MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetNIM1c

Total Repeats: 4540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021910	CCCTC	2	10	267668	267677	0 %	20 %	0 %	80 %	528835571
4502	NC_021910	GTCG	2	8	267712	267719	0 %	25 %	50 %	25 %	528835571
4503	NC_021910	CAA	2	6	267730	267735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835571
4504	NC_021910	CGG	2	6	267794	267799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835571
4505	NC_021910	CGT	2	6	267859	267864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835571
4506	NC_021910	AGAGCA	2	12	267929	267940	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	528835571
4507	NC_021910	GCC	2	6	267982	267987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835571
4508	NC_021910	GAC	2	6	268232	268237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835572
4509	NC_021910	GCG	2	6	268247	268252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835572
4510	NC_021910	CGCTCG	2	12	268261	268272	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528835572
4511	NC_021910	GCG	2	6	268274	268279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835572
4512	NC_021910	GCAAG	2	10	268304	268313	40 %	0 %	40 %	20 %	528835572
4513	NC_021910	CG	3	6	268485	268490	0 %	0 %	50 %	50 %	528835572
4514	NC_021910	GGCG	2	8	268499	268506	0 %	0 %	75 %	25 %	528835572
4515	NC_021910	TGG	2	6	268534	268539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835572
4516	NC_021910	TCA	2	6	268549	268554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835572
4517	NC_021910	CGC	2	6	268639	268644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835572
4518	NC_021910	GAG	2	6	268659	268664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835572
4519	NC_021910	GCA	2	6	268679	268684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835572
4520	NC_021910	GCG	2	6	268701	268706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835572
4521	NC_021910	TCA	2	6	268759	268764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835572
4522	NC_021910	GCA	2	6	268767	268772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835572
4523	NC_021910	CG	3	6	268843	268848	0 %	0 %	50 %	50 %	528835572
4524	NC_021910	CAC	2	6	268865	268870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835572
4525	NC_021910	CGA	2	6	268880	268885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835572
4526	NC_021910	GAA	2	6	268902	268907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835572
4527	NC_021910	TAG	2	6	268946	268951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835572
4528	NC_021910	ATG	2	6	268957	268962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835572
4529	NC_021910	AGC	2	6	268972	268977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835572
4530	NC_021910	CCA	2	6	269060	269065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835572
4531	NC_021910	GAA	2	6	269069	269074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835572
4532	NC_021910	CGA	2	6	269122	269127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835572
4533	NC_021910	CCG	2	6	269176	269181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835572
4534	NC_021910	GGT	2	6	269183	269188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835572
4535	NC_021910	AGG	2	6	269227	269232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835572
4536	NC_021910	TCA	2	6	269299	269304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835572
4537	NC_021910	GCGG	2	8	269310	269317	0 %	0 %	75 %	25 %	528835572
4538	NC_021910	CGCGG	2	10	269335	269344	0 %	0 %	60 %	40 %	528835572
4539	NC_021910	GAT	2	6	269372	269377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835572
4540	NC_021910	TTG	2	6	269385	269390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835572

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.