MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetNIM1c

Total Repeats: 4540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021910	TTG	2	6	30525	30530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835342
502	NC_021910	AAG	2	6	30632	30637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835342
503	NC_021910	CGT	2	6	30670	30675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835342
504	NC_021910	C	6	6	30684	30689	0 %	0 %	0 %	100 %	528835342
505	NC_021910	CAA	2	6	30832	30837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835342
506	NC_021910	ATC	2	6	30915	30920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835342
507	NC_021910	CGC	2	6	30968	30973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835342
508	NC_021910	AT	3	6	31039	31044	50 %	50 %	0 %	0 %	528835342
509	NC_021910	CTT	2	6	31254	31259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835343
510	NC_021910	GGAG	2	8	31310	31317	25 %	0 %	75 %	0 %	528835343
511	NC_021910	CG	3	6	31354	31359	0 %	0 %	50 %	50 %	528835343
512	NC_021910	TCA	2	6	31372	31377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835343
513	NC_021910	CT	3	6	31422	31427	0 %	50 %	0 %	50 %	528835343
514	NC_021910	GCT	2	6	31472	31477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835343
515	NC_021910	CGC	2	6	31498	31503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835343
516	NC_021910	TG	3	6	31510	31515	0 %	50 %	50 %	0 %	528835343
517	NC_021910	GAA	2	6	31520	31525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835343
518	NC_021910	GAC	2	6	31529	31534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835343
519	NC_021910	GA	3	6	31536	31541	50 %	0 %	50 %	0 %	528835343
520	NC_021910	GCC	2	6	31545	31550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835343
521	NC_021910	TCG	2	6	31606	31611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835343
522	NC_021910	GGAA	2	8	31666	31673	50 %	0 %	50 %	0 %	528835343
523	NC_021910	GCG	2	6	31729	31734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835343
524	NC_021910	CGAA	2	8	31759	31766	50 %	0 %	25 %	25 %	528835343
525	NC_021910	TGT	2	6	31792	31797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835343
526	NC_021910	TCA	2	6	31803	31808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835343
527	NC_021910	TGAT	2	8	31819	31826	25 %	50 %	25 %	0 %	528835343
528	NC_021910	GCA	2	6	31845	31850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835343
529	NC_021910	CGCTG	2	10	31901	31910	0 %	20 %	40 %	40 %	528835343
530	NC_021910	ACG	2	6	31944	31949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835343
531	NC_021910	CTGCCG	2	12	31951	31962	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528835343
532	NC_021910	GCG	2	6	32014	32019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835343
533	NC_021910	T	6	6	32075	32080	0 %	100 %	0 %	0 %	528835343
534	NC_021910	CGAT	2	8	32082	32089	25 %	25 %	25 %	25 %	528835343
535	NC_021910	CGGCCT	2	12	32090	32101	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528835343
536	NC_021910	CGC	2	6	32111	32116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835343
537	NC_021910	CG	3	6	32140	32145	0 %	0 %	50 %	50 %	528835343
538	NC_021910	TG	3	6	32252	32257	0 %	50 %	50 %	0 %	528835344
539	NC_021910	TC	3	6	32261	32266	0 %	50 %	0 %	50 %	528835344
540	NC_021910	GAAG	2	8	32351	32358	50 %	0 %	50 %	0 %	528835344
541	NC_021910	TTG	2	6	32376	32381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835344
542	NC_021910	AGA	2	6	32400	32405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835344
543	NC_021910	CGT	2	6	32413	32418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835344
544	NC_021910	ACG	2	6	32420	32425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835344
545	NC_021910	TCG	2	6	32466	32471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835344
546	NC_021910	GCG	2	6	32475	32480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835344
547	NC_021910	TCC	2	6	32496	32501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835344
548	NC_021910	ACT	2	6	32517	32522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835344
549	NC_021910	ACTG	2	8	32563	32570	25 %	25 %	25 %	25 %	528835344
550	NC_021910	AAC	2	6	32598	32603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835344
551	NC_021910	AAT	2	6	32645	32650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528835344
552	NC_021910	AAC	2	6	32654	32659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835344
553	NC_021910	AGG	2	6	32766	32771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835344
554	NC_021910	GCA	2	6	32829	32834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835344
555	NC_021910	TC	3	6	32847	32852	0 %	50 %	0 %	50 %	528835344
556	NC_021910	TTGG	2	8	32868	32875	0 %	50 %	50 %	0 %	528835344
557	NC_021910	ACA	2	6	32925	32930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835344
558	NC_021910	ACC	2	6	33095	33100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835344
559	NC_021910	CTG	2	6	33104	33109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835344
560	NC_021910	GCC	2	6	33299	33304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835344
561	NC_021910	GACT	2	8	33392	33399	25 %	25 %	25 %	25 %	528835345
562	NC_021910	GCT	2	6	33417	33422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835345
563	NC_021910	TGA	2	6	33441	33446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835345
564	NC_021910	CCG	2	6	33475	33480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835345
565	NC_021910	CGA	2	6	33534	33539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835345
566	NC_021910	TCT	2	6	33594	33599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835345
567	NC_021910	GTC	2	6	33715	33720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835345
568	NC_021910	CG	3	6	33721	33726	0 %	0 %	50 %	50 %	528835345
569	NC_021910	CGTG	2	8	33825	33832	0 %	25 %	50 %	25 %	528835345
