MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 1210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021909	CGGC	2	8	695	702	0 %	0 %	50 %	50 %	528834107
2	NC_021909	CGGC	2	8	713	720	0 %	0 %	50 %	50 %	528834107
3	NC_021909	AGGT	2	8	1357	1364	25 %	25 %	50 %	0 %	528834107
4	NC_021909	CTGT	2	8	1524	1531	0 %	50 %	25 %	25 %	528834108
5	NC_021909	CCGC	2	8	1824	1831	0 %	0 %	25 %	75 %	528834108
6	NC_021909	AGCC	2	8	2198	2205	25 %	0 %	25 %	50 %	528834108
7	NC_021909	CGTA	2	8	2210	2217	25 %	25 %	25 %	25 %	528834108
8	NC_021909	GTTC	2	8	2325	2332	0 %	50 %	25 %	25 %	528834108
9	NC_021909	CAGC	2	8	2869	2876	25 %	0 %	25 %	50 %	528834109
10	NC_021909	GGCG	2	8	2896	2903	0 %	0 %	75 %	25 %	528834109
11	NC_021909	TCGA	2	8	2906	2913	25 %	25 %	25 %	25 %	528834109
12	NC_021909	CGGC	2	8	3015	3022	0 %	0 %	50 %	50 %	528834109
13	NC_021909	GGCT	2	8	3276	3283	0 %	25 %	50 %	25 %	528834109
14	NC_021909	ACGA	2	8	3359	3366	50 %	0 %	25 %	25 %	528834109
15	NC_021909	CGAG	2	8	3952	3959	25 %	0 %	50 %	25 %	528834109
16	NC_021909	GATC	2	8	4330	4337	25 %	25 %	25 %	25 %	528834109
17	NC_021909	ATGG	2	8	4745	4752	25 %	25 %	50 %	0 %	528834109
18	NC_021909	GATG	2	8	6172	6179	25 %	25 %	50 %	0 %	528834111
19	NC_021909	TTCG	2	8	8230	8237	0 %	50 %	25 %	25 %	528834113
20	NC_021909	TGCG	2	8	8432	8439	0 %	25 %	50 %	25 %	528834113
21	NC_021909	CCGA	2	8	9967	9974	25 %	0 %	25 %	50 %	528834113
22	NC_021909	GCCG	2	8	10319	10326	0 %	0 %	50 %	50 %	528834113
23	NC_021909	ACCG	2	8	11002	11009	25 %	0 %	25 %	50 %	528834113
24	NC_021909	GACG	2	8	11448	11455	25 %	0 %	50 %	25 %	528834113
25	NC_021909	GATC	2	8	11523	11530	25 %	25 %	25 %	25 %	528834113
26	NC_021909	CGGT	2	8	11689	11696	0 %	25 %	50 %	25 %	528834113
27	NC_021909	GCCG	2	8	11908	11915	0 %	0 %	50 %	50 %	528834114
28	NC_021909	CGGG	2	8	11917	11924	0 %	0 %	75 %	25 %	528834114
29	NC_021909	GGAC	2	8	12008	12015	25 %	0 %	50 %	25 %	528834114
30	NC_021909	CCGG	2	8	12338	12345	0 %	0 %	50 %	50 %	528834114
31	NC_021909	CTAT	2	8	12417	12424	25 %	50 %	0 %	25 %	528834114
32	NC_021909	GCTG	2	8	12803	12810	0 %	25 %	50 %	25 %	528834114
33	NC_021909	CCGC	2	8	12827	12834	0 %	0 %	25 %	75 %	528834114
34	NC_021909	CCGA	2	8	13264	13271	25 %	0 %	25 %	50 %	528834115
35	NC_021909	CGGC	2	8	13787	13794	0 %	0 %	50 %	50 %	528834115
36	NC_021909	GGCA	2	8	14126	14133	25 %	0 %	50 %	25 %	528834115
37	NC_021909	TTGA	2	8	14894	14901	25 %	50 %	25 %	0 %	528834117
38	NC_021909	GCGA	2	8	15546	15553	25 %	0 %	50 %	25 %	528834119
39	NC_021909	CTGG	2	8	15953	15960	0 %	25 %	50 %	25 %	528834120
40	NC_021909	CCGC	2	8	16138	16145	0 %	0 %	25 %	75 %	528834120
41	NC_021909	TCGA	2	8	17336	17343	25 %	25 %	25 %	25 %	528834123
42	NC_021909	CCAC	2	8	18186	18193	25 %	0 %	0 %	75 %	528834124
43	NC_021909	CCGC	2	8	20074	20081	0 %	0 %	25 %	75 %	528834126
44	NC_021909	GGCA	2	8	20519	20526	25 %	0 %	50 %	25 %	528834126
45	NC_021909	TGAA	2	8	21441	21448	50 %	25 %	25 %	0 %	528834128
46	NC_021909	GCCG	2	8	22081	22088	0 %	0 %	50 %	50 %	528834128
