MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 11103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021908	GAC	2	6	44763	44768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1002	NC_021908	GC	3	6	44771	44776	0 %	0 %	50 %	50 %	528832520
1003	NC_021908	CTG	2	6	44859	44864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1004	NC_021908	CGA	2	6	44954	44959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1005	NC_021908	CCG	2	6	44998	45003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832520
1006	NC_021908	TGA	2	6	45047	45052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832520
1007	NC_021908	GCC	2	6	45110	45115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832520
1008	NC_021908	CGA	2	6	45176	45181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1009	NC_021908	GGC	2	6	45227	45232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832520
1010	NC_021908	GAC	2	6	45267	45272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1011	NC_021908	CGA	2	6	45284	45289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1012	NC_021908	GGC	3	9	45291	45299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832520
1013	NC_021908	GAT	2	6	45327	45332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832520
1014	NC_021908	CCG	2	6	45358	45363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832520
1015	NC_021908	GGGC	2	8	45368	45375	0 %	0 %	75 %	25 %	528832520
1016	NC_021908	GCC	2	6	45399	45404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832520
1017	NC_021908	TGG	2	6	45431	45436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832520
1018	NC_021908	CGG	2	6	45471	45476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832520
1019	NC_021908	GCA	2	6	45482	45487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1020	NC_021908	GCA	2	6	45518	45523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1021	NC_021908	CAC	2	6	45582	45587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832520
1022	NC_021908	GAA	2	6	45651	45656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832520
1023	NC_021908	ATC	2	6	45793	45798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832520
1024	NC_021908	CGA	2	6	45806	45811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1025	NC_021908	GCT	2	6	45827	45832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1026	NC_021908	TTC	2	6	45844	45849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832520
1027	NC_021908	GCGA	2	8	46065	46072	25 %	0 %	50 %	25 %	528832521
1028	NC_021908	ATC	2	6	46080	46085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832521
1029	NC_021908	ATG	2	6	46092	46097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832521
1030	NC_021908	TCT	2	6	46105	46110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832521
1031	NC_021908	CGAG	2	8	46126	46133	25 %	0 %	50 %	25 %	528832521
1032	NC_021908	CGC	2	6	46270	46275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832521
1033	NC_021908	CGA	2	6	46279	46284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832521
1034	NC_021908	GC	3	6	46400	46405	0 %	0 %	50 %	50 %	528832521
1035	NC_021908	CAG	2	6	46478	46483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832521
1036	NC_021908	GCA	2	6	46501	46506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832521
1037	NC_021908	GCC	2	6	46512	46517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832521
1038	NC_021908	CGC	3	9	46552	46560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832521
1039	NC_021908	CGATG	2	10	46565	46574	20 %	20 %	40 %	20 %	528832521
1040	NC_021908	CCG	2	6	46588	46593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832521
1041	NC_021908	CGG	3	9	46604	46612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832521
1042	NC_021908	CGA	2	6	46615	46620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832521
1043	NC_021908	GCCG	2	8	46870	46877	0 %	0 %	50 %	50 %	528832521
1044	NC_021908	GAT	2	6	46892	46897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832521
1045	NC_021908	GAC	2	6	46898	46903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832521
1046	NC_021908	AGC	2	6	46932	46937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832521
1047	NC_021908	CGG	2	6	46944	46949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832521
1048	NC_021908	GCG	2	6	46950	46955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832521
1049	NC_021908	TTC	2	6	46961	46966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832521
1050	NC_021908	GCCG	3	12	46967	46978	0 %	0 %	50 %	50 %	528832521
1051	NC_021908	CGA	2	6	47020	47025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832521
1052	NC_021908	CCG	2	6	47026	47031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832521
1053	NC_021908	GCC	2	6	47081	47086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832521
1054	NC_021908	CAC	2	6	47090	47095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832521
1055	NC_021908	AGA	3	9	47182	47190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832521
1056	NC_021908	CGG	2	6	47292	47297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832522
1057	NC_021908	CGC	2	6	47335	47340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832522
1058	NC_021908	AGC	2	6	47357	47362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832522
1059	NC_021908	TCC	2	6	47369	47374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832522
1060	NC_021908	GGC	2	6	47375	47380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832522
1061	NC_021908	ACG	2	6	47381	47386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832522
1062	NC_021908	CCGT	2	8	47399	47406	0 %	25 %	25 %	50 %	528832522
1063	NC_021908	CAG	2	6	47407	47412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832522
1064	NC_021908	CGT	2	6	47431	47436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832522
1065	NC_021908	GGC	2	6	47506	47511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832522
1066	NC_021908	CGGCG	2	10	47538	47547	0 %	0 %	60 %	40 %	528832522
1067	NC_021908	TCG	2	6	47645	47650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832522
1068	NC_021908	CCG	3	9	47651	47659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832522
1069	NC_021908	CGGC	2	8	47685	47692	0 %	0 %	50 %	50 %	528832522
1070	NC_021908	AGC	2	6	47693	47698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832522
