MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 1180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021908	TTGC	2	8	221	228	0 %	50 %	25 %	25 %	528832487
2	NC_021908	GCTG	2	8	1051	1058	0 %	25 %	50 %	25 %	528832487
3	NC_021908	CGGC	2	8	1126	1133	0 %	0 %	50 %	50 %	528832487
4	NC_021908	CGCC	2	8	1204	1211	0 %	0 %	25 %	75 %	528832487
5	NC_021908	TCCG	2	8	2350	2357	0 %	25 %	25 %	50 %	528832489
6	NC_021908	AGGC	2	8	2562	2569	25 %	0 %	50 %	25 %	528832489
7	NC_021908	GGCC	2	8	3172	3179	0 %	0 %	50 %	50 %	528832490
8	NC_021908	CGAT	2	8	3249	3256	25 %	25 %	25 %	25 %	528832490
9	NC_021908	CCGG	2	8	3983	3990	0 %	0 %	50 %	50 %	528832492
10	NC_021908	GGCA	2	8	4001	4008	25 %	0 %	50 %	25 %	528832492
11	NC_021908	AGGC	2	8	4296	4303	25 %	0 %	50 %	25 %	528832492
12	NC_021908	ACGC	2	8	5799	5806	25 %	0 %	25 %	50 %	528832493
13	NC_021908	GCCG	2	8	6537	6544	0 %	0 %	50 %	50 %	528832493
14	NC_021908	AGCC	2	8	7186	7193	25 %	0 %	25 %	50 %	528832494
15	NC_021908	GCTC	2	8	9236	9243	0 %	25 %	25 %	50 %	528832494
16	NC_021908	GCCG	2	8	9278	9285	0 %	0 %	50 %	50 %	528832494
17	NC_021908	GGCC	2	8	10128	10135	0 %	0 %	50 %	50 %	528832495
18	NC_021908	ACCG	2	8	10169	10176	25 %	0 %	25 %	50 %	528832495
19	NC_021908	CGGC	2	8	10537	10544	0 %	0 %	50 %	50 %	528832495
20	NC_021908	GCGG	2	8	10612	10619	0 %	0 %	75 %	25 %	528832495
21	NC_021908	GCGA	2	8	10836	10843	25 %	0 %	50 %	25 %	528832495
22	NC_021908	CCGG	2	8	11119	11126	0 %	0 %	50 %	50 %	528832495
23	NC_021908	CCGC	2	8	11353	11360	0 %	0 %	25 %	75 %	528832495
24	NC_021908	GCAC	2	8	11861	11868	25 %	0 %	25 %	50 %	528832496
25	NC_021908	CCGG	2	8	12032	12039	0 %	0 %	50 %	50 %	528832496
26	NC_021908	CGTT	2	8	12110	12117	0 %	50 %	25 %	25 %	528832496
27	NC_021908	TGGT	2	8	12260	12267	0 %	50 %	50 %	0 %	528832496
28	NC_021908	GCGG	2	8	12382	12389	0 %	0 %	75 %	25 %	528832496
29	NC_021908	CCGG	2	8	12486	12493	0 %	0 %	50 %	50 %	528832496
30	NC_021908	GTCG	2	8	12799	12806	0 %	25 %	50 %	25 %	528832496
31	NC_021908	GCCG	2	8	12958	12965	0 %	0 %	50 %	50 %	528832496
32	NC_021908	GCCG	2	8	13495	13502	0 %	0 %	50 %	50 %	528832496
33	NC_021908	GCCA	2	8	13990	13997	25 %	0 %	25 %	50 %	528832496
34	NC_021908	TTCG	2	8	14926	14933	0 %	50 %	25 %	25 %	528832496
35	NC_021908	CGGC	2	8	15543	15550	0 %	0 %	50 %	50 %	528832496
36	NC_021908	GCGA	2	8	15686	15693	25 %	0 %	50 %	25 %	528832496
37	NC_021908	TCGA	2	8	15905	15912	25 %	25 %	25 %	25 %	528832496
38	NC_021908	CTGC	2	8	16132	16139	0 %	25 %	25 %	50 %	528832496
39	NC_021908	GGCG	2	8	16758	16765	0 %	0 %	75 %	25 %	528832496
40	NC_021908	CAGC	2	8	18094	18101	25 %	0 %	25 %	50 %	528832497
41	NC_021908	CGGC	2	8	19180	19187	0 %	0 %	50 %	50 %	528832499
42	NC_021908	CGTC	2	8	19501	19508	0 %	25 %	25 %	50 %	528832500
43	NC_021908	CTCC	2	8	19702	19709	0 %	25 %	0 %	75 %	528832500
44	NC_021908	CTTC	2	8	20307	20314	0 %	50 %	0 %	50 %	528832501
45	NC_021908	CCCG	2	8	20853	20860	0 %	0 %	25 %	75 %	528832501
46	NC_021908	GGCT	2	8	21098	21105	0 %	25 %	50 %	25 %	528832501
47	NC_021908	TCGG	2	8	22743	22750	0 %	25 %	50 %	25 %	528832502
