MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 56310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022535	GAT	3	9	276649	276657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704687
5502	NC_022535	CGT	2	6	276666	276671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704687
5503	NC_022535	GTCAT	2	10	276680	276689	20 %	40 %	20 %	20 %	549704687
5504	NC_022535	C	6	6	276883	276888	0 %	0 %	0 %	100 %	549704687
5505	NC_022535	CGGC	2	8	276916	276923	0 %	0 %	50 %	50 %	549704687
5506	NC_022535	CG	3	6	276949	276954	0 %	0 %	50 %	50 %	549704687
5507	NC_022535	TCG	2	6	276957	276962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704687
5508	NC_022535	GAT	2	6	277000	277005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704687
5509	NC_022535	CGC	2	6	277008	277013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704687
5510	NC_022535	AGGA	2	8	277124	277131	50 %	0 %	50 %	0 %	549704687
5511	NC_022535	CGC	2	6	277138	277143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704687
5512	NC_022535	TGA	2	6	277146	277151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704687
5513	NC_022535	ATC	2	6	277190	277195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704687
5514	NC_022535	GAAA	2	8	277214	277221	75 %	0 %	25 %	0 %	549704688
5515	NC_022535	CGC	2	6	277243	277248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704688
5516	NC_022535	CAG	2	6	277289	277294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704688
5517	NC_022535	TCGC	2	8	277309	277316	0 %	25 %	25 %	50 %	549704688
5518	NC_022535	ATC	2	6	277374	277379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704688
5519	NC_022535	G	7	7	277424	277430	0 %	0 %	100 %	0 %	549704688
5520	NC_022535	CGG	2	6	277447	277452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704688
5521	NC_022535	GCA	2	6	277456	277461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704688
5522	NC_022535	TCGT	2	8	277640	277647	0 %	50 %	25 %	25 %	549704688
5523	NC_022535	GGC	2	6	277760	277765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704688
5524	NC_022535	CTT	2	6	277790	277795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704688
5525	NC_022535	AAG	2	6	277799	277804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704688
5526	NC_022535	TTCG	2	8	277805	277812	0 %	50 %	25 %	25 %	549704688
5527	NC_022535	GAAT	2	8	277828	277835	50 %	25 %	25 %	0 %	549704688
5528	NC_022535	CGG	2	6	277885	277890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704688
5529	NC_022535	CTT	2	6	277949	277954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704688
5530	NC_022535	ATA	2	6	277961	277966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549704688
5531	NC_022535	TCT	2	6	278068	278073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704688
5532	NC_022535	CGT	2	6	278075	278080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704688
5533	NC_022535	TCC	2	6	278115	278120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704688
5534	NC_022535	CGC	2	6	278191	278196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704688
5535	NC_022535	GGC	3	9	278220	278228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704688
5536	NC_022535	GTC	2	6	278262	278267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704688
5537	NC_022535	T	6	6	278312	278317	0 %	100 %	0 %	0 %	549704688
5538	NC_022535	T	6	6	278362	278367	0 %	100 %	0 %	0 %	549704689
5539	NC_022535	CG	3	6	278385	278390	0 %	0 %	50 %	50 %	549704689
5540	NC_022535	CGC	2	6	278403	278408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704689
5541	NC_022535	ATA	2	6	278415	278420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549704689
5542	NC_022535	GC	5	10	278437	278446	0 %	0 %	50 %	50 %	549704689
5543	NC_022535	AG	3	6	278502	278507	50 %	0 %	50 %	0 %	549704689
5544	NC_022535	GTC	2	6	278523	278528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704689
5545	NC_022535	GCTT	2	8	278530	278537	0 %	50 %	25 %	25 %	549704689
5546	NC_022535	CTC	2	6	278563	278568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704689
5547	NC_022535	GCA	2	6	278580	278585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704689
5548	NC_022535	GCAT	2	8	278618	278625	25 %	25 %	25 %	25 %	549704689
5549	NC_022535	CGG	2	6	278631	278636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704689
5550	NC_022535	TTGC	2	8	278698	278705	0 %	50 %	25 %	25 %	549704689
5551	NC_022535	GCA	2	6	278709	278714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704689
5552	NC_022535	T	6	6	278848	278853	0 %	100 %	0 %	0 %	549704689
5553	NC_022535	CCAA	2	8	278965	278972	50 %	0 %	0 %	50 %	549704689
5554	NC_022535	TTTCG	2	10	278983	278992	0 %	60 %	20 %	20 %	549704689
5555	NC_022535	GAT	2	6	279000	279005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704689
5556	NC_022535	GTC	2	6	279049	279054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704689
5557	NC_022535	CAAGC	2	10	279100	279109	40 %	0 %	20 %	40 %	549704689
5558	NC_022535	TGA	2	6	279252	279257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704689
