MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 11103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021908	GCC	2	6	137107	137112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832604
3002	NC_021908	TGG	2	6	137144	137149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832604
3003	NC_021908	CG	3	6	137159	137164	0 %	0 %	50 %	50 %	528832604
3004	NC_021908	GCG	2	6	137176	137181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832604
3005	NC_021908	AG	3	6	137186	137191	50 %	0 %	50 %	0 %	528832604
3006	NC_021908	CCTG	2	8	137198	137205	0 %	25 %	25 %	50 %	528832604
3007	NC_021908	GAA	2	6	137211	137216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832604
3008	NC_021908	CGG	2	6	137300	137305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832604
3009	NC_021908	GCA	2	6	137356	137361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832604
3010	NC_021908	GAC	2	6	137370	137375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832604
3011	NC_021908	ACG	2	6	137398	137403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832604
3012	NC_021908	CGA	2	6	137441	137446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832604
3013	NC_021908	TTG	2	6	137449	137454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832604
3014	NC_021908	GCC	2	6	137458	137463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832604
3015	NC_021908	GCCG	2	8	137478	137485	0 %	0 %	50 %	50 %	528832604
3016	NC_021908	GCC	2	6	137550	137555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832604
3017	NC_021908	GCG	2	6	137585	137590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832604
3018	NC_021908	ACG	2	6	137686	137691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832604
3019	NC_021908	CCGG	2	8	137705	137712	0 %	0 %	50 %	50 %	528832604
3020	NC_021908	GCAG	2	8	137727	137734	25 %	0 %	50 %	25 %	528832604
3021	NC_021908	GTC	2	6	137737	137742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832604
3022	NC_021908	TCA	2	6	137857	137862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832604
3023	NC_021908	TGA	2	6	137873	137878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832604
3024	NC_021908	ATA	2	6	137926	137931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528832604
3025	NC_021908	TGCC	2	8	137945	137952	0 %	25 %	25 %	50 %	528832604
3026	NC_021908	GCA	2	6	137993	137998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832604
3027	NC_021908	CTC	2	6	138009	138014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832605
3028	NC_021908	AAC	2	6	138018	138023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832605
3029	NC_021908	GAT	2	6	138126	138131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832605
3030	NC_021908	CAG	2	6	138174	138179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3031	NC_021908	AGC	2	6	138218	138223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3032	NC_021908	TCG	2	6	138262	138267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3033	NC_021908	CCT	2	6	138290	138295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832605
3034	NC_021908	GGC	2	6	138321	138326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832605
3035	NC_021908	CTG	2	6	138327	138332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3036	NC_021908	GGC	2	6	138357	138362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832605
3037	NC_021908	TGC	2	6	138376	138381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3038	NC_021908	GGC	2	6	138387	138392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832605
3039	NC_021908	GAA	2	6	138483	138488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832605
3040	NC_021908	AGC	2	6	138511	138516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3041	NC_021908	GCC	2	6	138594	138599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832605
3042	NC_021908	CCG	2	6	138634	138639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832605
3043	NC_021908	TCG	2	6	138686	138691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3044	NC_021908	GCCGAG	2	12	138750	138761	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528832605
3045	NC_021908	GAC	2	6	138783	138788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3046	NC_021908	GCG	2	6	138825	138830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832605
3047	NC_021908	GCC	2	6	138970	138975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832605
3048	NC_021908	CAG	2	6	138999	139004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3049	NC_021908	CGT	2	6	139029	139034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3050	NC_021908	AGCG	2	8	139054	139061	25 %	0 %	50 %	25 %	528832605
3051	NC_021908	GAT	2	6	139080	139085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832605
3052	NC_021908	CAG	2	6	139119	139124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3053	NC_021908	CAG	2	6	139176	139181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3054	NC_021908	CTTC	2	8	139259	139266	0 %	50 %	0 %	50 %	528832605
3055	NC_021908	GGCCG	2	10	139278	139287	0 %	0 %	60 %	40 %	528832605
3056	NC_021908	ATC	2	6	139296	139301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832605
3057	NC_021908	CG	3	6	139306	139311	0 %	0 %	50 %	50 %	528832605
3058	NC_021908	TCG	2	6	139366	139371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3059	NC_021908	CG	4	8	139370	139377	0 %	0 %	50 %	50 %	528832605
3060	NC_021908	CCG	2	6	139382	139387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832605
3061	NC_021908	ATCG	2	8	139452	139459	25 %	25 %	25 %	25 %	528832605
3062	NC_021908	TCG	2	6	139595	139600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3063	NC_021908	AAC	2	6	139603	139608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832605
3064	NC_021908	GAAA	2	8	139628	139635	75 %	0 %	25 %	0 %	528832605
3065	NC_021908	GC	3	6	139640	139645	0 %	0 %	50 %	50 %	528832605
3066	NC_021908	GAC	2	6	139659	139664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3067	NC_021908	CG	3	6	139679	139684	0 %	0 %	50 %	50 %	528832605
