MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetNIM1c

Total Repeats: 4540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021910	GCT	2	6	85238	85243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835399
1502	NC_021910	A	7	7	85288	85294	100 %	0 %	0 %	0 %	528835399
1503	NC_021910	GAT	2	6	85436	85441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835399
1504	NC_021910	AAT	2	6	85496	85501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528835399
1505	NC_021910	CG	3	6	85517	85522	0 %	0 %	50 %	50 %	528835399
1506	NC_021910	GCC	2	6	85578	85583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835399
1507	NC_021910	TGC	2	6	85700	85705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835399
1508	NC_021910	TGAGC	2	10	85706	85715	20 %	20 %	40 %	20 %	528835399
1509	NC_021910	GTC	2	6	85767	85772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835399
1510	NC_021910	GGA	2	6	85844	85849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835399
1511	NC_021910	CGA	2	6	85854	85859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835399
1512	NC_021910	GAAG	2	8	85862	85869	50 %	0 %	50 %	0 %	528835399
1513	NC_021910	CAA	2	6	85874	85879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835399
1514	NC_021910	TTC	2	6	85907	85912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835399
1515	NC_021910	CGAAC	2	10	85986	85995	40 %	0 %	20 %	40 %	528835399
1516	NC_021910	GGCA	2	8	86072	86079	25 %	0 %	50 %	25 %	528835399
1517	NC_021910	CCG	3	9	86110	86118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835399
1518	NC_021910	TCG	2	6	86121	86126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835399
1519	NC_021910	CCA	2	6	86222	86227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835399
1520	NC_021910	CTTG	2	8	86234	86241	0 %	50 %	25 %	25 %	528835399
1521	NC_021910	TCC	2	6	86334	86339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835399
1522	NC_021910	TTGA	2	8	86364	86371	25 %	50 %	25 %	0 %	528835399
1523	NC_021910	TCG	2	6	86407	86412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835399
1524	NC_021910	A	6	6	86434	86439	100 %	0 %	0 %	0 %	528835399
1525	NC_021910	TTA	2	6	86458	86463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528835399
1526	NC_021910	TGC	2	6	86483	86488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835399
1527	NC_021910	CGA	2	6	86494	86499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835399
1528	NC_021910	CGA	2	6	86530	86535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835399
1529	NC_021910	CAG	2	6	86566	86571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835399
1530	NC_021910	GAA	2	6	86580	86585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835399
1531	NC_021910	AG	3	6	86839	86844	50 %	0 %	50 %	0 %	528835400
1532	NC_021910	CTC	2	6	86866	86871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835400
1533	NC_021910	GCT	2	6	86876	86881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835400
1534	NC_021910	ACG	2	6	86981	86986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835400
1535	NC_021910	CCA	2	6	87000	87005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835400
1536	NC_021910	CTGT	2	8	87020	87027	0 %	50 %	25 %	25 %	528835400
1537	NC_021910	TCA	2	6	87204	87209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835400
1538	NC_021910	CTG	2	6	87305	87310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835400
1539	NC_021910	GC	3	6	87364	87369	0 %	0 %	50 %	50 %	528835400
1540	NC_021910	ATC	2	6	87472	87477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835400
1541	NC_021910	CT	3	6	87550	87555	0 %	50 %	0 %	50 %	528835400
1542	NC_021910	CTG	2	6	87607	87612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835400
1543	NC_021910	GTC	2	6	87628	87633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835400
1544	NC_021910	CGA	2	6	87642	87647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835400
1545	NC_021910	TCATT	2	10	87684	87693	20 %	60 %	0 %	20 %	528835400
1546	NC_021910	CAAAT	2	10	87839	87848	60 %	20 %	0 %	20 %	528835401
1547	NC_021910	CAG	2	6	87968	87973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835401
1548	NC_021910	CAG	2	6	87997	88002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835401
1549	NC_021910	ATG	2	6	88051	88056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835402
1550	NC_021910	CCA	2	6	88067	88072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835402
1551	NC_021910	GAG	2	6	88099	88104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835402
1552	NC_021910	GTG	2	6	88160	88165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835402
1553	NC_021910	TCC	2	6	88217	88222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835402
1554	NC_021910	CGTG	2	8	88260	88267	0 %	25 %	50 %	25 %	528835402
1555	NC_021910	CGAA	2	8	88274	88281	50 %	0 %	25 %	25 %	528835402
1556	NC_021910	TGGG	2	8	88356	88363	0 %	25 %	75 %	0 %	528835402
1557	NC_021910	TTCGAA	2	12	88372	88383	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	528835402
1558	NC_021910	ATT	2	6	88457	88462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528835402
1559	NC_021910	CGC	2	6	88521	88526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835402
