MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 21250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021911	GCT	2	6	271309	271314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837778
5002	NC_021911	GAT	2	6	271401	271406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837778
5003	NC_021911	CCG	2	6	271411	271416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837778
5004	NC_021911	CAG	2	6	271446	271451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837778
5005	NC_021911	CTTT	2	8	271484	271491	0 %	75 %	0 %	25 %	528837778
5006	NC_021911	TCG	2	6	271492	271497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837778
5007	NC_021911	CGA	2	6	271628	271633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837778
5008	NC_021911	GAT	2	6	271689	271694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837778
5009	NC_021911	CGTCGA	2	12	271712	271723	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528837778
5010	NC_021911	CG	3	6	271739	271744	0 %	0 %	50 %	50 %	528837778
5011	NC_021911	CGC	2	6	271812	271817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837778
5012	NC_021911	GTA	2	6	271849	271854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837778
5013	NC_021911	CGA	2	6	272036	272041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837778
5014	NC_021911	CGC	2	6	272054	272059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837778
5015	NC_021911	GGC	2	6	272265	272270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837779
5016	NC_021911	GC	3	6	272269	272274	0 %	0 %	50 %	50 %	528837779
5017	NC_021911	CGG	2	6	272286	272291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837779
5018	NC_021911	CAGA	2	8	272337	272344	50 %	0 %	25 %	25 %	528837779
5019	NC_021911	CAC	2	6	272355	272360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837779
5020	NC_021911	GGC	2	6	272373	272378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837779
5021	NC_021911	AAAG	2	8	272450	272457	75 %	0 %	25 %	0 %	528837779
5022	NC_021911	GA	3	6	272464	272469	50 %	0 %	50 %	0 %	528837779
5023	NC_021911	ACC	2	6	272517	272522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837779
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5025	NC_021911	CGA	2	6	272567	272572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837779
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5030	NC_021911	GGA	2	6	272829	272834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837779
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5034	NC_021911	CAG	2	6	273006	273011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837779
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5036	NC_021911	GCTC	2	8	273073	273080	0 %	25 %	25 %	50 %	528837779
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5041	NC_021911	ACA	2	6	273173	273178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528837779
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5044	NC_021911	GA	3	6	273271	273276	50 %	0 %	50 %	0 %	528837779
5045	NC_021911	ACC	2	6	273301	273306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837779
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5048	NC_021911	GA	3	6	273455	273460	50 %	0 %	50 %	0 %	528837779
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5053	NC_021911	TCG	2	6	273832	273837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837780
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5056	NC_021911	ACG	2	6	273889	273894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837780
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5059	NC_021911	CGA	2	6	273968	273973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837780
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5061	NC_021911	CGG	2	6	274007	274012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837780
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5121	NC_021911	GAC	2	6	279737	279742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837784
5122	NC_021911	GAA	2	6	279877	279882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837784
5123	NC_021911	CT	3	6	279886	279891	0 %	50 %	0 %	50 %	528837784
5124	NC_021911	CCG	2	6	279934	279939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837784
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5150	NC_021911	CGG	2	6	281300	281305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837784
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5152	NC_021911	AAGCT	2	10	281373	281382	40 %	20 %	20 %	20 %	528837784
5153	NC_021911	AGC	2	6	281412	281417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837784
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5156	NC_021911	TGC	2	6	281614	281619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837784
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5240	NC_021911	CGG	3	9	288413	288421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837790
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5242	NC_021911	GAC	2	6	288453	288458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837790
5243	NC_021911	CGG	2	6	288478	288483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837790
5244	NC_021911	GAC	2	6	288558	288563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837790
5245	NC_021911	CCA	2	6	288579	288584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837790
5246	NC_021911	TCG	2	6	288632	288637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837790
5247	NC_021911	TGCGA	2	10	288643	288652	20 %	20 %	40 %	20 %	528837790
5248	NC_021911	CGC	2	6	288681	288686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837790
5249	NC_021911	CTG	2	6	288712	288717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837790
5250	NC_021911	GGA	2	6	288741	288746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837790
5251	NC_021911	CTC	2	6	288781	288786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837790
5252	NC_021911	TCG	2	6	288814	288819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837790
5253	NC_021911	TGA	2	6	288824	288829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837790
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5255	NC_021911	AGC	2	6	288854	288859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837790
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5258	NC_021911	TCG	2	6	288929	288934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837790
5259	NC_021911	TCGTGG	2	12	288959	288970	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	528837790
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5261	NC_021911	GTT	2	6	289020	289025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528837790
5262	NC_021911	CCG	2	6	289042	289047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837790
5263	NC_021911	GGCG	2	8	289086	289093	0 %	0 %	75 %	25 %	528837790
5264	NC_021911	GGA	2	6	289223	289228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837791
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5266	NC_021911	CTG	2	6	289276	289281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837791
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5269	NC_021911	AGA	2	6	289417	289422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837791
5270	NC_021911	GC	3	6	289504	289509	0 %	0 %	50 %	50 %	528837791
5271	NC_021911	GC	3	6	289564	289569	0 %	0 %	50 %	50 %	528837791
5272	NC_021911	TGG	2	6	289683	289688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837791
5273	NC_021911	GCCG	2	8	289769	289776	0 %	0 %	50 %	50 %	528837791
5274	NC_021911	GCA	2	6	289856	289861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837791
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5347	NC_021911	CAT	2	6	292781	292786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837794
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5358	NC_021911	CGG	2	6	293177	293182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837794
5359	NC_021911	CTG	2	6	293208	293213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837794
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5361	NC_021911	GCA	2	6	293276	293281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837794
5362	NC_021911	GCT	3	9	293285	293293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837794
5363	NC_021911	GCTG	2	8	293299	293306	0 %	25 %	50 %	25 %	528837794
5364	NC_021911	GCT	2	6	293321	293326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837794
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5370	NC_021911	CAGA	2	8	293617	293624	50 %	0 %	25 %	25 %	528837795
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5482	NC_021911	GAA	2	6	299313	299318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837802
5483	NC_021911	CGG	2	6	299340	299345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837802
5484	NC_021911	ATA	2	6	299364	299369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528837802
5485	NC_021911	CGG	2	6	299388	299393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837802
5486	NC_021911	CAC	2	6	299507	299512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837802
5487	NC_021911	CCG	2	6	299583	299588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837802
5488	NC_021911	AGGCA	2	10	299603	299612	40 %	0 %	40 %	20 %	528837802
5489	NC_021911	GTC	2	6	299613	299618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837802
5490	NC_021911	CGA	2	6	299648	299653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837802
5491	NC_021911	ACG	2	6	299689	299694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837802
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