MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 21250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021911	GCG	2	6	27845	27850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837550
502	NC_021911	ACG	2	6	27908	27913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837550
503	NC_021911	AGCATC	2	12	27944	27955	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	528837550
504	NC_021911	CGA	2	6	27979	27984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837550
505	NC_021911	GGC	2	6	28026	28031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837550
506	NC_021911	CTC	2	6	28082	28087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837550
507	NC_021911	AGG	2	6	28089	28094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837550
508	NC_021911	CTG	2	6	28145	28150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837550
509	NC_021911	GAGC	2	8	28168	28175	25 %	0 %	50 %	25 %	528837550
510	NC_021911	CCT	2	6	28195	28200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837550
511	NC_021911	GCCC	2	8	28297	28304	0 %	0 %	25 %	75 %	528837550
512	NC_021911	CTG	2	6	28394	28399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837551
513	NC_021911	T	6	6	28520	28525	0 %	100 %	0 %	0 %	528837551
514	NC_021911	ACC	2	6	28841	28846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837552
515	NC_021911	GCC	2	6	28883	28888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837552
516	NC_021911	CGA	2	6	28891	28896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837552
517	NC_021911	ATTG	2	8	28918	28925	25 %	50 %	25 %	0 %	528837552
518	NC_021911	CTG	2	6	28973	28978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837552
519	NC_021911	TGT	2	6	28987	28992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528837552
520	NC_021911	TGC	2	6	29014	29019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837552
521	NC_021911	GCCT	2	8	29085	29092	0 %	25 %	25 %	50 %	528837552
522	NC_021911	GGCGCC	2	12	29108	29119	0 %	0 %	50 %	50 %	528837552
523	NC_021911	CCGTC	2	10	29181	29190	0 %	20 %	20 %	60 %	528837552
524	NC_021911	TTGC	2	8	29207	29214	0 %	50 %	25 %	25 %	528837552
525	NC_021911	TGCT	2	8	29311	29318	0 %	50 %	25 %	25 %	528837552
526	NC_021911	CG	3	6	29320	29325	0 %	0 %	50 %	50 %	528837552
527	NC_021911	GGC	2	6	29339	29344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837552
528	NC_021911	GCT	2	6	29404	29409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837552
529	NC_021911	ATC	2	6	29417	29422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837552
530	NC_021911	TGG	2	6	29482	29487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837552
531	NC_021911	GCT	2	6	29494	29499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837552
532	NC_021911	TCG	2	6	29555	29560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837552
533	NC_021911	GAAG	2	8	29603	29610	50 %	0 %	50 %	0 %	528837552
534	NC_021911	GCT	2	6	29685	29690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837552
535	NC_021911	CT	3	6	29802	29807	0 %	50 %	0 %	50 %	528837553
536	NC_021911	TCA	3	9	29814	29822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837553
537	NC_021911	GCA	2	6	29841	29846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837553
538	NC_021911	CAG	2	6	29908	29913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837553
539	NC_021911	GAC	2	6	29964	29969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837553
540	NC_021911	CGA	2	6	29985	29990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837553
541	NC_021911	CCGCCA	2	12	30087	30098	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	528837553
542	NC_021911	CGA	2	6	30114	30119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837553
543	NC_021911	GGC	2	6	30121	30126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837553
544	NC_021911	TGC	2	6	30164	30169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837553
545	NC_021911	GGC	2	6	30197	30202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837553
546	NC_021911	ACGAGC	2	12	30203	30214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837553
547	NC_021911	GAC	2	6	30280	30285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837553
548	NC_021911	TCA	2	6	30341	30346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837553
549	NC_021911	AGC	2	6	30347	30352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837553
550	NC_021911	GCT	2	6	30417	30422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837553
551	NC_021911	GCA	2	6	30447	30452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837553
552	NC_021911	CCA	2	6	30480	30485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837553
553	NC_021911	GGC	2	6	30511	30516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837553
554	NC_021911	TGC	2	6	30522	30527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837553
555	NC_021911	GCG	2	6	30542	30547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837553
556	NC_021911	GCA	2	6	30591	30596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837553
557	NC_021911	CCG	2	6	30634	30639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837553
558	NC_021911	CGC	2	6	30649	30654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837553
559	NC_021911	TCA	2	6	30699	30704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837553
560	NC_021911	GAT	2	6	30948	30953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837554
561	NC_021911	GAT	2	6	31012	31017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837554
562	NC_021911	GGC	2	6	31026	31031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837554
563	NC_021911	GC	3	6	31062	31067	0 %	0 %	50 %	50 %	528837554
564	NC_021911	AGCG	2	8	31122	31129	25 %	0 %	50 %	25 %	528837554
565	NC_021911	GC	3	6	31225	31230	0 %	0 %	50 %	50 %	528837554
566	NC_021911	GTC	2	6	31236	31241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837554
567	NC_021911	GC	3	6	31279	31284	0 %	0 %	50 %	50 %	528837554
568	NC_021911	GCC	2	6	31345	31350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837554
569	NC_021911	CGG	2	6	31361	31366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837554