570	NC_021910	CGAC	2	8	33864	33871	25 %	0 %	25 %	50 %	528835345
571	NC_021910	TGC	2	6	34097	34102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835345
572	NC_021910	ACG	2	6	34145	34150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835345
573	NC_021910	GAA	2	6	34155	34160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835345
574	NC_021910	ATG	2	6	34206	34211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835346
575	NC_021910	CGC	2	6	34232	34237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835346
576	NC_021910	AAGG	2	8	34241	34248	50 %	0 %	50 %	0 %	528835346
577	NC_021910	GC	3	6	34309	34314	0 %	0 %	50 %	50 %	528835346
578	NC_021910	GCT	2	6	34328	34333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835346
579	NC_021910	CGAT	2	8	34459	34466	25 %	25 %	25 %	25 %	528835346
580	NC_021910	CGCGG	2	10	34521	34530	0 %	0 %	60 %	40 %	528835346
581	NC_021910	TCG	2	6	34624	34629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835346
582	NC_021910	GAG	3	9	34635	34643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835346
583	NC_021910	TGG	2	6	34710	34715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835346
584	NC_021910	GGC	2	6	34855	34860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835346
585	NC_021910	GCC	2	6	34970	34975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835346
586	NC_021910	CAG	2	6	34995	35000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835346
587	NC_021910	TTG	2	6	35019	35024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835346
588	NC_021910	TGG	2	6	35096	35101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835346
589	NC_021910	ATG	2	6	35104	35109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835346
590	NC_021910	CGA	2	6	35234	35239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835346
591	NC_021910	GCT	2	6	35321	35326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835346
592	NC_021910	CGG	2	6	35347	35352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835346
593	NC_021910	CGTT	2	8	35392	35399	0 %	50 %	25 %	25 %	528835346
594	NC_021910	TCG	2	6	35479	35484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835346
595	NC_021910	TTC	2	6	35520	35525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835346
596	NC_021910	GCG	2	6	35544	35549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835346
597	NC_021910	TGA	2	6	35621	35626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835347
598	NC_021910	TCG	2	6	35654	35659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835347
599	NC_021910	GGC	2	6	35702	35707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835347
600	NC_021910	CAT	3	9	35721	35729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835347
601	NC_021910	TCT	2	6	35783	35788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835347
602	NC_021910	CGG	2	6	35790	35795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835347
603	NC_021910	CGC	2	6	35859	35864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835347
604	NC_021910	GCA	2	6	35878	35883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835347
605	NC_021910	CCG	2	6	35964	35969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835347
606	NC_021910	ATG	2	6	36004	36009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835347
607	NC_021910	AG	3	6	36057	36062	50 %	0 %	50 %	0 %	528835347
608	NC_021910	GGT	2	6	36075	36080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835347
609	NC_021910	GAA	2	6	36088	36093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835347
610	NC_021910	GTCG	2	8	36105	36112	0 %	25 %	50 %	25 %	528835347
611	NC_021910	CA	3	6	36225	36230	50 %	0 %	0 %	50 %	528835347
612	NC_021910	G	6	6	36385	36390	0 %	0 %	100 %	0 %	528835348
613	NC_021910	GCT	2	6	36440	36445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835348
614	NC_021910	GTT	2	6	36452	36457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835348
615	NC_021910	ATT	2	6	36459	36464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528835348
616	NC_021910	TAT	2	6	36465	36470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528835348
617	NC_021910	GATTG	2	10	36551	36560	20 %	40 %	40 %	0 %	528835348
618	NC_021910	CTG	2	6	36565	36570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835348
619	NC_021910	CCG	2	6	36577	36582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835348
620	NC_021910	GTGCG	2	10	36595	36604	0 %	20 %	60 %	20 %	528835348
621	NC_021910	TGC	2	6	36661	36666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835348
622	NC_021910	TCCT	2	8	36679	36686	0 %	50 %	0 %	50 %	528835348
623	NC_021910	TGA	2	6	36736	36741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835348
624	NC_021910	TCG	2	6	36802	36807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835348
625	NC_021910	CGGA	2	8	36878	36885	25 %	0 %	50 %	25 %	528835348
626	NC_021910	ACAG	2	8	36905	36912	50 %	0 %	25 %	25 %	528835348
627	NC_021910	GTTG	2	8	37147	37154	0 %	50 %	50 %	0 %	528835349
628	NC_021910	GCA	2	6	37181	37186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835349
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633	NC_021910	ATC	2	6	37755	37760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835350
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645	NC_021910	TTG	2	6	38143	38148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835350
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755	NC_021910	TTGA	2	8	44976	44983	25 %	50 %	25 %	0 %	528835357
756	NC_021910	GCT	2	6	45001	45006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835357
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772	NC_021910	TAT	2	6	46103	46108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528835358
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1000	NC_021910	CG	3	6	59171	59176	0 %	0 %	50 %	50 %	528835372

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