MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021909	A	8	8	1678	1685	100 %	0 %	0 %	0 %	528834108
2	NC_021909	T	6	6	2136	2141	0 %	100 %	0 %	0 %	528834108
3	NC_021909	T	6	6	22465	22470	0 %	100 %	0 %	0 %	528834129
4	NC_021909	G	6	6	22570	22575	0 %	0 %	100 %	0 %	528834129
5	NC_021909	T	6	6	22878	22883	0 %	100 %	0 %	0 %	528834130
6	NC_021909	G	6	6	25725	25730	0 %	0 %	100 %	0 %	528834132
7	NC_021909	C	7	7	30595	30601	0 %	0 %	0 %	100 %	528834138
8	NC_021909	T	6	6	36157	36162	0 %	100 %	0 %	0 %	528834142
9	NC_021909	G	6	6	40116	40121	0 %	0 %	100 %	0 %	528834148
10	NC_021909	A	7	7	46148	46154	100 %	0 %	0 %	0 %	528834156
11	NC_021909	A	6	6	46744	46749	100 %	0 %	0 %	0 %	528834157
12	NC_021909	A	6	6	48600	48605	100 %	0 %	0 %	0 %	528834158
13	NC_021909	T	6	6	53961	53966	0 %	100 %	0 %	0 %	528834162
14	NC_021909	G	6	6	60544	60549	0 %	0 %	100 %	0 %	528834165
15	NC_021909	T	6	6	60596	60601	0 %	100 %	0 %	0 %	528834165
16	NC_021909	G	6	6	63411	63416	0 %	0 %	100 %	0 %	528834168
17	NC_021909	A	6	6	64909	64914	100 %	0 %	0 %	0 %	528834170
18	NC_021909	C	6	6	68046	68051	0 %	0 %	0 %	100 %	528834173
19	NC_021909	A	6	6	68785	68790	100 %	0 %	0 %	0 %	528834174
20	NC_021909	T	6	6	70406	70411	0 %	100 %	0 %	0 %	528834176
21	NC_021909	A	6	6	70679	70684	100 %	0 %	0 %	0 %	528834176
22	NC_021909	C	6	6	84207	84212	0 %	0 %	0 %	100 %	528834188
23	NC_021909	T	6	6	102004	102009	0 %	100 %	0 %	0 %	528834211
24	NC_021909	A	6	6	104032	104037	100 %	0 %	0 %	0 %	528834212
25	NC_021909	T	6	6	109887	109892	0 %	100 %	0 %	0 %	528834219
26	NC_021909	A	6	6	116725	116730	100 %	0 %	0 %	0 %	528834225
27	NC_021909	A	6	6	118073	118078	100 %	0 %	0 %	0 %	528834228
28	NC_021909	C	6	6	124473	124478	0 %	0 %	0 %	100 %	528834234
29	NC_021909	A	9	9	126069	126077	100 %	0 %	0 %	0 %	528834236
30	NC_021909	T	7	7	127837	127843	0 %	100 %	0 %	0 %	528834237
31	NC_021909	A	6	6	132632	132637	100 %	0 %	0 %	0 %	528834242
32	NC_021909	G	6	6	136284	136289	0 %	0 %	100 %	0 %	528834247
33	NC_021909	C	6	6	137474	137479	0 %	0 %	0 %	100 %	528834249
34	NC_021909	C	6	6	143869	143874	0 %	0 %	0 %	100 %	528834255
35	NC_021909	A	6	6	144384	144389	100 %	0 %	0 %	0 %	528834255
36	NC_021909	T	6	6	151043	151048	0 %	100 %	0 %	0 %	528834263
37	NC_021909	T	6	6	156846	156851	0 %	100 %	0 %	0 %	528834269
38	NC_021909	C	6	6	162052	162057	0 %	0 %	0 %	100 %	528834276
39	NC_021909	G	6	6	166673	166678	0 %	0 %	100 %	0 %	528834281
40	NC_021909	A	6	6	167996	168001	100 %	0 %	0 %	0 %	528834281
41	NC_021909	A	6	6	168004	168009	100 %	0 %	0 %	0 %	528834281
42	NC_021909	A	7	7	168250	168256	100 %	0 %	0 %	0 %	528834281