5559	NC_022535	GTC	2	6	279319	279324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704689
5560	NC_022535	GC	3	6	279346	279351	0 %	0 %	50 %	50 %	549704689
5561	NC_022535	CCGT	2	8	279357	279364	0 %	25 %	25 %	50 %	549704689
5562	NC_022535	AG	3	6	279404	279409	50 %	0 %	50 %	0 %	549704689
5563	NC_022535	GAA	2	6	279518	279523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704689
5564	NC_022535	TGG	2	6	279594	279599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704689
5565	NC_022535	ATCG	2	8	279691	279698	25 %	25 %	25 %	25 %	549704689
5566	NC_022535	CGTCGC	2	12	279769	279780	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549704689
5567	NC_022535	GCA	2	6	279975	279980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704690
5568	NC_022535	CGAC	2	8	279991	279998	25 %	0 %	25 %	50 %	549704690
5569	NC_022535	GAG	2	6	280010	280015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704690
5570	NC_022535	GGC	2	6	280025	280030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704690
5571	NC_022535	CCTT	2	8	280047	280054	0 %	50 %	0 %	50 %	549704690
5572	NC_022535	ATC	2	6	280068	280073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704690
5573	NC_022535	GC	3	6	280098	280103	0 %	0 %	50 %	50 %	549704690
5574	NC_022535	TCG	2	6	280155	280160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704690
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5579	NC_022535	GCCT	2	8	280415	280422	0 %	25 %	25 %	50 %	549704690
5580	NC_022535	CAG	2	6	280499	280504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704690
5581	NC_022535	CGGCG	2	10	280528	280537	0 %	0 %	60 %	40 %	549704690
5582	NC_022535	GCCCG	2	10	280598	280607	0 %	0 %	40 %	60 %	549704690
5583	NC_022535	GTC	2	6	280659	280664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704690
5584	NC_022535	CGCC	2	8	280681	280688	0 %	0 %	25 %	75 %	549704690
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5588	NC_022535	TCG	2	6	280797	280802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704690
5589	NC_022535	CG	3	6	280956	280961	0 %	0 %	50 %	50 %	549704690
5590	NC_022535	TTC	2	6	280973	280978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704690
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5592	NC_022535	AAG	2	6	281141	281146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704690
5593	NC_022535	AAG	2	6	281152	281157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704690
5594	NC_022535	TCA	2	6	281351	281356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704691
5595	NC_022535	AGA	3	9	281360	281368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704691
5596	NC_022535	CCGT	2	8	281371	281378	0 %	25 %	25 %	50 %	549704691
5597	NC_022535	GAA	2	6	281419	281424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704691
5598	NC_022535	TGC	2	6	281441	281446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704691
5599	NC_022535	CTG	2	6	281520	281525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704691
5600	NC_022535	TTC	2	6	281532	281537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704691
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5602	NC_022535	CTG	2	6	281616	281621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704691
5603	NC_022535	GC	3	6	281643	281648	0 %	0 %	50 %	50 %	549704691
5604	NC_022535	GCC	2	6	281654	281659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704691
5605	NC_022535	GCC	3	9	281675	281683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704691
5606	NC_022535	GTTCCG	2	12	281686	281697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704691
5607	NC_022535	CGA	2	6	281711	281716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704691
5608	NC_022535	GAT	2	6	281808	281813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704691
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5611	NC_022535	AAT	2	6	281912	281917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549704691
5612	NC_022535	GC	3	6	281939	281944	0 %	0 %	50 %	50 %	549704691
5613	NC_022535	CGA	2	6	281957	281962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704691
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5615	NC_022535	CGC	2	6	282095	282100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704691
5616	NC_022535	TCAG	2	8	282193	282200	25 %	25 %	25 %	25 %	549704691
5617	NC_022535	GAAG	2	8	282225	282232	50 %	0 %	50 %	0 %	549704691
5618	NC_022535	GA	3	6	282292	282297	50 %	0 %	50 %	0 %	549704691
5619	NC_022535	CTG	2	6	282303	282308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704691
5620	NC_022535	AACAG	2	10	282394	282403	60 %	0 %	20 %	20 %	549704691
5621	NC_022535	GTC	2	6	282426	282431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704691
5622	NC_022535	CAT	2	6	282470	282475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704691
5623	NC_022535	CGCC	2	8	282610	282617	0 %	0 %	25 %	75 %	549704691
5624	NC_022535	GAC	2	6	282700	282705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704692
5625	NC_022535	GC	3	6	282838	282843	0 %	0 %	50 %	50 %	549704692