48	NC_021908	CGGC	2	8	22849	22856	0 %	0 %	50 %	50 %	528832502
49	NC_021908	TGCG	2	8	23123	23130	0 %	25 %	50 %	25 %	528832503
50	NC_021908	GGCC	2	8	23274	23281	0 %	0 %	50 %	50 %	528832503
51	NC_021908	ATCC	2	8	23488	23495	25 %	25 %	0 %	50 %	528832503
52	NC_021908	CGGT	2	8	23573	23580	0 %	25 %	50 %	25 %	528832503
53	NC_021908	CCGG	2	8	24492	24499	0 %	0 %	50 %	50 %	528832504
54	NC_021908	GCAC	2	8	25285	25292	25 %	0 %	25 %	50 %	528832505
55	NC_021908	CCTG	2	8	25847	25854	0 %	25 %	25 %	50 %	528832505
56	NC_021908	CCGA	2	8	26074	26081	25 %	0 %	25 %	50 %	528832505
57	NC_021908	GCAT	2	8	26940	26947	25 %	25 %	25 %	25 %	528832506
58	NC_021908	ATCG	2	8	27038	27045	25 %	25 %	25 %	25 %	528832506
59	NC_021908	AGGA	2	8	27288	27295	50 %	0 %	50 %	0 %	528832506
60	NC_021908	CGAC	2	8	28953	28960	25 %	0 %	25 %	50 %	528832507
61	NC_021908	CCTT	2	8	29193	29200	0 %	50 %	0 %	50 %	528832507
62	NC_021908	CCTC	2	8	29636	29643	0 %	25 %	0 %	75 %	528832508
63	NC_021908	GCCG	2	8	30600	30607	0 %	0 %	50 %	50 %	528832509
64	NC_021908	GCTC	3	12	31168	31179	0 %	25 %	25 %	50 %	528832509
65	NC_021908	GCGA	2	8	31227	31234	25 %	0 %	50 %	25 %	528832509
66	NC_021908	GCCG	2	8	31365	31372	0 %	0 %	50 %	50 %	528832509
67	NC_021908	CGGC	2	8	33057	33064	0 %	0 %	50 %	50 %	528832510
68	NC_021908	GTCG	2	8	33478	33485	0 %	25 %	50 %	25 %	528832510
69	NC_021908	AAAG	2	8	34323	34330	75 %	0 %	25 %	0 %	528832511
70	NC_021908	CCGG	2	8	34869	34876	0 %	0 %	50 %	50 %	528832511
71	NC_021908	CTGT	2	8	35354	35361	0 %	50 %	25 %	25 %	528832512
72	NC_021908	GCGG	2	8	35590	35597	0 %	0 %	75 %	25 %	528832512
73	NC_021908	CGCC	2	8	36034	36041	0 %	0 %	25 %	75 %	528832513
74	NC_021908	CCAG	2	8	36046	36053	25 %	0 %	25 %	50 %	528832513
75	NC_021908	GGCC	2	8	36118	36125	0 %	0 %	50 %	50 %	528832513
76	NC_021908	CGGC	2	8	36624	36631	0 %	0 %	50 %	50 %	528832514
77	NC_021908	CGTG	2	8	36666	36673	0 %	25 %	50 %	25 %	528832514
78	NC_021908	CGGC	2	8	37571	37578	0 %	0 %	50 %	50 %	528832515
79	NC_021908	AGCC	2	8	38278	38285	25 %	0 %	25 %	50 %	528832515
80	NC_021908	TCTG	2	8	39006	39013	0 %	50 %	25 %	25 %	528832516
81	NC_021908	CGCT	2	8	40666	40673	0 %	25 %	25 %	50 %	528832517
82	NC_021908	CGGC	2	8	41387	41394	0 %	0 %	50 %	50 %	528832517
83	NC_021908	CTGG	2	8	41606	41613	0 %	25 %	50 %	25 %	528832517
84	NC_021908	GCAA	2	8	42270	42277	50 %	0 %	25 %	25 %	528832518
85	NC_021908	CGTG	2	8	42785	42792	0 %	25 %	50 %	25 %	528832519
86	NC_021908	GCCG	2	8	42860	42867	0 %	0 %	50 %	50 %	528832519
87	NC_021908	CCTT	2	8	43318	43325	0 %	50 %	0 %	50 %	528832520
88	NC_021908	ACCG	2	8	44097	44104	25 %	0 %	25 %	50 %	528832520
89	NC_021908	CCGG	2	8	44297	44304	0 %	0 %	50 %	50 %	528832520
90	NC_021908	GCCG	2	8	44337	44344	0 %	0 %	50 %	50 %	528832520
91	NC_021908	CGTC	2	8	44584	44591	0 %	25 %	25 %	50 %	528832520
92	NC_021908	GGCG	2	8	44726	44733	0 %	0 %	75 %	25 %	528832520
93	NC_021908	GGGC	2	8	45368	45375	0 %	0 %	75 %	25 %	528832520
94	NC_021908	GCGA	2	8	46065	46072	25 %	0 %	50 %	25 %	528832521
