MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 11103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021908	GTCTC	2	10	111776	111785	0 %	40 %	20 %	40 %	528832582
2502	NC_021908	CTC	2	6	111793	111798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832582
2503	NC_021908	CGC	2	6	111813	111818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832582
2504	NC_021908	TTG	2	6	111827	111832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832582
2505	NC_021908	CGC	2	6	111841	111846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832582
2506	NC_021908	GAC	2	6	111886	111891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832582
2507	NC_021908	GTC	2	6	111892	111897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832582
2508	NC_021908	AAG	2	6	111992	111997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832582
2509	NC_021908	GC	3	6	112019	112024	0 %	0 %	50 %	50 %	528832582
2510	NC_021908	TCG	2	6	112064	112069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832582
2511	NC_021908	GCT	2	6	112101	112106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832582
2512	NC_021908	GCC	2	6	112108	112113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832582
2513	NC_021908	GCC	2	6	112187	112192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832582
2514	NC_021908	CGCC	2	8	112202	112209	0 %	0 %	25 %	75 %	528832582
2515	NC_021908	CTT	2	6	112233	112238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832582
2516	NC_021908	TCAT	2	8	112449	112456	25 %	50 %	0 %	25 %	528832582
2517	NC_021908	CGG	2	6	112581	112586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832583
2518	NC_021908	TCG	2	6	112709	112714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832583
2519	NC_021908	GTTG	2	8	112770	112777	0 %	50 %	50 %	0 %	528832583
2520	NC_021908	GCC	2	6	112824	112829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832583
2521	NC_021908	CGA	2	6	112874	112879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832583
2522	NC_021908	CGA	2	6	112886	112891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832583
2523	NC_021908	TGC	2	6	112936	112941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832583
2524	NC_021908	GCC	2	6	112947	112952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832583
2525	NC_021908	TCA	2	6	112955	112960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832583
2526	NC_021908	GAT	2	6	113013	113018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832583
2527	NC_021908	CATC	2	8	113102	113109	25 %	25 %	0 %	50 %	528832583
2528	NC_021908	CCG	2	6	113117	113122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832583
2529	NC_021908	TGT	2	6	113158	113163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832583
2530	NC_021908	GCCC	2	8	113165	113172	0 %	0 %	25 %	75 %	528832583
2531	NC_021908	AGC	2	6	113197	113202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832583
2532	NC_021908	CG	3	6	113219	113224	0 %	0 %	50 %	50 %	528832583
2533	NC_021908	CTT	2	6	113238	113243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832583
2534	NC_021908	ACC	2	6	113377	113382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832583
2535	NC_021908	CGA	2	6	113471	113476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832583
2536	NC_021908	CGT	2	6	113492	113497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832583
2537	NC_021908	TTG	2	6	113515	113520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832583
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2539	NC_021908	ACG	2	6	113655	113660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832584
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2542	NC_021908	GAA	2	6	113720	113725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832584
2543	NC_021908	GA	3	6	113766	113771	50 %	0 %	50 %	0 %	528832584
2544	NC_021908	ATAG	2	8	113816	113823	50 %	25 %	25 %	0 %	528832584
2545	NC_021908	GAT	2	6	113831	113836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832584
2546	NC_021908	GC	3	6	113900	113905	0 %	0 %	50 %	50 %	528832584
2547	NC_021908	TGT	2	6	113929	113934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832584
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2549	NC_021908	AGGT	2	8	113982	113989	25 %	25 %	50 %	0 %	528832584
2550	NC_021908	CG	3	6	114026	114031	0 %	0 %	50 %	50 %	528832584
2551	NC_021908	CTG	2	6	114064	114069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832584
2552	NC_021908	GAA	2	6	114095	114100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832584
2553	NC_021908	GTG	3	9	114180	114188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832584
2554	NC_021908	AGA	2	6	114208	114213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832584
2555	NC_021908	GGGT	2	8	114274	114281	0 %	25 %	75 %	0 %	528832584
2556	NC_021908	CCA	2	6	114290	114295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832584
2557	NC_021908	GCG	2	6	114298	114303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832584
2558	NC_021908	GGC	2	6	114314	114319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832584
2559	NC_021908	AGC	2	6	114375	114380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832584
2560	NC_021908	CG	3	6	114438	114443	0 %	0 %	50 %	50 %	528832584
2561	NC_021908	CAG	2	6	114553	114558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832585
2562	NC_021908	C	6	6	114579	114584	0 %	0 %	0 %	100 %	528832585
2563	NC_021908	GGC	2	6	114591	114596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832585
2564	NC_021908	ATGCG	2	10	114631	114640	20 %	20 %	40 %	20 %	528832585
2565	NC_021908	CGC	2	6	114651	114656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832585
2566	NC_021908	ATG	2	6	114674	114679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832585
2567	NC_021908	CAG	2	6	114703	114708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832585
2568	NC_021908	GCG	2	6	114794	114799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832585
2569	NC_021908	GCA	2	6	114801	114806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832585
2570	NC_021908	GCCA	2	8	114829	114836	25 %	0 %	25 %	50 %	528832585
2571	NC_021908	TCA	2	6	114837	114842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832585
2572	NC_021908	GAC	2	6	114877	114882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832585
2573	NC_021908	AGGG	2	8	114887	114894	25 %	0 %	75 %	0 %	528832585
2574	NC_021908	CGG	2	6	114925	114930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832585