3068	NC_021908	GGT	2	6	139714	139719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832605
3069	NC_021908	GCA	2	6	139745	139750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3070	NC_021908	GCC	2	6	139782	139787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832605
3071	NC_021908	GC	3	6	139810	139815	0 %	0 %	50 %	50 %	528832605
3072	NC_021908	GGC	2	6	139833	139838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832605
3073	NC_021908	TGC	2	6	139886	139891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3074	NC_021908	CCGGCA	2	12	139972	139983	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528832605
3075	NC_021908	CGA	2	6	140066	140071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832605
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3077	NC_021908	CCGGC	2	10	140145	140154	0 %	0 %	40 %	60 %	528832605
3078	NC_021908	GC	3	6	140174	140179	0 %	0 %	50 %	50 %	528832605
3079	NC_021908	CGT	2	6	140232	140237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3080	NC_021908	GCC	2	6	140332	140337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832605
3081	NC_021908	CGC	2	6	140352	140357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832605
3082	NC_021908	GC	3	6	140448	140453	0 %	0 %	50 %	50 %	528832605
3083	NC_021908	CAG	2	6	140478	140483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3084	NC_021908	CGC	2	6	140541	140546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832605
3085	NC_021908	GCT	2	6	140555	140560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3086	NC_021908	GCCG	2	8	140589	140596	0 %	0 %	50 %	50 %	528832605
3087	NC_021908	ATC	2	6	140605	140610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832605
3088	NC_021908	CGA	2	6	140615	140620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832605
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3090	NC_021908	CGG	2	6	140732	140737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832605
3091	NC_021908	GCA	2	6	140752	140757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3092	NC_021908	GGCG	2	8	140783	140790	0 %	0 %	75 %	25 %	528832605
3093	NC_021908	ACC	2	6	140830	140835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832605
3094	NC_021908	CGC	2	6	140845	140850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832605
3095	NC_021908	CCTTG	2	10	140885	140894	0 %	40 %	20 %	40 %	528832605
3096	NC_021908	CG	3	6	140957	140962	0 %	0 %	50 %	50 %	528832605
3097	NC_021908	ATGCCG	2	12	141043	141054	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3098	NC_021908	CCG	4	12	141052	141063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832605
3099	NC_021908	AGCG	2	8	141108	141115	25 %	0 %	50 %	25 %	528832605
3100	NC_021908	TCA	2	6	141118	141123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832605
3101	NC_021908	GCA	2	6	141149	141154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3102	NC_021908	CGC	2	6	141161	141166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832605
3103	NC_021908	CG	3	6	141182	141187	0 %	0 %	50 %	50 %	528832605
3104	NC_021908	AG	3	6	141210	141215	50 %	0 %	50 %	0 %	528832605
3105	NC_021908	CGG	2	6	141251	141256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832605
3106	NC_021908	ACG	2	6	141343	141348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832605
3107	NC_021908	GTT	2	6	141605	141610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832606
3108	NC_021908	CGA	2	6	141655	141660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832606
3109	NC_021908	CGA	2	6	141694	141699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832606
3110	NC_021908	GAA	2	6	141737	141742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832606
3111	NC_021908	GGCA	2	8	141811	141818	25 %	0 %	50 %	25 %	528832606
3112	NC_021908	CGG	2	6	141877	141882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832606
3113	NC_021908	GGC	2	6	141892	141897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832606
3114	NC_021908	TGCCGA	2	12	141955	141966	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528832606
3115	NC_021908	GGC	2	6	141971	141976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832606
3116	NC_021908	TCG	2	6	142023	142028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832606
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3118	NC_021908	CTG	2	6	142055	142060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832606
3119	NC_021908	ACG	2	6	142101	142106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832606
3120	NC_021908	AATGA	2	10	142130	142139	60 %	20 %	20 %	0 %	528832606
3121	NC_021908	GTT	2	6	142224	142229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832607
3122	NC_021908	CCG	2	6	142250	142255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832607
3123	NC_021908	ATC	2	6	142272	142277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832607
3124	NC_021908	GCC	2	6	142291	142296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832607
3125	NC_021908	TGA	2	6	142307	142312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832607
3126	NC_021908	CGGGAT	2	12	142334	142345	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528832607
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3133	NC_021908	GAT	2	6	142644	142649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832607
3134	NC_021908	GTC	2	6	142705	142710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832607
3135	NC_021908	CGA	2	6	142730	142735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832607
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3137	NC_021908	CGA	2	6	142772	142777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832607
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3139	NC_021908	TCG	2	6	142838	142843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832607
3140	NC_021908	GCC	2	6	142854	142859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832607
