MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 21250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021911	CGA	2	6	51061	51066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837571
1002	NC_021911	GCC	2	6	51077	51082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837571
1003	NC_021911	TCA	2	6	51165	51170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837571
1004	NC_021911	CCA	2	6	51171	51176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837571
1005	NC_021911	GGGC	2	8	51220	51227	0 %	0 %	75 %	25 %	528837571
1006	NC_021911	AGC	2	6	51233	51238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837571
1007	NC_021911	GTG	2	6	51248	51253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837571
1008	NC_021911	GAG	2	6	51278	51283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837571
1009	NC_021911	AGA	2	6	51285	51290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837571
1010	NC_021911	CCG	2	6	51303	51308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837571
1011	NC_021911	TCA	2	6	51336	51341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837571
1012	NC_021911	CT	3	6	51391	51396	0 %	50 %	0 %	50 %	528837572
1013	NC_021911	GCACG	2	10	51412	51421	20 %	0 %	40 %	40 %	528837572
1014	NC_021911	TCA	2	6	51472	51477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837572
1015	NC_021911	TC	3	6	51493	51498	0 %	50 %	0 %	50 %	528837572
1016	NC_021911	GAC	2	6	51531	51536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837572
1017	NC_021911	TCA	2	6	51655	51660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837572
1018	NC_021911	ATC	2	6	51669	51674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837572
1019	NC_021911	CAC	2	6	51680	51685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837572
1020	NC_021911	GGT	2	6	51770	51775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837572
1021	NC_021911	CAT	3	9	51806	51814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837572
1022	NC_021911	CT	3	6	51892	51897	0 %	50 %	0 %	50 %	528837572
1023	NC_021911	TTC	2	6	51918	51923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837572
1024	NC_021911	GCT	2	6	51941	51946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837572
1025	NC_021911	GCC	2	6	51951	51956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837572
1026	NC_021911	CCGA	2	8	52106	52113	25 %	0 %	25 %	50 %	528837572
1027	NC_021911	TTC	2	6	52134	52139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837572
1028	NC_021911	GGC	2	6	52172	52177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837572
1029	NC_021911	TGA	3	9	52186	52194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837572
1030	NC_021911	CCG	2	6	52255	52260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837572
1031	NC_021911	CTCC	2	8	52294	52301	0 %	25 %	0 %	75 %	528837573
1032	NC_021911	G	6	6	52308	52313	0 %	0 %	100 %	0 %	528837573
1033	NC_021911	CGG	2	6	52339	52344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837573
1034	NC_021911	GGC	2	6	52380	52385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837573
1035	NC_021911	GCT	2	6	52469	52474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837573
1036	NC_021911	TC	3	6	52549	52554	0 %	50 %	0 %	50 %	528837573
1037	NC_021911	CGA	2	6	52568	52573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837573
1038	NC_021911	CTG	2	6	52584	52589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837573
1039	NC_021911	CGG	2	6	52625	52630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837573
1040	NC_021911	CCGC	2	8	52640	52647	0 %	0 %	25 %	75 %	528837573
1041	NC_021911	CGG	2	6	52688	52693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837573
1042	NC_021911	AAC	2	6	52740	52745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528837573
1043	NC_021911	GGA	2	6	52769	52774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837573
1044	NC_021911	TCTT	2	8	52801	52808	0 %	75 %	0 %	25 %	528837573
1045	NC_021911	CGC	2	6	52826	52831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837573
1046	NC_021911	GCG	2	6	52849	52854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837573
1047	NC_021911	TGA	2	6	52886	52891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837573
1048	NC_021911	TCT	2	6	52906	52911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837573
1049	NC_021911	GTTCA	2	10	52950	52959	20 %	40 %	20 %	20 %	528837573
1050	NC_021911	CGA	2	6	53075	53080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837573
1051	NC_021911	CG	3	6	53104	53109	0 %	0 %	50 %	50 %	528837573
1052	NC_021911	GCG	2	6	53119	53124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837573
1053	NC_021911	GCG	2	6	53157	53162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837573
1054	NC_021911	TTC	2	6	53185	53190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837573
1055	NC_021911	CGG	3	9	53215	53223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837573
1056	NC_021911	TCT	2	6	53294	53299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837573
1057	NC_021911	TCG	2	6	53434	53439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837573
1058	NC_021911	CCGGT	2	10	53446	53455	0 %	20 %	40 %	40 %	528837573
1059	NC_021911	AGG	2	6	53494	53499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837573
1060	NC_021911	CGG	2	6	53529	53534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837573
1061	NC_021911	CGG	2	6	53546	53551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837573
1062	NC_021911	CGC	2	6	53563	53568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837573
1063	NC_021911	TCC	2	6	53665	53670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837573
1064	NC_021911	AAGG	2	8	53679	53686	50 %	0 %	50 %	0 %	528837573
1065	NC_021911	GGC	2	6	53723	53728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837573
1066	NC_021911	TTCTC	2	10	53764	53773	0 %	60 %	0 %	40 %	528837573
1067	NC_021911	CGC	2	6	53807	53812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837573
1068	NC_021911	GGGC	2	8	53887	53894	0 %	0 %	75 %	25 %	528837573
1069	NC_021911	GCC	2	6	54074	54079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837574
1070	NC_021911	CTT	2	6	54127	54132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837574
1071	NC_021911	CTT	2	6	54144	54149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837574
1072	NC_021911	GCA	2	6	54165	54170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837574
