MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetNIM1c

Total Repeats: 4540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021910	GC	3	6	59179	59184	0 %	0 %	50 %	50 %	528835372
1002	NC_021910	GTCC	2	8	59298	59305	0 %	25 %	25 %	50 %	528835372
1003	NC_021910	GAC	2	6	59308	59313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835372
1004	NC_021910	CGC	2	6	59319	59324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835372
1005	NC_021910	TGA	2	6	59345	59350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835372
1006	NC_021910	TGG	2	6	59372	59377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835372
1007	NC_021910	TTC	2	6	59383	59388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835372
1008	NC_021910	CGT	2	6	59526	59531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835372
1009	NC_021910	TCC	2	6	59555	59560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835372
1010	NC_021910	ATC	2	6	59626	59631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835372
1011	NC_021910	AACC	2	8	59723	59730	50 %	0 %	0 %	50 %	528835372
1012	NC_021910	ATG	2	6	59785	59790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835373
1013	NC_021910	GAT	2	6	59796	59801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835373
1014	NC_021910	CGC	2	6	59928	59933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835373
1015	NC_021910	CGG	2	6	59934	59939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835373
1016	NC_021910	CGA	2	6	59993	59998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835373
1017	NC_021910	GAT	2	6	60018	60023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835373
1018	NC_021910	GGC	3	9	60078	60086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835373
1019	NC_021910	GGC	2	6	60201	60206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835373
1020	NC_021910	CGGAG	2	10	60210	60219	20 %	0 %	60 %	20 %	528835373
1021	NC_021910	AAG	2	6	60229	60234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835373
1022	NC_021910	AAG	2	6	60244	60249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835373
1023	NC_021910	GGC	2	6	60328	60333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835373
1024	NC_021910	TTTCAT	2	12	60423	60434	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	528835373
1025	NC_021910	GTC	2	6	60502	60507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835373
1026	NC_021910	CGC	2	6	60527	60532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835373
1027	NC_021910	CAA	2	6	60561	60566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835373
1028	NC_021910	CGC	2	6	60618	60623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835373
1029	NC_021910	GC	3	6	60654	60659	0 %	0 %	50 %	50 %	528835373
1030	NC_021910	GC	3	6	60723	60728	0 %	0 %	50 %	50 %	528835373
1031	NC_021910	GAC	2	6	60736	60741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835373
1032	NC_021910	GAC	2	6	60768	60773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835373
1033	NC_021910	GAA	2	6	60886	60891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835373
1034	NC_021910	CTT	2	6	60896	60901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835373
1035	NC_021910	GACCC	2	10	60917	60926	20 %	0 %	20 %	60 %	528835373
1036	NC_021910	GAG	2	6	61038	61043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835374
1037	NC_021910	TCG	2	6	61102	61107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835374
1038	NC_021910	CTC	2	6	61191	61196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835374
1039	NC_021910	GTC	2	6	61203	61208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835374
1040	NC_021910	GGA	2	6	61259	61264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835374
1041	NC_021910	CTC	2	6	61431	61436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835374
1042	NC_021910	GTT	2	6	61520	61525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835374
1043	NC_021910	GCA	2	6	61532	61537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835374
1044	NC_021910	CCT	2	6	61595	61600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835374
1045	NC_021910	CGT	2	6	61606	61611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835374
1046	NC_021910	CCG	2	6	62023	62028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835375
1047	NC_021910	GGA	3	9	62087	62095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835375
1048	NC_021910	GAC	2	6	62096	62101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835375
1049	NC_021910	CGA	3	9	62165	62173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835375
1050	NC_021910	CGA	2	6	62297	62302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835375