1560	NC_021910	GGC	2	6	88558	88563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835402
1561	NC_021910	CAACG	2	10	88622	88631	40 %	0 %	20 %	40 %	528835402
1562	NC_021910	TGT	2	6	88650	88655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835402
1563	NC_021910	GCC	2	6	88659	88664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835402
1564	NC_021910	ATG	2	6	88693	88698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835402
1565	NC_021910	TTC	2	6	88801	88806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835402
1566	NC_021910	GCGG	2	8	88818	88825	0 %	0 %	75 %	25 %	528835402
1567	NC_021910	CG	3	6	88980	88985	0 %	0 %	50 %	50 %	528835402
1568	NC_021910	GGA	2	6	89019	89024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835402
1569	NC_021910	GCC	2	6	89033	89038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835402
1570	NC_021910	GCG	2	6	89087	89092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835402
1571	NC_021910	CG	3	6	89101	89106	0 %	0 %	50 %	50 %	528835402
1572	NC_021910	CG	3	6	89207	89212	0 %	0 %	50 %	50 %	528835402
1573	NC_021910	GCG	2	6	89375	89380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835402
1574	NC_021910	GAATG	2	10	89428	89437	40 %	20 %	40 %	0 %	528835402
1575	NC_021910	TGG	2	6	89642	89647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835402
1576	NC_021910	GTG	2	6	90050	90055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835403
1577	NC_021910	CA	3	6	90064	90069	50 %	0 %	0 %	50 %	528835403
1578	NC_021910	GCA	2	6	90070	90075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835403
1579	NC_021910	GCCTCG	2	12	90096	90107	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528835403
1580	NC_021910	ACA	2	6	90256	90261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835403
1581	NC_021910	CAT	2	6	90526	90531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835404
1582	NC_021910	T	6	6	90531	90536	0 %	100 %	0 %	0 %	528835404
1583	NC_021910	CGG	2	6	90545	90550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835404
1584	NC_021910	GCC	2	6	90567	90572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835404
1585	NC_021910	CAT	2	6	90644	90649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835404
1586	NC_021910	CGA	2	6	90749	90754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835404
1587	NC_021910	GGCG	2	8	90860	90867	0 %	0 %	75 %	25 %	528835404
1588	NC_021910	TCCAGA	2	12	90994	91005	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	528835404
1589	NC_021910	ACG	2	6	91039	91044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835404
1590	NC_021910	TCGC	2	8	91062	91069	0 %	25 %	25 %	50 %	528835404
1591	NC_021910	GCG	2	6	91078	91083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835404
1592	NC_021910	CCT	2	6	91100	91105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835404
1593	NC_021910	GAT	2	6	91125	91130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835404
1594	NC_021910	GCT	2	6	91159	91164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835404
1595	NC_021910	TCT	2	6	91166	91171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835404
1596	NC_021910	GACA	2	8	91195	91202	50 %	0 %	25 %	25 %	528835404
1597	NC_021910	CG	3	6	91217	91222	0 %	0 %	50 %	50 %	528835404
1598	NC_021910	GCG	2	6	91258	91263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835404
1599	NC_021910	TCA	2	6	91522	91527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835405
1600	NC_021910	TTG	2	6	91537	91542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835405
1601	NC_021910	GATC	2	8	91592	91599	25 %	25 %	25 %	25 %	528835405
1602	NC_021910	CTC	2	6	91629	91634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835405
1603	NC_021910	GAC	2	6	91664	91669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835405
1604	NC_021910	CATC	2	8	91713	91720	25 %	25 %	0 %	50 %	528835405
1605	NC_021910	CAAGGA	2	12	91952	91963	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	528835406
1606	NC_021910	GAG	2	6	92006	92011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835407
1607	NC_021910	GC	3	6	92017	92022	0 %	0 %	50 %	50 %	528835407
1608	NC_021910	GCAA	2	8	92046	92053	50 %	0 %	25 %	25 %	528835407
1609	NC_021910	CGC	2	6	92058	92063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835407
1610	NC_021910	CGCTG	2	10	92081	92090	0 %	20 %	40 %	40 %	528835407
1611	NC_021910	CGG	2	6	92164	92169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835407
1612	NC_021910	GCA	2	6	92178	92183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835407
1613	NC_021910	T	7	7	92239	92245	0 %	100 %	0 %	0 %	528835407
1614	NC_021910	GAA	2	6	92276	92281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835407
1615	NC_021910	GC	3	6	92284	92289	0 %	0 %	50 %	50 %	528835407
1616	NC_021910	GGT	2	6	92290	92295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835407
1617	NC_021910	TGA	2	6	92296	92301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835407
1618	NC_021910	AATTC	2	10	92337	92346	40 %	40 %	0 %	20 %	528835407
1619	NC_021910	TGA	2	6	92376	92381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835407
1620	NC_021910	CCT	2	6	92442	92447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835407