43	NC_021909	T	6	6	169324	169329	0 %	100 %	0 %	0 %	528834282
44	NC_021909	T	6	6	172174	172179	0 %	100 %	0 %	0 %	528834284
45	NC_021909	A	6	6	172325	172330	100 %	0 %	0 %	0 %	528834284
46	NC_021909	A	6	6	176516	176521	100 %	0 %	0 %	0 %	528834288
47	NC_021909	G	6	6	178046	178051	0 %	0 %	100 %	0 %	528834289
48	NC_021909	C	6	6	179164	179169	0 %	0 %	0 %	100 %	528834289
49	NC_021909	A	6	6	198459	198464	100 %	0 %	0 %	0 %	528834296
50	NC_021909	G	7	7	201173	201179	0 %	0 %	100 %	0 %	528834300
51	NC_021909	G	6	6	203890	203895	0 %	0 %	100 %	0 %	528834300
52	NC_021909	G	6	6	204507	204512	0 %	0 %	100 %	0 %	528834300
53	NC_021909	A	6	6	204919	204924	100 %	0 %	0 %	0 %	528834300
54	NC_021909	C	6	6	215607	215612	0 %	0 %	0 %	100 %	528834307
55	NC_021909	A	7	7	220056	220062	100 %	0 %	0 %	0 %	528834310
56	NC_021909	G	6	6	231910	231915	0 %	0 %	100 %	0 %	528834315
57	NC_021909	T	6	6	235942	235947	0 %	100 %	0 %	0 %	528834319
58	NC_021909	G	6	6	239310	239315	0 %	0 %	100 %	0 %	528834322
59	NC_021909	C	6	6	240760	240765	0 %	0 %	0 %	100 %	528834324
60	NC_021909	T	6	6	241757	241762	0 %	100 %	0 %	0 %	528834325
61	NC_021909	T	6	6	242459	242464	0 %	100 %	0 %	0 %	528834326
62	NC_021909	G	6	6	242601	242606	0 %	0 %	100 %	0 %	528834326
63	NC_021909	G	6	6	243594	243599	0 %	0 %	100 %	0 %	528834326
64	NC_021909	G	6	6	248400	248405	0 %	0 %	100 %	0 %	528834327
65	NC_021909	T	6	6	251076	251081	0 %	100 %	0 %	0 %	528834329
66	NC_021909	C	7	7	255208	255214	0 %	0 %	0 %	100 %	528834331
67	NC_021909	A	6	6	257605	257610	100 %	0 %	0 %	0 %	528834333
68	NC_021909	T	6	6	264858	264863	0 %	100 %	0 %	0 %	528834340
69	NC_021909	T	6	6	267288	267293	0 %	100 %	0 %	0 %	528834342
70	NC_021909	C	6	6	270080	270085	0 %	0 %	0 %	100 %	528834344
71	NC_021909	T	6	6	271801	271806	0 %	100 %	0 %	0 %	528834346
72	NC_021909	T	6	6	285038	285043	0 %	100 %	0 %	0 %	528834356
73	NC_021909	T	9	9	290237	290245	0 %	100 %	0 %	0 %	528834359
74	NC_021909	G	6	6	295709	295714	0 %	0 %	100 %	0 %	528834364
75	NC_021909	C	6	6	296771	296776	0 %	0 %	0 %	100 %	528834365
76	NC_021909	A	6	6	303787	303792	100 %	0 %	0 %	0 %	528834369
77	NC_021909	T	6	6	304034	304039	0 %	100 %	0 %	0 %	528834370
78	NC_021909	A	6	6	305200	305205	100 %	0 %	0 %	0 %	528834371
79	NC_021909	T	7	7	305565	305571	0 %	100 %	0 %	0 %	528834372
80	NC_021909	T	6	6	311547	311552	0 %	100 %	0 %	0 %	528834378
81	NC_021909	A	6	6	315282	315287	100 %	0 %	0 %	0 %	528834381
82	NC_021909	A	6	6	316792	316797	100 %	0 %	0 %	0 %	528834383
83	NC_021909	G	7	7	317391	317397	0 %	0 %	100 %	0 %	528834384
84	NC_021909	T	6	6	318310	318315	0 %	100 %	0 %	0 %	528834385
85	NC_021909	G	6	6	325668	325673	0 %	0 %	100 %	0 %	528834392