5626	NC_022535	ACCTTG	2	12	282851	282862	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549704692
5627	NC_022535	GCG	2	6	282887	282892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704692
5628	NC_022535	GGC	2	6	282901	282906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704692
5629	NC_022535	GAT	2	6	282997	283002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704692
5630	NC_022535	GGC	2	6	283009	283014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704692
5631	NC_022535	ACG	2	6	283039	283044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704692
5632	NC_022535	GC	3	6	283608	283613	0 %	0 %	50 %	50 %	549704693
5633	NC_022535	GTG	2	6	283652	283657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704693
5634	NC_022535	GCG	2	6	283678	283683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704693
5635	NC_022535	G	6	6	283702	283707	0 %	0 %	100 %	0 %	549704693
5636	NC_022535	TCA	2	6	283714	283719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704693
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5640	NC_022535	CTT	2	6	283815	283820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704693
5641	NC_022535	GCC	2	6	283826	283831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704693
5642	NC_022535	GCG	2	6	283907	283912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704693
5643	NC_022535	GGC	2	6	283985	283990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704693
5644	NC_022535	GCC	2	6	284016	284021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704693
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5646	NC_022535	CGA	2	6	284177	284182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704693
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5649	NC_022535	GTG	2	6	284266	284271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704693
5650	NC_022535	CTG	2	6	284282	284287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704693
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5653	NC_022535	CCATT	2	10	284376	284385	20 %	40 %	0 %	40 %	549704694
5654	NC_022535	GC	3	6	284410	284415	0 %	0 %	50 %	50 %	549704694
5655	NC_022535	CTGT	2	8	284439	284446	0 %	50 %	25 %	25 %	549704694
5656	NC_022535	GCCG	2	8	284553	284560	0 %	0 %	50 %	50 %	549704694
5657	NC_022535	GCA	2	6	284635	284640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704694
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5661	NC_022535	ATTTC	2	10	284699	284708	20 %	60 %	0 %	20 %	549704694
5662	NC_022535	CGC	2	6	284718	284723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704694
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5688	NC_022535	CGCT	2	8	285637	285644	0 %	25 %	25 %	50 %	549704695
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5730	NC_022535	TGG	2	6	287189	287194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704696
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5743	NC_022535	GAT	2	6	288331	288336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704698
5744	NC_022535	CGG	3	9	288354	288362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704698
5745	NC_022535	AGC	2	6	288379	288384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704698
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5853	NC_022535	GCG	2	6	293760	293765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704705
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5862	NC_022535	TCG	2	6	294035	294040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704705
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5985	NC_022535	GGT	2	6	299287	299292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704711
5986	NC_022535	TGC	2	6	299374	299379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704712
5987	NC_022535	GCG	2	6	299394	299399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704712
5988	NC_022535	TTC	2	6	299453	299458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704712
5989	NC_022535	CGT	2	6	299618	299623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704712
5990	NC_022535	CGG	2	6	299998	300003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704713
5991	NC_022535	GATG	2	8	300187	300194	25 %	25 %	50 %	0 %	549704713
5992	NC_022535	CATC	2	8	300196	300203	25 %	25 %	0 %	50 %	549704713
5993	NC_022535	CTG	2	6	300251	300256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704713
5994	NC_022535	TGG	2	6	300279	300284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704713
5995	NC_022535	CG	3	6	300388	300393	0 %	0 %	50 %	50 %	549704713
5996	NC_022535	TTCA	2	8	300459	300466	25 %	50 %	0 %	25 %	549704713
5997	NC_022535	GAC	2	6	300473	300478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704713
5998	NC_022535	GCT	2	6	300493	300498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704713
5999	NC_022535	CTG	2	6	300581	300586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704713
6000	NC_022535	TGGA	2	8	300588	300595	25 %	25 %	50 %	0 %	549704713

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