3141	NC_021908	GATG	2	8	142874	142881	25 %	25 %	50 %	0 %	528832607
3142	NC_021908	CGG	2	6	142886	142891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832607
3143	NC_021908	T	7	7	142957	142963	0 %	100 %	0 %	0 %	528832607
3144	NC_021908	CTC	2	6	142968	142973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832607
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3146	NC_021908	GGC	2	6	142989	142994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832607
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3150	NC_021908	TGA	2	6	143039	143044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832608
3151	NC_021908	GTC	2	6	143051	143056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832608
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3227	NC_021908	TGCC	2	8	146871	146878	0 %	25 %	25 %	50 %	528832611
3228	NC_021908	CAA	2	6	146880	146885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832611
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3241	NC_021908	CGT	2	6	147495	147500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832611
3242	NC_021908	CGG	2	6	147515	147520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832611
3243	NC_021908	TGCCGA	2	12	147570	147581	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528832611
3244	NC_021908	ACG	2	6	147616	147621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832611
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3246	NC_021908	AGC	2	6	147762	147767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832611
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3253	NC_021908	CGCT	2	8	147977	147984	0 %	25 %	25 %	50 %	528832611
3254	NC_021908	CGA	2	6	148085	148090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832611
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3259	NC_021908	CGTC	2	8	148160	148167	0 %	25 %	25 %	50 %	528832611
3260	NC_021908	CGC	2	6	148197	148202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832611
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3264	NC_021908	TCT	2	6	148361	148366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832611
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3272	NC_021908	GCT	2	6	148726	148731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832611
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3323	NC_021908	CGC	2	6	151221	151226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832613
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3331	NC_021908	CGGC	2	8	152033	152040	0 %	0 %	50 %	50 %	528832614
3332	NC_021908	TGG	2	6	152075	152080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832614
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3342	NC_021908	GAAC	2	8	153049	153056	50 %	0 %	25 %	25 %	528832616
3343	NC_021908	GTC	2	6	153140	153145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832616
3344	NC_021908	CGAG	2	8	153162	153169	25 %	0 %	50 %	25 %	528832616
3345	NC_021908	TCG	2	6	153252	153257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832616
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3349	NC_021908	TCC	2	6	153353	153358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832616
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3352	NC_021908	TCGA	2	8	153413	153420	25 %	25 %	25 %	25 %	528832616
3353	NC_021908	CGG	2	6	153421	153426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832616
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3355	NC_021908	CAG	2	6	153481	153486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832616
3356	NC_021908	GACGCT	2	12	153490	153501	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528832616
3357	NC_021908	ACC	2	6	153503	153508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832616
3358	NC_021908	CGG	2	6	153519	153524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832616
3359	NC_021908	GCC	2	6	153529	153534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832616
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3361	NC_021908	CGC	2	6	153553	153558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832616
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3481	NC_021908	CGA	2	6	157768	157773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832618
3482	NC_021908	CGA	2	6	157810	157815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832618
3483	NC_021908	CG	3	6	157901	157906	0 %	0 %	50 %	50 %	528832618
3484	NC_021908	CGA	2	6	157924	157929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832618
3485	NC_021908	CGA	3	9	158013	158021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832618
3486	NC_021908	TGC	2	6	158035	158040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832618
3487	NC_021908	G	6	6	158062	158067	0 %	0 %	100 %	0 %	528832618
3488	NC_021908	GTCACC	2	12	158072	158083	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	528832618
3489	NC_021908	CGC	2	6	158107	158112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832618
3490	NC_021908	CGC	2	6	158135	158140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832618
3491	NC_021908	GCT	2	6	158146	158151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832618
3492	NC_021908	TGCC	2	8	158158	158165	0 %	25 %	25 %	50 %	528832618
3493	NC_021908	GGC	2	6	158194	158199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832618
3494	NC_021908	GCCG	2	8	158200	158207	0 %	0 %	50 %	50 %	528832618
3495	NC_021908	CGGCC	2	10	158227	158236	0 %	0 %	40 %	60 %	528832618
3496	NC_021908	GCC	2	6	158251	158256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832618
3497	NC_021908	CGG	2	6	158290	158295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832618
3498	NC_021908	TGGTC	2	10	158307	158316	0 %	40 %	40 %	20 %	528832618
3499	NC_021908	CCG	2	6	158363	158368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832618
3500	NC_021908	CCG	2	6	158383	158388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832618

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