86	NC_021909	T	6	6	327026	327031	0 %	100 %	0 %	0 %	528834394
87	NC_021909	A	6	6	329952	329957	100 %	0 %	0 %	0 %	528834399
88	NC_021909	T	6	6	333527	333532	0 %	100 %	0 %	0 %	528834401
89	NC_021909	T	7	7	341918	341924	0 %	100 %	0 %	0 %	528834410
90	NC_021909	T	6	6	344859	344864	0 %	100 %	0 %	0 %	528834413
91	NC_021909	A	7	7	345795	345801	100 %	0 %	0 %	0 %	528834414
92	NC_021909	A	6	6	347380	347385	100 %	0 %	0 %	0 %	528834415
93	NC_021909	A	6	6	347757	347762	100 %	0 %	0 %	0 %	528834416
94	NC_021909	A	6	6	353481	353486	100 %	0 %	0 %	0 %	528834421
95	NC_021909	T	6	6	354166	354171	0 %	100 %	0 %	0 %	528834423
96	NC_021909	C	6	6	363887	363892	0 %	0 %	0 %	100 %	528834433
97	NC_021909	A	6	6	368421	368426	100 %	0 %	0 %	0 %	528834438
98	NC_021909	A	6	6	370537	370542	100 %	0 %	0 %	0 %	528834440
99	NC_021909	A	6	6	374883	374888	100 %	0 %	0 %	0 %	528834443
100	NC_021909	A	6	6	376004	376009	100 %	0 %	0 %	0 %	528834445
101	NC_021909	A	7	7	376579	376585	100 %	0 %	0 %	0 %	528834446
102	NC_021909	A	6	6	377891	377896	100 %	0 %	0 %	0 %	528834447
103	NC_021909	A	6	6	380509	380514	100 %	0 %	0 %	0 %	528834449
104	NC_021909	C	6	6	383244	383249	0 %	0 %	0 %	100 %	528834452
105	NC_021909	C	6	6	384735	384740	0 %	0 %	0 %	100 %	528834453
106	NC_021909	A	6	6	385666	385671	100 %	0 %	0 %	0 %	528834453
107	NC_021909	C	6	6	390737	390742	0 %	0 %	0 %	100 %	528834459
108	NC_021909	T	6	6	391247	391252	0 %	100 %	0 %	0 %	528834460
109	NC_021909	A	6	6	396693	396698	100 %	0 %	0 %	0 %	528834464
110	NC_021909	A	6	6	396911	396916	100 %	0 %	0 %	0 %	528834464
111	NC_021909	A	6	6	397135	397140	100 %	0 %	0 %	0 %	528834464
112	NC_021909	C	6	6	397265	397270	0 %	0 %	0 %	100 %	528834464
113	NC_021909	T	6	6	400247	400252	0 %	100 %	0 %	0 %	528834467
114	NC_021909	A	6	6	402904	402909	100 %	0 %	0 %	0 %	528834468
115	NC_021909	T	6	6	405176	405181	0 %	100 %	0 %	0 %	528834471
116	NC_021909	T	6	6	406472	406477	0 %	100 %	0 %	0 %	528834472
117	NC_021909	A	6	6	406825	406830	100 %	0 %	0 %	0 %	528834472
118	NC_021909	A	7	7	414665	414671	100 %	0 %	0 %	0 %	528834481
119	NC_021909	G	7	7	415378	415384	0 %	0 %	100 %	0 %	528834482
120	NC_021909	T	6	6	415636	415641	0 %	100 %	0 %	0 %	528834482
121	NC_021909	A	6	6	416849	416854	100 %	0 %	0 %	0 %	528834482
122	NC_021909	T	6	6	419681	419686	0 %	100 %	0 %	0 %	528834486
123	NC_021909	T	7	7	420034	420040	0 %	100 %	0 %	0 %	528834486
124	NC_021909	G	6	6	434835	434840	0 %	0 %	100 %	0 %	528834507
125	NC_021909	T	6	6	436824	436829	0 %	100 %	0 %	0 %	528834509
126	NC_021909	A	6	6	437283	437288	100 %	0 %	0 %	0 %	528834510
