MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 11103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021908	CGA	2	6	65778	65783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832535
1502	NC_021908	GC	3	6	65791	65796	0 %	0 %	50 %	50 %	528832535
1503	NC_021908	GGC	2	6	65811	65816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832535
1504	NC_021908	GCG	2	6	65817	65822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832535
1505	NC_021908	GCTC	2	8	65840	65847	0 %	25 %	25 %	50 %	528832535
1506	NC_021908	GGC	2	6	65853	65858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832535
1507	NC_021908	ATGAA	2	10	65905	65914	60 %	20 %	20 %	0 %	528832535
1508	NC_021908	GCC	2	6	65964	65969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832536
1509	NC_021908	GC	3	6	65979	65984	0 %	0 %	50 %	50 %	528832536
1510	NC_021908	GGC	2	6	66110	66115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832536
1511	NC_021908	ACCA	2	8	66168	66175	50 %	0 %	0 %	50 %	528832536
1512	NC_021908	GCCGG	2	10	66177	66186	0 %	0 %	60 %	40 %	528832536
1513	NC_021908	AAG	2	6	66192	66197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832536
1514	NC_021908	CGGC	2	8	66216	66223	0 %	0 %	50 %	50 %	528832536
1515	NC_021908	GTG	2	6	66228	66233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832536
1516	NC_021908	GCT	2	6	66260	66265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832536
1517	NC_021908	GCC	2	6	66305	66310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832536
1518	NC_021908	ACGG	2	8	66379	66386	25 %	0 %	50 %	25 %	528832536
1519	NC_021908	GGC	2	6	66396	66401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832536
1520	NC_021908	GCT	2	6	66410	66415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832536
1521	NC_021908	CAT	2	6	66431	66436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832536
1522	NC_021908	CG	3	6	66451	66456	0 %	0 %	50 %	50 %	528832536
1523	NC_021908	TGG	2	6	66478	66483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832536
1524	NC_021908	TGG	2	6	66490	66495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832536
1525	NC_021908	GCCG	2	8	66516	66523	0 %	0 %	50 %	50 %	528832536
1526	NC_021908	CGA	2	6	66524	66529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832536
1527	NC_021908	GCT	2	6	66539	66544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832536
1528	NC_021908	CACC	2	8	66545	66552	25 %	0 %	0 %	75 %	528832536
1529	NC_021908	CGC	2	6	66569	66574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832536
1530	NC_021908	GACC	2	8	66605	66612	25 %	0 %	25 %	50 %	528832536
1531	NC_021908	CGG	2	6	66634	66639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832536
1532	NC_021908	GGC	2	6	66676	66681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832537
1533	NC_021908	AGC	2	6	66740	66745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832537
1534	NC_021908	GCC	3	9	66751	66759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832537
1535	NC_021908	GATCA	2	10	66925	66934	40 %	20 %	20 %	20 %	528832537
1536	NC_021908	GTG	2	6	66959	66964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832537
1537	NC_021908	CGGG	2	8	66990	66997	0 %	0 %	75 %	25 %	528832537
1538	NC_021908	GGC	3	9	67013	67021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832537
1539	NC_021908	GCCT	2	8	67076	67083	0 %	25 %	25 %	50 %	528832537
1540	NC_021908	GAT	2	6	67171	67176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832537
1541	NC_021908	AG	3	6	67248	67253	50 %	0 %	50 %	0 %	528832537
1542	NC_021908	CCAG	2	8	67290	67297	25 %	0 %	25 %	50 %	528832537
1543	NC_021908	GCA	3	9	67446	67454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832537
1544	NC_021908	CGGC	2	8	67472	67479	0 %	0 %	50 %	50 %	528832537
1545	NC_021908	ATG	2	6	67514	67519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832537
1546	NC_021908	GGC	2	6	67534	67539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832537
1547	NC_021908	TCC	2	6	67555	67560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832538
1548	NC_021908	TGC	2	6	67564	67569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832538
1549	NC_021908	CCGG	2	8	67583	67590	0 %	0 %	50 %	50 %	528832538
1550	NC_021908	GCG	2	6	67637	67642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832538
1551	NC_021908	TCG	3	9	67684	67692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832538
1552	NC_021908	TCCT	2	8	67816	67823	0 %	50 %	0 %	50 %	528832538
1553	NC_021908	CGC	2	6	67862	67867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832538
1554	NC_021908	CAC	2	6	68013	68018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832539
1555	NC_021908	CG	4	8	68030	68037	0 %	0 %	50 %	50 %	528832539
1556	NC_021908	GGC	2	6	68055	68060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832539
1557	NC_021908	CGC	2	6	68061	68066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832539
1558	NC_021908	GTG	2	6	68112	68117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832539
1559	NC_021908	GAC	2	6	68235	68240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832539
1560	NC_021908	CAT	2	6	68256	68261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832539
1561	NC_021908	GCC	2	6	68358	68363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832539
1562	NC_021908	TCG	2	6	68447	68452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832539
1563	NC_021908	GGGC	2	8	68484	68491	0 %	0 %	75 %	25 %	528832539
