MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetNIM1c

Total Repeats: 4540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021910	GGCC	2	8	150611	150618	0 %	0 %	50 %	50 %	528835458
2502	NC_021910	GTC	2	6	150641	150646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835458
2503	NC_021910	GCC	2	6	150727	150732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835458
2504	NC_021910	CA	3	6	150758	150763	50 %	0 %	0 %	50 %	528835458
2505	NC_021910	CCA	2	6	150929	150934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835459
2506	NC_021910	AG	4	8	151186	151193	50 %	0 %	50 %	0 %	528835459
2507	NC_021910	GTG	2	6	151210	151215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835459
2508	NC_021910	GAG	2	6	151241	151246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835459
2509	NC_021910	TCT	2	6	151284	151289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835459
2510	NC_021910	CGA	2	6	151315	151320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835459
2511	NC_021910	TCG	2	6	151350	151355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835459
2512	NC_021910	GCC	2	6	151410	151415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835459
2513	NC_021910	CTG	2	6	151425	151430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835459
2514	NC_021910	T	6	6	151466	151471	0 %	100 %	0 %	0 %	528835459
2515	NC_021910	CAT	2	6	151507	151512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835459
2516	NC_021910	GAG	2	6	151553	151558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835459
2517	NC_021910	GGTGT	2	10	151672	151681	0 %	40 %	60 %	0 %	528835459
2518	NC_021910	CGAT	2	8	151824	151831	25 %	25 %	25 %	25 %	528835459
2519	NC_021910	CGTCGC	2	12	151836	151847	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528835459
2520	NC_021910	TCG	2	6	151860	151865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835459
2521	NC_021910	GAG	2	6	151889	151894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835459
2522	NC_021910	AGC	2	6	151908	151913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835459
2523	NC_021910	ACG	2	6	151962	151967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835459
2524	NC_021910	GTTGGT	2	12	152018	152029	0 %	50 %	50 %	0 %	528835459
2525	NC_021910	G	6	6	152039	152044	0 %	0 %	100 %	0 %	528835459
2526	NC_021910	TCG	2	6	152124	152129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835459
2527	NC_021910	TCC	2	6	152160	152165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835459
2528	NC_021910	TGC	2	6	152191	152196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835459
2529	NC_021910	GAC	2	6	152231	152236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835459
2530	NC_021910	TTG	2	6	152297	152302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835459
2531	NC_021910	CGT	2	6	152355	152360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835459
2532	NC_021910	ATG	2	6	152363	152368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835459
2533	NC_021910	CCT	2	6	152380	152385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835459
2534	NC_021910	GGC	2	6	152423	152428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835459
2535	NC_021910	GGC	2	6	152455	152460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835459
2536	NC_021910	GCT	2	6	152504	152509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835459
2537	NC_021910	GGT	3	9	152573	152581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835459
2538	NC_021910	CCG	2	6	152595	152600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835459
2539	NC_021910	CAT	2	6	152653	152658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835459
2540	NC_021910	CCA	2	6	152795	152800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835459
2541	NC_021910	TGC	2	6	152812	152817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835459
2542	NC_021910	ATC	2	6	152841	152846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835459
2543	NC_021910	CCT	2	6	152902	152907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835459
2544	NC_021910	TGG	2	6	152922	152927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835459
2545	NC_021910	GCG	2	6	152937	152942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835459
2546	NC_021910	TAA	2	6	153201	153206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528835460
2547	NC_021910	AAC	2	6	153352	153357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835460
2548	NC_021910	ACG	2	6	153532	153537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835461
2549	NC_021910	TCT	2	6	153581	153586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835461
2550	NC_021910	TGG	2	6	153620	153625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835461
2551	NC_021910	CGA	2	6	153642	153647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835461
