MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetNIM1c

Total Repeats: 395

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021910	AG	3	6	446	451	50 %	0 %	50 %	0 %	528835311
2	NC_021910	GA	3	6	1752	1757	50 %	0 %	50 %	0 %	528835312
3	NC_021910	CG	3	6	2210	2215	0 %	0 %	50 %	50 %	528835313
4	NC_021910	GC	3	6	3271	3276	0 %	0 %	50 %	50 %	528835315
5	NC_021910	GC	3	6	3947	3952	0 %	0 %	50 %	50 %	528835315
6	NC_021910	GC	3	6	4756	4761	0 %	0 %	50 %	50 %	528835316
7	NC_021910	CG	3	6	5565	5570	0 %	0 %	50 %	50 %	528835316
8	NC_021910	GC	5	10	5931	5940	0 %	0 %	50 %	50 %	528835317
9	NC_021910	GC	3	6	6010	6015	0 %	0 %	50 %	50 %	528835317
10	NC_021910	GC	3	6	6063	6068	0 %	0 %	50 %	50 %	528835317
11	NC_021910	TC	3	6	6712	6717	0 %	50 %	0 %	50 %	528835317
12	NC_021910	CG	3	6	6983	6988	0 %	0 %	50 %	50 %	528835318
13	NC_021910	GC	3	6	7325	7330	0 %	0 %	50 %	50 %	528835318
14	NC_021910	GC	4	8	8020	8027	0 %	0 %	50 %	50 %	528835320
15	NC_021910	CG	4	8	8239	8246	0 %	0 %	50 %	50 %	528835320
16	NC_021910	GT	3	6	9228	9233	0 %	50 %	50 %	0 %	528835321
17	NC_021910	TG	3	6	9984	9989	0 %	50 %	50 %	0 %	528835321
18	NC_021910	AT	3	6	11244	11249	50 %	50 %	0 %	0 %	528835323
19	NC_021910	CG	3	6	11461	11466	0 %	0 %	50 %	50 %	528835324
20	NC_021910	GA	3	6	12148	12153	50 %	0 %	50 %	0 %	528835324
21	NC_021910	CA	3	6	12170	12175	50 %	0 %	0 %	50 %	528835325
22	NC_021910	CG	3	6	12658	12663	0 %	0 %	50 %	50 %	528835325
23	NC_021910	GA	3	6	12917	12922	50 %	0 %	50 %	0 %	528835325
24	NC_021910	GT	4	8	13180	13187	0 %	50 %	50 %	0 %	528835325
25	NC_021910	GC	3	6	14157	14162	0 %	0 %	50 %	50 %	528835326
26	NC_021910	CG	3	6	15711	15716	0 %	0 %	50 %	50 %	528835328
27	NC_021910	AT	3	6	16048	16053	50 %	50 %	0 %	0 %	528835328
28	NC_021910	CA	3	6	16128	16133	50 %	0 %	0 %	50 %	528835328
29	NC_021910	GC	3	6	17296	17301	0 %	0 %	50 %	50 %	528835330
30	NC_021910	CG	3	6	20427	20432	0 %	0 %	50 %	50 %	528835335
31	NC_021910	CG	3	6	20455	20460	0 %	0 %	50 %	50 %	528835335
32	NC_021910	TC	3	6	20759	20764	0 %	50 %	0 %	50 %	528835335
33	NC_021910	TC	3	6	21906	21911	0 %	50 %	0 %	50 %	528835336
34	NC_021910	TC	3	6	22152	22157	0 %	50 %	0 %	50 %	528835336
35	NC_021910	GC	3	6	23170	23175	0 %	0 %	50 %	50 %	528835336
36	NC_021910	CG	4	8	23549	23556	0 %	0 %	50 %	50 %	528835336
37	NC_021910	GC	3	6	24258	24263	0 %	0 %	50 %	50 %	528835338
38	NC_021910	CG	4	8	26264	26271	0 %	0 %	50 %	50 %	528835339
39	NC_021910	AG	3	6	27259	27264	50 %	0 %	50 %	0 %	528835339
40	NC_021910	GC	3	6	28878	28883	0 %	0 %	50 %	50 %	528835341
41	NC_021910	AT	3	6	31039	31044	50 %	50 %	0 %	0 %	528835342
42	NC_021910	CG	3	6	31354	31359	0 %	0 %	50 %	50 %	528835343
43	NC_021910	CT	3	6	31422	31427	0 %	50 %	0 %	50 %	528835343
44	NC_021910	TG	3	6	31510	31515	0 %	50 %	50 %	0 %	528835343
45	NC_021910	GA	3	6	31536	31541	50 %	0 %	50 %	0 %	528835343
46	NC_021910	CG	3	6	32140	32145	0 %	0 %	50 %	50 %	528835343