1621	NC_021910	ATC	2	6	92474	92479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835407
1622	NC_021910	TCG	2	6	92504	92509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835407
1623	NC_021910	GGA	2	6	92542	92547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835407
1624	NC_021910	GAC	2	6	92594	92599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835407
1625	NC_021910	AGCCAA	2	12	92788	92799	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	528835407
1626	NC_021910	AGG	2	6	93455	93460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835408
1627	NC_021910	CGGC	2	8	93502	93509	0 %	0 %	50 %	50 %	528835408
1628	NC_021910	TGTAAT	2	12	93515	93526	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	528835408
1629	NC_021910	AGC	2	6	93550	93555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835408
1630	NC_021910	TCC	2	6	93558	93563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835408
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1633	NC_021910	CT	3	6	93775	93780	0 %	50 %	0 %	50 %	528835408
1634	NC_021910	GAT	2	6	93785	93790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835408
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1647	NC_021910	C	6	6	94822	94827	0 %	0 %	0 %	100 %	528835409
1648	NC_021910	CCGG	2	8	94848	94855	0 %	0 %	50 %	50 %	528835409
1649	NC_021910	CGT	2	6	94875	94880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835409
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1654	NC_021910	AAAG	2	8	95104	95111	75 %	0 %	25 %	0 %	528835409
1655	NC_021910	GGA	2	6	95127	95132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835409
1656	NC_021910	AAC	2	6	95200	95205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835409
1657	NC_021910	AGAA	2	8	95220	95227	75 %	0 %	25 %	0 %	528835409
1658	NC_021910	ACA	2	6	95230	95235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835409
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1660	NC_021910	CGCA	2	8	95266	95273	25 %	0 %	25 %	50 %	528835409
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1666	NC_021910	TGT	2	6	95571	95576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835409
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1732	NC_021910	ATC	2	6	99723	99728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835413
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1736	NC_021910	TGG	2	6	99874	99879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835413
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1750	NC_021910	GTG	2	6	100665	100670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835413
1751	NC_021910	TGG	2	6	100677	100682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835413
1752	NC_021910	TCCC	2	8	100711	100718	0 %	25 %	0 %	75 %	528835413
1753	NC_021910	AG	3	6	100742	100747	50 %	0 %	50 %	0 %	528835413
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1859	NC_021910	AG	5	10	109359	109368	50 %	0 %	50 %	0 %	528835420
1860	NC_021910	ATG	2	6	109419	109424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835420
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1863	NC_021910	CTT	2	6	109508	109513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835420
1864	NC_021910	AAGC	2	8	109570	109577	50 %	0 %	25 %	25 %	528835420
1865	NC_021910	ATA	2	6	109598	109603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528835420
1866	NC_021910	GTT	2	6	109880	109885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835421
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1868	NC_021910	GT	3	6	109983	109988	0 %	50 %	50 %	0 %	528835421
1869	NC_021910	CGC	2	6	109989	109994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835421
1870	NC_021910	CGGCG	2	10	110001	110010	0 %	0 %	60 %	40 %	528835421
1871	NC_021910	CGT	2	6	110246	110251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835422
1872	NC_021910	TGTC	2	8	110261	110268	0 %	50 %	25 %	25 %	528835422
1873	NC_021910	TTC	2	6	110316	110321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835422
1874	NC_021910	GAC	2	6	110374	110379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835422
1875	NC_021910	A	6	6	110427	110432	100 %	0 %	0 %	0 %	528835422
1876	NC_021910	CCGA	2	8	110530	110537	25 %	0 %	25 %	50 %	528835422
1877	NC_021910	GTT	2	6	110596	110601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835422
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1885	NC_021910	TGTC	2	8	112013	112020	0 %	50 %	25 %	25 %	528835423
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1994	NC_021910	TAG	2	6	119920	119925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835429
1995	NC_021910	AAT	2	6	119957	119962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528835429
1996	NC_021910	A	7	7	119970	119976	100 %	0 %	0 %	0 %	528835429
1997	NC_021910	CTCG	2	8	120050	120057	0 %	25 %	25 %	50 %	528835429
1998	NC_021910	GAGC	2	8	120063	120070	25 %	0 %	50 %	25 %	528835429
1999	NC_021910	TCG	2	6	120090	120095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835429
2000	NC_021910	CGA	2	6	120238	120243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835430

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