1051	NC_021910	GCT	2	6	62329	62334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835375
1052	NC_021910	CGG	2	6	62355	62360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835375
1053	NC_021910	GC	3	6	62373	62378	0 %	0 %	50 %	50 %	528835375
1054	NC_021910	CGTT	2	8	62414	62421	0 %	50 %	25 %	25 %	528835375
1055	NC_021910	TGCG	2	8	62494	62501	0 %	25 %	50 %	25 %	528835376
1056	NC_021910	CAA	2	6	62503	62508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835376
1057	NC_021910	GAT	2	6	62604	62609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835376
1058	NC_021910	GCA	2	6	62616	62621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835376
1059	NC_021910	TGC	2	6	62625	62630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835376
1060	NC_021910	GAT	2	6	62812	62817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835377
1061	NC_021910	CGA	2	6	62896	62901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835377
1062	NC_021910	GGAG	2	8	62926	62933	25 %	0 %	75 %	0 %	528835377
1063	NC_021910	AAAGC	2	10	63014	63023	60 %	0 %	20 %	20 %	528835377
1064	NC_021910	ATGG	2	8	63098	63105	25 %	25 %	50 %	0 %	528835377
1065	NC_021910	GA	3	6	63122	63127	50 %	0 %	50 %	0 %	528835377
1066	NC_021910	AAG	2	6	63128	63133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835377
1067	NC_021910	TGAA	2	8	63201	63208	50 %	25 %	25 %	0 %	528835377
1068	NC_021910	TGA	2	6	63238	63243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835377
1069	NC_021910	TTCA	2	8	63347	63354	25 %	50 %	0 %	25 %	528835377
1070	NC_021910	C	6	6	63398	63403	0 %	0 %	0 %	100 %	528835377
1071	NC_021910	GAT	2	6	63449	63454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835377
1072	NC_021910	TGG	2	6	63523	63528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835377
1073	NC_021910	GCG	2	6	63540	63545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835377
1074	NC_021910	GGCTTT	2	12	63550	63561	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	528835377
1075	NC_021910	CTTG	2	8	63746	63753	0 %	50 %	25 %	25 %	528835378
1076	NC_021910	GGC	2	6	63765	63770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835378
1077	NC_021910	TGC	2	6	63781	63786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835378
1078	NC_021910	ATG	2	6	63798	63803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835378
1079	NC_021910	GC	3	6	63850	63855	0 %	0 %	50 %	50 %	528835378
1080	NC_021910	CGT	2	6	63917	63922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835378
1081	NC_021910	ATC	2	6	63948	63953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835378
1082	NC_021910	TGG	2	6	63968	63973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835378
1083	NC_021910	CTT	2	6	63981	63986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835378
1084	NC_021910	GCG	2	6	64006	64011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835378
1085	NC_021910	TGC	2	6	64073	64078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835378
1086	NC_021910	AGC	2	6	64136	64141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835378
1087	NC_021910	CAA	2	6	64223	64228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835378
1088	NC_021910	ACC	2	6	64296	64301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835378
1089	NC_021910	TGC	2	6	64307	64312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835378
1090	NC_021910	CAG	2	6	64375	64380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835378
1091	NC_021910	GTT	2	6	64392	64397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835378
1092	NC_021910	TCTT	2	8	64467	64474	0 %	75 %	0 %	25 %	528835379
1093	NC_021910	CCT	2	6	64492	64497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835379
1094	NC_021910	GGA	2	6	64547	64552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835379
1095	NC_021910	CAG	2	6	64585	64590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835379
1096	NC_021910	GCC	2	6	64598	64603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835379
1097	NC_021910	TA	3	6	64622	64627	50 %	50 %	0 %	0 %	528835379
1098	NC_021910	CGG	2	6	64773	64778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835379
1099	NC_021910	GC	3	6	64810	64815	0 %	0 %	50 %	50 %	528835379
1100	NC_021910	AGG	2	6	64827	64832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835379
1101	NC_021910	GAT	2	6	64942	64947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835379
1102	NC_021910	GAT	2	6	65008	65013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835379
1103	NC_021910	GCG	2	6	65051	65056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835379
1104	NC_021910	AT	3	6	65060	65065	50 %	50 %	0 %	0 %	528835379