47	NC_021910	TG	3	6	32252	32257	0 %	50 %	50 %	0 %	528835344
48	NC_021910	TC	3	6	32261	32266	0 %	50 %	0 %	50 %	528835344
49	NC_021910	TC	3	6	32847	32852	0 %	50 %	0 %	50 %	528835344
50	NC_021910	CG	3	6	33721	33726	0 %	0 %	50 %	50 %	528835345
51	NC_021910	GC	3	6	34309	34314	0 %	0 %	50 %	50 %	528835346
52	NC_021910	AG	3	6	36057	36062	50 %	0 %	50 %	0 %	528835347
53	NC_021910	CA	3	6	36225	36230	50 %	0 %	0 %	50 %	528835347
54	NC_021910	TC	3	6	38042	38047	0 %	50 %	0 %	50 %	528835350
55	NC_021910	CT	3	6	38348	38353	0 %	50 %	0 %	50 %	528835350
56	NC_021910	TA	3	6	38399	38404	50 %	50 %	0 %	0 %	528835350
57	NC_021910	CG	3	6	39687	39692	0 %	0 %	50 %	50 %	528835352
58	NC_021910	CT	3	6	40231	40236	0 %	50 %	0 %	50 %	528835353
59	NC_021910	AG	3	6	40771	40776	50 %	0 %	50 %	0 %	528835353
60	NC_021910	TC	3	6	41957	41962	0 %	50 %	0 %	50 %	528835354
61	NC_021910	CG	3	6	42197	42202	0 %	0 %	50 %	50 %	528835355
62	NC_021910	TG	3	6	44161	44166	0 %	50 %	50 %	0 %	528835356
63	NC_021910	CT	3	6	44544	44549	0 %	50 %	0 %	50 %	528835357
64	NC_021910	CG	3	6	44956	44961	0 %	0 %	50 %	50 %	528835357
65	NC_021910	CG	3	6	46016	46021	0 %	0 %	50 %	50 %	528835358
66	NC_021910	GT	3	6	46409	46414	0 %	50 %	50 %	0 %	528835359
67	NC_021910	CG	3	6	47572	47577	0 %	0 %	50 %	50 %	528835361
68	NC_021910	GC	3	6	48065	48070	0 %	0 %	50 %	50 %	528835361
69	NC_021910	GC	3	6	48989	48994	0 %	0 %	50 %	50 %	528835363
70	NC_021910	CG	3	6	49235	49240	0 %	0 %	50 %	50 %	528835363
71	NC_021910	AC	3	6	49872	49877	50 %	0 %	0 %	50 %	528835364
72	NC_021910	CG	3	6	49925	49930	0 %	0 %	50 %	50 %	528835364
73	NC_021910	GA	3	6	53203	53208	50 %	0 %	50 %	0 %	528835366
74	NC_021910	GC	3	6	55030	55035	0 %	0 %	50 %	50 %	528835368
75	NC_021910	GC	3	6	55522	55527	0 %	0 %	50 %	50 %	528835368
76	NC_021910	GC	3	6	55859	55864	0 %	0 %	50 %	50 %	528835368
77	NC_021910	TC	3	6	56609	56614	0 %	50 %	0 %	50 %	528835369
78	NC_021910	CG	3	6	57153	57158	0 %	0 %	50 %	50 %	528835370
79	NC_021910	CG	3	6	58102	58107	0 %	0 %	50 %	50 %	528835371
80	NC_021910	GC	3	6	58548	58553	0 %	0 %	50 %	50 %	528835371
81	NC_021910	TC	4	8	58886	58893	0 %	50 %	0 %	50 %	528835372
82	NC_021910	TC	3	6	58938	58943	0 %	50 %	0 %	50 %	528835372
83	NC_021910	CG	3	6	59171	59176	0 %	0 %	50 %	50 %	528835372
84	NC_021910	GC	3	6	59179	59184	0 %	0 %	50 %	50 %	528835372
85	NC_021910	GC	3	6	60654	60659	0 %	0 %	50 %	50 %	528835373
86	NC_021910	GC	3	6	60723	60728	0 %	0 %	50 %	50 %	528835373
87	NC_021910	GC	3	6	62373	62378	0 %	0 %	50 %	50 %	528835375
88	NC_021910	GA	3	6	63122	63127	50 %	0 %	50 %	0 %	528835377
89	NC_021910	GC	3	6	63850	63855	0 %	0 %	50 %	50 %	528835378
90	NC_021910	TA	3	6	64622	64627	50 %	50 %	0 %	0 %	528835379
91	NC_021910	GC	3	6	64810	64815	0 %	0 %	50 %	50 %	528835379
92	NC_021910	AT	3	6	65060	65065	50 %	50 %	0 %	0 %	528835379
93	NC_021910	GC	3	6	66089	66094	0 %	0 %	50 %	50 %	528835381
94	NC_021910	GA	3	6	66287	66292	50 %	0 %	50 %	0 %	528835381