1564	NC_021908	TGA	2	6	68492	68497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832539
1565	NC_021908	ATA	2	6	68571	68576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528832539
1566	NC_021908	GAA	2	6	68586	68591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832539
1567	NC_021908	GAT	2	6	68601	68606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832539
1568	NC_021908	AGTGGC	2	12	68615	68626	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528832539
1569	NC_021908	GAA	2	6	68628	68633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832539
1570	NC_021908	AGC	2	6	68662	68667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832539
1571	NC_021908	CCG	2	6	68752	68757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832539
1572	NC_021908	GTC	2	6	68830	68835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832539
1573	NC_021908	GCA	3	9	69245	69253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832540
1574	NC_021908	TGG	2	6	69307	69312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832540
1575	NC_021908	GCGA	2	8	69343	69350	25 %	0 %	50 %	25 %	528832540
1576	NC_021908	GAG	2	6	69397	69402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832540
1577	NC_021908	GCC	3	9	69405	69413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832540
1578	NC_021908	CGC	2	6	69428	69433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832540
1579	NC_021908	GCGA	2	8	69571	69578	25 %	0 %	50 %	25 %	528832540
1580	NC_021908	ACGG	2	8	69582	69589	25 %	0 %	50 %	25 %	528832540
1581	NC_021908	GCA	2	6	69625	69630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832540
1582	NC_021908	CCG	2	6	69631	69636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832540
1583	NC_021908	GCG	2	6	69686	69691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832540
1584	NC_021908	CG	3	6	69690	69695	0 %	0 %	50 %	50 %	528832540
1585	NC_021908	CGC	2	6	69732	69737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832540
1586	NC_021908	GCC	2	6	69768	69773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832540
1587	NC_021908	CGGC	2	8	69820	69827	0 %	0 %	50 %	50 %	528832540
1588	NC_021908	ACC	2	6	69838	69843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832540
1589	NC_021908	ATC	2	6	69856	69861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832540
1590	NC_021908	CTGG	2	8	69882	69889	0 %	25 %	50 %	25 %	528832540
1591	NC_021908	CCG	2	6	69922	69927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832540
1592	NC_021908	GAC	3	9	69960	69968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832540
1593	NC_021908	GCC	2	6	70093	70098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832540
1594	NC_021908	CGG	2	6	70130	70135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832540
1595	NC_021908	GAG	2	6	70164	70169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832540
1596	NC_021908	AATG	2	8	70438	70445	50 %	25 %	25 %	0 %	528832541
1597	NC_021908	ATC	2	6	70479	70484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832541
1598	NC_021908	CAG	2	6	70517	70522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832541
1599	NC_021908	TCC	2	6	70548	70553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832541
1600	NC_021908	CGA	2	6	70597	70602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832541
1601	NC_021908	GCG	2	6	70618	70623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832541
1602	NC_021908	CCTG	2	8	70624	70631	0 %	25 %	25 %	50 %	528832541
1603	NC_021908	CGG	2	6	70735	70740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832541
1604	NC_021908	CGC	2	6	70741	70746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832541
1605	NC_021908	TGT	2	6	70762	70767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832541
1606	NC_021908	CGA	2	6	70798	70803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832541
1607	NC_021908	CGGTGA	2	12	70846	70857	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528832541
1608	NC_021908	CAG	2	6	70966	70971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832541
1609	NC_021908	GCT	2	6	71002	71007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832541
1610	NC_021908	TCG	2	6	71043	71048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832542
1611	NC_021908	GCG	2	6	71050	71055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832542
1612	NC_021908	GCA	2	6	71061	71066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832542
1613	NC_021908	GCG	2	6	71121	71126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832542
1614	NC_021908	GCT	2	6	71133	71138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832542
1615	NC_021908	CGC	2	6	71143	71148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832542
1616	NC_021908	CGA	2	6	71166	71171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832542
1617	NC_021908	GGGCG	2	10	71265	71274	0 %	0 %	80 %	20 %	528832542
1618	NC_021908	TCG	2	6	71345	71350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832542
1619	NC_021908	GCC	2	6	71368	71373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832542
1620	NC_021908	CGC	2	6	71389	71394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832542
1621	NC_021908	CTT	2	6	71407	71412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832542
1622	NC_021908	GCC	2	6	71425	71430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832542
1623	NC_021908	TCG	2	6	71483	71488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832542
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