MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 56310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022535	CCTT	2	8	225617	225624	0 %	50 %	0 %	50 %	549704623
4502	NC_022535	CTG	2	6	225628	225633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704623
4503	NC_022535	GTT	2	6	225655	225660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549704623
4504	NC_022535	CCG	2	6	225686	225691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704623
4505	NC_022535	ATG	2	6	225707	225712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704623
4506	NC_022535	GCA	2	6	225732	225737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704623
4507	NC_022535	CCG	2	6	225743	225748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704623
4508	NC_022535	CCG	2	6	225792	225797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704623
4509	NC_022535	ATG	2	6	225812	225817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704623
4510	NC_022535	ACG	2	6	225881	225886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704623
4511	NC_022535	T	6	6	225917	225922	0 %	100 %	0 %	0 %	549704623
4512	NC_022535	GGC	2	6	225993	225998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704623
4513	NC_022535	GAA	2	6	226019	226024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704623
4514	NC_022535	GAT	2	6	226054	226059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704623
4515	NC_022535	CCA	2	6	226131	226136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704623
4516	NC_022535	T	8	8	226390	226397	0 %	100 %	0 %	0 %	549704624
4517	NC_022535	AGC	2	6	226404	226409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704624
4518	NC_022535	GC	3	6	226449	226454	0 %	0 %	50 %	50 %	549704624
4519	NC_022535	CAG	2	6	226481	226486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704624
4520	NC_022535	TCC	2	6	226487	226492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704624
4521	NC_022535	CAA	2	6	226519	226524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704624
4522	NC_022535	CAC	2	6	226579	226584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704624
4523	NC_022535	GCAG	2	8	226613	226620	25 %	0 %	50 %	25 %	549704624
4524	NC_022535	CGCC	2	8	226630	226637	0 %	0 %	25 %	75 %	549704624
4525	NC_022535	CAG	2	6	226703	226708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704624
4526	NC_022535	CGC	2	6	226760	226765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704624
4527	NC_022535	GTC	2	6	226959	226964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704625
4528	NC_022535	CGC	2	6	226969	226974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704625
4529	NC_022535	TG	3	6	227001	227006	0 %	50 %	50 %	0 %	549704625
4530	NC_022535	CGA	2	6	227008	227013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704625
4531	NC_022535	GCC	2	6	227021	227026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704625
4532	NC_022535	CAG	2	6	227042	227047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704625
4533	NC_022535	GCA	2	6	227049	227054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704625
4534	NC_022535	TCC	2	6	227655	227660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704626
4535	NC_022535	TCG	2	6	227688	227693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704626
4536	NC_022535	CCA	2	6	227730	227735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704626
4537	NC_022535	TCG	2	6	227805	227810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704626
4538	NC_022535	TGA	2	6	227833	227838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704626
4539	NC_022535	AGC	2	6	227904	227909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704626
4540	NC_022535	GCC	2	6	227982	227987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704627
4541	NC_022535	AGG	2	6	228104	228109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704627
4542	NC_022535	GAT	2	6	228433	228438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704628
4543	NC_022535	CCG	2	6	228479	228484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704628
4544	NC_022535	CGC	2	6	228534	228539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704628
4545	NC_022535	CCAT	2	8	228603	228610	25 %	25 %	0 %	50 %	549704628
4546	NC_022535	GCA	2	6	228618	228623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704628
4547	NC_022535	TCA	3	9	228675	228683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704628
4548	NC_022535	ATC	2	6	228829	228834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704629
4549	NC_022535	GTTC	2	8	228845	228852	0 %	50 %	25 %	25 %	549704629
4550	NC_022535	CCG	2	6	228853	228858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704629
4551	NC_022535	AC	3	6	228879	228884	50 %	0 %	0 %	50 %	549704629
4552	NC_022535	TGG	2	6	228889	228894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704629