2552	NC_021910	AAG	2	6	153649	153654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835461
2553	NC_021910	ACG	2	6	153692	153697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835461
2554	NC_021910	AGTTGG	2	12	153750	153761	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	528835461
2555	NC_021910	GAA	2	6	153798	153803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835461
2556	NC_021910	ATG	2	6	153883	153888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835461
2557	NC_021910	GTC	2	6	153905	153910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835461
2558	NC_021910	CGAAA	2	10	154003	154012	60 %	0 %	20 %	20 %	528835461
2559	NC_021910	TGGC	2	8	154046	154053	0 %	25 %	50 %	25 %	528835461
2560	NC_021910	CGAG	2	8	154071	154078	25 %	0 %	50 %	25 %	528835461
2561	NC_021910	TTG	2	6	154174	154179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835461
2562	NC_021910	CGG	2	6	154226	154231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835461
2563	NC_021910	TGT	2	6	154241	154246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835461
2564	NC_021910	CTGC	2	8	154257	154264	0 %	25 %	25 %	50 %	528835461
2565	NC_021910	TGG	2	6	154310	154315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835461
2566	NC_021910	GC	4	8	154330	154337	0 %	0 %	50 %	50 %	528835461
2567	NC_021910	ACG	2	6	154406	154411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835461
2568	NC_021910	AGC	2	6	154551	154556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835461
2569	NC_021910	GA	3	6	154565	154570	50 %	0 %	50 %	0 %	528835461
2570	NC_021910	TTG	2	6	154613	154618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835461
2571	NC_021910	GAA	2	6	154629	154634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835461
2572	NC_021910	TTA	2	6	154667	154672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528835461
2573	NC_021910	TGGC	2	8	154749	154756	0 %	25 %	50 %	25 %	528835461
2574	NC_021910	GAA	2	6	154765	154770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835461
2575	NC_021910	TGA	2	6	154812	154817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835461
2576	NC_021910	GC	3	6	154831	154836	0 %	0 %	50 %	50 %	528835461
2577	NC_021910	TGG	2	6	154852	154857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835461
2578	NC_021910	TCG	2	6	154928	154933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835461
2579	NC_021910	ATCTTC	2	12	155039	155050	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	528835462
2580	NC_021910	GAT	2	6	155293	155298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835462
2581	NC_021910	GGC	2	6	155492	155497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835462
2582	NC_021910	CAC	2	6	155663	155668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835462
2583	NC_021910	GAA	2	6	155674	155679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835462
2584	NC_021910	CGG	2	6	155731	155736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835462
2585	NC_021910	GTC	2	6	155786	155791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835462
2586	NC_021910	ATC	2	6	155819	155824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835462
2587	NC_021910	TCT	2	6	155869	155874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835462
2588	NC_021910	GATC	2	8	155896	155903	25 %	25 %	25 %	25 %	528835462
2589	NC_021910	CT	4	8	155926	155933	0 %	50 %	0 %	50 %	528835463
2590	NC_021910	AAGCG	2	10	155989	155998	40 %	0 %	40 %	20 %	528835463
2591	NC_021910	CGCT	2	8	156082	156089	0 %	25 %	25 %	50 %	528835463
2592	NC_021910	GCA	2	6	156110	156115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835463
2593	NC_021910	CAT	2	6	156254	156259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835463
2594	NC_021910	TGT	2	6	156287	156292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835463
2595	NC_021910	TTG	2	6	156385	156390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835463
2596	NC_021910	TGT	2	6	156437	156442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835463
2597	NC_021910	TGG	2	6	156485	156490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835463
2598	NC_021910	CG	3	6	156491	156496	0 %	0 %	50 %	50 %	528835463
2599	NC_021910	GGC	2	6	156514	156519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835463
2600	NC_021910	C	7	7	156540	156546	0 %	0 %	0 %	100 %	528835463
2601	NC_021910	CG	3	6	156889	156894	0 %	0 %	50 %	50 %	528835464
2602	NC_021910	TTG	2	6	156941	156946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835464
2603	NC_021910	CT	3	6	156977	156982	0 %	50 %	0 %	50 %	528835464
2604	NC_021910	TCC	2	6	156986	156991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835464
2605	NC_021910	GGC	2	6	157024	157029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835464
2606	NC_021910	TCT	2	6	157053	157058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835464