570	NC_021911	GCC	3	9	31408	31416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837554
571	NC_021911	TCGCCG	2	12	31447	31458	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528837554
572	NC_021911	GAT	2	6	31481	31486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837554
573	NC_021911	CG	3	6	31492	31497	0 %	0 %	50 %	50 %	528837554
574	NC_021911	CCT	2	6	31563	31568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837555
575	NC_021911	GAT	2	6	31589	31594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837555
576	NC_021911	TCG	3	9	31612	31620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837555
577	NC_021911	CGCC	2	8	31643	31650	0 %	0 %	25 %	75 %	528837555
578	NC_021911	CGAG	2	8	31655	31662	25 %	0 %	50 %	25 %	528837555
579	NC_021911	CGA	2	6	31676	31681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837555
580	NC_021911	TG	3	6	31686	31691	0 %	50 %	50 %	0 %	528837555
581	NC_021911	TCG	2	6	31708	31713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837555
582	NC_021911	CGC	2	6	31729	31734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837555
583	NC_021911	ATG	2	6	31738	31743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837555
584	NC_021911	CAT	2	6	31752	31757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837555
585	NC_021911	TCG	2	6	31843	31848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837555
586	NC_021911	CG	3	6	31877	31882	0 %	0 %	50 %	50 %	528837555
587	NC_021911	ATCTCC	2	12	31915	31926	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	528837555
588	NC_021911	GC	3	6	32004	32009	0 %	0 %	50 %	50 %	528837555
589	NC_021911	CG	3	6	32025	32030	0 %	0 %	50 %	50 %	528837555
590	NC_021911	AGA	2	6	32053	32058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837555
591	NC_021911	GCAG	2	8	32061	32068	25 %	0 %	50 %	25 %	528837555
592	NC_021911	CGG	2	6	32072	32077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837555
593	NC_021911	TGAAGA	2	12	32081	32092	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	528837555
594	NC_021911	CGC	2	6	32105	32110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837555
595	NC_021911	GCC	2	6	32111	32116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837555
596	NC_021911	TCG	2	6	32149	32154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837555
597	NC_021911	GTC	2	6	32181	32186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837555
598	NC_021911	CCG	2	6	32201	32206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837555
599	NC_021911	TCA	2	6	32219	32224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837555
600	NC_021911	CGC	2	6	32264	32269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837555
601	NC_021911	GATCG	2	10	32295	32304	20 %	20 %	40 %	20 %	528837555
602	NC_021911	GGC	3	9	32305	32313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837555
603	NC_021911	CGG	2	6	32336	32341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837555
604	NC_021911	GCC	3	9	32394	32402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837555
605	NC_021911	CCTTGC	2	12	32417	32428	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	528837555
606	NC_021911	ATG	2	6	32446	32451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837555
607	NC_021911	GC	3	6	32452	32457	0 %	0 %	50 %	50 %	528837555
608	NC_021911	CGT	2	6	32462	32467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837555
609	NC_021911	GCA	2	6	32510	32515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837555
610	NC_021911	CTT	2	6	32550	32555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837555
611	NC_021911	GGC	2	6	32639	32644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837556
612	NC_021911	GCG	2	6	32742	32747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837556
613	NC_021911	CGA	2	6	32755	32760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837556
614	NC_021911	GCC	3	9	32851	32859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837556
615	NC_021911	CCG	2	6	33033	33038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837556
616	NC_021911	TCG	2	6	33088	33093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837556
617	NC_021911	GTC	2	6	33116	33121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837556
618	NC_021911	CGGA	2	8	33132	33139	25 %	0 %	50 %	25 %	528837556
619	NC_021911	TGA	2	6	33145	33150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837556
620	NC_021911	TCG	2	6	33186	33191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837556
621	NC_021911	CCG	3	9	33288	33296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837556
622	NC_021911	GGC	2	6	33314	33319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837556
623	NC_021911	GAGGG	2	10	33344	33353	20 %	0 %	80 %	0 %	528837556
624	NC_021911	TGC	2	6	33367	33372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837556
625	NC_021911	GCG	2	6	33376	33381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837556
626	NC_021911	ATCTGC	2	12	33438	33449	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	528837556
627	NC_021911	CG	3	6	33450	33455	0 %	0 %	50 %	50 %	528837556
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629	NC_021911	CGCC	2	8	33469	33476	0 %	0 %	25 %	75 %	528837556
630	NC_021911	CGA	2	6	33479	33484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837556
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649	NC_021911	GCA	2	6	34467	34472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837557
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751	NC_021911	TCC	2	6	38659	38664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837560
752	NC_021911	TGA	2	6	38678	38683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837560
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756	NC_021911	TGA	2	6	38868	38873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837561
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873	NC_021911	CGG	2	6	43618	43623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837566
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1000	NC_021911	GAT	2	6	51025	51030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837571

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