4553	NC_022535	CGG	2	6	228913	228918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704629
4554	NC_022535	CTG	2	6	228924	228929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704629
4555	NC_022535	TGG	2	6	228979	228984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704629
4556	NC_022535	TCT	2	6	229009	229014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704629
4557	NC_022535	CGC	2	6	229018	229023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704629
4558	NC_022535	GGC	2	6	229028	229033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704629
4559	NC_022535	TTC	2	6	229041	229046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704629
4560	NC_022535	CGGC	2	8	229080	229087	0 %	0 %	50 %	50 %	549704629
4561	NC_022535	CGC	2	6	229094	229099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704629
4562	NC_022535	TGGTG	2	10	229133	229142	0 %	40 %	60 %	0 %	549704629
4563	NC_022535	GCG	2	6	229185	229190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704629
4564	NC_022535	TTC	2	6	229200	229205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704629
4565	NC_022535	GGC	2	6	229215	229220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704629
4566	NC_022535	GCGG	2	8	229524	229531	0 %	0 %	75 %	25 %	549704630
4567	NC_022535	ATG	2	6	229534	229539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704630
4568	NC_022535	CGA	2	6	229574	229579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704630
4569	NC_022535	TGA	2	6	229615	229620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704630
4570	NC_022535	GGGCA	2	10	229637	229646	20 %	0 %	60 %	20 %	549704630
4571	NC_022535	CAGC	2	8	229667	229674	25 %	0 %	25 %	50 %	549704630
4572	NC_022535	TGG	2	6	229691	229696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704630
4573	NC_022535	ATA	2	6	229699	229704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549704630
4574	NC_022535	ACC	2	6	229835	229840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704630
4575	NC_022535	CA	3	6	229913	229918	50 %	0 %	0 %	50 %	549704630
4576	NC_022535	CCG	2	6	229936	229941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704630
4577	NC_022535	A	6	6	229984	229989	100 %	0 %	0 %	0 %	549704630
4578	NC_022535	GGCT	2	8	229998	230005	0 %	25 %	50 %	25 %	549704630
4579	NC_022535	ATC	2	6	230020	230025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704630
4580	NC_022535	CCAGA	2	10	230125	230134	40 %	0 %	20 %	40 %	549704631
4581	NC_022535	TTTCGC	2	12	230218	230229	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	549704631
4582	NC_022535	AAGGCC	2	12	230275	230286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704631
4583	NC_022535	TGG	2	6	230421	230426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704632
4584	NC_022535	AAGAT	2	10	230438	230447	60 %	20 %	20 %	0 %	549704632
4585	NC_022535	T	6	6	230454	230459	0 %	100 %	0 %	0 %	549704632
4586	NC_022535	TTC	2	6	230547	230552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704633
4587	NC_022535	CTT	2	6	230566	230571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704633
4588	NC_022535	GGC	2	6	230590	230595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704633
4589	NC_022535	TCCGG	2	10	230608	230617	0 %	20 %	40 %	40 %	549704633
4590	NC_022535	CCG	2	6	230780	230785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704634
4591	NC_022535	CGC	2	6	230840	230845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704634
4592	NC_022535	GAT	2	6	230853	230858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704634
4593	NC_022535	GGC	3	9	230904	230912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704634
4594	NC_022535	CGG	2	6	230915	230920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704634
4595	NC_022535	TCA	2	6	231098	231103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704634
4596	NC_022535	GGC	2	6	231115	231120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704634
4597	NC_022535	CTT	2	6	231195	231200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704634
4598	NC_022535	GC	3	6	231471	231476	0 %	0 %	50 %	50 %	549704634
4599	NC_022535	GGT	2	6	231495	231500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704634
4600	NC_022535	GC	3	6	231656	231661	0 %	0 %	50 %	50 %	549704635
4601	NC_022535	CAC	2	6	231689	231694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704635
4602	NC_022535	GCA	2	6	231736	231741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704635
4603	NC_022535	GAA	2	6	231764	231769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704635
4604	NC_022535	GCA	2	6	231775	231780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704635
4605	NC_022535	GCC	2	6	231806	231811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704635
4606	NC_022535	AGA	2	6	231832	231837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704635
4607	NC_022535	GCC	2	6	231878	231883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704635
