	CGC	2	6	30976	30981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704438
629	NC_022535	CAGC	2	8	31070	31077	25 %	0 %	25 %	50 %	549704438
630	NC_022535	CGGC	2	8	31123	31130	0 %	0 %	50 %	50 %	549704438
631	NC_022535	GCG	2	6	31181	31186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704438
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641	NC_022535	CG	3	6	31807	31812	0 %	0 %	50 %	50 %	549704439
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653	NC_022535	GTG	2	6	32341	32346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704440
654	NC_022535	CGG	2	6	32357	32362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704440
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748	NC_022535	GCA	2	6	35933	35938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704444
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750	NC_022535	AGC	2	6	35971	35976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704444
751	NC_022535	GGCATC	2	12	35982	35993	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549704444
752	NC_022535	CG	4	8	36001	36008	0 %	0 %	50 %	50 %	549704444
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754	NC_022535	GCA	2	6	36035	36040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704444
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