1073	NC_021911	CGGCA	2	10	54172	54181	20 %	0 %	40 %	40 %	528837574
1074	NC_021911	GCT	2	6	54195	54200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837574
1075	NC_021911	GAT	2	6	54328	54333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837574
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1078	NC_021911	GCGCG	2	10	54465	54474	0 %	0 %	60 %	40 %	528837574
1079	NC_021911	TAG	2	6	54515	54520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837574
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1081	NC_021911	TCC	2	6	54578	54583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837575
1082	NC_021911	GAC	2	6	54597	54602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837575
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1086	NC_021911	GAT	3	9	54979	54987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837576
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1088	NC_021911	CCTC	2	8	55055	55062	0 %	25 %	0 %	75 %	528837576
1089	NC_021911	GAA	2	6	55116	55121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837576
1090	NC_021911	GCCG	2	8	55128	55135	0 %	0 %	50 %	50 %	528837576
1091	NC_021911	TGC	2	6	55187	55192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837576
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1096	NC_021911	TCG	2	6	55376	55381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837576
1097	NC_021911	CG	3	6	55522	55527	0 %	0 %	50 %	50 %	528837577
1098	NC_021911	CAT	3	9	55621	55629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837577
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1100	NC_021911	CCG	2	6	55680	55685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837577
1101	NC_021911	GGCC	2	8	55719	55726	0 %	0 %	50 %	50 %	528837577
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1105	NC_021911	GC	3	6	55897	55902	0 %	0 %	50 %	50 %	528837577
1106	NC_021911	AAG	2	6	55973	55978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837577
1107	NC_021911	TCG	2	6	55980	55985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837577
1108	NC_021911	GGCC	2	8	56031	56038	0 %	0 %	50 %	50 %	528837577
1109	NC_021911	GC	3	6	56090	56095	0 %	0 %	50 %	50 %	528837577
1110	NC_021911	ACG	2	6	56097	56102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837577
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1112	NC_021911	TGG	2	6	56214	56219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837577
1113	NC_021911	TTG	2	6	56345	56350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528837577
1114	NC_021911	CTG	2	6	56432	56437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837577
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1118	NC_021911	CCA	2	6	56598	56603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837577
1119	NC_021911	GCCG	2	8	56626	56633	0 %	0 %	50 %	50 %	528837577
1120	NC_021911	GTC	2	6	56725	56730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837577
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1123	NC_021911	GAT	2	6	56838	56843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837577
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1125	NC_021911	CGA	2	6	56956	56961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837578
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1245	NC_021911	TCAT	2	8	63018	63025	25 %	50 %	0 %	25 %	528837586
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1249	NC_021911	GACA	2	8	63133	63140	50 %	0 %	25 %	25 %	528837587
1250	NC_021911	TCG	2	6	63152	63157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837587
1251	NC_021911	AGC	2	6	63185	63190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837587
1252	NC_021911	GCG	2	6	63191	63196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837587
1253	NC_021911	CCT	2	6	63198	63203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837587
1254	NC_021911	GATG	2	8	63300	63307	25 %	25 %	50 %	0 %	528837587
1255	NC_021911	ATA	2	6	63510	63515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528837588
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1257	NC_021911	GCG	2	6	63538	63543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837588
1258	NC_021911	ATC	2	6	63544	63549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837588
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1262	NC_021911	TCG	2	6	63676	63681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837588
1263	NC_021911	GAT	2	6	63696	63701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837588
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1265	NC_021911	GAT	2	6	63831	63836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837588
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1279	NC_021911	GCAG	2	8	65019	65026	25 %	0 %	50 %	25 %	528837591
1280	NC_021911	CGTC	2	8	65031	65038	0 %	25 %	25 %	50 %	528837591
1281	NC_021911	TCG	2	6	65061	65066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837591
1282	NC_021911	TGC	2	6	65071	65076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837591
1283	NC_021911	GAG	2	6	65150	65155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837591
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1289	NC_021911	GCA	2	6	65455	65460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837591
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1293	NC_021911	CGT	2	6	65656	65661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837591
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1332	NC_021911	CGG	2	6	67580	67585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837594
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1369	NC_021911	CAC	2	6	69092	69097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837595
1370	NC_021911	GAA	2	6	69188	69193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837595
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1373	NC_021911	GC	3	6	69814	69819	0 %	0 %	50 %	50 %	528837596
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1496	NC_021911	GCAG	2	8	75495	75502	25 %	0 %	50 %	25 %	528837602
1497	NC_021911	GCCGG	2	10	75507	75516	0 %	0 %	60 %	40 %	528837602
1498	NC_021911	CGGC	2	8	75562	75569	0 %	0 %	50 %	50 %	528837602
1499	NC_021911	CCG	2	6	75706	75711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837602
1500	NC_021911	TTG	2	6	75718	75723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528837602

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