4608	NC_022535	GCA	2	6	231940	231945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704635
4609	NC_022535	GA	3	6	231957	231962	50 %	0 %	50 %	0 %	549704635
4610	NC_022535	C	6	6	231990	231995	0 %	0 %	0 %	100 %	549704635
4611	NC_022535	GGC	2	6	232010	232015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704635
4612	NC_022535	GAT	2	6	232043	232048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704635
4613	NC_022535	CCA	2	6	232126	232131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704635
4614	NC_022535	CGGGCG	2	12	232166	232177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704635
4615	NC_022535	GC	3	6	232340	232345	0 %	0 %	50 %	50 %	549704635
4616	NC_022535	AGC	3	9	232368	232376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704635
4617	NC_022535	ACC	2	6	232377	232382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704635
4618	NC_022535	CG	3	6	232450	232455	0 %	0 %	50 %	50 %	549704635
4619	NC_022535	CAC	2	6	232481	232486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704635
4620	NC_022535	CAGC	2	8	232502	232509	25 %	0 %	25 %	50 %	549704635
4621	NC_022535	GGC	2	6	232652	232657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704636
4622	NC_022535	GC	4	8	232751	232758	0 %	0 %	50 %	50 %	549704636
4623	NC_022535	TGT	2	6	232809	232814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549704636
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4740	NC_022535	CCGCGC	2	12	237658	237669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704642
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4743	NC_022535	ATC	2	6	237865	237870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704642
4744	NC_022535	GCC	2	6	237936	237941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704642
4745	NC_022535	TCG	2	6	237965	237970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704642
4746	NC_022535	CAC	2	6	238005	238010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704642
4747	NC_022535	CGA	2	6	238094	238099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704642
4748	NC_022535	GAT	2	6	238195	238200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704642
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4753	NC_022535	GTC	2	6	238356	238361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704642
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4776	NC_022535	GC	3	6	239877	239882	0 %	0 %	50 %	50 %	549704643
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4802	NC_022535	GC	3	6	241058	241063	0 %	0 %	50 %	50 %	549704645
4803	NC_022535	TGC	2	6	241141	241146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704645
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4864	NC_022535	TTC	2	6	243992	243997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704649
4865	NC_022535	CTG	3	9	244066	244074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704649
4866	NC_022535	GAA	2	6	244079	244084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704649
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4868	NC_022535	TCA	2	6	244145	244150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704649
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4887	NC_022535	GGCCG	2	10	245150	245159	0 %	0 %	60 %	40 %	549704650
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4894	NC_022535	CTG	2	6	245297	245302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704650
4895	NC_022535	GTC	2	6	245372	245377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704650
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4934	NC_022535	GAC	2	6	247392	247397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704652
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4983	NC_022535	CTT	3	9	249873	249881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704655
4984	NC_022535	GAAG	2	8	249887	249894	50 %	0 %	50 %	0 %	549704655
4985	NC_022535	GCCGA	2	10	249921	249930	20 %	0 %	40 %	40 %	549704655
4986	NC_022535	GAT	3	9	249947	249955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704655
4987	NC_022535	AAG	2	6	250189	250194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704656
4988	NC_022535	GTT	2	6	250222	250227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549704656
4989	NC_022535	GCC	3	9	250231	250239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704656
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4991	NC_022535	CG	3	6	250287	250292	0 %	0 %	50 %	50 %	549704656
4992	NC_022535	AAG	2	6	250324	250329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704656
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4999	NC_022535	GC	3	6	250722	250727	0 %	0 %	50 %	50 %	549704657
5000	NC_022535	TCG	2	6	250728	250733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704657

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