MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 9614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021909	GCTC	3	12	118215	118226	0 %	25 %	25 %	50 %	528834228
2002	NC_021909	GGGA	2	8	118267	118274	25 %	0 %	75 %	0 %	528834229
2003	NC_021909	TGGC	2	8	118327	118334	0 %	25 %	50 %	25 %	528834229
2004	NC_021909	CG	3	6	118398	118403	0 %	0 %	50 %	50 %	528834229
2005	NC_021909	CGGA	2	8	118450	118457	25 %	0 %	50 %	25 %	528834229
2006	NC_021909	GAA	2	6	118508	118513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834229
2007	NC_021909	CAT	2	6	118537	118542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834229
2008	NC_021909	GC	3	6	118598	118603	0 %	0 %	50 %	50 %	528834229
2009	NC_021909	GGC	2	6	118612	118617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834229
2010	NC_021909	ATC	2	6	118623	118628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834229
2011	NC_021909	CCA	2	6	118650	118655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834229
2012	NC_021909	ATG	2	6	118670	118675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834229
2013	NC_021909	TTC	2	6	118686	118691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834229
2014	NC_021909	TCG	2	6	118721	118726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834229
2015	NC_021909	GATC	2	8	118740	118747	25 %	25 %	25 %	25 %	528834229
2016	NC_021909	GAC	2	6	118773	118778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834229
2017	NC_021909	TCCA	2	8	118900	118907	25 %	25 %	0 %	50 %	528834230
2018	NC_021909	TCG	2	6	118920	118925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834230
2019	NC_021909	GTCGAT	2	12	118976	118987	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	528834230
2020	NC_021909	GAC	2	6	119024	119029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834230
2021	NC_021909	GC	3	6	119042	119047	0 %	0 %	50 %	50 %	528834230
2022	NC_021909	CACC	2	8	119094	119101	25 %	0 %	0 %	75 %	528834230
2023	NC_021909	CGACC	2	10	119149	119158	20 %	0 %	20 %	60 %	528834230
2024	NC_021909	ATC	3	9	119177	119185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834230
2025	NC_021909	TTG	2	6	119217	119222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834230
2026	NC_021909	GGA	2	6	119359	119364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834230
2027	NC_021909	TC	3	6	119851	119856	0 %	50 %	0 %	50 %	528834231
2028	NC_021909	GAC	2	6	119858	119863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834231
2029	NC_021909	GGCT	2	8	119904	119911	0 %	25 %	50 %	25 %	528834231
2030	NC_021909	AGG	2	6	120058	120063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834231
2031	NC_021909	GACGGC	2	12	120188	120199	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528834231
2032	NC_021909	GAA	2	6	120213	120218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834231
2033	NC_021909	GAC	2	6	120273	120278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834231
2034	NC_021909	CGT	2	6	120314	120319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834231
2035	NC_021909	GC	3	6	120387	120392	0 %	0 %	50 %	50 %	528834231
2036	NC_021909	AAGGT	2	10	120457	120466	40 %	20 %	40 %	0 %	528834231
2037	NC_021909	CAA	2	6	120704	120709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834231
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2041	NC_021909	TGA	2	6	120816	120821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834231
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2050	NC_021909	CGA	2	6	121389	121394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2051	NC_021909	GCT	2	6	121415	121420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2052	NC_021909	CGG	2	6	121480	121485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834232
2053	NC_021909	GCA	2	6	121567	121572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834232
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2055	NC_021909	CAG	2	6	121693	121698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2056	NC_021909	ATCC	2	8	121760	121767	25 %	25 %	0 %	50 %	528834232
2057	NC_021909	GTC	2	6	121853	121858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2058	NC_021909	GC	3	6	121879	121884	0 %	0 %	50 %	50 %	528834232
2059	NC_021909	CGT	2	6	121966	121971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834232
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2063	NC_021909	CGCC	2	8	122041	122048	0 %	0 %	25 %	75 %	528834232
2064	NC_021909	CGC	2	6	122077	122082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834232
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2107	NC_021909	GC	4	8	124125	124132	0 %	0 %	50 %	50 %	528834233
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2121	NC_021909	CGT	2	6	125205	125210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834234
2122	NC_021909	AAC	2	6	125338	125343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834235
2123	NC_021909	CCA	2	6	125355	125360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834235
2124	NC_021909	CGGC	2	8	125365	125372	0 %	0 %	50 %	50 %	528834235
2125	NC_021909	CGG	2	6	125405	125410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834235
2126	NC_021909	CTT	2	6	125415	125420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834235
2127	NC_021909	CA	3	6	125542	125547	50 %	0 %	0 %	50 %	528834235
2128	NC_021909	GGC	2	6	125567	125572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834235
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2130	NC_021909	GC	3	6	125761	125766	0 %	0 %	50 %	50 %	528834235
2131	NC_021909	TGC	2	6	125840	125845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834235
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2142	NC_021909	ACG	2	6	126357	126362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834236
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2147	NC_021909	CGC	2	6	126615	126620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834236
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2151	NC_021909	CGGA	2	8	126794	126801	25 %	0 %	50 %	25 %	528834236
2152	NC_021909	CGA	2	6	126918	126923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834236
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2219	NC_021909	ATC	2	6	130623	130628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834240
2220	NC_021909	GC	3	6	130696	130701	0 %	0 %	50 %	50 %	528834240
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2223	NC_021909	CTA	2	6	130884	130889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834240