2607	NC_021910	GCG	2	6	157263	157268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835464
2608	NC_021910	AAC	2	6	157273	157278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835464
2609	NC_021910	TCG	2	6	157418	157423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835464
2610	NC_021910	TCA	2	6	157457	157462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835464
2611	NC_021910	CA	3	6	157461	157466	50 %	0 %	0 %	50 %	528835464
2612	NC_021910	TCG	3	9	157608	157616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835464
2613	NC_021910	GCC	2	6	157771	157776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835464
2614	NC_021910	GTT	2	6	157865	157870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835465
2615	NC_021910	CGTTT	2	10	157907	157916	0 %	60 %	20 %	20 %	528835465
2616	NC_021910	GCA	2	6	157923	157928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835465
2617	NC_021910	TCG	2	6	157945	157950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835465
2618	NC_021910	CG	3	6	157979	157984	0 %	0 %	50 %	50 %	528835465
2619	NC_021910	GCGG	2	8	158014	158021	0 %	0 %	75 %	25 %	528835465
2620	NC_021910	GCC	3	9	158077	158085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835465
2621	NC_021910	CAG	2	6	158137	158142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835465
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2864	NC_021910	CCG	2	6	181490	181495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835479
2865	NC_021910	TG	3	6	181531	181536	0 %	50 %	50 %	0 %	528835479
2866	NC_021910	TCT	2	6	181550	181555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835479
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2868	NC_021910	AGC	2	6	181627	181632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835479
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2872	NC_021910	GATT	2	8	181671	181678	25 %	50 %	25 %	0 %	528835479
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2895	NC_021910	ATCGT	2	10	183118	183127	20 %	40 %	20 %	20 %	528835480
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2897	NC_021910	GCA	3	9	183385	183393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835480
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2961	NC_021910	GCCAGC	2	12	187588	187599	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528835483
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2966	NC_021910	TCGA	2	8	187889	187896	25 %	25 %	25 %	25 %	528835483
2967	NC_021910	CAG	2	6	187921	187926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835483
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2970	NC_021910	CTGG	2	8	188042	188049	0 %	25 %	50 %	25 %	528835483
2971	NC_021910	GCC	2	6	188079	188084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835483
2972	NC_021910	CAA	2	6	188088	188093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835483
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2976	NC_021910	AACC	2	8	188321	188328	50 %	0 %	0 %	50 %	528835483
2977	NC_021910	GCT	2	6	188358	188363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835483
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2983	NC_021910	CG	3	6	188437	188442	0 %	0 %	50 %	50 %	528835483
2984	NC_021910	TCA	2	6	188480	188485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835483
2985	NC_021910	TC	3	6	188503	188508	0 %	50 %	0 %	50 %	528835483
2986	NC_021910	CTT	2	6	188529	188534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835483
2987	NC_021910	GAA	2	6	188571	188576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835483
2988	NC_021910	GAG	2	6	188626	188631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835483
2989	NC_021910	GCTC	2	8	188640	188647	0 %	25 %	25 %	50 %	528835483
2990	NC_021910	TGG	2	6	188665	188670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835483
2991	NC_021910	AT	3	6	188700	188705	50 %	50 %	0 %	0 %	528835483
2992	NC_021910	GGC	2	6	188784	188789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835483
2993	NC_021910	AGACTA	2	12	189046	189057	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	528835484
2994	NC_021910	GCC	2	6	189065	189070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835484
2995	NC_021910	AGT	2	6	189167	189172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835484
2996	NC_021910	ACT	2	6	189303	189308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835484
2997	NC_021910	AACC	2	8	189340	189347	50 %	0 %	0 %	50 %	528835484
2998	NC_021910	CCA	2	6	189372	189377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835484
2999	NC_021910	GCT	2	6	189473	189478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835484
3000	NC_021910	CGC	2	6	189600	189605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835484

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