1071	NC_021908	GCA	2	6	47709	47714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832522
1072	NC_021908	CGT	2	6	47718	47723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832522
1073	NC_021908	CTT	2	6	47728	47733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832522
1074	NC_021908	CCT	2	6	47862	47867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832522
1075	NC_021908	CG	3	6	48096	48101	0 %	0 %	50 %	50 %	528832522
1076	NC_021908	GGC	2	6	48123	48128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832522
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1078	NC_021908	TCA	2	6	48177	48182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832522
1079	NC_021908	CGA	2	6	48213	48218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832522
1080	NC_021908	GAC	2	6	48268	48273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832522
1081	NC_021908	GC	3	6	48274	48279	0 %	0 %	50 %	50 %	528832522
1082	NC_021908	CTT	2	6	48307	48312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832522
1083	NC_021908	GTCG	2	8	48313	48320	0 %	25 %	50 %	25 %	528832522
1084	NC_021908	ACG	2	6	48422	48427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832522
1085	NC_021908	GCG	2	6	48436	48441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832522
1086	NC_021908	GGC	2	6	48443	48448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832522
1087	NC_021908	CGA	2	6	48471	48476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832523
1088	NC_021908	GGTG	2	8	48483	48490	0 %	25 %	75 %	0 %	528832523
1089	NC_021908	TGC	2	6	48555	48560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832523
1090	NC_021908	CGG	2	6	48571	48576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832523
1091	NC_021908	ATG	2	6	48611	48616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832523
1092	NC_021908	GCA	3	9	48639	48647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832523
1093	NC_021908	CGA	2	6	48651	48656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832523
1094	NC_021908	GC	3	6	48680	48685	0 %	0 %	50 %	50 %	528832523
1095	NC_021908	AGC	2	6	48686	48691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832523
1096	NC_021908	CG	3	6	48699	48704	0 %	0 %	50 %	50 %	528832523
1097	NC_021908	CG	3	6	48711	48716	0 %	0 %	50 %	50 %	528832523
1098	NC_021908	GCC	2	6	48769	48774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832523
1099	NC_021908	CGA	2	6	48780	48785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832523
1100	NC_021908	TTC	2	6	48808	48813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832523
1101	NC_021908	GC	3	6	48878	48883	0 %	0 %	50 %	50 %	528832523
1102	NC_021908	CGG	2	6	48885	48890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832523
1103	NC_021908	ACG	2	6	48911	48916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832523
1104	NC_021908	TCA	2	6	48957	48962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832523
1105	NC_021908	CGT	2	6	48963	48968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832523
1106	NC_021908	CGC	4	12	48987	48998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832523
1107	NC_021908	GAG	2	6	49009	49014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832523
1108	NC_021908	CGCTG	2	10	49059	49068	0 %	20 %	40 %	40 %	528832523
1109	NC_021908	CGA	2	6	49077	49082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832523
1110	NC_021908	CGG	2	6	49144	49149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832523
1111	NC_021908	TCT	2	6	49185	49190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832523
1112	NC_021908	ATG	2	6	49193	49198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832523
1113	NC_021908	GCG	2	6	49230	49235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832523
1114	NC_021908	CGA	2	6	49338	49343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832523
1115	NC_021908	CGG	2	6	49368	49373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832523
1116	NC_021908	TGGC	2	8	49424	49431	0 %	25 %	50 %	25 %	528832523
1117	NC_021908	TGA	2	6	49461	49466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832523
1118	NC_021908	TCG	2	6	49521	49526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832523
1119	NC_021908	GCG	2	6	49594	49599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832523
1120	NC_021908	GGCCGA	2	12	49605	49616	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528832523
1121	NC_021908	AAC	2	6	49832	49837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832524
1122	NC_021908	AGC	2	6	49854	49859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832524
1123	NC_021908	TGACGC	2	12	49876	49887	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528832524
1124	NC_021908	CAG	2	6	49901	49906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832524
1125	NC_021908	CGG	2	6	49925	49930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832524
1126	NC_021908	AGGCCG	2	12	49935	49946	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528832524
1127	NC_021908	AGGA	2	8	49947	49954	50 %	0 %	50 %	0 %	528832524
1128	NC_021908	TCG	2	6	49993	49998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832524
1129	NC_021908	GGC	2	6	50038	50043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832524
1130	NC_021908	GAT	2	6	50045	50050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832524
1131	NC_021908	GCGTG	2	10	50051	50060	0 %	20 %	60 %	20 %	528832524
1132	NC_021908	TCC	2	6	50094	50099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832524
1133	NC_021908	GAT	2	6	50153	50158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832524
1134	NC_021908	AAAT	2	8	50181	50188	75 %	25 %	0 %	0 %	528832524
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1136	NC_021908	GCG	2	6	50220	50225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832524
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1138	NC_021908	GCA	2	6	50260	50265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832524
1139	NC_021908	CGC	2	6	50299	50304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832524
1140	NC_021908	GCC	2	6	50321	50326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832524
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1142	NC_021908	CGGT	2	8	50430	50437	0 %	25 %	50 %	25 %	528832524
1143	NC_021908	GCC	2	6	50456	50461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832524