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2578	NC_021908	GTA	2	6	115279	115284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832585
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2581	NC_021908	CGT	2	6	115547	115552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832586
2582	NC_021908	GCT	2	6	115555	115560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832586
2583	NC_021908	GCA	2	6	115595	115600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832586
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2586	NC_021908	CGT	2	6	115677	115682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832586
2587	NC_021908	GAT	2	6	115809	115814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832586
2588	NC_021908	GCC	2	6	115842	115847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832586
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2590	NC_021908	GTC	2	6	115984	115989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832586
2591	NC_021908	TTC	2	6	115990	115995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832586
2592	NC_021908	ATC	2	6	116035	116040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832586
2593	NC_021908	CTG	2	6	116082	116087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832586
2594	NC_021908	ACAT	2	8	116125	116132	50 %	25 %	0 %	25 %	528832586
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2599	NC_021908	CGC	3	9	116222	116230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832586
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2601	NC_021908	GAC	2	6	116343	116348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832586
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2603	NC_021908	GGC	2	6	116553	116558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832586
2604	NC_021908	GCC	2	6	116568	116573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832586
2605	NC_021908	AAG	2	6	116613	116618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832586
2606	NC_021908	CAG	2	6	116637	116642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832586
2607	NC_021908	GAA	2	6	116706	116711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832586
2608	NC_021908	GCA	2	6	116729	116734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832586
2609	NC_021908	G	6	6	116795	116800	0 %	0 %	100 %	0 %	528832586
2610	NC_021908	GCC	2	6	116818	116823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832586
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2612	NC_021908	CCG	2	6	116962	116967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832586
2613	NC_021908	C	6	6	117219	117224	0 %	0 %	0 %	100 %	528832587
2614	NC_021908	CGAG	2	8	117250	117257	25 %	0 %	50 %	25 %	528832587
2615	NC_021908	GAC	2	6	117285	117290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832587
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2618	NC_021908	TCA	2	6	117328	117333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832587
2619	NC_021908	CAAC	2	8	117361	117368	50 %	0 %	0 %	50 %	528832587
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2621	NC_021908	GC	3	6	117435	117440	0 %	0 %	50 %	50 %	528832587
2622	NC_021908	CGAT	2	8	117448	117455	25 %	25 %	25 %	25 %	528832587
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2743	NC_021908	CGAC	2	8	124714	124721	25 %	0 %	25 %	50 %	528832593
2744	NC_021908	TG	3	6	124735	124740	0 %	50 %	50 %	0 %	528832593
2745	NC_021908	TTGGC	2	10	124755	124764	0 %	40 %	40 %	20 %	528832593
2746	NC_021908	TCA	2	6	124795	124800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832593
2747	NC_021908	CGC	2	6	124883	124888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832593
2748	NC_021908	AGT	2	6	124941	124946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832593
2749	NC_021908	CAAC	2	8	125194	125201	50 %	0 %	0 %	50 %	528832593
2750	NC_021908	GCA	2	6	125271	125276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832593
2751	NC_021908	GCTT	2	8	125309	125316	0 %	50 %	25 %	25 %	528832593
2752	NC_021908	GAC	2	6	125409	125414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832593
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2758	NC_021908	TGC	2	6	125692	125697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832593
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2761	NC_021908	CGG	2	6	125802	125807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832594
2762	NC_021908	CGC	2	6	125824	125829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832594
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2772	NC_021908	CTG	2	6	126400	126405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832595
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2862	NC_021908	ATG	2	6	130711	130716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832598
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2979	NC_021908	GC	3	6	135924	135929	0 %	0 %	50 %	50 %	528832603
2980	NC_021908	T	6	6	136194	136199	0 %	100 %	0 %	0 %	528832604
2981	NC_021908	GC	3	6	136219	136224	0 %	0 %	50 %	50 %	528832604
2982	NC_021908	C	6	6	136228	136233	0 %	0 %	0 %	100 %	528832604
2983	NC_021908	CG	4	8	136247	136254	0 %	0 %	50 %	50 %	528832604
2984	NC_021908	TGCCGA	2	12	136319	136330	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528832604
2985	NC_021908	CGG	2	6	136443	136448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832604
2986	NC_021908	GCA	2	6	136460	136465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832604
2987	NC_021908	GCC	2	6	136512	136517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832604
2988	NC_021908	CGA	4	12	136565	136576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832604
2989	NC_021908	CGG	2	6	136595	136600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832604
2990	NC_021908	GCCG	2	8	136731	136738	0 %	0 %	50 %	50 %	528832604
2991	NC_021908	CGC	2	6	136779	136784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832604
2992	NC_021908	TTC	2	6	136857	136862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832604
2993	NC_021908	GGT	2	6	136872	136877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832604
2994	NC_021908	GCA	2	6	136889	136894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832604
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2996	NC_021908	TCT	2	6	136928	136933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832604
2997	NC_021908	GGC	2	6	136968	136973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832604
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