95	NC_021908	CGAG	2	8	46126	46133	25 %	0 %	50 %	25 %	528832521
96	NC_021908	GCCG	2	8	46870	46877	0 %	0 %	50 %	50 %	528832521
97	NC_021908	GCCG	3	12	46967	46978	0 %	0 %	50 %	50 %	528832521
98	NC_021908	CCGT	2	8	47399	47406	0 %	25 %	25 %	50 %	528832522
99	NC_021908	CGGC	2	8	47685	47692	0 %	0 %	50 %	50 %	528832522
100	NC_021908	GTCG	2	8	48313	48320	0 %	25 %	50 %	25 %	528832522
101	NC_021908	GGTG	2	8	48483	48490	0 %	25 %	75 %	0 %	528832523
102	NC_021908	TGGC	2	8	49424	49431	0 %	25 %	50 %	25 %	528832523
103	NC_021908	AGGA	2	8	49947	49954	50 %	0 %	50 %	0 %	528832524
104	NC_021908	AAAT	2	8	50181	50188	75 %	25 %	0 %	0 %	528832524
105	NC_021908	CCAT	2	8	50230	50237	25 %	25 %	0 %	50 %	528832524
106	NC_021908	TGCG	2	8	50386	50393	0 %	25 %	50 %	25 %	528832524
107	NC_021908	CGGT	2	8	50430	50437	0 %	25 %	50 %	25 %	528832524
108	NC_021908	CGGT	2	8	50562	50569	0 %	25 %	50 %	25 %	528832524
109	NC_021908	AAGA	2	8	50756	50763	75 %	0 %	25 %	0 %	528832524
110	NC_021908	GCCG	2	8	51313	51320	0 %	0 %	50 %	50 %	528832525
111	NC_021908	GCCG	2	8	51322	51329	0 %	0 %	50 %	50 %	528832525
112	NC_021908	GATC	2	8	52176	52183	25 %	25 %	25 %	25 %	528832526
113	NC_021908	ATGC	2	8	52240	52247	25 %	25 %	25 %	25 %	528832526
114	NC_021908	CTGC	2	8	52993	53000	0 %	25 %	25 %	50 %	528832526
115	NC_021908	CGGC	2	8	53052	53059	0 %	0 %	50 %	50 %	528832526
116	NC_021908	GCTG	2	8	53613	53620	0 %	25 %	50 %	25 %	528832526
117	NC_021908	GCGG	3	12	53691	53702	0 %	0 %	75 %	25 %	528832526
118	NC_021908	GCAG	2	8	53720	53727	25 %	0 %	50 %	25 %	528832526
119	NC_021908	CTGC	2	8	53769	53776	0 %	25 %	25 %	50 %	528832526
120	NC_021908	GCGG	2	8	54011	54018	0 %	0 %	75 %	25 %	528832527
121	NC_021908	GCCG	2	8	55436	55443	0 %	0 %	50 %	50 %	528832527
122	NC_021908	GTCG	2	8	56772	56779	0 %	25 %	50 %	25 %	528832528
123	NC_021908	CGGC	2	8	56885	56892	0 %	0 %	50 %	50 %	528832528
124	NC_021908	GGCC	2	8	56981	56988	0 %	0 %	50 %	50 %	528832528
125	NC_021908	CGAT	2	8	58676	58683	25 %	25 %	25 %	25 %	528832529
126	NC_021908	CGAC	2	8	59063	59070	25 %	0 %	25 %	50 %	528832529
127	NC_021908	GCGG	2	8	59387	59394	0 %	0 %	75 %	25 %	528832530
128	NC_021908	GCCG	3	12	59566	59577	0 %	0 %	50 %	50 %	528832530
129	NC_021908	AAGG	2	8	60915	60922	50 %	0 %	50 %	0 %	528832531
130	NC_021908	AACC	2	8	61268	61275	50 %	0 %	0 %	50 %	528832532
131	NC_021908	ATCC	2	8	62283	62290	25 %	25 %	0 %	50 %	528832533
132	NC_021908	GGTC	2	8	62372	62379	0 %	25 %	50 %	25 %	528832533
133	NC_021908	TCCT	2	8	62635	62642	0 %	50 %	0 %	50 %	528832533
134	NC_021908	CCGC	2	8	63375	63382	0 %	0 %	25 %	75 %	528832534
135	NC_021908	GGCA	2	8	63610	63617	25 %	0 %	50 %	25 %	528832534
136	NC_021908	GCTT	2	8	63776	63783	0 %	50 %	25 %	25 %	528832534
137	NC_021908	CGGT	2	8	64127	64134	0 %	25 %	50 %	25 %	528832534
138	NC_021908	GGCG	2	8	64198	64205	0 %	0 %	75 %	25 %	528832534
139	NC_021908	GATC	2	8	64303	64310	25 %	25 %	25 %	25 %	528832534
140	NC_021908	ATTC	2	8	64632	64639	25 %	50 %	0 %	25 %	528832534
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