1144	NC_021908	AGATG	2	10	50473	50482	40 %	20 %	40 %	0 %	528832524
1145	NC_021908	CGA	2	6	50494	50499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832524
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1148	NC_021908	CGT	2	6	50551	50556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832524
1149	NC_021908	CGGT	2	8	50562	50569	0 %	25 %	50 %	25 %	528832524
1150	NC_021908	ATCGAG	2	12	50588	50599	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528832524
1151	NC_021908	TGC	2	6	50605	50610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832524
1152	NC_021908	CGA	2	6	50629	50634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832524
1153	NC_021908	GAA	2	6	50648	50653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832524
1154	NC_021908	GCG	3	9	50665	50673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832524
1155	NC_021908	ATC	2	6	50736	50741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832524
1156	NC_021908	CGG	2	6	50749	50754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832524
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1158	NC_021908	TGC	2	6	50787	50792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832524
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1161	NC_021908	GCC	2	6	50847	50852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832524
1162	NC_021908	GC	3	6	50911	50916	0 %	0 %	50 %	50 %	528832524
1163	NC_021908	ATT	2	6	50937	50942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528832524
1164	NC_021908	AAG	2	6	51023	51028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832525
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1175	NC_021908	GCCG	2	8	51322	51329	0 %	0 %	50 %	50 %	528832525
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1189	NC_021908	TGA	2	6	52071	52076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832526
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1230	NC_021908	GCGG	3	12	53691	53702	0 %	0 %	75 %	25 %	528832526
1231	NC_021908	GCAG	2	8	53720	53727	25 %	0 %	50 %	25 %	528832526
1232	NC_021908	CTGC	2	8	53769	53776	0 %	25 %	25 %	50 %	528832526
1233	NC_021908	CCG	2	6	53790	53795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832526
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1241	NC_021908	GCGG	2	8	54011	54018	0 %	0 %	75 %	25 %	528832527
1242	NC_021908	CGG	2	6	54038	54043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832527
1243	NC_021908	AGC	2	6	54046	54051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832527
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1245	NC_021908	CG	3	6	54092	54097	0 %	0 %	50 %	50 %	528832527
1246	NC_021908	TCG	2	6	54271	54276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832527
1247	NC_021908	GCGCTG	2	12	54324	54335	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528832527
1248	NC_021908	GCC	2	6	54336	54341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832527
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1250	NC_021908	CTTGCG	2	12	54411	54422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832527
1251	NC_021908	TCG	2	6	54424	54429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832527
1252	NC_021908	CGC	2	6	54434	54439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832527
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1365	NC_021908	TCA	2	6	59299	59304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832530
1366	NC_021908	CTT	2	6	59356	59361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832530
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1368	NC_021908	GCGG	2	8	59387	59394	0 %	0 %	75 %	25 %	528832530
1369	NC_021908	CGT	2	6	59422	59427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832530
1370	NC_021908	GCG	2	6	59471	59476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832530
1371	NC_021908	ACG	2	6	59520	59525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832530
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1373	NC_021908	CGG	2	6	59671	59676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832530
1374	NC_021908	CGA	2	6	59683	59688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832530
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1376	NC_021908	GAT	2	6	59744	59749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832530
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1380	NC_021908	GCA	2	6	59995	60000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832530
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1385	NC_021908	CGC	2	6	60097	60102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832530
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1387	NC_021908	GCC	2	6	60191	60196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832530
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1392	NC_021908	GCC	2	6	60625	60630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832531
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1402	NC_021908	AACC	2	8	61268	61275	50 %	0 %	0 %	50 %	528832532
1403	NC_021908	TGA	2	6	61276	61281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832532
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1486	NC_021908	TCA	2	6	65190	65195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832535
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1488	NC_021908	GCGG	2	8	65220	65227	0 %	0 %	75 %	25 %	528832535
1489	NC_021908	CGCCGG	2	12	65342	65353	0 %	0 %	50 %	50 %	528832535
1490	NC_021908	TGA	2	6	65366	65371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832535
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1493	NC_021908	GCG	2	6	65612	65617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832535
1494	NC_021908	GCC	2	6	65650	65655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832535
1495	NC_021908	CGT	2	6	65664	65669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832535
1496	NC_021908	CAG	2	6	65681	65686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832535
1497	NC_021908	GGT	2	6	65697	65702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832535
1498	NC_021908	GCT	2	6	65721	65726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832535
1499	NC_021908	CGC	2	6	65745	65750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832535
1500	NC_021908	GCTGC	2	10	65767	65776	0 %	20 %	40 %	40 %	528832535

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