127	NC_021909	T	6	6	437936	437941	0 %	100 %	0 %	0 %	528834510
128	NC_021909	A	7	7	445556	445562	100 %	0 %	0 %	0 %	528834518
129	NC_021909	G	6	6	445666	445671	0 %	0 %	100 %	0 %	528834518
130	NC_021909	T	6	6	445765	445770	0 %	100 %	0 %	0 %	528834518
131	NC_021909	C	6	6	446114	446119	0 %	0 %	0 %	100 %	528834518
132	NC_021909	T	6	6	452213	452218	0 %	100 %	0 %	0 %	528834523
133	NC_021909	C	6	6	453427	453432	0 %	0 %	0 %	100 %	528834525
134	NC_021909	C	6	6	456293	456298	0 %	0 %	0 %	100 %	528834529
135	NC_021909	G	6	6	464924	464929	0 %	0 %	100 %	0 %	528834538
136	NC_021909	A	6	6	468373	468378	100 %	0 %	0 %	0 %	528834541
137	NC_021909	A	6	6	470442	470447	100 %	0 %	0 %	0 %	528834543
138	NC_021909	T	6	6	481992	481997	0 %	100 %	0 %	0 %	528834552
139	NC_021909	T	6	6	485450	485455	0 %	100 %	0 %	0 %	528834556
140	NC_021909	C	6	6	486475	486480	0 %	0 %	0 %	100 %	528834557
141	NC_021909	C	6	6	491261	491266	0 %	0 %	0 %	100 %	528834559
142	NC_021909	C	6	6	492420	492425	0 %	0 %	0 %	100 %	528834560
143	NC_021909	A	6	6	495734	495739	100 %	0 %	0 %	0 %	528834562
144	NC_021909	C	6	6	503950	503955	0 %	0 %	0 %	100 %	528834570
145	NC_021909	A	6	6	517188	517193	100 %	0 %	0 %	0 %	528834585
146	NC_021909	T	6	6	519736	519741	0 %	100 %	0 %	0 %	528834586
147	NC_021909	C	6	6	520799	520804	0 %	0 %	0 %	100 %	528834587
148	NC_021909	C	6	6	530662	530667	0 %	0 %	0 %	100 %	528834598
149	NC_021909	C	8	8	547837	547844	0 %	0 %	0 %	100 %	528834616
150	NC_021909	G	6	6	568037	568042	0 %	0 %	100 %	0 %	528834641
151	NC_021909	T	7	7	569838	569844	0 %	100 %	0 %	0 %	528834643
152	NC_021909	A	7	7	572666	572672	100 %	0 %	0 %	0 %	528834646
153	NC_021909	C	7	7	572972	572978	0 %	0 %	0 %	100 %	528834646
154	NC_021909	C	6	6	574522	574527	0 %	0 %	0 %	100 %	528834648
155	NC_021909	C	6	6	574529	574534	0 %	0 %	0 %	100 %	528834648
156	NC_021909	A	6	6	574586	574591	100 %	0 %	0 %	0 %	528834648
157	NC_021909	G	6	6	578045	578050	0 %	0 %	100 %	0 %	528834651
158	NC_021909	T	6	6	581220	581225	0 %	100 %	0 %	0 %	528834653
159	NC_021909	A	6	6	581454	581459	100 %	0 %	0 %	0 %	528834654
160	NC_021909	T	6	6	587306	587311	0 %	100 %	0 %	0 %	528834660
161	NC_021909	T	6	6	587396	587401	0 %	100 %	0 %	0 %	528834660
162	NC_021909	T	6	6	588886	588891	0 %	100 %	0 %	0 %	528834661
163	NC_021909	A	6	6	604596	604601	100 %	0 %	0 %	0 %	528834673
164	NC_021909	T	6	6	605162	605167	0 %	100 %	0 %	0 %	528834674
165	NC_021909	A	6	6	608142	608147	100 %	0 %	0 %	0 %	528834679
166	NC_021909	T	6	6	609100	609105	0 %	100 %	0 %	0 %	528834681
167	NC_021909	C	6	6	610930	610935	0 %	0 %	0 %	100 %	528834682

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.