95	NC_021910	CG	3	6	66406	66411	0 %	0 %	50 %	50 %	528835381
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97	NC_021910	GA	3	6	68648	68653	50 %	0 %	50 %	0 %	528835384
98	NC_021910	AG	3	6	69120	69125	50 %	0 %	50 %	0 %	528835385
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100	NC_021910	GC	3	6	70770	70775	0 %	0 %	50 %	50 %	528835386
101	NC_021910	GC	3	6	71259	71264	0 %	0 %	50 %	50 %	528835387
102	NC_021910	CG	3	6	71410	71415	0 %	0 %	50 %	50 %	528835387
103	NC_021910	GC	3	6	71833	71838	0 %	0 %	50 %	50 %	528835388
104	NC_021910	AT	3	6	72393	72398	50 %	50 %	0 %	0 %	528835388
105	NC_021910	AG	3	6	73165	73170	50 %	0 %	50 %	0 %	528835390
106	NC_021910	GC	3	6	73418	73423	0 %	0 %	50 %	50 %	528835390
107	NC_021910	CG	3	6	74100	74105	0 %	0 %	50 %	50 %	528835390
108	NC_021910	CG	3	6	74147	74152	0 %	0 %	50 %	50 %	528835390
109	NC_021910	GA	3	6	74165	74170	50 %	0 %	50 %	0 %	528835390
110	NC_021910	CG	3	6	74296	74301	0 %	0 %	50 %	50 %	528835391
111	NC_021910	GC	4	8	74791	74798	0 %	0 %	50 %	50 %	528835391
112	NC_021910	GA	3	6	74896	74901	50 %	0 %	50 %	0 %	528835391
113	NC_021910	GC	3	6	75048	75053	0 %	0 %	50 %	50 %	528835392
114	NC_021910	GC	3	6	75587	75592	0 %	0 %	50 %	50 %	528835392
115	NC_021910	GC	3	6	76105	76110	0 %	0 %	50 %	50 %	528835393
116	NC_021910	CT	3	6	76399	76404	0 %	50 %	0 %	50 %	528835393
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119	NC_021910	CG	3	6	78114	78119	0 %	0 %	50 %	50 %	528835395
120	NC_021910	GC	3	6	78375	78380	0 %	0 %	50 %	50 %	528835395
121	NC_021910	CG	3	6	79270	79275	0 %	0 %	50 %	50 %	528835396
122	NC_021910	CG	3	6	79286	79291	0 %	0 %	50 %	50 %	528835396
123	NC_021910	GC	3	6	79381	79386	0 %	0 %	50 %	50 %	528835396
124	NC_021910	TG	3	6	79953	79958	0 %	50 %	50 %	0 %	528835396
125	NC_021910	GC	3	6	80537	80542	0 %	0 %	50 %	50 %	528835396
126	NC_021910	CG	3	6	80857	80862	0 %	0 %	50 %	50 %	528835396
127	NC_021910	CG	3	6	81573	81578	0 %	0 %	50 %	50 %	528835396
128	NC_021910	GC	4	8	81947	81954	0 %	0 %	50 %	50 %	528835396
129	NC_021910	TC	3	6	82191	82196	0 %	50 %	0 %	50 %	528835396
130	NC_021910	TC	3	6	82203	82208	0 %	50 %	0 %	50 %	528835396
131	NC_021910	GC	3	6	82274	82279	0 %	0 %	50 %	50 %	528835396
132	NC_021910	CG	3	6	82319	82324	0 %	0 %	50 %	50 %	528835396
133	NC_021910	GA	3	6	82829	82834	50 %	0 %	50 %	0 %	528835397
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135	NC_021910	TG	3	6	84015	84020	0 %	50 %	50 %	0 %	528835398
136	NC_021910	CG	3	6	85517	85522	0 %	0 %	50 %	50 %	528835399
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138	NC_021910	GC	3	6	87364	87369	0 %	0 %	50 %	50 %	528835400
139	NC_021910	CT	3	6	87550	87555	0 %	50 %	0 %	50 %	528835400
140	NC_021910	CG	3	6	88980	88985	0 %	0 %	50 %	50 %	528835402
141	NC_021910	CG	3	6	89101	89106	0 %	0 %	50 %	50 %	528835402
142	NC_021910	CG	3	6	89207	89212	0 %	0 %	50 %	50 %	528835402
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.