47	NC_021909	CGGG	2	8	22126	22133	0 %	0 %	75 %	25 %	528834128
48	NC_021909	CCCG	2	8	22183	22190	0 %	0 %	25 %	75 %	528834128
49	NC_021909	ACGG	2	8	22216	22223	25 %	0 %	50 %	25 %	528834128
50	NC_021909	TGAA	2	8	22264	22271	50 %	25 %	25 %	0 %	528834128
51	NC_021909	TTTC	2	8	23134	23141	0 %	75 %	0 %	25 %	528834131
52	NC_021909	GCGG	2	8	24522	24529	0 %	0 %	75 %	25 %	528834131
53	NC_021909	GAAG	2	8	24647	24654	50 %	0 %	50 %	0 %	528834131
54	NC_021909	GTCC	2	8	24704	24711	0 %	25 %	25 %	50 %	528834131
55	NC_021909	AGCG	2	8	24771	24778	25 %	0 %	50 %	25 %	528834131
56	NC_021909	CGCC	2	8	24797	24804	0 %	0 %	25 %	75 %	528834131
57	NC_021909	GAGC	2	8	25489	25496	25 %	0 %	50 %	25 %	528834131
58	NC_021909	GCTC	2	8	27270	27277	0 %	25 %	25 %	50 %	528834133
59	NC_021909	GGCG	2	8	27603	27610	0 %	0 %	75 %	25 %	528834134
60	NC_021909	GGCC	2	8	28337	28344	0 %	0 %	50 %	50 %	528834135
61	NC_021909	GGCC	2	8	28628	28635	0 %	0 %	50 %	50 %	528834135
62	NC_021909	CCGG	2	8	29294	29301	0 %	0 %	50 %	50 %	528834136
63	NC_021909	TCTG	2	8	29306	29313	0 %	50 %	25 %	25 %	528834136
64	NC_021909	CTCA	2	8	29779	29786	25 %	25 %	0 %	50 %	528834137
65	NC_021909	CCTG	2	8	30243	30250	0 %	25 %	25 %	50 %	528834137
66	NC_021909	TCGA	2	8	30389	30396	25 %	25 %	25 %	25 %	528834138
67	NC_021909	CAGG	2	8	30766	30773	25 %	0 %	50 %	25 %	528834138
68	NC_021909	CGCC	2	8	30903	30910	0 %	0 %	25 %	75 %	528834138
69	NC_021909	GTCG	2	8	30991	30998	0 %	25 %	50 %	25 %	528834138
70	NC_021909	CGGC	2	8	31132	31139	0 %	0 %	50 %	50 %	528834138
71	NC_021909	ACGG	2	8	31433	31440	25 %	0 %	50 %	25 %	528834138
72	NC_021909	CTTT	2	8	31737	31744	0 %	75 %	0 %	25 %	528834139
73	NC_021909	GCAA	2	8	32039	32046	50 %	0 %	25 %	25 %	528834139
74	NC_021909	GCGT	2	8	32175	32182	0 %	25 %	50 %	25 %	528834139
75	NC_021909	GCAA	2	8	33179	33186	50 %	0 %	25 %	25 %	528834140
76	NC_021909	TTGG	2	8	33344	33351	0 %	50 %	50 %	0 %	528834140
77	NC_021909	CGAT	2	8	34119	34126	25 %	25 %	25 %	25 %	528834140
78	NC_021909	GCAG	2	8	34557	34564	25 %	0 %	50 %	25 %	528834140
79	NC_021909	GTCG	2	8	34588	34595	0 %	25 %	50 %	25 %	528834140
80	NC_021909	GGAC	2	8	35006	35013	25 %	0 %	50 %	25 %	528834140
81	NC_021909	GCTC	2	8	35349	35356	0 %	25 %	25 %	50 %	528834140
82	NC_021909	ACCC	2	8	36054	36061	25 %	0 %	0 %	75 %	528834142
83	NC_021909	GTTC	2	8	37152	37159	0 %	50 %	25 %	25 %	528834142
84	NC_021909	GCAA	2	8	37173	37180	50 %	0 %	25 %	25 %	528834142
85	NC_021909	GTGG	2	8	37339	37346	0 %	25 %	75 %	0 %	528834142
86	NC_021909	GAAG	2	8	38054	38061	50 %	0 %	50 %	0 %	528834144
87	NC_021909	TTCC	2	8	38105	38112	0 %	50 %	0 %	50 %	528834144
88	NC_021909	ACTG	2	8	39456	39463	25 %	25 %	25 %	25 %	528834147
89	NC_021909	AGGA	2	8	39811	39818	50 %	0 %	50 %	0 %	528834148
90	NC_021909	GCCG	2	8	40223	40230	0 %	0 %	50 %	50 %	528834148
91	NC_021909	CCGC	2	8	40689	40696	0 %	0 %	25 %	75 %	528834149
92	NC_021909	GCCG	2	8	41068	41075	0 %	0 %	50 %	50 %	528834150
93	NC_021909	GCGA	2	8	41268	41275	25 %	0 %	50 %	25 %	528834150