1105	NC_021910	CTC	2	6	65066	65071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835379
1106	NC_021910	TCC	2	6	65079	65084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835379
1107	NC_021910	GCG	2	6	65110	65115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835379
1108	NC_021910	CGG	2	6	65146	65151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835379
1109	NC_021910	ACAGA	2	10	65189	65198	60 %	0 %	20 %	20 %	528835380
1110	NC_021910	CGG	2	6	65384	65389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835380
1111	NC_021910	AGC	2	6	65424	65429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835380
1112	NC_021910	CCG	2	6	65441	65446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835380
1113	NC_021910	CGGA	2	8	65463	65470	25 %	0 %	50 %	25 %	528835380
1114	NC_021910	CAT	2	6	65528	65533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835380
1115	NC_021910	GAG	2	6	65589	65594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835380
1116	NC_021910	GCG	2	6	65621	65626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835380
1117	NC_021910	TAT	2	6	65631	65636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528835380
1118	NC_021910	CAG	2	6	65658	65663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835380
1119	NC_021910	TGT	2	6	65710	65715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835380
1120	NC_021910	TGA	2	6	65717	65722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835380
1121	NC_021910	TGG	2	6	65749	65754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835380
1122	NC_021910	TCC	2	6	65860	65865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835380
1123	NC_021910	CGC	2	6	66029	66034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835381
1124	NC_021910	GTC	2	6	66063	66068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835381
1125	NC_021910	GC	3	6	66089	66094	0 %	0 %	50 %	50 %	528835381
1126	NC_021910	CCA	2	6	66108	66113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835381
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1129	NC_021910	CG	3	6	66406	66411	0 %	0 %	50 %	50 %	528835381
1130	NC_021910	GGC	3	9	66536	66544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835381
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1132	NC_021910	GGC	2	6	66572	66577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835381
1133	NC_021910	CGT	2	6	66596	66601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835381
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1135	NC_021910	CGAT	2	8	66640	66647	25 %	25 %	25 %	25 %	528835381
1136	NC_021910	ACG	2	6	66678	66683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835381
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1140	NC_021910	TGA	2	6	67255	67260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835382
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1143	NC_021910	CGGGG	2	10	67570	67579	0 %	0 %	80 %	20 %	528835382
1144	NC_021910	CATT	2	8	67592	67599	25 %	50 %	0 %	25 %	528835382
1145	NC_021910	ACG	2	6	67720	67725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835382
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1154	NC_021910	GCGCCG	2	12	68126	68137	0 %	0 %	50 %	50 %	528835382
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1159	NC_021910	CGA	2	6	68441	68446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835383
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1163	NC_021910	CTCA	2	8	68773	68780	25 %	25 %	0 %	50 %	528835384
1164	NC_021910	CGC	2	6	68789	68794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835384
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1242	NC_021910	GCA	2	6	72232	72237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835388
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1374	NC_021910	GCC	3	9	78273	78281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835395
1375	NC_021910	GGC	2	6	78297	78302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835395
1376	NC_021910	CGAT	2	8	78330	78337	25 %	25 %	25 %	25 %	528835395
1377	NC_021910	GCCGA	2	10	78362	78371	20 %	0 %	40 %	40 %	528835395
1378	NC_021910	GC	3	6	78375	78380	0 %	0 %	50 %	50 %	528835395
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1382	NC_021910	CGGCA	2	10	78514	78523	20 %	0 %	40 %	40 %	528835395
1383	NC_021910	CCCG	2	8	78527	78534	0 %	0 %	25 %	75 %	528835395
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1498	NC_021910	GCA	2	6	85067	85072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835399
1499	NC_021910	T	6	6	85086	85091	0 %	100 %	0 %	0 %	528835399
1500	NC_021910	GTG	2	6	85129	85134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835399

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