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2226	NC_021909	TCC	2	6	131131	131136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834240
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2229	NC_021909	CG	4	8	131242	131249	0 %	0 %	50 %	50 %	528834240
2230	NC_021909	AAG	2	6	131298	131303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834240
2231	NC_021909	AATCA	2	10	131373	131382	60 %	20 %	0 %	20 %	528834241
2232	NC_021909	CCA	2	6	131421	131426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834241
2233	NC_021909	TCCCTC	2	12	131466	131477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834241
2234	NC_021909	GACC	2	8	131510	131517	25 %	0 %	25 %	50 %	528834241
2235	NC_021909	TTG	2	6	131534	131539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834241
2236	NC_021909	TGC	2	6	131564	131569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834241
2237	NC_021909	CTT	3	9	131621	131629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834241
2238	NC_021909	TTTG	2	8	131708	131715	0 %	75 %	25 %	0 %	528834241
2239	NC_021909	TTG	2	6	131758	131763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834241
2240	NC_021909	AG	3	6	131802	131807	50 %	0 %	50 %	0 %	528834241
2241	NC_021909	CTT	2	6	131810	131815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834241
2242	NC_021909	CTA	2	6	131880	131885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834242
2243	NC_021909	CAAG	2	8	131937	131944	50 %	0 %	25 %	25 %	528834242
2244	NC_021909	AGGG	2	8	131964	131971	25 %	0 %	75 %	0 %	528834242
2245	NC_021909	CTA	2	6	132018	132023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834242
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2247	NC_021909	GCT	2	6	132155	132160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834242
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2363	NC_021909	TCG	2	6	139242	139247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834250
2364	NC_021909	CG	5	10	139246	139255	0 %	0 %	50 %	50 %	528834250
2365	NC_021909	GAA	2	6	139263	139268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834250
2366	NC_021909	TGG	2	6	139320	139325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834250
2367	NC_021909	CAGA	2	8	139359	139366	50 %	0 %	25 %	25 %	528834250
2368	NC_021909	CTGC	2	8	139389	139396	0 %	25 %	25 %	50 %	528834250
2369	NC_021909	CG	3	6	139439	139444	0 %	0 %	50 %	50 %	528834250
2370	NC_021909	CGC	2	6	139488	139493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834250
2371	NC_021909	CGA	2	6	139519	139524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834250
2372	NC_021909	CCG	2	6	139671	139676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834250
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2374	NC_021909	TTCG	2	8	139819	139826	0 %	50 %	25 %	25 %	528834250
2375	NC_021909	CGT	2	6	139845	139850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834250
2376	NC_021909	GCCG	3	12	139873	139884	0 %	0 %	50 %	50 %	528834250
2377	NC_021909	CAG	2	6	139911	139916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834251
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2385	NC_021909	GCA	2	6	140505	140510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834252
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2388	NC_021909	CGG	2	6	140665	140670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834252
2389	NC_021909	AAGA	2	8	140757	140764	75 %	0 %	25 %	0 %	528834252
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2392	NC_021909	CTC	2	6	142190	142195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834253
2393	NC_021909	TTG	2	6	142297	142302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834253
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2395	NC_021909	CGC	2	6	142495	142500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834254
2396	NC_021909	TTC	2	6	142594	142599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834254
2397	NC_021909	TGGCT	2	10	143025	143034	0 %	40 %	40 %	20 %	528834255
2398	NC_021909	GTC	3	9	143044	143052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834255
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2402	NC_021909	TTA	2	6	143184	143189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528834255
2403	NC_021909	CGG	2	6	143213	143218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834255
2404	NC_021909	CGT	2	6	143223	143228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834255
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2465	NC_021909	ATGCCA	2	12	145743	145754	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	528834257
2466	NC_021909	GA	4	8	145757	145764	50 %	0 %	50 %	0 %	528834257
2467	NC_021909	CAGC	2	8	145789	145796	25 %	0 %	25 %	50 %	528834257
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2470	NC_021909	CGAC	2	8	145847	145854	25 %	0 %	25 %	50 %	528834257
2471	NC_021909	ACC	2	6	145899	145904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834257
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2473	NC_021909	AGGC	2	8	146000	146007	25 %	0 %	50 %	25 %	528834257
2474	NC_021909	GCC	2	6	146119	146124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834257
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2482	NC_021909	GGC	2	6	146469	146474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834257
2483	NC_021909	GC	3	6	146498	146503	0 %	0 %	50 %	50 %	528834257
2484	NC_021909	CAGG	2	8	146504	146511	25 %	0 %	50 %	25 %	528834257
2485	NC_021909	ATC	2	6	146558	146563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834257
2486	NC_021909	GCC	2	6	146612	146617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834257
2487	NC_021909	ATC	2	6	146618	146623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834257
2488	NC_021909	CGAC	2	8	146630	146637	25 %	0 %	25 %	50 %	528834257
2489	NC_021909	CAT	2	6	146638	146643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834257
2490	NC_021909	AGA	2	6	146713	146718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834257
2491	NC_021909	CAGC	2	8	146794	146801	25 %	0 %	25 %	50 %	528834257
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2497	NC_021909	CG	3	6	147298	147303	0 %	0 %	50 %	50 %	528834258
2498	NC_021909	GGTT	2	8	147309	147316	0 %	50 %	50 %	0 %	528834258
2499	NC_021909	TGT	2	6	147335	147340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834258
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