94	NC_021909	GAGC	2	8	41596	41603	25 %	0 %	50 %	25 %	528834150
95	NC_021909	TCGC	2	8	42175	42182	0 %	25 %	25 %	50 %	528834152
96	NC_021909	CGAT	2	8	42842	42849	25 %	25 %	25 %	25 %	528834152
97	NC_021909	GAAC	2	8	42921	42928	50 %	0 %	25 %	25 %	528834153
98	NC_021909	GGAA	2	8	43078	43085	50 %	0 %	50 %	0 %	528834153
99	NC_021909	CATG	2	8	43443	43450	25 %	25 %	25 %	25 %	528834154
100	NC_021909	GCTC	2	8	44127	44134	0 %	25 %	25 %	50 %	528834155
101	NC_021909	CGAT	2	8	44313	44320	25 %	25 %	25 %	25 %	528834155
102	NC_021909	TGCG	2	8	44340	44347	0 %	25 %	50 %	25 %	528834155
103	NC_021909	GGCC	2	8	44631	44638	0 %	0 %	50 %	50 %	528834155
104	NC_021909	GATA	2	8	45511	45518	50 %	25 %	25 %	0 %	528834155
105	NC_021909	CGGA	2	8	45599	45606	25 %	0 %	50 %	25 %	528834155
106	NC_021909	CAAC	2	8	45616	45623	50 %	0 %	0 %	50 %	528834155
107	NC_021909	GGCT	2	8	46003	46010	0 %	25 %	50 %	25 %	528834156
108	NC_021909	TCCA	2	8	46033	46040	25 %	25 %	0 %	50 %	528834156
109	NC_021909	GCGA	2	8	46792	46799	25 %	0 %	50 %	25 %	528834157
110	NC_021909	GATC	2	8	47028	47035	25 %	25 %	25 %	25 %	528834157
111	NC_021909	GGAA	2	8	47493	47500	50 %	0 %	50 %	0 %	528834157
112	NC_021909	ATCA	2	8	47848	47855	50 %	25 %	0 %	25 %	528834158
113	NC_021909	CATA	2	8	48124	48131	50 %	25 %	0 %	25 %	528834158
114	NC_021909	TCCT	2	8	48235	48242	0 %	50 %	0 %	50 %	528834158
115	NC_021909	AGCC	2	8	48328	48335	25 %	0 %	25 %	50 %	528834158
116	NC_021909	GTAT	2	8	48502	48509	25 %	50 %	25 %	0 %	528834158
117	NC_021909	TCGG	2	8	48556	48563	0 %	25 %	50 %	25 %	528834158
118	NC_021909	GAAA	2	8	48749	48756	75 %	0 %	25 %	0 %	528834158
119	NC_021909	GCCA	2	8	49067	49074	25 %	0 %	25 %	50 %	528834158
120	NC_021909	CACC	2	8	49242	49249	25 %	0 %	0 %	75 %	528834158
121	NC_021909	AACG	2	8	51464	51471	50 %	0 %	25 %	25 %	528834159
122	NC_021909	CGAA	2	8	51561	51568	50 %	0 %	25 %	25 %	528834159
123	NC_021909	CATA	2	8	51718	51725	50 %	25 %	0 %	25 %	528834159
124	NC_021909	CGGC	2	8	52645	52652	0 %	0 %	50 %	50 %	528834160
125	NC_021909	ACCT	2	8	54294	54301	25 %	25 %	0 %	50 %	528834162
126	NC_021909	TCAC	2	8	54652	54659	25 %	25 %	0 %	50 %	528834162
127	NC_021909	CTTT	2	8	54909	54916	0 %	75 %	0 %	25 %	528834162
128	NC_021909	TCGA	2	8	59292	59299	25 %	25 %	25 %	25 %	528834164
129	NC_021909	AAAC	2	8	60587	60594	75 %	0 %	0 %	25 %	528834165
130	NC_021909	TTGG	2	8	60815	60822	0 %	50 %	50 %	0 %	528834165
131	NC_021909	CGGT	2	8	61038	61045	0 %	25 %	50 %	25 %	528834165
132	NC_021909	ATTC	2	8	61268	61275	25 %	50 %	0 %	25 %	528834165
133	NC_021909	AGCG	2	8	61358	61365	25 %	0 %	50 %	25 %	528834166
134	NC_021909	GCTG	2	8	63420	63427	0 %	25 %	50 %	25 %	528834168
135	NC_021909	CCAA	2	8	65003	65010	50 %	0 %	0 %	50 %	528834170
136	NC_021909	TCGT	2	8	65283	65290	0 %	50 %	25 %	25 %	528834170
137	NC_021909	CATC	2	8	65482	65489	25 %	25 %	0 %	50 %	528834170
138	NC_021909	AAGG	2	8	65528	65535	50 %	0 %	50 %	0 %	528834170
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